MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_015416	CCT	2	6	2338741	2338746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508526
48002	NC_015416	CTC	2	6	2338793	2338798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508526
48003	NC_015416	TCCA	2	8	2338953	2338960	25 %	25 %	0 %	50 %	330508526
48004	NC_015416	CCAT	2	8	2338995	2339002	25 %	25 %	0 %	50 %	330508526
48005	NC_015416	ATC	2	6	2339022	2339027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508526
48006	NC_015416	TAT	2	6	2339068	2339073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48007	NC_015416	CCAT	2	8	2339196	2339203	25 %	25 %	0 %	50 %	330508527
48008	NC_015416	CTG	2	6	2339245	2339250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508527
48009	NC_015416	AT	3	6	2339320	2339325	50 %	50 %	0 %	0 %	330508527
48010	NC_015416	TGG	3	9	2339326	2339334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508527
48011	NC_015416	GCT	2	6	2339360	2339365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508527
48012	NC_015416	AGT	2	6	2339381	2339386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508527
48013	NC_015416	CAT	2	6	2339551	2339556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508527
48014	NC_015416	GAG	2	6	2339609	2339614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508527
48015	NC_015416	TGCCTC	2	12	2339651	2339662	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330508527
48016	NC_015416	GAATCT	2	12	2339715	2339726	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330508527
48017	NC_015416	TAA	2	6	2339753	2339758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508527
48018	NC_015416	GGGGCA	2	12	2339767	2339778	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	330508527
48019	NC_015416	GGC	2	6	2339849	2339854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508527
48020	NC_015416	CAT	2	6	2339896	2339901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508527
48021	NC_015416	CA	3	6	2339937	2339942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48022	NC_015416	CT	3	6	2339945	2339950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48023	NC_015416	TAT	2	6	2339970	2339975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48024	NC_015416	ATTAT	2	10	2339977	2339986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48025	NC_015416	CCA	2	6	2340061	2340066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48026	NC_015416	CAGC	2	8	2340103	2340110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48027	NC_015416	GGA	2	6	2340296	2340301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48028	NC_015416	GATA	2	8	2340339	2340346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48029	NC_015416	TCG	4	12	2340358	2340369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508528
48030	NC_015416	ACC	2	6	2340381	2340386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508528
48031	NC_015416	GCC	2	6	2340427	2340432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508528
48032	NC_015416	CCG	2	6	2340457	2340462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508528
48033	NC_015416	CT	3	6	2340471	2340476	0 %	50 %	0 %	50 %	330508528
48034	NC_015416	CGG	2	6	2340518	2340523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508528
48035	NC_015416	TGG	2	6	2340547	2340552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508528
48036	NC_015416	GA	3	6	2340582	2340587	50 %	0 %	50 %	0 %	330508528
48037	NC_015416	CTG	2	6	2340592	2340597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508528
48038	NC_015416	CTC	2	6	2340600	2340605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508528
48039	NC_015416	GCT	2	6	2340689	2340694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508528
48040	NC_015416	GGA	2	6	2340695	2340700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508528
48041	NC_015416	GAGG	2	8	2340734	2340741	25 %	0 %	75 %	0 %	330508528
48042	NC_015416	CA	3	6	2340810	2340815	50 %	0 %	0 %	50 %	330508528
48043	NC_015416	GGA	3	9	2340827	2340835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508528
48044	NC_015416	CTC	2	6	2340840	2340845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508528
48045	NC_015416	GTT	2	6	2340864	2340869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508528
48046	NC_015416	GCT	2	6	2340923	2340928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508528
48047	NC_015416	ATA	2	6	2340959	2340964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508528
48048	NC_015416	ATC	2	6	2340983	2340988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48049	NC_015416	CCT	2	6	2341042	2341047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508529
48050	NC_015416	AAT	2	6	2341093	2341098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508529
48051	NC_015416	GGAT	2	8	2341145	2341152	25 %	25 %	50 %	0 %	330508529
48052	NC_015416	TCT	2	6	2341164	2341169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508529
48053	NC_015416	AT	3	6	2341231	2341236	50 %	50 %	0 %	0 %	330508529
48054	NC_015416	AAT	2	6	2341278	2341283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48055	NC_015416	CTC	2	6	2341351	2341356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48056	NC_015416	GTG	2	6	2341412	2341417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48057	NC_015416	T	6	6	2341514	2341519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48058	NC_015416	AGA	2	6	2341524	2341529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48059	NC_015416	CAC	2	6	2341577	2341582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48060	NC_015416	TAA	2	6	2341645	2341650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48061	NC_015416	TC	3	6	2341664	2341669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48062	NC_015416	AGA	2	6	2341676	2341681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48063	NC_015416	GAT	2	6	2341718	2341723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508530
48064	NC_015416	CTT	2	6	2341905	2341910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508530
48065	NC_015416	GA	3	6	2341977	2341982	50 %	0 %	50 %	0 %	330508530
48066	NC_015416	GCC	3	9	2342021	2342029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508530
48067	NC_015416	TGG	2	6	2342058	2342063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508530
48068	NC_015416	CTT	2	6	2342081	2342086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508530
48069	NC_015416	GAG	2	6	2342096	2342101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508530
48070	NC_015416	CTC	2	6	2342105	2342110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508530
48071	NC_015416	CGG	2	6	2342116	2342121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508530
48072	NC_015416	TGG	2	6	2342223	2342228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508530
48073	NC_015416	TCC	2	6	2342280	2342285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508530
48074	NC_015416	GGCTGA	2	12	2342437	2342448	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330508530
48075	NC_015416	TAG	2	6	2342520	2342525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508530
48076	NC_015416	TGG	2	6	2342640	2342645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508530
48077	NC_015416	AGA	2	6	2342713	2342718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508530
48078	NC_015416	AG	3	6	2342739	2342744	50 %	0 %	50 %	0 %	330508530
48079	NC_015416	GTA	2	6	2342843	2342848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508530
48080	NC_015416	AATA	2	8	2342863	2342870	75 %	25 %	0 %	0 %	330508530
48081	NC_015416	CAT	2	6	2343015	2343020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508530
48082	NC_015416	GAA	2	6	2343032	2343037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508530
48083	NC_015416	CATA	2	8	2343149	2343156	50 %	25 %	0 %	25 %	330508531
48084	NC_015416	GAT	2	6	2343300	2343305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508532
48085	NC_015416	AGA	2	6	2343321	2343326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508532
48086	NC_015416	GA	3	6	2343374	2343379	50 %	0 %	50 %	0 %	330508532
48087	NC_015416	TGA	2	6	2343387	2343392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508532
48088	NC_015416	AGA	2	6	2343459	2343464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508532
48089	NC_015416	CCG	2	6	2343666	2343671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508533
48090	NC_015416	AG	3	6	2343673	2343678	50 %	0 %	50 %	0 %	330508533
48091	NC_015416	CAG	2	6	2343728	2343733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508533
48092	NC_015416	AGC	2	6	2343745	2343750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508533
48093	NC_015416	GGTG	2	8	2343764	2343771	0 %	25 %	75 %	0 %	330508533
48094	NC_015416	GTGAT	2	10	2343859	2343868	20 %	40 %	40 %	0 %	330508533
48095	NC_015416	ACT	2	6	2343892	2343897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508533
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48097	NC_015416	ATG	2	6	2343988	2343993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508533
48098	NC_015416	CAC	2	6	2344004	2344009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508533
48099	NC_015416	AAG	2	6	2344047	2344052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508533
48100	NC_015416	AACG	2	8	2344071	2344078	50 %	0 %	25 %	25 %	330508533
48101	NC_015416	AAG	2	6	2344080	2344085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508533
48102	NC_015416	TGG	2	6	2344111	2344116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508533
48103	NC_015416	AG	3	6	2344117	2344122	50 %	0 %	50 %	0 %	330508533
48104	NC_015416	GAC	2	6	2344182	2344187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508533
48105	NC_015416	T	6	6	2344246	2344251	0 %	100 %	0 %	0 %	330508534
48106	NC_015416	GATC	2	8	2344252	2344259	25 %	25 %	25 %	25 %	330508534
48107	NC_015416	GGA	2	6	2344303	2344308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508534
48108	NC_015416	GCTG	2	8	2344354	2344361	0 %	25 %	50 %	25 %	330508534
48109	NC_015416	GCCG	2	8	2344367	2344374	0 %	0 %	50 %	50 %	330508534
48110	NC_015416	GATC	2	8	2344390	2344397	25 %	25 %	25 %	25 %	330508534
48111	NC_015416	CCGC	2	8	2344738	2344745	0 %	0 %	25 %	75 %	330508534
48112	NC_015416	AG	3	6	2344750	2344755	50 %	0 %	50 %	0 %	330508534
48113	NC_015416	AAG	2	6	2344817	2344822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508534
48114	NC_015416	A	7	7	2344825	2344831	100 %	0 %	0 %	0 %	330508534
48115	NC_015416	GCA	2	6	2344838	2344843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508534
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48117	NC_015416	CCGA	2	8	2345072	2345079	25 %	0 %	25 %	50 %	330508535
48118	NC_015416	CCA	2	6	2345097	2345102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508535
48119	NC_015416	CTG	2	6	2345167	2345172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508535
48120	NC_015416	TATG	2	8	2345204	2345211	25 %	50 %	25 %	0 %	330508535
48121	NC_015416	CT	3	6	2345303	2345308	0 %	50 %	0 %	50 %	330508535
48122	NC_015416	GCC	2	6	2345396	2345401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508535
48123	NC_015416	TCT	2	6	2345452	2345457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508535
48124	NC_015416	GCT	2	6	2345461	2345466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508535
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48128	NC_015416	CCA	2	6	2345806	2345811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508535
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48132	NC_015416	TGA	2	6	2346010	2346015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508535
48133	NC_015416	GGA	2	6	2346040	2346045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508535
48134	NC_015416	GCCA	2	8	2346069	2346076	25 %	0 %	25 %	50 %	330508535
48135	NC_015416	TCC	2	6	2346088	2346093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508535
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48139	NC_015416	CT	3	6	2346207	2346212	0 %	50 %	0 %	50 %	330508535
48140	NC_015416	AG	3	6	2346274	2346279	50 %	0 %	50 %	0 %	330508535
48141	NC_015416	CTT	2	6	2346287	2346292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508535
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48143	NC_015416	CCT	2	6	2346471	2346476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48144	NC_015416	GAAT	2	8	2346506	2346513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48145	NC_015416	CAT	2	6	2346544	2346549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48146	NC_015416	GATC	2	8	2346608	2346615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48147	NC_015416	GAG	2	6	2346657	2346662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508536
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48149	NC_015416	C	7	7	2346763	2346769	0 %	0 %	0 %	100 %	330508536
48150	NC_015416	GAA	2	6	2346791	2346796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508536
48151	NC_015416	AG	3	6	2346819	2346824	50 %	0 %	50 %	0 %	330508536
48152	NC_015416	AGG	2	6	2346842	2346847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508536
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48172	NC_015416	ATCT	2	8	2347899	2347906	25 %	50 %	0 %	25 %	330508538
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48183	NC_015416	GATC	2	8	2348264	2348271	25 %	25 %	25 %	25 %	330508538
48184	NC_015416	CTGC	2	8	2348352	2348359	0 %	25 %	25 %	50 %	330508538
48185	NC_015416	AG	3	6	2348361	2348366	50 %	0 %	50 %	0 %	330508538
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48225	NC_015416	ATC	2	6	2350267	2350272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508540
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48230	NC_015416	CT	3	6	2350624	2350629	0 %	50 %	0 %	50 %	330508540
48231	NC_015416	ATG	2	6	2350651	2350656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508540
48232	NC_015416	AGA	2	6	2350691	2350696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508540
48233	NC_015416	GAG	2	6	2350720	2350725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508540
48234	NC_015416	GAG	2	6	2350733	2350738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508540
48235	NC_015416	GCG	2	6	2350775	2350780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508540
48236	NC_015416	TG	3	6	2350786	2350791	0 %	50 %	50 %	0 %	330508540
48237	NC_015416	ATCAAT	2	12	2350868	2350879	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48238	NC_015416	AGA	2	6	2350984	2350989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508541
48239	NC_015416	GAA	2	6	2351023	2351028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508541
48240	NC_015416	TAT	2	6	2351035	2351040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508541
48241	NC_015416	GAA	2	6	2351049	2351054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508541
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48243	NC_015416	AGA	2	6	2351150	2351155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508541
48244	NC_015416	AAGTC	2	10	2351165	2351174	40 %	20 %	20 %	20 %	330508541
48245	NC_015416	AAT	2	6	2351211	2351216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508541
48246	NC_015416	GAA	2	6	2351218	2351223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508541
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48274	NC_015416	ATA	2	6	2352604	2352609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48275	NC_015416	GA	3	6	2352612	2352617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48276	NC_015416	GAA	2	6	2352649	2352654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48277	NC_015416	ATAA	2	8	2352737	2352744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48278	NC_015416	TTG	2	6	2352967	2352972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508542
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48291	NC_015416	TGCA	2	8	2353618	2353625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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48303	NC_015416	GCA	2	6	2354851	2354856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508546
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48340	NC_015416	CTCC	2	8	2356512	2356519	0 %	25 %	0 %	75 %	330508548
48341	NC_015416	AGA	2	6	2356624	2356629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508548
48342	NC_015416	AGA	2	6	2356638	2356643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508548
48343	NC_015416	GAT	2	6	2356660	2356665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508548
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48348	NC_015416	TCTCT	2	10	2356879	2356888	0 %	60 %	0 %	40 %	330508549
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48350	NC_015416	GCTC	2	8	2356908	2356915	0 %	25 %	25 %	50 %	330508549
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48354	NC_015416	TCAG	2	8	2357136	2357143	25 %	25 %	25 %	25 %	330508549
48355	NC_015416	GC	3	6	2357145	2357150	0 %	0 %	50 %	50 %	330508549
48356	NC_015416	GTG	2	6	2357190	2357195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508549
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48384	NC_015416	ATCC	2	8	2358604	2358611	25 %	25 %	0 %	50 %	330508551
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48424	NC_015416	GCCT	2	8	2360618	2360625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48425	NC_015416	GCC	2	6	2360775	2360780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508554
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48445	NC_015416	C	6	6	2361668	2361673	0 %	0 %	0 %	100 %	330508555
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48453	NC_015416	GCA	2	6	2361973	2361978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508555
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48456	NC_015416	GAT	2	6	2362193	2362198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508556
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48460	NC_015416	CT	3	6	2362395	2362400	0 %	50 %	0 %	50 %	330508556
48461	NC_015416	CCAGCT	2	12	2362416	2362427	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330508556
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48464	NC_015416	AT	3	6	2362575	2362580	50 %	50 %	0 %	0 %	330508556
48465	NC_015416	GAAT	2	8	2362653	2362660	50 %	25 %	25 %	0 %	330508556
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48469	NC_015416	TGC	2	6	2363118	2363123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508557
48470	NC_015416	G	6	6	2363175	2363180	0 %	0 %	100 %	0 %	330508557
48471	NC_015416	GAT	2	6	2363182	2363187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508557
48472	NC_015416	GGT	2	6	2363212	2363217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508557
48473	NC_015416	CCA	2	6	2363256	2363261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508557
48474	NC_015416	TGC	2	6	2363334	2363339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508557
48475	NC_015416	G	6	6	2363373	2363378	0 %	0 %	100 %	0 %	330508557
48476	NC_015416	CCAG	2	8	2363379	2363386	25 %	0 %	25 %	50 %	330508557
48477	NC_015416	CAG	2	6	2363473	2363478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508557
48478	NC_015416	AGGG	2	8	2363548	2363555	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48479	NC_015416	AATC	2	8	2363568	2363575	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48480	NC_015416	TA	3	6	2363584	2363589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48481	NC_015416	ATA	2	6	2363601	2363606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48483	NC_015416	GAT	2	6	2363675	2363680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508558
48484	NC_015416	GTC	2	6	2363766	2363771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508558
48485	NC_015416	TTGGT	2	10	2363818	2363827	0 %	60 %	40 %	0 %	330508558
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48495	NC_015416	GCA	2	6	2364255	2364260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508558
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48498	NC_015416	A	6	6	2364443	2364448	100 %	0 %	0 %	0 %	330508558
48499	NC_015416	ATG	2	6	2364608	2364613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508558
48500	NC_015416	ACA	2	6	2364627	2364632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508558

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