MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015416	CTT	2	6	148937	148942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506454
3002	NC_015416	GA	3	6	148997	149002	50 %	0 %	50 %	0 %	330506454
3003	NC_015416	ATGC	2	8	149006	149013	25 %	25 %	25 %	25 %	330506454
3004	NC_015416	TCT	2	6	149082	149087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506454
3005	NC_015416	AAG	2	6	149099	149104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506454
3006	NC_015416	G	6	6	149145	149150	0 %	0 %	100 %	0 %	330506454
3007	NC_015416	CAG	2	6	149151	149156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506454
3008	NC_015416	GA	4	8	149162	149169	50 %	0 %	50 %	0 %	330506454
3009	NC_015416	GAG	2	6	149201	149206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506454
3010	NC_015416	TGG	2	6	149220	149225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506454
3011	NC_015416	TCT	2	6	149241	149246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506454
3012	NC_015416	GA	3	6	149251	149256	50 %	0 %	50 %	0 %	330506454
3013	NC_015416	CCTGA	2	10	149270	149279	20 %	20 %	20 %	40 %	330506454
3014	NC_015416	AAC	2	6	149327	149332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506454
3015	NC_015416	CT	3	6	149347	149352	0 %	50 %	0 %	50 %	330506454
3016	NC_015416	CATG	2	8	149419	149426	25 %	25 %	25 %	25 %	330506454
3017	NC_015416	CAG	2	6	149501	149506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506454
3018	NC_015416	GAGGCG	2	12	149531	149542	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	330506454
3019	NC_015416	AGG	2	6	149646	149651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506454
3020	NC_015416	CTT	2	6	149758	149763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506454
3021	NC_015416	GGC	2	6	149779	149784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506454
3022	NC_015416	TC	3	6	149820	149825	0 %	50 %	0 %	50 %	330506454
3023	NC_015416	GCAGG	2	10	149839	149848	20 %	0 %	60 %	20 %	330506454
3024	NC_015416	ACC	2	6	149892	149897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506454
3025	NC_015416	AT	3	6	149934	149939	50 %	50 %	0 %	0 %	330506454
3026	NC_015416	ACC	2	6	149940	149945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506454
3027	NC_015416	GAT	2	6	149953	149958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506454
3028	NC_015416	AGC	2	6	150024	150029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506454
3029	NC_015416	GCC	2	6	150043	150048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506454
3030	NC_015416	GACGAT	2	12	150092	150103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330506454
3031	NC_015416	TAC	2	6	150104	150109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506454
3032	NC_015416	TGA	2	6	150135	150140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506454
3033	NC_015416	AGC	3	9	150147	150155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506454
3034	NC_015416	GAATT	2	10	150311	150320	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_015416	GA	3	6	150349	150354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_015416	CA	3	6	150372	150377	50 %	0 %	0 %	50 %	330506455
3037	NC_015416	AGA	2	6	150383	150388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506455
3038	NC_015416	TTG	2	6	150391	150396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506455
3039	NC_015416	AAG	2	6	150457	150462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506455
3040	NC_015416	TCT	2	6	150530	150535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506455
3041	NC_015416	GCT	2	6	150540	150545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506455
3042	NC_015416	AGG	2	6	150549	150554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506455
3043	NC_015416	GGC	2	6	150621	150626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506455
3044	NC_015416	GA	3	6	150632	150637	50 %	0 %	50 %	0 %	330506455
3045	NC_015416	GCC	2	6	150670	150675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506455
3046	NC_015416	CTG	2	6	150766	150771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506455
3047	NC_015416	AGA	2	6	150780	150785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506455
3048	NC_015416	AAG	2	6	150799	150804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506455
3049	NC_015416	TGA	2	6	150958	150963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015416	TCA	3	9	150986	150994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_015416	TGC	2	6	151004	151009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_015416	GAG	2	6	151163	151168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506456
3053	NC_015416	GA	3	6	151230	151235	50 %	0 %	50 %	0 %	330506456
3054	NC_015416	GCA	2	6	151269	151274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506456
3055	NC_015416	TTGAGA	2	12	151338	151349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506456
3056	NC_015416	A	6	6	151363	151368	100 %	0 %	0 %	0 %	330506456
3057	NC_015416	AAT	2	6	151398	151403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506456
3058	NC_015416	T	6	6	151406	151411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015416	ATA	2	6	151439	151444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_015416	TAA	2	6	151458	151463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_015416	GCAT	2	8	151544	151551	25 %	25 %	25 %	25 %	330506457
3062	NC_015416	AGA	2	6	151567	151572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506457
3063	NC_015416	GATC	2	8	151581	151588	25 %	25 %	25 %	25 %	330506457
3064	NC_015416	CTG	2	6	151609	151614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506457
3065	NC_015416	TGCA	2	8	151636	151643	25 %	25 %	25 %	25 %	330506457
3066	NC_015416	ACC	2	6	151688	151693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506457
3067	NC_015416	AG	3	6	151707	151712	50 %	0 %	50 %	0 %	330506457
3068	NC_015416	AGT	2	6	151869	151874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506457
3069	NC_015416	TGG	2	6	151917	151922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506457
3070	NC_015416	AT	3	6	151946	151951	50 %	50 %	0 %	0 %	330506457
3071	NC_015416	TGC	2	6	151983	151988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506457
3072	NC_015416	TAA	2	6	152009	152014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506457
3073	NC_015416	TCC	2	6	152186	152191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506457
3074	NC_015416	AAT	2	6	152212	152217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506457
3075	NC_015416	AAC	2	6	152237	152242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506457
3076	NC_015416	TCC	2	6	152255	152260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3077	NC_015416	ATC	2	6	152278	152283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_015416	ATA	2	6	152318	152323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_015416	A	6	6	152323	152328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015416	T	6	6	152352	152357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_015416	TCC	2	6	152369	152374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506458
3082	NC_015416	GTT	2	6	152431	152436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506458
3083	NC_015416	AGAT	2	8	152441	152448	50 %	25 %	25 %	0 %	330506458
3084	NC_015416	AGG	2	6	152468	152473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506458
3085	NC_015416	TCC	2	6	152500	152505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506458
3086	NC_015416	CCA	2	6	152547	152552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506458
3087	NC_015416	GA	3	6	152568	152573	50 %	0 %	50 %	0 %	330506458
3088	NC_015416	AGC	2	6	152589	152594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506458
3089	NC_015416	GAG	2	6	152719	152724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506458
3090	NC_015416	CTC	2	6	152725	152730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506458
3091	NC_015416	AT	3	6	152820	152825	50 %	50 %	0 %	0 %	330506458
3092	NC_015416	TG	3	6	152831	152836	0 %	50 %	50 %	0 %	330506458
3093	NC_015416	TCA	2	6	152888	152893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506458
3094	NC_015416	TCCA	2	8	152899	152906	25 %	25 %	0 %	50 %	330506458
3095	NC_015416	TTG	2	6	153090	153095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_015416	AT	3	6	153108	153113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_015416	GCTCGT	2	12	153130	153141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_015416	CAT	2	6	153220	153225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_015416	TTC	2	6	153269	153274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_015416	T	6	6	153340	153345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_015416	TC	4	8	153425	153432	0 %	50 %	0 %	50 %	330506459
3102	NC_015416	ATA	2	6	153516	153521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506459
3103	NC_015416	TCG	2	6	153523	153528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506459
3104	NC_015416	CTG	2	6	153591	153596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506459
3105	NC_015416	TGG	2	6	153627	153632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506459
3106	NC_015416	GC	3	6	153643	153648	0 %	0 %	50 %	50 %	330506459
3107	NC_015416	TCA	2	6	153674	153679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506459
3108	NC_015416	T	6	6	153748	153753	0 %	100 %	0 %	0 %	330506459
3109	NC_015416	TAC	2	6	153759	153764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506459
3110	NC_015416	ATAC	2	8	153778	153785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_015416	A	7	7	154016	154022	100 %	0 %	0 %	0 %	330506460
3112	NC_015416	CCAG	2	8	154056	154063	25 %	0 %	25 %	50 %	330506460
3113	NC_015416	TATC	2	8	154230	154237	25 %	50 %	0 %	25 %	330506460
3114	NC_015416	AG	3	6	154254	154259	50 %	0 %	50 %	0 %	330506460
3115	NC_015416	GCGA	2	8	154271	154278	25 %	0 %	50 %	25 %	330506460
3116	NC_015416	TCC	2	6	154305	154310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506460
3117	NC_015416	CCTC	2	8	154315	154322	0 %	25 %	0 %	75 %	330506460
3118	NC_015416	GACTC	2	10	154356	154365	20 %	20 %	20 %	40 %	330506460
3119	NC_015416	GC	3	6	154390	154395	0 %	0 %	50 %	50 %	330506460
3120	NC_015416	AG	3	6	154408	154413	50 %	0 %	50 %	0 %	330506460
3121	NC_015416	GGC	2	6	154453	154458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506460
3122	NC_015416	CCT	2	6	154474	154479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506460
3123	NC_015416	AGA	2	6	154495	154500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506460
3124	NC_015416	GCTCG	2	10	154523	154532	0 %	20 %	40 %	40 %	330506460
3125	NC_015416	CGC	2	6	154631	154636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506460
3126	NC_015416	GGGA	2	8	154694	154701	25 %	0 %	75 %	0 %	330506460
3127	NC_015416	TC	3	6	154731	154736	0 %	50 %	0 %	50 %	330506460
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3142	NC_015416	GATA	2	8	155297	155304	50 %	25 %	25 %	0 %	330506461
3143	NC_015416	CATC	2	8	155365	155372	25 %	25 %	0 %	50 %	330506461
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3152	NC_015416	GAG	2	6	155700	155705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506461
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3154	NC_015416	ATGC	2	8	155893	155900	25 %	25 %	25 %	25 %	330506461
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3163	NC_015416	GCCA	2	8	156266	156273	25 %	0 %	25 %	50 %	330506461
3164	NC_015416	GAA	2	6	156320	156325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506461
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3179	NC_015416	GATCG	2	10	157100	157109	20 %	20 %	40 %	20 %	330506462
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3182	NC_015416	ACC	2	6	157305	157310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506463
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3187	NC_015416	ATC	2	6	157544	157549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506463
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3190	NC_015416	AAT	2	6	157704	157709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3221	NC_015416	TAG	2	6	158856	158861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_015416	AGAATA	2	12	158874	158885	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3223	NC_015416	CGG	2	6	158900	158905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3224	NC_015416	CAGA	2	8	158981	158988	50 %	0 %	25 %	25 %	330506465
3225	NC_015416	CAT	2	6	159050	159055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506465
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3227	NC_015416	GAGAA	2	10	159120	159129	60 %	0 %	40 %	0 %	330506465
3228	NC_015416	GAG	2	6	159249	159254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506465
3229	NC_015416	TGG	2	6	159307	159312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506465
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3231	NC_015416	TGG	2	6	159364	159369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506465
3232	NC_015416	GGC	2	6	159372	159377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506465
3233	NC_015416	TGGTC	2	10	159407	159416	0 %	40 %	40 %	20 %	330506465
3234	NC_015416	AGG	2	6	159437	159442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506465
3235	NC_015416	ATA	2	6	159447	159452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506465
3236	NC_015416	GA	4	8	159457	159464	50 %	0 %	50 %	0 %	330506465
3237	NC_015416	CCT	2	6	159548	159553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506465
3238	NC_015416	AG	3	6	159692	159697	50 %	0 %	50 %	0 %	330506466
3239	NC_015416	TCAACC	2	12	159736	159747	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330506466
3240	NC_015416	CAG	2	6	159813	159818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3241	NC_015416	CATC	2	8	159830	159837	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3242	NC_015416	CTCA	2	8	159858	159865	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3243	NC_015416	GC	3	6	159898	159903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3244	NC_015416	CTC	2	6	159906	159911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3245	NC_015416	GGC	2	6	159916	159921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3246	NC_015416	TCC	2	6	159962	159967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3247	NC_015416	ATT	2	6	159993	159998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_015416	TTA	2	6	160169	160174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506467
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3250	NC_015416	AAG	2	6	160276	160281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506467
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3253	NC_015416	GAA	2	6	160318	160323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506467
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3263	NC_015416	CTA	2	6	160905	160910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506467
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3352	NC_015416	TGA	2	6	165330	165335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506469
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3355	NC_015416	G	6	6	165496	165501	0 %	0 %	100 %	0 %	330506469
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3361	NC_015416	AAG	2	6	165880	165885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506469
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3363	NC_015416	A	7	7	165919	165925	100 %	0 %	0 %	0 %	330506469
3364	NC_015416	AGGC	2	8	165964	165971	25 %	0 %	50 %	25 %	330506469
3365	NC_015416	TTTTG	2	10	165993	166002	0 %	80 %	20 %	0 %	330506469
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3368	NC_015416	AAGA	2	8	166140	166147	75 %	0 %	25 %	0 %	330506469
3369	NC_015416	AT	3	6	166270	166275	50 %	50 %	0 %	0 %	330506469
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3493	NC_015416	AAAT	2	8	172915	172922	75 %	25 %	0 %	0 %	330506476
3494	NC_015416	GA	3	6	172971	172976	50 %	0 %	50 %	0 %	330506476
3495	NC_015416	TCT	2	6	173014	173019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506476
3496	NC_015416	CCA	2	6	173034	173039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506476
3497	NC_015416	GAT	2	6	173075	173080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506476
3498	NC_015416	AT	3	6	173130	173135	50 %	50 %	0 %	0 %	330506476
3499	NC_015416	ACT	2	6	173162	173167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506476
3500	NC_015416	AAT	2	6	173218	173223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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