MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 97526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015572	GATAAA	2	12	27010	27021	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333981768
502	NC_015572	TTACC	2	10	27029	27038	20 %	40 %	0 %	40 %	333981768
503	NC_015572	ATCA	2	8	27040	27047	50 %	25 %	0 %	25 %	333981768
504	NC_015572	AGCA	2	8	27049	27056	50 %	0 %	25 %	25 %	333981768
505	NC_015572	GGC	2	6	27138	27143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981768
506	NC_015572	GAT	2	6	27217	27222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981768
507	NC_015572	GTC	2	6	27293	27298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981768
508	NC_015572	TGA	2	6	27348	27353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981768
509	NC_015572	GTT	2	6	27354	27359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981768
510	NC_015572	AAGC	2	8	27373	27380	50 %	0 %	25 %	25 %	333981768
511	NC_015572	AAAAT	2	10	27398	27407	80 %	20 %	0 %	0 %	333981768
512	NC_015572	GTGTT	2	10	27449	27458	0 %	60 %	40 %	0 %	333981768
513	NC_015572	ATG	2	6	27542	27547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981768
514	NC_015572	GAA	2	6	27552	27557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981768
515	NC_015572	GTTT	2	8	27654	27661	0 %	75 %	25 %	0 %	333981768
516	NC_015572	AAGC	2	8	27991	27998	50 %	0 %	25 %	25 %	333981769
517	NC_015572	GCA	2	6	28032	28037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981769
518	NC_015572	CAA	2	6	28065	28070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981769
519	NC_015572	TGG	2	6	28160	28165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981769
520	NC_015572	ACC	2	6	28180	28185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981769
521	NC_015572	GGC	2	6	28186	28191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981769
522	NC_015572	A	6	6	28211	28216	100 %	0 %	0 %	0 %	333981769
523	NC_015572	CGTGCT	2	12	28222	28233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981769
524	NC_015572	GTG	2	6	28237	28242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981769
525	NC_015572	GTG	2	6	28270	28275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981769
526	NC_015572	GATTC	2	10	28349	28358	20 %	40 %	20 %	20 %	333981769
527	NC_015572	GCC	2	6	28384	28389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981769
528	NC_015572	CAA	2	6	28404	28409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981769
529	NC_015572	CCA	2	6	28559	28564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981770
530	NC_015572	GCC	2	6	28690	28695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981770
531	NC_015572	GC	3	6	28774	28779	0 %	0 %	50 %	50 %	333981770
532	NC_015572	TGA	2	6	28803	28808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981770
533	NC_015572	ATT	2	6	28908	28913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981771
534	NC_015572	TTGTT	2	10	28916	28925	0 %	80 %	20 %	0 %	333981771
535	NC_015572	TGG	2	6	29006	29011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981771
536	NC_015572	GGT	2	6	29016	29021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981771
537	NC_015572	CTA	2	6	29094	29099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981771
538	NC_015572	TCA	2	6	29166	29171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981771
539	NC_015572	GTT	2	6	29196	29201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981771
540	NC_015572	TCA	2	6	29222	29227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981771
541	NC_015572	GGT	2	6	29271	29276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981771
542	NC_015572	GCC	2	6	29392	29397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981771
543	NC_015572	ATC	2	6	29489	29494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981771
544	NC_015572	AAGACA	2	12	29507	29518	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333981771
545	NC_015572	CGG	2	6	29560	29565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015572	AGC	2	6	29580	29585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015572	TAA	2	6	29696	29701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015572	TAA	2	6	29759	29764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015572	CCTG	2	8	29797	29804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
550	NC_015572	GTC	2	6	29942	29947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981772
551	NC_015572	TCG	2	6	29997	30002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981772
552	NC_015572	ACCT	2	8	30023	30030	25 %	25 %	0 %	50 %	333981772
553	NC_015572	AAC	2	6	30068	30073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981772
554	NC_015572	GAT	2	6	30151	30156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015572	CGAC	2	8	30190	30197	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
556	NC_015572	GCC	2	6	30331	30336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_015572	ATC	2	6	30472	30477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981773
558	NC_015572	CAA	2	6	30519	30524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981773
559	NC_015572	TAAC	2	8	30642	30649	50 %	25 %	0 %	25 %	333981773
560	NC_015572	CAA	2	6	30679	30684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981773
561	NC_015572	CCA	2	6	30693	30698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981773
562	NC_015572	AT	3	6	30810	30815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015572	AAG	2	6	30891	30896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015572	CAA	2	6	30918	30923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015572	GAG	2	6	30937	30942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015572	GAA	2	6	30953	30958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015572	TTTG	2	8	31009	31016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015572	GGC	2	6	31108	31113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_015572	TAG	2	6	31187	31192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981774
570	NC_015572	TAGC	2	8	31254	31261	25 %	25 %	25 %	25 %	333981774
571	NC_015572	CTG	2	6	31312	31317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981774
572	NC_015572	CTG	2	6	31328	31333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981774
573	NC_015572	CAT	2	6	31393	31398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981774
574	NC_015572	TGA	2	6	31439	31444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981774
575	NC_015572	TC	3	6	31478	31483	0 %	50 %	0 %	50 %	333981774
576	NC_015572	CAC	2	6	31488	31493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981774
577	NC_015572	ATACT	2	10	31540	31549	40 %	40 %	0 %	20 %	333981774
578	NC_015572	CCAG	2	8	31598	31605	25 %	0 %	25 %	50 %	333981774
579	NC_015572	AGC	2	6	31610	31615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981774
580	NC_015572	A	6	6	31630	31635	100 %	0 %	0 %	0 %	333981774
581	NC_015572	TCA	2	6	31698	31703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981774
582	NC_015572	TGG	2	6	31704	31709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981774
583	NC_015572	TCA	2	6	31728	31733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981774
584	NC_015572	TGT	2	6	31744	31749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981774
585	NC_015572	TTG	2	6	31813	31818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981774
586	NC_015572	TGT	2	6	32026	32031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015572	CGAC	2	8	32054	32061	25 %	0 %	25 %	50 %	333981775
588	NC_015572	AAC	2	6	32097	32102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981775
589	NC_015572	ACTT	2	8	32116	32123	25 %	50 %	0 %	25 %	333981775
590	NC_015572	T	6	6	32142	32147	0 %	100 %	0 %	0 %	333981775
591	NC_015572	GA	3	6	32211	32216	50 %	0 %	50 %	0 %	333981775
592	NC_015572	GAA	3	9	32250	32258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981775
593	NC_015572	TCC	2	6	32259	32264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333981775
594	NC_015572	TTG	2	6	32305	32310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981775
595	NC_015572	GGTT	2	8	32316	32323	0 %	50 %	50 %	0 %	333981775
596	NC_015572	T	6	6	32382	32387	0 %	100 %	0 %	0 %	333981775
597	NC_015572	AG	3	6	32396	32401	50 %	0 %	50 %	0 %	333981775
598	NC_015572	TGATT	2	10	32570	32579	20 %	60 %	20 %	0 %	333981775
599	NC_015572	GAA	2	6	32595	32600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981775
600	NC_015572	T	7	7	32624	32630	0 %	100 %	0 %	0 %	333981775
601	NC_015572	GTTG	2	8	32720	32727	0 %	50 %	50 %	0 %	333981775
602	NC_015572	ATT	2	6	32759	32764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981775
603	NC_015572	ACAA	2	8	32798	32805	75 %	0 %	0 %	25 %	333981775
604	NC_015572	CGG	2	6	32806	32811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981775
605	NC_015572	CTG	2	6	32850	32855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981775
606	NC_015572	A	6	6	32969	32974	100 %	0 %	0 %	0 %	333981775
607	NC_015572	TCA	2	6	32982	32987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981775
608	NC_015572	TGC	2	6	32996	33001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981775
609	NC_015572	TTG	2	6	33030	33035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981775
610	NC_015572	CCG	2	6	33043	33048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981775
611	NC_015572	TCC	2	6	33083	33088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333981775
612	NC_015572	TCG	2	6	33101	33106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981775
613	NC_015572	GAT	2	6	33167	33172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981775
614	NC_015572	CAG	2	6	33193	33198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981775
615	NC_015572	TGTTCT	2	12	33290	33301	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333981775
616	NC_015572	AAG	2	6	33391	33396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981775
617	NC_015572	TTA	2	6	33442	33447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981775
618	NC_015572	AGCG	2	8	33524	33531	25 %	0 %	50 %	25 %	333981776
619	NC_015572	GTTG	2	8	33540	33547	0 %	50 %	50 %	0 %	333981776
620	NC_015572	CAG	2	6	33550	33555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981776
621	NC_015572	ACC	2	6	33764	33769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981776
622	NC_015572	AG	3	6	33834	33839	50 %	0 %	50 %	0 %	333981776
623	NC_015572	TTC	2	6	33977	33982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981776
624	NC_015572	GGT	2	6	34167	34172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981777
625	NC_015572	TGG	2	6	34237	34242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981777
626	NC_015572	CGA	2	6	34370	34375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981777
627	NC_015572	TC	3	6	34390	34395	0 %	50 %	0 %	50 %	333981777
628	NC_015572	CAC	2	6	34518	34523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981777
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