MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_015416	GA	3	6	2364694	2364699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48502	NC_015416	AAC	2	6	2364762	2364767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508559
48503	NC_015416	TGGT	2	8	2364837	2364844	0 %	50 %	50 %	0 %	330508559
48504	NC_015416	TGA	2	6	2364859	2364864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508559
48505	NC_015416	TCC	2	6	2365055	2365060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508559
48506	NC_015416	TCA	2	6	2365122	2365127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48507	NC_015416	AT	3	6	2365151	2365156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48508	NC_015416	TGG	2	6	2365163	2365168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48509	NC_015416	TCC	2	6	2365183	2365188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48510	NC_015416	TGT	2	6	2365234	2365239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48511	NC_015416	GGC	2	6	2365272	2365277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48512	NC_015416	T	6	6	2365336	2365341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48513	NC_015416	GTC	2	6	2365405	2365410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48514	NC_015416	AAT	2	6	2365411	2365416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48515	NC_015416	TA	3	6	2365456	2365461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48516	NC_015416	TA	4	8	2365483	2365490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48517	NC_015416	AAT	2	6	2365538	2365543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48518	NC_015416	AGA	2	6	2365590	2365595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508560
48519	NC_015416	CAA	2	6	2365615	2365620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508560
48520	NC_015416	CT	3	6	2365668	2365673	0 %	50 %	0 %	50 %	330508560
48521	NC_015416	TGA	2	6	2365703	2365708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508560
48522	NC_015416	GGA	2	6	2365733	2365738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508560
48523	NC_015416	AGA	3	9	2365814	2365822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508560
48524	NC_015416	TGG	2	6	2365857	2365862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508560
48525	NC_015416	TGG	2	6	2365866	2365871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508560
48526	NC_015416	CCA	2	6	2365887	2365892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508560
48527	NC_015416	TAT	2	6	2365911	2365916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508560
48528	NC_015416	GAA	2	6	2365972	2365977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508560
48529	NC_015416	ATA	2	6	2365979	2365984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508560
48530	NC_015416	CGA	2	6	2365988	2365993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48531	NC_015416	GAT	2	6	2365998	2366003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48532	NC_015416	TGA	2	6	2366017	2366022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48533	NC_015416	AAT	2	6	2366130	2366135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508561
48534	NC_015416	GAAA	2	8	2366154	2366161	75 %	0 %	25 %	0 %	330508561
48535	NC_015416	GGT	2	6	2366177	2366182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508561
48536	NC_015416	TGG	2	6	2366203	2366208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508561
48537	NC_015416	GAT	2	6	2366268	2366273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508561
48538	NC_015416	ATC	2	6	2366278	2366283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508561
48539	NC_015416	T	6	6	2366316	2366321	0 %	100 %	0 %	0 %	330508561
48540	NC_015416	A	6	6	2366363	2366368	100 %	0 %	0 %	0 %	330508561
48541	NC_015416	GAT	2	6	2366421	2366426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508561
48542	NC_015416	TAT	2	6	2366428	2366433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508561
48543	NC_015416	TCCT	2	8	2366448	2366455	0 %	50 %	0 %	50 %	330508561
48544	NC_015416	TGC	2	6	2366458	2366463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508561
48545	NC_015416	GGTTG	2	10	2366530	2366539	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
48546	NC_015416	TTTGGG	2	12	2366583	2366594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48547	NC_015416	GGT	2	6	2366656	2366661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508562
48548	NC_015416	GATAT	2	10	2366683	2366692	40 %	40 %	20 %	0 %	330508562
48549	NC_015416	AGC	2	6	2366766	2366771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508562
48550	NC_015416	CATC	2	8	2366826	2366833	25 %	25 %	0 %	50 %	330508562
48551	NC_015416	GTT	2	6	2366869	2366874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508562
48552	NC_015416	GAGC	2	8	2366887	2366894	25 %	0 %	50 %	25 %	330508562
48553	NC_015416	GAA	2	6	2366927	2366932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508562
48554	NC_015416	CAC	2	6	2366987	2366992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508562
48555	NC_015416	GGGA	2	8	2367074	2367081	25 %	0 %	75 %	0 %	330508562
48556	NC_015416	ATA	2	6	2367100	2367105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508562
48557	NC_015416	ACT	2	6	2367106	2367111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508562
48558	NC_015416	CAG	2	6	2367146	2367151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508562
48559	NC_015416	AAG	2	6	2367177	2367182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508562
48560	NC_015416	AAT	2	6	2367187	2367192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508562
48561	NC_015416	AGATG	2	10	2367198	2367207	40 %	20 %	40 %	0 %	330508562
48562	NC_015416	AAAT	2	8	2367230	2367237	75 %	25 %	0 %	0 %	330508562
48563	NC_015416	GAT	2	6	2367253	2367258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508562
48564	NC_015416	AAAG	2	8	2367307	2367314	75 %	0 %	25 %	0 %	330508562
48565	NC_015416	TTA	2	6	2367355	2367360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508562
48566	NC_015416	TGA	2	6	2367380	2367385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508562
48567	NC_015416	AT	3	6	2367404	2367409	50 %	50 %	0 %	0 %	330508562
48568	NC_015416	AAG	2	6	2367454	2367459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508562
48569	NC_015416	GAT	2	6	2367576	2367581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508562
48570	NC_015416	TTG	2	6	2367587	2367592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508562
48571	NC_015416	AG	3	6	2367666	2367671	50 %	0 %	50 %	0 %	330508562
48572	NC_015416	CCAT	2	8	2367691	2367698	25 %	25 %	0 %	50 %	330508562
48573	NC_015416	AGGG	2	8	2367765	2367772	25 %	0 %	75 %	0 %	330508562
48574	NC_015416	CCA	2	6	2367790	2367795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508562
48575	NC_015416	AAT	2	6	2367860	2367865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48576	NC_015416	TAA	2	6	2367871	2367876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48577	NC_015416	TA	3	6	2367883	2367888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48578	NC_015416	GGCC	2	8	2367907	2367914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48579	NC_015416	AGA	2	6	2367935	2367940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48580	NC_015416	CGT	2	6	2368081	2368086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508563
48581	NC_015416	ATC	3	9	2368133	2368141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508563
48582	NC_015416	TCT	2	6	2368171	2368176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508563
48583	NC_015416	CTC	2	6	2368211	2368216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508563
48584	NC_015416	GGA	2	6	2368278	2368283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508563
48585	NC_015416	CA	3	6	2368601	2368606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48586	NC_015416	TAC	2	6	2368611	2368616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48587	NC_015416	ATC	2	6	2368711	2368716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508564
48588	NC_015416	AC	3	6	2368764	2368769	50 %	0 %	0 %	50 %	330508564
48589	NC_015416	GCC	2	6	2368816	2368821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508564
48590	NC_015416	AGA	2	6	2368961	2368966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508564
48591	NC_015416	GCA	2	6	2368983	2368988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508564
48592	NC_015416	GAC	2	6	2369026	2369031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508564
48593	NC_015416	GCA	2	6	2369041	2369046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508564
48594	NC_015416	TGG	2	6	2369060	2369065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508564
48595	NC_015416	AGG	2	6	2369079	2369084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508564
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48597	NC_015416	TC	3	6	2369169	2369174	0 %	50 %	0 %	50 %	330508564
48598	NC_015416	ATA	2	6	2369234	2369239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508565
48599	NC_015416	CAG	2	6	2369278	2369283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508565
48600	NC_015416	CCT	3	9	2369314	2369322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508565
48601	NC_015416	CCA	2	6	2369350	2369355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508565
48602	NC_015416	CCGG	2	8	2369366	2369373	0 %	0 %	50 %	50 %	330508565
48603	NC_015416	GAG	2	6	2369377	2369382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508565
48604	NC_015416	CCA	2	6	2369417	2369422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508565
48605	NC_015416	TAT	2	6	2369590	2369595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508565
48606	NC_015416	CT	3	6	2369646	2369651	0 %	50 %	0 %	50 %	330508565
48607	NC_015416	GT	3	6	2369666	2369671	0 %	50 %	50 %	0 %	330508565
48608	NC_015416	CGAC	2	8	2369697	2369704	25 %	0 %	25 %	50 %	330508565
48609	NC_015416	GCC	2	6	2369721	2369726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508565
48610	NC_015416	CGC	2	6	2369755	2369760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508565
48611	NC_015416	GGA	2	6	2369808	2369813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508565
48612	NC_015416	CTG	2	6	2369830	2369835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508565
48613	NC_015416	AAC	2	6	2369870	2369875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508565
48614	NC_015416	CCTGA	2	10	2369965	2369974	20 %	20 %	20 %	40 %	330508565
48615	NC_015416	AGG	2	6	2370035	2370040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508565
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48617	NC_015416	CCGC	2	8	2370101	2370108	0 %	0 %	25 %	75 %	330508565
48618	NC_015416	AGA	2	6	2370156	2370161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508565
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48620	NC_015416	GA	3	6	2370195	2370200	50 %	0 %	50 %	0 %	330508565
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48857	NC_015416	TGA	2	6	2382682	2382687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508576
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48980	NC_015416	TAT	2	6	2389729	2389734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508582
48981	NC_015416	A	7	7	2389832	2389838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48982	NC_015416	G	6	6	2389843	2389848	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48983	NC_015416	CAG	2	6	2389858	2389863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48985	NC_015416	CTT	2	6	2389885	2389890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508583
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