MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_015416	GAA	2	6	2045302	2045307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508248
42003	NC_015416	TC	3	6	2045321	2045326	0 %	50 %	0 %	50 %	330508248
42004	NC_015416	GCT	2	6	2045341	2045346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508248
42005	NC_015416	AAC	2	6	2045390	2045395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508248
42006	NC_015416	AACATC	2	12	2045449	2045460	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	330508248
42007	NC_015416	AATC	2	8	2045536	2045543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42008	NC_015416	TCT	2	6	2045553	2045558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42009	NC_015416	CCT	2	6	2045573	2045578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508249
42010	NC_015416	CCAA	2	8	2045583	2045590	50 %	0 %	0 %	50 %	330508249
42011	NC_015416	GAT	2	6	2045628	2045633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508249
42012	NC_015416	CCT	2	6	2045634	2045639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508249
42013	NC_015416	GTT	2	6	2045657	2045662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508249
42014	NC_015416	CAG	2	6	2045695	2045700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508249
42015	NC_015416	TCT	2	6	2045742	2045747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508249
42016	NC_015416	TAAT	2	8	2045797	2045804	50 %	50 %	0 %	0 %	330508249
42017	NC_015416	GTC	2	6	2045812	2045817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508249
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42020	NC_015416	CAT	2	6	2046065	2046070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42021	NC_015416	ATA	2	6	2046077	2046082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42022	NC_015416	CAG	2	6	2046193	2046198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42024	NC_015416	T	8	8	2046241	2046248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42025	NC_015416	CAGG	2	8	2046276	2046283	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42026	NC_015416	ATC	2	6	2046466	2046471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42043	NC_015416	ATC	2	6	2047571	2047576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508250
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42049	NC_015416	TAGC	2	8	2047813	2047820	25 %	25 %	25 %	25 %	330508250
42050	NC_015416	T	9	9	2047834	2047842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42051	NC_015416	TATG	2	8	2047900	2047907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42052	NC_015416	GAA	2	6	2047913	2047918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42053	NC_015416	TC	3	6	2047932	2047937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42054	NC_015416	GCT	2	6	2047952	2047957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42055	NC_015416	ATT	2	6	2048054	2048059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42056	NC_015416	TGA	2	6	2048106	2048111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42057	NC_015416	TAA	2	6	2048219	2048224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42058	NC_015416	TA	4	8	2048232	2048239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42059	NC_015416	TAC	2	6	2048244	2048249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508251
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42062	NC_015416	TG	3	6	2048637	2048642	0 %	50 %	50 %	0 %	330508251
42063	NC_015416	TAA	2	6	2048680	2048685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508251
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42068	NC_015416	GATCT	2	10	2048987	2048996	20 %	40 %	20 %	20 %	330508251
42069	NC_015416	GCA	2	6	2049021	2049026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508251
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42071	NC_015416	CCA	3	9	2049135	2049143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508251
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42082	NC_015416	AT	3	6	2049819	2049824	50 %	50 %	0 %	0 %	330508252
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42086	NC_015416	TGC	3	9	2049958	2049966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508252
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42089	NC_015416	ATCA	2	8	2050016	2050023	50 %	25 %	0 %	25 %	330508252
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42091	NC_015416	TGA	2	6	2050052	2050057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42092	NC_015416	AT	3	6	2050223	2050228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42093	NC_015416	T	6	6	2050263	2050268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42094	NC_015416	AT	3	6	2050438	2050443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42095	NC_015416	TAC	2	6	2050457	2050462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42103	NC_015416	TGG	2	6	2051008	2051013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508253
42104	NC_015416	GCT	2	6	2051073	2051078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508253
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42106	NC_015416	GTA	2	6	2051140	2051145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508253
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42108	NC_015416	TGG	2	6	2051258	2051263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508253
42109	NC_015416	TC	3	6	2051278	2051283	0 %	50 %	0 %	50 %	330508253
42110	NC_015416	TGC	2	6	2051477	2051482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42111	NC_015416	GA	4	8	2051486	2051493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42112	NC_015416	ACA	2	6	2051501	2051506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42113	NC_015416	GAT	2	6	2051514	2051519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42114	NC_015416	GCT	2	6	2051595	2051600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42115	NC_015416	CAGG	2	8	2051672	2051679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42116	NC_015416	ACG	2	6	2051682	2051687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42117	NC_015416	A	6	6	2051696	2051701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42118	NC_015416	T	7	7	2051736	2051742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42119	NC_015416	T	7	7	2051771	2051777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42120	NC_015416	ATCA	2	8	2051803	2051810	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42121	NC_015416	AT	5	10	2051817	2051826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42122	NC_015416	AAT	2	6	2051835	2051840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42123	NC_015416	TAAA	2	8	2051910	2051917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42124	NC_015416	A	6	6	2051934	2051939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42159	NC_015416	CAA	2	6	2053554	2053559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42161	NC_015416	CAA	2	6	2053582	2053587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42223	NC_015416	GTC	2	6	2056586	2056591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508257
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42232	NC_015416	CGG	2	6	2056885	2056890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508257
42233	NC_015416	GAACA	2	10	2056928	2056937	60 %	0 %	20 %	20 %	330508257
42234	NC_015416	GGA	2	6	2057075	2057080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508257
42235	NC_015416	AGA	2	6	2057164	2057169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508257
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42353	NC_015416	GCA	2	6	2062633	2062638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508259
42354	NC_015416	ATG	2	6	2062711	2062716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508259
42355	NC_015416	TCAGT	2	10	2062720	2062729	20 %	40 %	20 %	20 %	330508259
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42373	NC_015416	AGTC	2	8	2063347	2063354	25 %	25 %	25 %	25 %	330508259
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42379	NC_015416	TAAT	2	8	2063538	2063545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42380	NC_015416	CAG	3	9	2063623	2063631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508260
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42422	NC_015416	CAA	2	6	2065538	2065543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508260
42423	NC_015416	ATG	3	9	2065576	2065584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508260
42424	NC_015416	AGTC	2	8	2065588	2065595	25 %	25 %	25 %	25 %	330508260
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42432	NC_015416	GAT	2	6	2065849	2065854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42433	NC_015416	CTT	2	6	2065902	2065907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42434	NC_015416	T	8	8	2065913	2065920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42435	NC_015416	AGC	2	6	2065921	2065926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42443	NC_015416	CTG	3	9	2066239	2066247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508261
42444	NC_015416	CTCCGC	2	12	2066294	2066305	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	330508261
42445	NC_015416	CCT	2	6	2066464	2066469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508261
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42450	NC_015416	CT	3	6	2066726	2066731	0 %	50 %	0 %	50 %	330508262
42451	NC_015416	CTG	2	6	2066741	2066746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508262
42452	NC_015416	CCA	2	6	2066784	2066789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508262
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42454	NC_015416	GGC	2	6	2066915	2066920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508262
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42456	NC_015416	AGC	2	6	2067012	2067017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508262
42457	NC_015416	GGCCA	2	10	2067080	2067089	20 %	0 %	40 %	40 %	330508262
42458	NC_015416	GCT	2	6	2067112	2067117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508262
42459	NC_015416	CGA	2	6	2067151	2067156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508262
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42461	NC_015416	TGG	2	6	2067201	2067206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508262
42462	NC_015416	CGC	2	6	2067368	2067373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508262
42463	NC_015416	CCAG	2	8	2067379	2067386	25 %	0 %	25 %	50 %	330508262
42464	NC_015416	TCA	2	6	2067432	2067437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508263
42465	NC_015416	T	6	6	2067443	2067448	0 %	100 %	0 %	0 %	330508263
42466	NC_015416	TCCTC	2	10	2067524	2067533	0 %	40 %	0 %	60 %	330508263
42467	NC_015416	GA	3	6	2067602	2067607	50 %	0 %	50 %	0 %	330508263
42468	NC_015416	TGC	2	6	2067635	2067640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508263
42469	NC_015416	CCTTCT	2	12	2067752	2067763	0 %	50 %	0 %	50 %	330508263
42470	NC_015416	GC	3	6	2067796	2067801	0 %	0 %	50 %	50 %	330508263
42471	NC_015416	CTC	2	6	2067804	2067809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508263
42472	NC_015416	TCA	2	6	2067854	2067859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508263
42473	NC_015416	GA	3	6	2067944	2067949	50 %	0 %	50 %	0 %	330508263
42474	NC_015416	CTC	2	6	2067963	2067968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508263
42475	NC_015416	TCTG	2	8	2067970	2067977	0 %	50 %	25 %	25 %	330508263
42476	NC_015416	TCT	2	6	2067980	2067985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508263
42477	NC_015416	T	7	7	2067989	2067995	0 %	100 %	0 %	0 %	330508263
42478	NC_015416	CTC	2	6	2067996	2068001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508263
42479	NC_015416	GCC	2	6	2068045	2068050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508263
42480	NC_015416	TC	3	6	2068062	2068067	0 %	50 %	0 %	50 %	330508263
42481	NC_015416	AGC	2	6	2068086	2068091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508263
42482	NC_015416	TGC	2	6	2068094	2068099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508263
42483	NC_015416	CCT	2	6	2068109	2068114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508263
42484	NC_015416	CTT	3	9	2068125	2068133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508263
42485	NC_015416	CTTC	2	8	2068209	2068216	0 %	50 %	0 %	50 %	330508263
42486	NC_015416	ATC	2	6	2068225	2068230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508263
42487	NC_015416	GGT	2	6	2068335	2068340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508263
42488	NC_015416	TC	3	6	2068347	2068352	0 %	50 %	0 %	50 %	330508263
42489	NC_015416	GTG	2	6	2068374	2068379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508263
42490	NC_015416	ATCT	2	8	2068416	2068423	25 %	50 %	0 %	25 %	330508263
42491	NC_015416	ACC	2	6	2068450	2068455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508263
42492	NC_015416	GCG	2	6	2068465	2068470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508263
42493	NC_015416	GCCCT	2	10	2068472	2068481	0 %	20 %	20 %	60 %	330508263
42494	NC_015416	GAG	2	6	2068482	2068487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508263
42495	NC_015416	GGA	2	6	2068492	2068497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508263
42496	NC_015416	AT	3	6	2068575	2068580	50 %	50 %	0 %	0 %	330508263
42497	NC_015416	TCC	2	6	2068621	2068626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508263
42498	NC_015416	TCC	2	6	2068642	2068647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508263
42499	NC_015416	CCGATC	2	12	2068670	2068681	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330508263
42500	NC_015416	CTT	2	6	2068731	2068736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508264

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