MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_015416	GACC	2	8	2118790	2118797	25 %	0 %	25 %	50 %	330508305
43502	NC_015416	GAT	2	6	2118874	2118879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508305
43503	NC_015416	ATC	2	6	2118905	2118910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508305
43504	NC_015416	CGGG	2	8	2118922	2118929	0 %	0 %	75 %	25 %	330508305
43505	NC_015416	ACG	2	6	2118941	2118946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508305
43506	NC_015416	TCC	2	6	2119226	2119231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508305
43507	NC_015416	GGA	2	6	2119251	2119256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508305
43508	NC_015416	GCT	2	6	2119299	2119304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508305
43509	NC_015416	TATT	2	8	2119404	2119411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43510	NC_015416	CCT	2	6	2119474	2119479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508306
43511	NC_015416	TCA	2	6	2119498	2119503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508306
43512	NC_015416	CAG	2	6	2119519	2119524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508306
43513	NC_015416	GA	3	6	2119538	2119543	50 %	0 %	50 %	0 %	330508306
43514	NC_015416	TTC	2	6	2119545	2119550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508306
43515	NC_015416	CAC	2	6	2119586	2119591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508306
43516	NC_015416	TC	3	6	2119634	2119639	0 %	50 %	0 %	50 %	330508306
43517	NC_015416	GAAAC	2	10	2119685	2119694	60 %	0 %	20 %	20 %	330508306
43518	NC_015416	TCGGA	2	10	2119989	2119998	20 %	20 %	40 %	20 %	330508307
43519	NC_015416	ATG	2	6	2120106	2120111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508307
43520	NC_015416	GGT	2	6	2120130	2120135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508307
43521	NC_015416	GAT	2	6	2120183	2120188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508307
43522	NC_015416	TAA	2	6	2120194	2120199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508307
43523	NC_015416	GCA	2	6	2120401	2120406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43524	NC_015416	CTA	2	6	2120517	2120522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43525	NC_015416	AAG	2	6	2120578	2120583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43526	NC_015416	ACT	2	6	2120645	2120650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508308
43527	NC_015416	GAC	2	6	2120700	2120705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508308
43528	NC_015416	ATT	2	6	2120845	2120850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508308
43529	NC_015416	GAA	2	6	2120876	2120881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508308
43530	NC_015416	A	6	6	2120992	2120997	100 %	0 %	0 %	0 %	330508308
43531	NC_015416	TGT	2	6	2121046	2121051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508308
43532	NC_015416	CTT	2	6	2121062	2121067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508308
43533	NC_015416	T	6	6	2121105	2121110	0 %	100 %	0 %	0 %	330508308
43534	NC_015416	CGGT	2	8	2121113	2121120	0 %	25 %	50 %	25 %	330508308
43535	NC_015416	CGA	2	6	2121216	2121221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508308
43536	NC_015416	CTT	2	6	2121275	2121280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508308
43537	NC_015416	TTC	2	6	2121323	2121328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508308
43538	NC_015416	AGA	2	6	2121331	2121336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508308
43539	NC_015416	ATATC	2	10	2121365	2121374	40 %	40 %	0 %	20 %	330508308
43540	NC_015416	AAG	2	6	2121385	2121390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508308
43541	NC_015416	ACT	2	6	2121399	2121404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508308
43542	NC_015416	AAG	2	6	2121470	2121475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508308
43543	NC_015416	ATCTCT	2	12	2121489	2121500	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	330508308
43544	NC_015416	GAG	2	6	2121587	2121592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508308
43545	NC_015416	A	6	6	2121596	2121601	100 %	0 %	0 %	0 %	330508308
43546	NC_015416	TCA	2	6	2121615	2121620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508308
43547	NC_015416	ATGA	2	8	2121635	2121642	50 %	25 %	25 %	0 %	330508308
43548	NC_015416	AAG	2	6	2121645	2121650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508308
43549	NC_015416	ATT	2	6	2121658	2121663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508308
43550	NC_015416	AAGAG	2	10	2121665	2121674	60 %	0 %	40 %	0 %	330508308
43551	NC_015416	ATG	3	9	2121738	2121746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508308
43552	NC_015416	AAG	2	6	2121818	2121823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508308
43553	NC_015416	A	7	7	2121836	2121842	100 %	0 %	0 %	0 %	330508308
43554	NC_015416	GAC	2	6	2121851	2121856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508308
43555	NC_015416	AAT	2	6	2121910	2121915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508308
43556	NC_015416	AT	3	6	2122051	2122056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43557	NC_015416	AT	4	8	2122112	2122119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43558	NC_015416	GAAA	2	8	2122128	2122135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43559	NC_015416	AAT	2	6	2122170	2122175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43560	NC_015416	ACT	2	6	2122182	2122187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43561	NC_015416	TAC	2	6	2122193	2122198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43562	NC_015416	A	6	6	2122251	2122256	100 %	0 %	0 %	0 %	330508309
43563	NC_015416	TTG	2	6	2122258	2122263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508309
43564	NC_015416	TCA	2	6	2122267	2122272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508309
43565	NC_015416	ATGG	2	8	2122280	2122287	25 %	25 %	50 %	0 %	330508309
43566	NC_015416	AT	3	6	2122341	2122346	50 %	50 %	0 %	0 %	330508309
43567	NC_015416	GA	3	6	2122352	2122357	50 %	0 %	50 %	0 %	330508309
43568	NC_015416	A	6	6	2122376	2122381	100 %	0 %	0 %	0 %	330508309
43569	NC_015416	TTG	2	6	2122399	2122404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508309
43570	NC_015416	ATA	2	6	2122407	2122412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508309
43571	NC_015416	AATG	2	8	2122439	2122446	50 %	25 %	25 %	0 %	330508309
43572	NC_015416	GCGAA	2	10	2122474	2122483	40 %	0 %	40 %	20 %	330508309
43573	NC_015416	CCT	2	6	2122507	2122512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508309
43574	NC_015416	GAT	2	6	2122597	2122602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43575	NC_015416	CTTT	2	8	2122640	2122647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43576	NC_015416	T	7	7	2122668	2122674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43577	NC_015416	CATT	2	8	2122681	2122688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43578	NC_015416	GAT	2	6	2122693	2122698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43579	NC_015416	T	7	7	2122751	2122757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43580	NC_015416	AT	3	6	2122780	2122785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43581	NC_015416	GCAAC	2	10	2122794	2122803	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43582	NC_015416	AGAAA	2	10	2122851	2122860	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43583	NC_015416	TGA	2	6	2122899	2122904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43584	NC_015416	ATCAG	2	10	2122911	2122920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43585	NC_015416	CTTC	2	8	2123002	2123009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43586	NC_015416	ATA	2	6	2123107	2123112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43587	NC_015416	ACATAA	2	12	2123132	2123143	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43588	NC_015416	A	6	6	2123142	2123147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43589	NC_015416	AAAGG	2	10	2123201	2123210	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43590	NC_015416	ATT	2	6	2123289	2123294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43591	NC_015416	ATC	2	6	2123301	2123306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43592	NC_015416	TTC	2	6	2123363	2123368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43593	NC_015416	CAG	2	6	2123437	2123442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43594	NC_015416	AAG	2	6	2123458	2123463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43595	NC_015416	TCA	2	6	2123537	2123542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43596	NC_015416	AGC	2	6	2123544	2123549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43597	NC_015416	GC	3	6	2123572	2123577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43598	NC_015416	GCA	2	6	2123649	2123654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43599	NC_015416	AAAGC	2	10	2123714	2123723	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43600	NC_015416	ATGGG	2	10	2123753	2123762	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
43601	NC_015416	GAT	2	6	2123790	2123795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43602	NC_015416	GCTG	2	8	2123810	2123817	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43603	NC_015416	TGG	2	6	2123886	2123891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43604	NC_015416	ACG	3	9	2123953	2123961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43605	NC_015416	A	6	6	2123994	2123999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43606	NC_015416	TCAT	2	8	2124098	2124105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43607	NC_015416	CGA	2	6	2124107	2124112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43608	NC_015416	AAT	2	6	2124258	2124263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43609	NC_015416	AAT	2	6	2124294	2124299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43610	NC_015416	TAC	2	6	2124435	2124440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43611	NC_015416	CAG	2	6	2124627	2124632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508310
43612	NC_015416	TA	3	6	2124755	2124760	50 %	50 %	0 %	0 %	330508310
43613	NC_015416	AAC	2	6	2124789	2124794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508310
43614	NC_015416	AAT	2	6	2124917	2124922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508310
43615	NC_015416	ATTAT	2	10	2125032	2125041	40 %	60 %	0 %	0 %	330508310
43616	NC_015416	GCA	2	6	2125047	2125052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508310
43617	NC_015416	TGA	2	6	2125060	2125065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508310
43618	NC_015416	GAGAG	2	10	2125105	2125114	40 %	0 %	60 %	0 %	330508310
43619	NC_015416	GGC	2	6	2125170	2125175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43620	NC_015416	GGAT	2	8	2125206	2125213	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43621	NC_015416	CAG	2	6	2125386	2125391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43622	NC_015416	GGCAAA	2	12	2125397	2125408	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43623	NC_015416	A	6	6	2125406	2125411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43624	NC_015416	ACAA	2	8	2125456	2125463	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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43740	NC_015416	CTG	2	6	2131000	2131005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508316
43741	NC_015416	GTA	2	6	2131023	2131028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508316
43742	NC_015416	CTGG	2	8	2131059	2131066	0 %	25 %	50 %	25 %	330508316
43743	NC_015416	ATC	2	6	2131090	2131095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508316
43744	NC_015416	TTC	2	6	2131111	2131116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508316
43745	NC_015416	TGG	2	6	2131196	2131201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508316
43746	NC_015416	AGT	2	6	2131202	2131207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508316
43747	NC_015416	ATC	2	6	2131222	2131227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508316
43748	NC_015416	AT	3	6	2131375	2131380	50 %	50 %	0 %	0 %	330508316
43749	NC_015416	AGC	2	6	2131411	2131416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508317
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43752	NC_015416	TCC	2	6	2131526	2131531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508317
43753	NC_015416	CAC	2	6	2131540	2131545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508317
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43756	NC_015416	TGA	2	6	2131728	2131733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508317
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43761	NC_015416	CT	3	6	2131871	2131876	0 %	50 %	0 %	50 %	330508317
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43764	NC_015416	TCC	2	6	2131971	2131976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508317
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43778	NC_015416	GAG	2	6	2132765	2132770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508317
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43788	NC_015416	ATG	2	6	2133071	2133076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43790	NC_015416	AGA	2	6	2133255	2133260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43791	NC_015416	TTC	2	6	2133279	2133284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43811	NC_015416	CCCTT	2	10	2134557	2134566	0 %	40 %	0 %	60 %	330508318
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43825	NC_015416	TAA	2	6	2135294	2135299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43826	NC_015416	ATTT	2	8	2135330	2135337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43827	NC_015416	AAT	2	6	2135381	2135386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43828	NC_015416	TATT	2	8	2135409	2135416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43829	NC_015416	TCT	2	6	2135545	2135550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43830	NC_015416	TGA	2	6	2135567	2135572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508320
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43833	NC_015416	GA	3	6	2135606	2135611	50 %	0 %	50 %	0 %	330508320
43834	NC_015416	GGAGA	2	10	2135632	2135641	40 %	0 %	60 %	0 %	330508320
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43840	NC_015416	CGGT	2	8	2135982	2135989	0 %	25 %	50 %	25 %	330508320
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43845	NC_015416	GAT	2	6	2136099	2136104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508320
43846	NC_015416	C	6	6	2136147	2136152	0 %	0 %	0 %	100 %	330508320
43847	NC_015416	ATC	2	6	2136269	2136274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508320
43848	NC_015416	GGC	2	6	2136356	2136361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508320
43849	NC_015416	GAGG	2	8	2136369	2136376	25 %	0 %	75 %	0 %	330508320
43850	NC_015416	CCT	2	6	2136389	2136394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508320
43851	NC_015416	GCTTT	2	10	2136409	2136418	0 %	60 %	20 %	20 %	330508320
43852	NC_015416	AGA	2	6	2136441	2136446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43853	NC_015416	AG	3	6	2136465	2136470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43854	NC_015416	TCA	3	9	2136551	2136559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43855	NC_015416	CGA	2	6	2136600	2136605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43856	NC_015416	GCC	2	6	2136629	2136634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43857	NC_015416	A	6	6	2136641	2136646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43858	NC_015416	CTC	2	6	2136651	2136656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43859	NC_015416	CT	3	6	2136689	2136694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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43979	NC_015416	CAGCTA	2	12	2142252	2142263	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330508329
43980	NC_015416	TGC	2	6	2142362	2142367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508329
43981	NC_015416	TCAGGA	2	12	2142404	2142415	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330508329
43982	NC_015416	GAT	2	6	2142484	2142489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508329
43983	NC_015416	GGA	3	9	2142510	2142518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508329
43984	NC_015416	CGA	2	6	2142533	2142538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508329
43985	NC_015416	AGG	2	6	2142557	2142562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508329
43986	NC_015416	GA	3	6	2142568	2142573	50 %	0 %	50 %	0 %	330508329
43987	NC_015416	GGC	2	6	2142612	2142617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508329
43988	NC_015416	TCA	2	6	2142627	2142632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508329
43989	NC_015416	AG	3	6	2142653	2142658	50 %	0 %	50 %	0 %	330508329
43990	NC_015416	AGC	2	6	2142767	2142772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508329
43991	NC_015416	ATG	2	6	2142806	2142811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508329
43992	NC_015416	CTG	2	6	2142826	2142831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508329
43993	NC_015416	TTC	2	6	2142842	2142847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508329
43994	NC_015416	TCA	2	6	2142882	2142887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508329
43995	NC_015416	AGG	2	6	2142898	2142903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508329
43996	NC_015416	GATG	2	8	2142909	2142916	25 %	25 %	50 %	0 %	330508329
43997	NC_015416	AGG	3	9	2142965	2142973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508329
43998	NC_015416	A	6	6	2143000	2143005	100 %	0 %	0 %	0 %	330508329
43999	NC_015416	AG	3	6	2143027	2143032	50 %	0 %	50 %	0 %	330508329
44000	NC_015416	GCA	2	6	2143053	2143058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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