MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_015416	ATG	2	6	2167387	2167392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44502	NC_015416	A	8	8	2167480	2167487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44503	NC_015416	GTGC	2	8	2167511	2167518	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44504	NC_015416	GTT	2	6	2167620	2167625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44505	NC_015416	T	6	6	2167839	2167844	0 %	100 %	0 %	0 %	330508350
44506	NC_015416	GCT	2	6	2167921	2167926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508350
44507	NC_015416	T	6	6	2167942	2167947	0 %	100 %	0 %	0 %	330508350
44508	NC_015416	CAT	2	6	2167958	2167963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508350
44509	NC_015416	CGG	2	6	2168023	2168028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508350
44510	NC_015416	CCT	2	6	2168138	2168143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508350
44511	NC_015416	A	7	7	2168188	2168194	100 %	0 %	0 %	0 %	330508350
44512	NC_015416	CT	3	6	2168313	2168318	0 %	50 %	0 %	50 %	330508351
44513	NC_015416	TCA	2	6	2168422	2168427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44514	NC_015416	ATC	2	6	2168460	2168465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44515	NC_015416	GA	3	6	2168466	2168471	50 %	0 %	50 %	0 %	330508351
44516	NC_015416	TCA	2	6	2168524	2168529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44517	NC_015416	CTT	2	6	2168553	2168558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508351
44518	NC_015416	TTGT	2	8	2168559	2168566	0 %	75 %	25 %	0 %	330508351
44519	NC_015416	TCA	2	6	2168626	2168631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44520	NC_015416	TCA	2	6	2168647	2168652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44521	NC_015416	GA	4	8	2168670	2168677	50 %	0 %	50 %	0 %	330508351
44522	NC_015416	TTG	2	6	2168683	2168688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508351
44523	NC_015416	TCA	2	6	2168728	2168733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44524	NC_015416	TCA	2	6	2168749	2168754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44525	NC_015416	GA	4	8	2168772	2168779	50 %	0 %	50 %	0 %	330508351
44526	NC_015416	TTG	2	6	2168785	2168790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508351
44527	NC_015416	TCA	2	6	2168830	2168835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44528	NC_015416	TCA	2	6	2168851	2168856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44529	NC_015416	GA	4	8	2168874	2168881	50 %	0 %	50 %	0 %	330508351
44530	NC_015416	TTG	2	6	2168887	2168892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508351
44531	NC_015416	TCGG	2	8	2168908	2168915	0 %	25 %	50 %	25 %	330508351
44532	NC_015416	TCA	2	6	2168932	2168937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44533	NC_015416	GA	4	8	2168976	2168983	50 %	0 %	50 %	0 %	330508351
44534	NC_015416	TTG	2	6	2168989	2168994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508351
44535	NC_015416	TCA	2	6	2169034	2169039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44536	NC_015416	TCA	2	6	2169055	2169060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44537	NC_015416	GA	3	6	2169078	2169083	50 %	0 %	50 %	0 %	330508351
44538	NC_015416	TTTGCC	2	12	2169084	2169095	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	330508351
44539	NC_015416	CTT	2	6	2169165	2169170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508351
44540	NC_015416	TTGT	2	8	2169171	2169178	0 %	75 %	25 %	0 %	330508351
44541	NC_015416	TCA	2	6	2169238	2169243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44542	NC_015416	GA	3	6	2169282	2169287	50 %	0 %	50 %	0 %	330508351
44543	NC_015416	TTG	2	6	2169295	2169300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508351
44544	NC_015416	TCA	2	6	2169340	2169345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44545	NC_015416	TCA	2	6	2169361	2169366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44546	NC_015416	TCA	2	6	2169442	2169447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44547	NC_015416	TCA	2	6	2169463	2169468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508351
44548	NC_015416	CTG	2	6	2169522	2169527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508351
44549	NC_015416	AGG	2	6	2169556	2169561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508351
44550	NC_015416	AT	3	6	2169611	2169616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44551	NC_015416	ATGC	2	8	2169643	2169650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44552	NC_015416	ATC	2	6	2169666	2169671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44553	NC_015416	TCG	2	6	2169672	2169677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44554	NC_015416	TC	3	6	2169988	2169993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44555	NC_015416	GGT	2	6	2170060	2170065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44556	NC_015416	CAT	2	6	2170125	2170130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44557	NC_015416	TTC	2	6	2170218	2170223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44558	NC_015416	AAG	2	6	2170276	2170281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44559	NC_015416	TTTG	2	8	2170315	2170322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44560	NC_015416	AGG	2	6	2170330	2170335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44561	NC_015416	ATA	2	6	2170498	2170503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508352
44562	NC_015416	TTA	3	9	2170508	2170516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508352
44563	NC_015416	AGAA	2	8	2170640	2170647	75 %	0 %	25 %	0 %	330508352
44564	NC_015416	AG	4	8	2170665	2170672	50 %	0 %	50 %	0 %	330508352
44565	NC_015416	TATAAA	2	12	2170860	2170871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508352
44566	NC_015416	A	7	7	2170896	2170902	100 %	0 %	0 %	0 %	330508352
44567	NC_015416	TCA	2	6	2170935	2170940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508352
44568	NC_015416	ATG	2	6	2170980	2170985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44569	NC_015416	GCAT	2	8	2171009	2171016	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44570	NC_015416	CAA	2	6	2171087	2171092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44571	NC_015416	TATGAT	2	12	2171169	2171180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44572	NC_015416	ACC	2	6	2171201	2171206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44573	NC_015416	AGCGG	2	10	2171313	2171322	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44574	NC_015416	AGG	2	6	2171385	2171390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44575	NC_015416	GGT	2	6	2171441	2171446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44576	NC_015416	GCT	2	6	2171447	2171452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44577	NC_015416	ATCA	2	8	2171513	2171520	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44578	NC_015416	GAT	2	6	2171533	2171538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44579	NC_015416	GGA	2	6	2171631	2171636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44580	NC_015416	TGT	2	6	2171709	2171714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44581	NC_015416	GA	3	6	2171766	2171771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44582	NC_015416	CA	4	8	2171772	2171779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44583	NC_015416	GCA	2	6	2171799	2171804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44584	NC_015416	TCC	2	6	2171923	2171928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44585	NC_015416	AGGGG	2	10	2171950	2171959	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44586	NC_015416	CCG	2	6	2171988	2171993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508353
44587	NC_015416	TC	3	6	2171995	2172000	0 %	50 %	0 %	50 %	330508353
44588	NC_015416	TCC	2	6	2172019	2172024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508353
44589	NC_015416	GGA	2	6	2172037	2172042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508353
44590	NC_015416	CAG	2	6	2172122	2172127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508353
44591	NC_015416	TCG	2	6	2172174	2172179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508353
44592	NC_015416	GATG	2	8	2172188	2172195	25 %	25 %	50 %	0 %	330508353
44593	NC_015416	CT	3	6	2172226	2172231	0 %	50 %	0 %	50 %	330508353
44594	NC_015416	CTC	2	6	2172302	2172307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508353
44595	NC_015416	GCT	2	6	2172321	2172326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508353
44596	NC_015416	T	6	6	2172326	2172331	0 %	100 %	0 %	0 %	330508353
44597	NC_015416	GAT	3	9	2172394	2172402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508353
44598	NC_015416	CAG	2	6	2172512	2172517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508353
44599	NC_015416	CAG	2	6	2172530	2172535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508353
44600	NC_015416	TGCCGC	2	12	2172544	2172555	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330508353
44601	NC_015416	CGA	2	6	2172661	2172666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508353
44602	NC_015416	CCA	2	6	2172782	2172787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508354
44603	NC_015416	GGA	2	6	2172940	2172945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508354
44604	NC_015416	AGG	2	6	2173141	2173146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508354
44605	NC_015416	TCA	2	6	2173318	2173323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508354
44606	NC_015416	CTG	2	6	2173349	2173354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508354
44607	NC_015416	GCTTCA	2	12	2173406	2173417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330508354
44608	NC_015416	TCT	2	6	2173420	2173425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508354
44609	NC_015416	CTT	2	6	2173455	2173460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508354
44610	NC_015416	AGC	2	6	2173525	2173530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508354
44611	NC_015416	ATG	2	6	2173543	2173548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508354
44612	NC_015416	CCT	2	6	2173679	2173684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508354
44613	NC_015416	TGC	2	6	2173721	2173726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508354
44614	NC_015416	TGA	2	6	2173727	2173732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508354
44615	NC_015416	TCC	2	6	2173735	2173740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508354
44616	NC_015416	CAT	2	6	2173761	2173766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508354
44617	NC_015416	GCT	2	6	2173768	2173773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508354
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44619	NC_015416	GCC	2	6	2174012	2174017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508355
44620	NC_015416	CAAG	2	8	2174080	2174087	50 %	0 %	25 %	25 %	330508355
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44622	NC_015416	CTG	2	6	2174155	2174160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508355
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44695	NC_015416	TCTG	2	8	2178224	2178231	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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44706	NC_015416	T	6	6	2178844	2178849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44734	NC_015416	CGC	2	6	2180252	2180257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508364
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44736	NC_015416	GGA	2	6	2180312	2180317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44737	NC_015416	ACA	2	6	2180476	2180481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508365
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44740	NC_015416	GGA	2	6	2180585	2180590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508365
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44755	NC_015416	A	6	6	2181294	2181299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44824	NC_015416	T	7	7	2184507	2184513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44849	NC_015416	AGC	2	6	2185753	2185758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508369
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44851	NC_015416	ATC	2	6	2185810	2185815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508369
44852	NC_015416	ACCT	2	8	2185825	2185832	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44853	NC_015416	AG	3	6	2185906	2185911	50 %	0 %	50 %	0 %	330508370
44854	NC_015416	CAT	2	6	2185929	2185934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508370
44855	NC_015416	CTC	2	6	2185951	2185956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508370
44856	NC_015416	ATC	2	6	2185993	2185998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508370
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44958	NC_015416	TCT	2	6	2191420	2191425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508375
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44961	NC_015416	ATG	2	6	2191648	2191653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44964	NC_015416	GCA	2	6	2191787	2191792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508377
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44966	NC_015416	CTT	2	6	2191970	2191975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508378
44967	NC_015416	CT	3	6	2191977	2191982	0 %	50 %	0 %	50 %	330508378
44968	NC_015416	CTA	2	6	2192062	2192067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508378
44969	NC_015416	CGC	2	6	2192116	2192121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508378
44970	NC_015416	GAC	3	9	2192126	2192134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508378
44971	NC_015416	TTG	2	6	2192232	2192237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508378
44972	NC_015416	TCCT	2	8	2192255	2192262	0 %	50 %	0 %	50 %	330508378
44973	NC_015416	GCC	2	6	2192283	2192288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508378
44974	NC_015416	TAA	2	6	2192308	2192313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508378
44975	NC_015416	TTG	3	9	2192380	2192388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508379
44976	NC_015416	AGC	2	6	2192406	2192411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508379
44977	NC_015416	CT	3	6	2192442	2192447	0 %	50 %	0 %	50 %	330508379
44978	NC_015416	ATC	2	6	2192539	2192544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508379
44979	NC_015416	GTC	2	6	2192549	2192554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508379
44980	NC_015416	CT	4	8	2192570	2192577	0 %	50 %	0 %	50 %	330508379
44981	NC_015416	GCC	2	6	2192580	2192585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508379
44982	NC_015416	TGA	2	6	2192636	2192641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508379
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44984	NC_015416	CTA	3	9	2192738	2192746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508379
44985	NC_015416	GCC	2	6	2192825	2192830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508380
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44987	NC_015416	CAG	2	6	2192980	2192985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508380
44988	NC_015416	TCT	2	6	2193100	2193105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508380
44989	NC_015416	TCC	2	6	2193121	2193126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508380
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44991	NC_015416	CCA	2	6	2193232	2193237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44992	NC_015416	TGA	2	6	2193286	2193291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44993	NC_015416	ATA	2	6	2193314	2193319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44994	NC_015416	ATT	2	6	2193332	2193337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44995	NC_015416	ATATT	2	10	2193345	2193354	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44996	NC_015416	TTA	2	6	2193376	2193381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44997	NC_015416	ATC	2	6	2193475	2193480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508381
44998	NC_015416	AAC	2	6	2193508	2193513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508381
44999	NC_015416	TC	3	6	2193536	2193541	0 %	50 %	0 %	50 %	330508381
45000	NC_015416	CTC	4	12	2193547	2193558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508381

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