MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_015416	ACAA	2	8	1038017	1038024	75 %	0 %	0 %	25 %	330507315
21002	NC_015416	CCGC	2	8	1038028	1038035	0 %	0 %	25 %	75 %	330507315
21003	NC_015416	CGGG	2	8	1038036	1038043	0 %	0 %	75 %	25 %	330507315
21004	NC_015416	TAATT	2	10	1038057	1038066	40 %	60 %	0 %	0 %	330507315
21005	NC_015416	AAT	2	6	1038093	1038098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21006	NC_015416	TGAA	2	8	1038114	1038121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21007	NC_015416	CCT	2	6	1038171	1038176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21008	NC_015416	TCA	2	6	1038185	1038190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21009	NC_015416	ATT	2	6	1038201	1038206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21010	NC_015416	C	8	8	1038229	1038236	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21011	NC_015416	TCG	2	6	1038416	1038421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21012	NC_015416	GGT	2	6	1038465	1038470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21013	NC_015416	CGA	2	6	1038560	1038565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507316
21014	NC_015416	GCGG	2	8	1038621	1038628	0 %	0 %	75 %	25 %	330507316
21015	NC_015416	AGCC	2	8	1038633	1038640	25 %	0 %	25 %	50 %	330507316
21016	NC_015416	TGA	2	6	1038654	1038659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507316
21017	NC_015416	GA	3	6	1038719	1038724	50 %	0 %	50 %	0 %	330507316
21018	NC_015416	TCAT	2	8	1038749	1038756	25 %	50 %	0 %	25 %	330507316
21019	NC_015416	GAAA	2	8	1038824	1038831	75 %	0 %	25 %	0 %	330507316
21020	NC_015416	GCA	2	6	1038850	1038855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507316
21021	NC_015416	GTC	2	6	1038904	1038909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507316
21022	NC_015416	GAG	2	6	1038970	1038975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507316
21023	NC_015416	GTG	2	6	1038976	1038981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507316
21024	NC_015416	GGA	2	6	1039019	1039024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507316
21025	NC_015416	T	7	7	1039067	1039073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21026	NC_015416	TCA	2	6	1039077	1039082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21027	NC_015416	AATA	2	8	1039090	1039097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21028	NC_015416	TA	3	6	1039096	1039101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21029	NC_015416	GAG	2	6	1039257	1039262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507317
21030	NC_015416	AAG	2	6	1039270	1039275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507317
21031	NC_015416	GGC	2	6	1039284	1039289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330507317
21032	NC_015416	GAGC	2	8	1039305	1039312	25 %	0 %	50 %	25 %	330507317
21033	NC_015416	GGT	2	6	1039338	1039343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507317
21034	NC_015416	GA	3	6	1039356	1039361	50 %	0 %	50 %	0 %	330507317
21035	NC_015416	TCT	2	6	1039379	1039384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507317
21036	NC_015416	GCCT	2	8	1039419	1039426	0 %	25 %	25 %	50 %	330507317
21037	NC_015416	TGC	3	9	1039428	1039436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507317
21038	NC_015416	GCTGT	2	10	1039439	1039448	0 %	40 %	40 %	20 %	330507317
21039	NC_015416	TGG	2	6	1039475	1039480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507317
21040	NC_015416	ATA	2	6	1039528	1039533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507317
21041	NC_015416	GGGA	2	8	1039559	1039566	25 %	0 %	75 %	0 %	330507317
21042	NC_015416	CAC	2	6	1039572	1039577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507317
21043	NC_015416	CAT	2	6	1039596	1039601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507317
21044	NC_015416	TGA	2	6	1039625	1039630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507317
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21046	NC_015416	CCAT	2	8	1039699	1039706	25 %	25 %	0 %	50 %	330507317
21047	NC_015416	CGG	2	6	1039737	1039742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330507317
21048	NC_015416	GGA	3	9	1039743	1039751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507317
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21051	NC_015416	GA	3	6	1039890	1039895	50 %	0 %	50 %	0 %	330507317
21052	NC_015416	ACCCC	2	10	1039898	1039907	20 %	0 %	0 %	80 %	330507317
21053	NC_015416	AGA	2	6	1039908	1039913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507317
21054	NC_015416	GAT	2	6	1039951	1039956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507317
21055	NC_015416	AAG	2	6	1039972	1039977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507317
21056	NC_015416	CCCAG	2	10	1040009	1040018	20 %	0 %	20 %	60 %	330507317
21057	NC_015416	AGC	2	6	1040115	1040120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507317
21058	NC_015416	AAAG	2	8	1040154	1040161	75 %	0 %	25 %	0 %	330507317
21059	NC_015416	GGC	2	6	1040176	1040181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21060	NC_015416	ATA	2	6	1040218	1040223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507318
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21063	NC_015416	CTG	2	6	1040386	1040391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507318
21064	NC_015416	ATC	2	6	1040410	1040415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507318
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21069	NC_015416	GAG	2	6	1040755	1040760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507318
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21073	NC_015416	GAA	2	6	1040871	1040876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507318
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21089	NC_015416	GAG	2	6	1041516	1041521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507319
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21092	NC_015416	AGG	2	6	1041634	1041639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507319
21093	NC_015416	AAT	2	6	1041640	1041645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507319
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21097	NC_015416	GA	4	8	1041830	1041837	50 %	0 %	50 %	0 %	330507320
21098	NC_015416	GATG	2	8	1041855	1041862	25 %	25 %	50 %	0 %	330507320
21099	NC_015416	CAA	2	6	1041898	1041903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330507320
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21101	NC_015416	GAG	2	6	1042083	1042088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21102	NC_015416	ATT	2	6	1042140	1042145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21103	NC_015416	A	6	6	1042148	1042153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21104	NC_015416	TCT	2	6	1042160	1042165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21105	NC_015416	AGG	2	6	1042179	1042184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21108	NC_015416	CAT	2	6	1042497	1042502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507321
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21110	NC_015416	CCT	2	6	1042682	1042687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507321
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21113	NC_015416	AG	3	6	1042772	1042777	50 %	0 %	50 %	0 %	330507321
21114	NC_015416	TGA	2	6	1042787	1042792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507321
21115	NC_015416	TGA	2	6	1042856	1042861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507321
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21119	NC_015416	TGA	2	6	1043027	1043032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507321
21120	NC_015416	GAT	2	6	1043034	1043039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507321
21121	NC_015416	AT	3	6	1043045	1043050	50 %	50 %	0 %	0 %	330507321
21122	NC_015416	GCA	2	6	1043115	1043120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507321
21123	NC_015416	TGATC	2	10	1043145	1043154	20 %	40 %	20 %	20 %	330507321
21124	NC_015416	GAG	2	6	1043155	1043160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507321
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21126	NC_015416	AT	3	6	1043226	1043231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21127	NC_015416	AAT	2	6	1043234	1043239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21128	NC_015416	AT	4	8	1043251	1043258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21129	NC_015416	CAG	2	6	1043267	1043272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21130	NC_015416	GAT	2	6	1043285	1043290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21131	NC_015416	TGC	2	6	1043381	1043386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21132	NC_015416	AATT	2	8	1043400	1043407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21133	NC_015416	TAT	3	9	1043439	1043447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21134	NC_015416	TGG	2	6	1043474	1043479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507322
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21136	NC_015416	GAG	2	6	1043512	1043517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507322
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21157	NC_015416	AG	3	6	1044352	1044357	50 %	0 %	50 %	0 %	330507322
21158	NC_015416	AGG	2	6	1044383	1044388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507322
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21160	NC_015416	ATA	3	9	1044462	1044470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507323
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21165	NC_015416	AG	3	6	1044722	1044727	50 %	0 %	50 %	0 %	330507323
21166	NC_015416	AG	3	6	1044735	1044740	50 %	0 %	50 %	0 %	330507323
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21183	NC_015416	AT	3	6	1045546	1045551	50 %	50 %	0 %	0 %	330507324
21184	NC_015416	AAG	2	6	1045589	1045594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507324
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21188	NC_015416	TGA	2	6	1045911	1045916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507324
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21203	NC_015416	TTTA	2	8	1046267	1046274	25 %	75 %	0 %	0 %	330507324
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21214	NC_015416	TAA	2	6	1046722	1046727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507324
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21219	NC_015416	TGA	2	6	1046866	1046871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507324
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21221	NC_015416	GA	3	6	1046899	1046904	50 %	0 %	50 %	0 %	330507324
21222	NC_015416	AT	3	6	1046946	1046951	50 %	50 %	0 %	0 %	330507324
21223	NC_015416	AT	3	6	1047000	1047005	50 %	50 %	0 %	0 %	330507324
21224	NC_015416	A	7	7	1047017	1047023	100 %	0 %	0 %	0 %	330507324
21225	NC_015416	ATG	2	6	1047236	1047241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21226	NC_015416	TA	3	6	1047270	1047275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21227	NC_015416	A	6	6	1047319	1047324	100 %	0 %	0 %	0 %	330507325
21228	NC_015416	ATCCC	2	10	1047452	1047461	20 %	20 %	0 %	60 %	330507325
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21230	NC_015416	AT	3	6	1047583	1047588	50 %	50 %	0 %	0 %	330507325
21231	NC_015416	GTC	2	6	1047671	1047676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507325
21232	NC_015416	TCC	2	6	1047683	1047688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507325
21233	NC_015416	CGA	2	6	1047724	1047729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507325
21234	NC_015416	ATAC	2	8	1047846	1047853	50 %	25 %	0 %	25 %	330507325
21235	NC_015416	AGA	2	6	1047915	1047920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507325
21236	NC_015416	TCA	2	6	1048079	1048084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507325
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21238	NC_015416	A	7	7	1048259	1048265	100 %	0 %	0 %	0 %	330507325
21239	NC_015416	TGGGC	2	10	1048320	1048329	0 %	20 %	60 %	20 %	330507326
21240	NC_015416	TAC	2	6	1048347	1048352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507326
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21242	NC_015416	GCA	2	6	1048496	1048501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507326
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21250	NC_015416	AT	3	6	1048827	1048832	50 %	50 %	0 %	0 %	330507326
21251	NC_015416	TGA	2	6	1048865	1048870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507326
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21272	NC_015416	A	6	6	1049715	1049720	100 %	0 %	0 %	0 %	330507327
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21302	NC_015416	CATT	2	8	1050947	1050954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21303	NC_015416	ATG	2	6	1050958	1050963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21305	NC_015416	CCT	2	6	1051058	1051063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507330
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21321	NC_015416	GGAA	2	8	1051881	1051888	50 %	0 %	50 %	0 %	330507330
21322	NC_015416	AG	3	6	1051893	1051898	50 %	0 %	50 %	0 %	330507330
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21327	NC_015416	AAT	2	6	1052238	1052243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21328	NC_015416	TTAG	2	8	1052261	1052268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21329	NC_015416	TG	3	6	1052288	1052293	0 %	50 %	50 %	0 %	330507331
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21343	NC_015416	T	7	7	1052741	1052747	0 %	100 %	0 %	0 %	330507331
21344	NC_015416	TTC	2	6	1052751	1052756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507331
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21348	NC_015416	CTTT	2	8	1052858	1052865	0 %	75 %	0 %	25 %	330507331
21349	NC_015416	AGA	2	6	1052876	1052881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507331
21350	NC_015416	GCT	2	6	1052891	1052896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507331
21351	NC_015416	TATAA	2	10	1052944	1052953	60 %	40 %	0 %	0 %	330507331
21352	NC_015416	GA	3	6	1052962	1052967	50 %	0 %	50 %	0 %	330507331
21353	NC_015416	GAG	2	6	1052983	1052988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507331
21354	NC_015416	TGG	2	6	1053014	1053019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507331
21355	NC_015416	GA	4	8	1053157	1053164	50 %	0 %	50 %	0 %	330507331
21356	NC_015416	AGA	2	6	1053194	1053199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507331
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21358	NC_015416	ATT	2	6	1053262	1053267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330507331
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21478	NC_015416	TTC	2	6	1058297	1058302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507334
21479	NC_015416	AGG	2	6	1058313	1058318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507334
21480	NC_015416	ATC	2	6	1058323	1058328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507334
21481	NC_015416	GAC	2	6	1058362	1058367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507334
21482	NC_015416	TCT	2	6	1058384	1058389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507334
21483	NC_015416	CCA	2	6	1058469	1058474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507335
21484	NC_015416	AG	3	6	1058539	1058544	50 %	0 %	50 %	0 %	330507335
21485	NC_015416	GAC	2	6	1058627	1058632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507335
21486	NC_015416	CTC	2	6	1058715	1058720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507335
21487	NC_015416	AGA	2	6	1058788	1058793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507335
21488	NC_015416	GCA	2	6	1058801	1058806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507335
21489	NC_015416	TCC	2	6	1058863	1058868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507335
21490	NC_015416	TCT	2	6	1058916	1058921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507335
21491	NC_015416	TCC	2	6	1058954	1058959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507335
21492	NC_015416	GCCA	2	8	1058960	1058967	25 %	0 %	25 %	50 %	330507335
21493	NC_015416	TCC	2	6	1058978	1058983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507335
21494	NC_015416	CAG	3	9	1059013	1059021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507335
21495	NC_015416	CAT	2	6	1059078	1059083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507335
21496	NC_015416	TC	3	6	1059166	1059171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21497	NC_015416	AAT	2	6	1059203	1059208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21498	NC_015416	T	7	7	1059219	1059225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21499	NC_015416	AAG	2	6	1059236	1059241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21500	NC_015416	CCT	2	6	1059347	1059352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507336

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