MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_015416	TC	4	8	1995227	1995234	0 %	50 %	0 %	50 %	330508209
41003	NC_015416	AGA	2	6	1995295	1995300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508209
41004	NC_015416	TTC	2	6	1995313	1995318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508209
41005	NC_015416	CTG	2	6	1995356	1995361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508209
41006	NC_015416	AAC	2	6	1995407	1995412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508209
41007	NC_015416	GAA	2	6	1995493	1995498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508209
41008	NC_015416	AAGAA	2	10	1995600	1995609	80 %	0 %	20 %	0 %	330508209
41009	NC_015416	CCG	2	6	1995672	1995677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508209
41010	NC_015416	CCG	2	6	1995690	1995695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508209
41011	NC_015416	CGG	2	6	1995708	1995713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508209
41012	NC_015416	AGA	2	6	1995733	1995738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508209
41013	NC_015416	AT	3	6	1995792	1995797	50 %	50 %	0 %	0 %	330508209
41014	NC_015416	GCCT	2	8	1995812	1995819	0 %	25 %	25 %	50 %	330508209
41015	NC_015416	GGAGCT	2	12	1995940	1995951	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330508209
41016	NC_015416	CTG	2	6	1995962	1995967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508209
41017	NC_015416	CCT	2	6	1995985	1995990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508209
41018	NC_015416	CAA	2	6	1996033	1996038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508209
41019	NC_015416	CCT	2	6	1996078	1996083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508209
41020	NC_015416	G	6	6	1996110	1996115	0 %	0 %	100 %	0 %	330508209
41021	NC_015416	GACC	2	8	1996165	1996172	25 %	0 %	25 %	50 %	330508209
41022	NC_015416	GAT	2	6	1996181	1996186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508209
41023	NC_015416	GCCT	2	8	1996269	1996276	0 %	25 %	25 %	50 %	330508209
41024	NC_015416	CCAG	2	8	1996326	1996333	25 %	0 %	25 %	50 %	330508209
41025	NC_015416	TGA	2	6	1996350	1996355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508209
41026	NC_015416	GAACG	2	10	1996480	1996489	40 %	0 %	40 %	20 %	330508209
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41028	NC_015416	ACC	3	9	1996610	1996618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508209
41029	NC_015416	GAGG	2	8	1996750	1996757	25 %	0 %	75 %	0 %	330508209
41030	NC_015416	AGCTC	2	10	1996782	1996791	20 %	20 %	20 %	40 %	330508209
41031	NC_015416	CAAG	2	8	1996829	1996836	50 %	0 %	25 %	25 %	330508209
41032	NC_015416	GAG	2	6	1996847	1996852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508209
41033	NC_015416	AGC	2	6	1997000	1997005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508209
41034	NC_015416	GCA	2	6	1997085	1997090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508209
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41036	NC_015416	CAG	2	6	1997143	1997148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508209
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41038	NC_015416	CTG	2	6	1997247	1997252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508209
41039	NC_015416	CAG	2	6	1997329	1997334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508209
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41043	NC_015416	CAG	2	6	1997580	1997585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508209
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41051	NC_015416	GGAT	2	8	1997902	1997909	25 %	25 %	50 %	0 %	330508209
41052	NC_015416	AGC	2	6	1997915	1997920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508209
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41054	NC_015416	CTG	2	6	1997988	1997993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508209
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41060	NC_015416	CAAT	2	8	1998230	1998237	50 %	25 %	0 %	25 %	330508209
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41067	NC_015416	T	6	6	1998615	1998620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41068	NC_015416	ATG	2	6	1998663	1998668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41087	NC_015416	CT	3	6	1999773	1999778	0 %	50 %	0 %	50 %	330508212
41088	NC_015416	CAT	2	6	1999826	1999831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508212
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41093	NC_015416	TCA	2	6	1999951	1999956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508212
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41100	NC_015416	TAT	2	6	2000399	2000404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508212
41101	NC_015416	AATA	2	8	2000552	2000559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41102	NC_015416	A	8	8	2000591	2000598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41103	NC_015416	A	6	6	2000627	2000632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41104	NC_015416	GGA	2	6	2000655	2000660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41105	NC_015416	TA	3	6	2000707	2000712	50 %	50 %	0 %	0 %	330508213
41106	NC_015416	GTC	2	6	2000730	2000735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508213
41107	NC_015416	TCC	2	6	2000747	2000752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508213
41108	NC_015416	TGATC	2	10	2000897	2000906	20 %	40 %	20 %	20 %	330508213
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41112	NC_015416	CCCG	2	8	2001139	2001146	0 %	0 %	25 %	75 %	330508213
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41118	NC_015416	GAT	2	6	2001393	2001398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508213
41119	NC_015416	GCA	2	6	2001439	2001444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508213
41120	NC_015416	CAGCTC	2	12	2001450	2001461	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330508213
41121	NC_015416	GTAGAC	2	12	2001474	2001485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330508213
41122	NC_015416	TCCA	2	8	2001508	2001515	25 %	25 %	0 %	50 %	330508213
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41220	NC_015416	ATTGC	2	10	2005727	2005736	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41221	NC_015416	CGC	2	6	2005831	2005836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41222	NC_015416	CT	3	6	2005932	2005937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41223	NC_015416	AC	3	6	2006014	2006019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41224	NC_015416	GGA	2	6	2006022	2006027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41236	NC_015416	TGC	2	6	2006672	2006677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508215
41237	NC_015416	GCG	2	6	2006681	2006686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508215
41238	NC_015416	TCT	2	6	2006726	2006731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508215
41239	NC_015416	GCA	2	6	2006737	2006742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508215
41240	NC_015416	GA	3	6	2006882	2006887	50 %	0 %	50 %	0 %	330508215
41241	NC_015416	ATT	2	6	2006960	2006965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508215
41242	NC_015416	ACT	2	6	2007080	2007085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508215
41243	NC_015416	CGG	2	6	2007093	2007098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508215
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41247	NC_015416	ACCT	2	8	2007181	2007188	25 %	25 %	0 %	50 %	330508215
41248	NC_015416	AGAAA	2	10	2007254	2007263	80 %	0 %	20 %	0 %	330508215
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41253	NC_015416	GCT	2	6	2007516	2007521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508216
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41272	NC_015416	GAC	2	6	2008637	2008642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508217
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41279	NC_015416	CAGT	2	8	2008936	2008943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41280	NC_015416	AGC	2	6	2009025	2009030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508218
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41297	NC_015416	TTC	2	6	2010093	2010098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508218
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41305	NC_015416	CAT	2	6	2010499	2010504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508218
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41310	NC_015416	TGC	2	6	2010726	2010731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508218
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41314	NC_015416	CCCT	2	8	2010959	2010966	0 %	25 %	0 %	75 %	330508218
41315	NC_015416	TCG	2	6	2010972	2010977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508218
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41319	NC_015416	GC	3	6	2011263	2011268	0 %	0 %	50 %	50 %	330508218
41320	NC_015416	AAG	2	6	2011313	2011318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508218
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41322	NC_015416	CTT	2	6	2011387	2011392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508218
41323	NC_015416	CA	3	6	2011428	2011433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41324	NC_015416	TCA	2	6	2011477	2011482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508219
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41326	NC_015416	CGT	2	6	2011583	2011588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508219
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41332	NC_015416	GC	3	6	2011845	2011850	0 %	0 %	50 %	50 %	330508219
41333	NC_015416	ATC	2	6	2011862	2011867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508219
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41335	NC_015416	CGAT	2	8	2011932	2011939	25 %	25 %	25 %	25 %	330508220
41336	NC_015416	TCC	2	6	2011979	2011984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508220
41337	NC_015416	AAAAG	2	10	2011990	2011999	80 %	0 %	20 %	0 %	330508220
41338	NC_015416	AG	3	6	2012018	2012023	50 %	0 %	50 %	0 %	330508220
41339	NC_015416	GCT	2	6	2012055	2012060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508220
41340	NC_015416	CTG	2	6	2012062	2012067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508220
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41342	NC_015416	CAAG	2	8	2012152	2012159	50 %	0 %	25 %	25 %	330508220
41343	NC_015416	ATCA	2	8	2012223	2012230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41344	NC_015416	ATT	2	6	2012231	2012236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41345	NC_015416	TAAC	2	8	2012254	2012261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41346	NC_015416	TAT	2	6	2012274	2012279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41347	NC_015416	TAT	2	6	2012281	2012286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41348	NC_015416	GA	3	6	2012409	2012414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41349	NC_015416	GCA	2	6	2012418	2012423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508221
41350	NC_015416	GCA	2	6	2012430	2012435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508221
41351	NC_015416	GGC	2	6	2012486	2012491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508221
41352	NC_015416	TCCAG	2	10	2012618	2012627	20 %	20 %	20 %	40 %	330508221
41353	NC_015416	CTG	2	6	2012637	2012642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508221
41354	NC_015416	AGA	2	6	2012658	2012663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508221
41355	NC_015416	T	7	7	2012698	2012704	0 %	100 %	0 %	0 %	330508221
41356	NC_015416	AGG	2	6	2012735	2012740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508221
41357	NC_015416	GA	3	6	2012783	2012788	50 %	0 %	50 %	0 %	330508221
41358	NC_015416	AAG	2	6	2012823	2012828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508221
41359	NC_015416	CTT	2	6	2013046	2013051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508222
41360	NC_015416	GGT	2	6	2013056	2013061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508222
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41362	NC_015416	GAA	2	6	2013146	2013151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508222
41363	NC_015416	AT	3	6	2013187	2013192	50 %	50 %	0 %	0 %	330508222
41364	NC_015416	CGA	2	6	2013206	2013211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508222
41365	NC_015416	CCAG	2	8	2013265	2013272	25 %	0 %	25 %	50 %	330508222
41366	NC_015416	TGG	2	6	2013367	2013372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508222
41367	NC_015416	TGG	2	6	2013436	2013441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508222
41368	NC_015416	CGA	2	6	2013449	2013454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508222
41369	NC_015416	GAC	2	6	2013567	2013572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508222
41370	NC_015416	ACC	2	6	2013585	2013590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508222
41371	NC_015416	CCA	2	6	2013745	2013750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508222
41372	NC_015416	AG	3	6	2013759	2013764	50 %	0 %	50 %	0 %	330508222
41373	NC_015416	GGT	2	6	2013788	2013793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508222
41374	NC_015416	ATG	2	6	2013836	2013841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508222
41375	NC_015416	AGCAA	2	10	2013874	2013883	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41376	NC_015416	TA	3	6	2013902	2013907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41377	NC_015416	GGA	2	6	2013910	2013915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41378	NC_015416	ATAG	2	8	2013929	2013936	50 %	25 %	25 %	0 %	330508223
41379	NC_015416	AT	3	6	2013939	2013944	50 %	50 %	0 %	0 %	330508223
41380	NC_015416	A	6	6	2013951	2013956	100 %	0 %	0 %	0 %	330508223
41381	NC_015416	AG	4	8	2013959	2013966	50 %	0 %	50 %	0 %	330508223
41382	NC_015416	CCA	2	6	2013977	2013982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508223
41383	NC_015416	TC	4	8	2013987	2013994	0 %	50 %	0 %	50 %	330508223
41384	NC_015416	ATC	2	6	2014022	2014027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508223
41385	NC_015416	TGC	3	9	2014032	2014040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508223
41386	NC_015416	GGA	2	6	2014052	2014057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508223
41387	NC_015416	GGT	2	6	2014111	2014116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508223
41388	NC_015416	CCA	2	6	2014171	2014176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508223
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41390	NC_015416	CAG	2	6	2014258	2014263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508223
41391	NC_015416	TCCT	2	8	2014345	2014352	0 %	50 %	0 %	50 %	330508223
41392	NC_015416	AAG	2	6	2014379	2014384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508223
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41402	NC_015416	GAAG	2	8	2014600	2014607	50 %	0 %	50 %	0 %	330508223
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41404	NC_015416	TTA	2	6	2014805	2014810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41405	NC_015416	T	6	6	2014837	2014842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41406	NC_015416	CGC	2	6	2014848	2014853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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41408	NC_015416	CCTC	2	8	2014869	2014876	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41409	NC_015416	ATG	2	6	2014969	2014974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41410	NC_015416	GGA	2	6	2015027	2015032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41413	NC_015416	T	6	6	2015114	2015119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41414	NC_015416	AGG	2	6	2015155	2015160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41415	NC_015416	CAG	2	6	2015186	2015191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41416	NC_015416	CTG	2	6	2015212	2015217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41417	NC_015416	TCGA	2	8	2015222	2015229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41418	NC_015416	ATTTT	2	10	2015333	2015342	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41419	NC_015416	TGC	2	6	2015363	2015368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41420	NC_015416	GAT	2	6	2015420	2015425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508224
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41423	NC_015416	ATCG	2	8	2015514	2015521	25 %	25 %	25 %	25 %	330508224
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41425	NC_015416	ATTTCG	2	12	2015569	2015580	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330508224
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41429	NC_015416	AAG	2	6	2015694	2015699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508224
41430	NC_015416	A	6	6	2015712	2015717	100 %	0 %	0 %	0 %	330508224
41431	NC_015416	GAA	2	6	2015826	2015831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508224
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41433	NC_015416	TA	3	6	2016016	2016021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41434	NC_015416	CCG	2	6	2016137	2016142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508225
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41438	NC_015416	AGC	2	6	2016252	2016257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508225
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41442	NC_015416	GCT	2	6	2016635	2016640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508225
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41446	NC_015416	AG	3	6	2016823	2016828	50 %	0 %	50 %	0 %	330508225
41447	NC_015416	TCA	2	6	2016840	2016845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508225
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41449	NC_015416	TAC	2	6	2016877	2016882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508225
41450	NC_015416	GAT	3	9	2016904	2016912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508225
41451	NC_015416	TGG	2	6	2016963	2016968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508225
41452	NC_015416	TTTAGC	2	12	2016969	2016980	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330508225
41453	NC_015416	A	6	6	2016986	2016991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41454	NC_015416	AGG	2	6	2017022	2017027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41455	NC_015416	TTTAT	2	10	2017190	2017199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41456	NC_015416	AG	3	6	2017417	2017422	50 %	0 %	50 %	0 %	330508226
41457	NC_015416	GCA	2	6	2017511	2017516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508226
41458	NC_015416	CA	3	6	2017540	2017545	50 %	0 %	0 %	50 %	330508226
41459	NC_015416	AGCC	2	8	2017594	2017601	25 %	0 %	25 %	50 %	330508226
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41465	NC_015416	GGCA	2	8	2017880	2017887	25 %	0 %	50 %	25 %	330508226
41466	NC_015416	AAG	2	6	2017982	2017987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508226
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41468	NC_015416	CAG	2	6	2018348	2018353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508226
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41471	NC_015416	TTA	2	6	2018423	2018428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508226
41472	NC_015416	CTCAGA	2	12	2018445	2018456	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330508226
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41480	NC_015416	AG	3	6	2018663	2018668	50 %	0 %	50 %	0 %	330508227
41481	NC_015416	GCC	2	6	2018740	2018745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508227
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41491	NC_015416	GAT	2	6	2019204	2019209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508227
41492	NC_015416	AGGC	2	8	2019341	2019348	25 %	0 %	50 %	25 %	330508228
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