MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 97526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015572	GAT	2	6	518305	518310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333982219
10002	NC_015572	CAC	2	6	518318	518323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982219
10003	NC_015572	GCA	2	6	518370	518375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982219
10004	NC_015572	GCT	2	6	518383	518388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982219
10005	NC_015572	GGC	3	9	518395	518403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982219
10006	NC_015572	GTT	2	6	518428	518433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982219
10007	NC_015572	GC	3	6	518437	518442	0 %	0 %	50 %	50 %	333982219
10008	NC_015572	GCGG	2	8	518458	518465	0 %	0 %	75 %	25 %	333982219
10009	NC_015572	CGAA	2	8	518474	518481	50 %	0 %	25 %	25 %	333982219
10010	NC_015572	CGG	2	6	518507	518512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982219
10011	NC_015572	ATC	2	6	518519	518524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982219
10012	NC_015572	GCCA	2	8	518537	518544	25 %	0 %	25 %	50 %	333982219
10013	NC_015572	GCC	3	9	518584	518592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982219
10014	NC_015572	CAG	3	9	518641	518649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982219
10015	NC_015572	GCA	2	6	518676	518681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982219
10016	NC_015572	TCG	2	6	518764	518769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982220
10017	NC_015572	CGG	2	6	518789	518794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982220
10018	NC_015572	T	6	6	518795	518800	0 %	100 %	0 %	0 %	333982220
10019	NC_015572	TGG	2	6	518813	518818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333982220
10020	NC_015572	T	6	6	518825	518830	0 %	100 %	0 %	0 %	333982220
10021	NC_015572	TTC	2	6	518838	518843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333982220
10022	NC_015572	GGGT	2	8	518855	518862	0 %	25 %	75 %	0 %	333982220
10023	NC_015572	GCG	2	6	518893	518898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982220
10024	NC_015572	CGG	2	6	518981	518986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982220
10025	NC_015572	CACC	2	8	519095	519102	25 %	0 %	0 %	75 %	333982220
10026	NC_015572	GCAGCG	2	12	519158	519169	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333982220
10027	NC_015572	CAT	2	6	519282	519287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982220
10028	NC_015572	CCA	2	6	519320	519325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982220
10029	NC_015572	T	6	6	519365	519370	0 %	100 %	0 %	0 %	333982220
10030	NC_015572	CCT	2	6	519386	519391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333982220
10031	NC_015572	CGC	2	6	519530	519535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982220
10032	NC_015572	GCC	2	6	519561	519566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982220
10033	NC_015572	TCT	2	6	519583	519588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333982220
10034	NC_015572	CCG	2	6	519589	519594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982220
10035	NC_015572	TTG	2	6	519772	519777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982221
10036	NC_015572	TTG	3	9	519781	519789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982221
10037	NC_015572	GGT	2	6	519823	519828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333982221
10038	NC_015572	ATC	2	6	519881	519886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982221
10039	NC_015572	CG	3	6	519887	519892	0 %	0 %	50 %	50 %	333982221
10040	NC_015572	ATC	2	6	519917	519922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982221
10041	NC_015572	GC	3	6	519945	519950	0 %	0 %	50 %	50 %	333982221
10042	NC_015572	GTT	2	6	519960	519965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982221
10043	NC_015572	C	6	6	519983	519988	0 %	0 %	0 %	100 %	333982221
10044	NC_015572	GCA	2	6	519999	520004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982221
10045	NC_015572	GC	3	6	520032	520037	0 %	0 %	50 %	50 %	333982221
10046	NC_015572	CCTT	2	8	520040	520047	0 %	50 %	0 %	50 %	333982221
10047	NC_015572	TTTG	2	8	520083	520090	0 %	75 %	25 %	0 %	333982221
10048	NC_015572	TTG	2	6	520127	520132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982221
10049	NC_015572	CGT	2	6	520182	520187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982221
10050	NC_015572	GTT	2	6	520230	520235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982221
10051	NC_015572	GTC	2	6	520327	520332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982221
10052	NC_015572	GCA	2	6	520335	520340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982221
10053	NC_015572	GCCG	2	8	520402	520409	0 %	0 %	50 %	50 %	333982221
10054	NC_015572	CAG	2	6	520426	520431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982221
10055	NC_015572	GC	4	8	520584	520591	0 %	0 %	50 %	50 %	333982221
10056	NC_015572	GCG	2	6	520604	520609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982221
10057	NC_015572	TTAT	2	8	520610	520617	25 %	75 %	0 %	0 %	333982221
10058	NC_015572	ATA	2	6	520679	520684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333982222
10059	NC_015572	CCA	2	6	520699	520704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982222
10060	NC_015572	CTGGTG	2	12	520722	520733	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333982222
10061	NC_015572	TCATT	2	10	520741	520750	20 %	60 %	0 %	20 %	333982222
10062	NC_015572	TCT	2	6	520794	520799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333982222
10063	NC_015572	TTGT	2	8	520814	520821	0 %	75 %	25 %	0 %	333982222
10064	NC_015572	CTT	2	6	520918	520923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333982222
10065	NC_015572	GC	3	6	520947	520952	0 %	0 %	50 %	50 %	333982222
10066	NC_015572	ACTG	2	8	520957	520964	25 %	25 %	25 %	25 %	333982222
10067	NC_015572	CCA	2	6	520990	520995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982222
10068	NC_015572	GC	3	6	521040	521045	0 %	0 %	50 %	50 %	333982222
10069	NC_015572	GCC	2	6	521053	521058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982222
10070	NC_015572	TGG	2	6	521076	521081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333982222
10071	NC_015572	CGTC	2	8	521092	521099	0 %	25 %	25 %	50 %	333982222
10072	NC_015572	GGC	2	6	521102	521107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982222
10073	NC_015572	GCC	2	6	521165	521170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982222
10074	NC_015572	CGC	2	6	521177	521182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982222
10075	NC_015572	GGC	2	6	521219	521224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982222
10076	NC_015572	GCT	2	6	521272	521277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982222
10077	NC_015572	TTC	2	6	521360	521365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333982222
10078	NC_015572	CTG	2	6	521366	521371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982222
10079	NC_015572	TGC	2	6	521562	521567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982222
10080	NC_015572	T	7	7	521642	521648	0 %	100 %	0 %	0 %	333982222
10081	NC_015572	TGA	2	6	521665	521670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333982222
10082	NC_015572	GTC	2	6	521681	521686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982222
10083	NC_015572	CAG	2	6	521690	521695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982222
10084	NC_015572	TTGA	2	8	521705	521712	25 %	50 %	25 %	0 %	333982222
10085	NC_015572	T	6	6	521749	521754	0 %	100 %	0 %	0 %	333982222
10086	NC_015572	TTC	2	6	521864	521869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333982222
10087	NC_015572	GCC	3	9	521951	521959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982222
10088	NC_015572	ATG	2	6	521973	521978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333982222
10089	NC_015572	CAG	2	6	522023	522028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982222
10090	NC_015572	GT	3	6	522078	522083	0 %	50 %	50 %	0 %	333982222
10091	NC_015572	T	8	8	522121	522128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_015572	TTTTG	2	10	522174	522183	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_015572	ACAAA	2	10	522186	522195	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10094	NC_015572	A	6	6	522205	522210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_015572	TAT	2	6	522277	522282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_015572	ACA	2	6	522284	522289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_015572	ATC	2	6	522369	522374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982223
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10099	NC_015572	ACC	2	6	522429	522434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982223
10100	NC_015572	GCT	3	9	522435	522443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982223
10101	NC_015572	CAA	2	6	522476	522481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333982223
10102	NC_015572	AAT	3	9	522517	522525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_015572	T	6	6	522573	522578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_015572	TC	3	6	522597	522602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10105	NC_015572	GAA	2	6	522719	522724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333982224
10106	NC_015572	CAG	2	6	522740	522745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982224
10107	NC_015572	AAG	2	6	522810	522815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333982224
10108	NC_015572	CGG	2	6	522820	522825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982224
10109	NC_015572	TGC	2	6	522849	522854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982224
10110	NC_015572	ATTT	2	8	522866	522873	25 %	75 %	0 %	0 %	333982224
10111	NC_015572	GGA	2	6	522985	522990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333982224
10112	NC_015572	CGC	2	6	523016	523021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982224
10113	NC_015572	ATT	2	6	523072	523077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333982224
10114	NC_015572	TA	3	6	523118	523123	50 %	50 %	0 %	0 %	333982224
10115	NC_015572	TGCCGC	2	12	523147	523158	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333982224
10116	NC_015572	ATC	2	6	523178	523183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982224
10117	NC_015572	GTC	2	6	523265	523270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982224
10118	NC_015572	GGAAGC	2	12	523279	523290	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333982224
10119	NC_015572	ATT	2	6	523305	523310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333982224
10120	NC_015572	ATT	2	6	523360	523365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333982224
10121	NC_015572	CTG	2	6	523385	523390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982224
10122	NC_015572	TTG	2	6	523400	523405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982224
10123	NC_015572	CA	3	6	523441	523446	50 %	0 %	0 %	50 %	333982224
10124	NC_015572	CCG	2	6	523488	523493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982224
10125	NC_015572	CTGG	2	8	523498	523505	0 %	25 %	50 %	25 %	333982224
10126	NC_015572	GCTGCG	2	12	523567	523578	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333982224
10127	NC_015572	GCG	2	6	523583	523588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982224
10128	NC_015572	TGC	2	6	523632	523637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982224
10129	NC_015572	CCGG	2	8	523646	523653	0 %	0 %	50 %	50 %	333982224
10130	NC_015572	CTAT	2	8	523746	523753	25 %	50 %	0 %	25 %	333982224
10131	NC_015572	GC	3	6	523799	523804	0 %	0 %	50 %	50 %	333982224
10132	NC_015572	ACGGC	2	10	523845	523854	20 %	0 %	40 %	40 %	333982224
10133	NC_015572	CG	3	6	523857	523862	0 %	0 %	50 %	50 %	333982224
10134	NC_015572	TGA	2	6	523887	523892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333982224
10135	NC_015572	GGCG	2	8	523936	523943	0 %	0 %	75 %	25 %	333982224
10136	NC_015572	GGC	2	6	523969	523974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982224
10137	NC_015572	GCG	2	6	524007	524012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982224
10138	NC_015572	CGC	2	6	524027	524032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982224
10139	NC_015572	GTG	2	6	524141	524146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333982224
10140	NC_015572	CGG	2	6	524190	524195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982224
10141	NC_015572	A	6	6	524294	524299	100 %	0 %	0 %	0 %	333982224
10142	NC_015572	CCG	2	6	524382	524387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982224
10143	NC_015572	AGG	2	6	524601	524606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333982224
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10145	NC_015572	A	8	8	524843	524850	100 %	0 %	0 %	0 %	333982224
10146	NC_015572	A	6	6	524889	524894	100 %	0 %	0 %	0 %	333982224
10147	NC_015572	A	6	6	524966	524971	100 %	0 %	0 %	0 %	333982224
10148	NC_015572	AAAATG	2	12	524973	524984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333982224
10149	NC_015572	T	6	6	524996	525001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10150	NC_015572	GCG	2	6	525022	525027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10151	NC_015572	ATA	2	6	525043	525048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10152	NC_015572	GAA	2	6	525101	525106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10153	NC_015572	TGC	2	6	525124	525129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10154	NC_015572	TGCA	2	8	525179	525186	25 %	25 %	25 %	25 %	333982225
10155	NC_015572	T	7	7	525200	525206	0 %	100 %	0 %	0 %	333982225
10156	NC_015572	GCC	2	6	525210	525215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982225
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10159	NC_015572	ATT	2	6	525327	525332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333982225
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10163	NC_015572	GATTT	2	10	525429	525438	20 %	60 %	20 %	0 %	333982225
10164	NC_015572	TG	3	6	525479	525484	0 %	50 %	50 %	0 %	333982225
10165	NC_015572	ACC	2	6	525504	525509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982225
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10168	NC_015572	T	6	6	525665	525670	0 %	100 %	0 %	0 %	333982226
10169	NC_015572	TAAA	2	8	525743	525750	75 %	25 %	0 %	0 %	333982226
10170	NC_015572	AGCGCC	2	12	525831	525842	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333982226
10171	NC_015572	CCG	2	6	525870	525875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982226
10172	NC_015572	GCG	2	6	525886	525891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982226
10173	NC_015572	TCT	2	6	525918	525923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333982226
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10178	NC_015572	GTC	2	6	526061	526066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982226
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10180	NC_015572	GCT	2	6	526105	526110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982226
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10184	NC_015572	CAAG	2	8	526297	526304	50 %	0 %	25 %	25 %	333982226
10185	NC_015572	GTT	2	6	526363	526368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982226
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10191	NC_015572	ATTTT	2	10	526620	526629	20 %	80 %	0 %	0 %	333982226
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10193	NC_015572	TCCT	2	8	526676	526683	0 %	50 %	0 %	50 %	333982226
10194	NC_015572	CCTTGC	2	12	526747	526758	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333982226
10195	NC_015572	TTC	2	6	526817	526822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333982226
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10210	NC_015572	TGA	2	6	527407	527412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333982226
10211	NC_015572	TTC	2	6	527417	527422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333982226
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10213	NC_015572	CCAAC	2	10	527510	527519	40 %	0 %	0 %	60 %	333982226
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10221	NC_015572	CTG	2	6	528188	528193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982226
10222	NC_015572	TTG	2	6	528195	528200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982226
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10224	NC_015572	TTG	2	6	528272	528277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982226
10225	NC_015572	TGT	2	6	528318	528323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982226
10226	NC_015572	TGCT	2	8	528332	528339	0 %	50 %	25 %	25 %	333982226
10227	NC_015572	TCC	2	6	528372	528377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333982226
10228	NC_015572	CGG	2	6	528388	528393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982226
10229	NC_015572	TGT	2	6	528438	528443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982226
10230	NC_015572	GCC	2	6	528518	528523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982226
10231	NC_015572	T	6	6	528526	528531	0 %	100 %	0 %	0 %	333982226
10232	NC_015572	GGC	2	6	528572	528577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982226
10233	NC_015572	TAA	2	6	528680	528685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333982226
10234	NC_015572	GTAT	2	8	528779	528786	25 %	50 %	25 %	0 %	333982226
10235	NC_015572	TCG	2	6	528822	528827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982226
10236	NC_015572	TCA	2	6	528838	528843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982226
10237	NC_015572	AT	3	6	529027	529032	50 %	50 %	0 %	0 %	333982226
10238	NC_015572	TGCGGC	2	12	529084	529095	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10239	NC_015572	AAACAA	2	12	529170	529181	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10240	NC_015572	CGT	2	6	529290	529295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10241	NC_015572	CCG	2	6	529299	529304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10242	NC_015572	GAT	2	6	529345	529350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10244	NC_015572	CCG	2	6	529396	529401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10245	NC_015572	GGC	2	6	529416	529421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10363	NC_015572	CCG	2	6	535386	535391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982232
10364	NC_015572	CCAG	2	8	535408	535415	25 %	0 %	25 %	50 %	333982232
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10490	NC_015572	GCA	2	6	542124	542129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982241
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