MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_015416	TTC	2	6	124212	124217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506426
2503	NC_015416	GA	3	6	124228	124233	50 %	0 %	50 %	0 %	330506426
2504	NC_015416	ACA	2	6	124234	124239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506426
2505	NC_015416	CGG	2	6	124256	124261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506426
2506	NC_015416	GAG	2	6	124301	124306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506426
2507	NC_015416	CCA	2	6	124355	124360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506426
2508	NC_015416	TGA	2	6	124429	124434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506426
2509	NC_015416	CCA	2	6	124535	124540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506426
2510	NC_015416	TC	3	6	124542	124547	0 %	50 %	0 %	50 %	330506426
2511	NC_015416	ACCA	2	8	124662	124669	50 %	0 %	0 %	50 %	330506426
2512	NC_015416	AGG	2	6	124734	124739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506426
2513	NC_015416	CT	3	6	124748	124753	0 %	50 %	0 %	50 %	330506426
2514	NC_015416	GGC	2	6	124787	124792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506426
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2516	NC_015416	AT	3	6	124920	124925	50 %	50 %	0 %	0 %	330506426
2517	NC_015416	TGA	2	6	124934	124939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506426
2518	NC_015416	CAA	2	6	125063	125068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506426
2519	NC_015416	ACT	2	6	125132	125137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506426
2520	NC_015416	GCT	2	6	125162	125167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_015416	AGA	2	6	125245	125250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506427
2522	NC_015416	CATG	2	8	125352	125359	25 %	25 %	25 %	25 %	330506427
2523	NC_015416	AT	3	6	125401	125406	50 %	50 %	0 %	0 %	330506427
2524	NC_015416	ACT	2	6	125420	125425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506427
2525	NC_015416	ATG	2	6	125525	125530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506427
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2527	NC_015416	A	8	8	125601	125608	100 %	0 %	0 %	0 %	330506427
2528	NC_015416	GAC	2	6	125632	125637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506427
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2532	NC_015416	GCT	2	6	125717	125722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506427
2533	NC_015416	GAG	2	6	125743	125748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506427
2534	NC_015416	ACTCT	2	10	125775	125784	20 %	40 %	0 %	40 %	330506427
2535	NC_015416	TGG	2	6	125833	125838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506427
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2537	NC_015416	CTG	2	6	125860	125865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506427
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2539	NC_015416	TGC	2	6	125979	125984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506427
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2541	NC_015416	ATGA	2	8	126070	126077	50 %	25 %	25 %	0 %	330506427
2542	NC_015416	GAA	2	6	126084	126089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506427
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2544	NC_015416	CAT	3	9	126147	126155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506427
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2546	NC_015416	TCCGGC	2	12	126194	126205	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330506427
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2550	NC_015416	GAA	2	6	126250	126255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506427
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2555	NC_015416	CGAT	2	8	126469	126476	25 %	25 %	25 %	25 %	330506428
2556	NC_015416	GAC	2	6	126485	126490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506428
2557	NC_015416	TCT	2	6	126522	126527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506428
2558	NC_015416	CCT	2	6	126582	126587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506428
2559	NC_015416	GGA	2	6	126604	126609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506428
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2561	NC_015416	TGG	2	6	126849	126854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506428
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2563	NC_015416	G	7	7	126964	126970	0 %	0 %	100 %	0 %	330506428
2564	NC_015416	GA	4	8	126985	126992	50 %	0 %	50 %	0 %	330506428
2565	NC_015416	GA	3	6	127128	127133	50 %	0 %	50 %	0 %	330506428
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2574	NC_015416	ATC	2	6	127493	127498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506428
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2582	NC_015416	AG	3	6	128073	128078	50 %	0 %	50 %	0 %	330506429
2583	NC_015416	GAT	2	6	128194	128199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506429
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2587	NC_015416	TGA	2	6	128526	128531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506429
2588	NC_015416	TA	3	6	128669	128674	50 %	50 %	0 %	0 %	330506429
2589	NC_015416	CAG	2	6	128714	128719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506430
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2593	NC_015416	CTG	2	6	128846	128851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506430
2594	NC_015416	ACGG	2	8	128966	128973	25 %	0 %	50 %	25 %	330506430
2595	NC_015416	TGG	2	6	129300	129305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506431
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2604	NC_015416	CCGA	2	8	129722	129729	25 %	0 %	25 %	50 %	330506432
2605	NC_015416	ATG	2	6	129796	129801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506432
2606	NC_015416	CGGC	2	8	129980	129987	0 %	0 %	50 %	50 %	330506432
2607	NC_015416	TGG	2	6	129999	130004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506432
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2609	NC_015416	TGA	2	6	130014	130019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506432
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2615	NC_015416	CATGG	2	10	130228	130237	20 %	20 %	40 %	20 %	330506432
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2619	NC_015416	C	6	6	130460	130465	0 %	0 %	0 %	100 %	330506432
2620	NC_015416	CAA	2	6	130705	130710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_015416	TGCC	2	8	130737	130744	0 %	25 %	25 %	50 %	330506433
2622	NC_015416	TCT	2	6	130866	130871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506433
2623	NC_015416	GCC	2	6	130903	130908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506433
2624	NC_015416	GCCTTT	2	12	131055	131066	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	330506433
2625	NC_015416	GGTG	2	8	131073	131080	0 %	25 %	75 %	0 %	330506433
2626	NC_015416	AG	3	6	131082	131087	50 %	0 %	50 %	0 %	330506433
2627	NC_015416	GACCC	2	10	131149	131158	20 %	0 %	20 %	60 %	330506434
2628	NC_015416	GCT	2	6	131164	131169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506434
2629	NC_015416	GCT	2	6	131194	131199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506434
2630	NC_015416	T	6	6	131203	131208	0 %	100 %	0 %	0 %	330506434
2631	NC_015416	AGA	2	6	131222	131227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506434
2632	NC_015416	GC	3	6	131229	131234	0 %	0 %	50 %	50 %	330506434
2633	NC_015416	GCAA	2	8	131249	131256	50 %	0 %	25 %	25 %	330506434
2634	NC_015416	T	6	6	131275	131280	0 %	100 %	0 %	0 %	330506434
2635	NC_015416	TTA	2	6	131493	131498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506434
2636	NC_015416	CT	3	6	131527	131532	0 %	50 %	0 %	50 %	330506435
2637	NC_015416	AT	3	6	131543	131548	50 %	50 %	0 %	0 %	330506435
2638	NC_015416	TAT	3	9	131546	131554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506435
2639	NC_015416	TC	3	6	131580	131585	0 %	50 %	0 %	50 %	330506435
2640	NC_015416	GCTGC	2	10	131589	131598	0 %	20 %	40 %	40 %	330506435
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2642	NC_015416	TGGC	2	8	131710	131717	0 %	25 %	50 %	25 %	330506435
2643	NC_015416	ACTGG	2	10	131807	131816	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2644	NC_015416	GGC	2	6	131908	131913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2645	NC_015416	GGT	2	6	131986	131991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2646	NC_015416	GACC	2	8	132001	132008	25 %	0 %	25 %	50 %	330506436
2647	NC_015416	CTTCCA	2	12	132010	132021	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	330506436
2648	NC_015416	GCC	2	6	132077	132082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506436
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2650	NC_015416	GCAT	2	8	132150	132157	25 %	25 %	25 %	25 %	330506436
2651	NC_015416	CAGC	2	8	132193	132200	25 %	0 %	25 %	50 %	330506436
2652	NC_015416	CTG	2	6	132247	132252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506436
2653	NC_015416	T	6	6	132321	132326	0 %	100 %	0 %	0 %	330506437
2654	NC_015416	TC	3	6	132420	132425	0 %	50 %	0 %	50 %	330506437
2655	NC_015416	CTTC	2	8	132434	132441	0 %	50 %	0 %	50 %	330506437
2656	NC_015416	TCC	2	6	132450	132455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2657	NC_015416	GCC	2	6	132533	132538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506438
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2661	NC_015416	T	6	6	132865	132870	0 %	100 %	0 %	0 %	330506438
2662	NC_015416	GGC	2	6	132962	132967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506438
2663	NC_015416	CAC	2	6	133034	133039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506438
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2665	NC_015416	CTCC	2	8	133113	133120	0 %	25 %	0 %	75 %	330506438
2666	NC_015416	GTAGG	2	10	133220	133229	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2667	NC_015416	GATA	2	8	133314	133321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2668	NC_015416	ATA	3	9	133319	133327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2669	NC_015416	AG	3	6	133362	133367	50 %	0 %	50 %	0 %	330506439
2670	NC_015416	C	6	6	133375	133380	0 %	0 %	0 %	100 %	330506439
2671	NC_015416	GCTG	2	8	133382	133389	0 %	25 %	50 %	25 %	330506439
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2680	NC_015416	CTG	2	6	133672	133677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506439
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2690	NC_015416	ATC	2	6	134190	134195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506440
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2694	NC_015416	GGC	2	6	134321	134326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506440
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2700	NC_015416	C	6	6	134629	134634	0 %	0 %	0 %	100 %	330506440
2701	NC_015416	TGG	2	6	134641	134646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506440
2702	NC_015416	GCT	2	6	134669	134674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506440
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2706	NC_015416	ATC	2	6	134721	134726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506440
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2708	NC_015416	GAC	2	6	134898	134903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506440
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2710	NC_015416	AT	3	6	135021	135026	50 %	50 %	0 %	0 %	330506440
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2712	NC_015416	CTT	2	6	135068	135073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506440
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2714	NC_015416	ATC	2	6	135327	135332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506440
2715	NC_015416	TGA	2	6	135367	135372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506440
2716	NC_015416	GAG	2	6	135417	135422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506440
2717	NC_015416	GA	3	6	135444	135449	50 %	0 %	50 %	0 %	330506440
2718	NC_015416	ATG	2	6	135607	135612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2719	NC_015416	GGT	2	6	135745	135750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506441
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2721	NC_015416	GGCG	2	8	135861	135868	0 %	0 %	75 %	25 %	330506441
2722	NC_015416	GGC	2	6	135952	135957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506441
2723	NC_015416	GGGAG	2	10	135982	135991	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2724	NC_015416	ACGC	2	8	136039	136046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2725	NC_015416	GA	3	6	136047	136052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2726	NC_015416	CAG	2	6	136063	136068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2727	NC_015416	CGA	2	6	136070	136075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2728	NC_015416	AAT	2	6	136109	136114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506442
2729	NC_015416	TGA	2	6	136213	136218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506442
2730	NC_015416	CAG	2	6	136229	136234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506442
2731	NC_015416	GGA	2	6	136319	136324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506442
2732	NC_015416	GAA	2	6	136362	136367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506442
2733	NC_015416	T	6	6	136368	136373	0 %	100 %	0 %	0 %	330506442
2734	NC_015416	AGGGG	2	10	136382	136391	20 %	0 %	80 %	0 %	330506442
2735	NC_015416	GGC	2	6	136415	136420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506442
2736	NC_015416	CCG	2	6	136444	136449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506442
2737	NC_015416	GA	3	6	136451	136456	50 %	0 %	50 %	0 %	330506442
2738	NC_015416	CTC	2	6	136496	136501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506442
2739	NC_015416	GAT	2	6	136527	136532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506442
2740	NC_015416	A	6	6	136535	136540	100 %	0 %	0 %	0 %	330506442
2741	NC_015416	GAT	2	6	136602	136607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506442
2742	NC_015416	A	6	6	136610	136615	100 %	0 %	0 %	0 %	330506442
2743	NC_015416	GAT	2	6	136677	136682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506442
2744	NC_015416	A	6	6	136685	136690	100 %	0 %	0 %	0 %	330506442
2745	NC_015416	CTC	2	6	136721	136726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506442
2746	NC_015416	ATC	2	6	136758	136763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506442
2747	NC_015416	GATAG	2	10	136764	136773	40 %	20 %	40 %	0 %	330506442
2748	NC_015416	GAG	2	6	136785	136790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506442
2749	NC_015416	GAG	2	6	136839	136844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506442
2750	NC_015416	ATC	3	9	136932	136940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2751	NC_015416	CAG	2	6	136974	136979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506443
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2753	NC_015416	AG	3	6	137049	137054	50 %	0 %	50 %	0 %	330506443
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2824	NC_015416	CAG	2	6	140889	140894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2828	NC_015416	ATT	2	6	141086	141091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2832	NC_015416	TA	3	6	141157	141162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2833	NC_015416	AAC	2	6	141171	141176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2834	NC_015416	ATA	2	6	141183	141188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2859	NC_015416	TTG	2	6	142288	142293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506447
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2865	NC_015416	CGG	3	9	142430	142438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506447
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2868	NC_015416	ATG	2	6	142668	142673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506447
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2993	NC_015416	A	6	6	148690	148695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_015416	A	6	6	148702	148707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2995	NC_015416	TCA	2	6	148724	148729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2996	NC_015416	ATCA	2	8	148752	148759	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2997	NC_015416	CTT	2	6	148764	148769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2998	NC_015416	GA	3	6	148826	148831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2999	NC_015416	A	8	8	148847	148854	100 %	0 %	0 %	0 %	330506454
3000	NC_015416	AAG	2	6	148859	148864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506454

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