MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015416	CAGG	2	8	938232	938239	25 %	0 %	50 %	25 %	330507221
19002	NC_015416	TCCT	2	8	938296	938303	0 %	50 %	0 %	50 %	330507221
19003	NC_015416	CTC	2	6	938322	938327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507221
19004	NC_015416	TCT	2	6	938351	938356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507221
19005	NC_015416	GGC	2	6	938420	938425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19006	NC_015416	CCT	2	6	938454	938459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19007	NC_015416	GAA	2	6	938466	938471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19008	NC_015416	AGG	2	6	938494	938499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19009	NC_015416	AGG	2	6	938597	938602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19010	NC_015416	GGGA	2	8	938624	938631	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_015416	CGA	2	6	938673	938678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19012	NC_015416	GA	3	6	938726	938731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19013	NC_015416	AGG	2	6	938737	938742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_015416	G	6	6	938741	938746	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_015416	AGG	2	6	938763	938768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_015416	ATA	2	6	938794	938799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_015416	ATC	2	6	938805	938810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19018	NC_015416	TA	3	6	938815	938820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19019	NC_015416	TCC	2	6	938902	938907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19020	NC_015416	CAT	2	6	938918	938923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19021	NC_015416	AT	3	6	938922	938927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19022	NC_015416	TAAA	2	8	938964	938971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19023	NC_015416	AC	3	6	939014	939019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19024	NC_015416	CAAT	2	8	939091	939098	50 %	25 %	0 %	25 %	330507222
19025	NC_015416	TCC	2	6	939117	939122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507222
19026	NC_015416	TC	3	6	939127	939132	0 %	50 %	0 %	50 %	330507222
19027	NC_015416	ATTCC	2	10	939219	939228	20 %	40 %	0 %	40 %	330507222
19028	NC_015416	ATC	2	6	939349	939354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19029	NC_015416	CGA	2	6	939431	939436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19030	NC_015416	GAA	2	6	939481	939486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_015416	GCA	2	6	939561	939566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19032	NC_015416	GGT	3	9	939601	939609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_015416	CAG	2	6	939612	939617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19034	NC_015416	GA	4	8	939625	939632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_015416	T	6	6	939728	939733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19036	NC_015416	TGAGA	3	15	939786	939800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_015416	CAT	2	6	939816	939821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19038	NC_015416	T	6	6	939853	939858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_015416	ATT	2	6	939904	939909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_015416	AGG	2	6	939911	939916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19041	NC_015416	ATG	2	6	939947	939952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507223
19042	NC_015416	GCA	2	6	940016	940021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507223
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19044	NC_015416	GGA	2	6	940087	940092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507223
19045	NC_015416	CAAT	2	8	940115	940122	50 %	25 %	0 %	25 %	330507223
19046	NC_015416	GGAG	2	8	940126	940133	25 %	0 %	75 %	0 %	330507223
19047	NC_015416	CCGG	2	8	940191	940198	0 %	0 %	50 %	50 %	330507223
19048	NC_015416	CGG	2	6	940230	940235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330507223
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19050	NC_015416	TGGA	2	8	940315	940322	25 %	25 %	50 %	0 %	330507223
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19054	NC_015416	GAG	2	6	940459	940464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507223
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19056	NC_015416	CAT	2	6	940590	940595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507223
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19059	NC_015416	GCA	2	6	940661	940666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507223
19060	NC_015416	AGGTGG	2	12	940679	940690	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	330507223
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19064	NC_015416	CGC	2	6	940785	940790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330507223
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19067	NC_015416	TGG	2	6	940880	940885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507223
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19072	NC_015416	CGG	2	6	941124	941129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330507223
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19075	NC_015416	GGAA	2	8	941227	941234	50 %	0 %	50 %	0 %	330507223
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19080	NC_015416	AAG	2	6	941533	941538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507223
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19082	NC_015416	AGC	2	6	941648	941653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507223
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19088	NC_015416	CCG	2	6	941948	941953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330507224
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19090	NC_015416	CCGC	2	8	942010	942017	0 %	0 %	25 %	75 %	330507224
19091	NC_015416	GTG	2	6	942018	942023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507224
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19095	NC_015416	GAG	2	6	942207	942212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507224
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19097	NC_015416	GCTC	2	8	942265	942272	0 %	25 %	25 %	50 %	330507224
19098	NC_015416	ATC	2	6	942393	942398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507224
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19102	NC_015416	CGGG	2	8	942489	942496	0 %	0 %	75 %	25 %	330507224
19103	NC_015416	GAG	2	6	942558	942563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507224
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19107	NC_015416	CAA	2	6	942803	942808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330507224
19108	NC_015416	TGG	2	6	942817	942822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507224
19109	NC_015416	CT	3	6	942840	942845	0 %	50 %	0 %	50 %	330507224
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19114	NC_015416	TCTCC	2	10	943049	943058	0 %	40 %	0 %	60 %	330507224
19115	NC_015416	GAG	2	6	943059	943064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507224
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19123	NC_015416	G	6	6	943399	943404	0 %	0 %	100 %	0 %	330507224
19124	NC_015416	CCA	2	6	943459	943464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507224
19125	NC_015416	CTT	2	6	943478	943483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507224
19126	NC_015416	AGGG	2	8	943705	943712	25 %	0 %	75 %	0 %	330507224
19127	NC_015416	TGG	2	6	943783	943788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507224
19128	NC_015416	CCA	2	6	943789	943794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507224
19129	NC_015416	CGA	2	6	943886	943891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507224
19130	NC_015416	GGCTCA	2	12	943920	943931	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330507224
19131	NC_015416	GAG	2	6	943980	943985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507224
19132	NC_015416	CAG	2	6	943992	943997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507224
19133	NC_015416	G	7	7	944002	944008	0 %	0 %	100 %	0 %	330507224
19134	NC_015416	CTG	2	6	944048	944053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507224
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19137	NC_015416	ATT	2	6	944081	944086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330507224
19138	NC_015416	CAC	2	6	944090	944095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507224
19139	NC_015416	GGC	2	6	944198	944203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330507224
19140	NC_015416	CGG	2	6	944232	944237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19141	NC_015416	AG	3	6	944238	944243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19142	NC_015416	GCT	2	6	944269	944274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19143	NC_015416	GCT	2	6	944325	944330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19144	NC_015416	AGA	2	6	944331	944336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19145	NC_015416	GCT	2	6	944474	944479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19146	NC_015416	TTCGCC	2	12	944519	944530	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19147	NC_015416	ATC	2	6	944648	944653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19149	NC_015416	ACG	2	6	944677	944682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507225
19150	NC_015416	TGT	2	6	944775	944780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507225
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19154	NC_015416	CTG	2	6	945119	945124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507225
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19159	NC_015416	CTG	2	6	945425	945430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507225
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19161	NC_015416	ACCG	2	8	945482	945489	25 %	0 %	25 %	50 %	330507225
19162	NC_015416	GCCA	2	8	945504	945511	25 %	0 %	25 %	50 %	330507225
19163	NC_015416	ATGTT	2	10	945598	945607	20 %	60 %	20 %	0 %	330507225
19164	NC_015416	AGA	2	6	945629	945634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507225
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19167	NC_015416	TAGC	2	8	945878	945885	25 %	25 %	25 %	25 %	330507225
19168	NC_015416	TCT	2	6	945951	945956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507225
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19173	NC_015416	TTCA	2	8	946191	946198	25 %	50 %	0 %	25 %	330507225
19174	NC_015416	GAT	2	6	946262	946267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507225
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19177	NC_015416	CCT	2	6	946392	946397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507225
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19181	NC_015416	TCG	2	6	946662	946667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507225
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19186	NC_015416	AAT	2	6	946851	946856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507225
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19225	NC_015416	TAA	2	6	949035	949040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19227	NC_015416	CAG	2	6	949139	949144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19228	NC_015416	TGGA	2	8	949147	949154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19229	NC_015416	ACT	2	6	949197	949202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507227
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19231	NC_015416	ATC	2	6	949340	949345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507227
19232	NC_015416	ATTG	2	8	949346	949353	25 %	50 %	25 %	0 %	330507227
19233	NC_015416	GAT	2	6	949530	949535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507227
19234	NC_015416	AAAG	2	8	949595	949602	75 %	0 %	25 %	0 %	330507227
19235	NC_015416	AT	3	6	949612	949617	50 %	50 %	0 %	0 %	330507227
19236	NC_015416	CT	3	6	949667	949672	0 %	50 %	0 %	50 %	330507228
19237	NC_015416	GTA	2	6	949696	949701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507228
19238	NC_015416	GA	3	6	949706	949711	50 %	0 %	50 %	0 %	330507228
19239	NC_015416	TA	3	6	949853	949858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19240	NC_015416	TCT	2	6	949880	949885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19241	NC_015416	CTG	2	6	949899	949904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19242	NC_015416	CTCC	2	8	950208	950215	0 %	25 %	0 %	75 %	330507229
19243	NC_015416	GC	3	6	950324	950329	0 %	0 %	50 %	50 %	330507229
19244	NC_015416	GCT	2	6	950366	950371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507229
19245	NC_015416	GAC	2	6	950432	950437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507229
19246	NC_015416	CTC	2	6	950449	950454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507229
19247	NC_015416	CGG	2	6	950514	950519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330507229
19248	NC_015416	AGG	2	6	950526	950531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507229
19249	NC_015416	GGA	2	6	950566	950571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507229
19250	NC_015416	CAC	3	9	950596	950604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507229
19251	NC_015416	GAA	2	6	950656	950661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507229
19252	NC_015416	GTTC	2	8	950692	950699	0 %	50 %	25 %	25 %	330507229
19253	NC_015416	GGCC	2	8	950714	950721	0 %	0 %	50 %	50 %	330507229
19254	NC_015416	AG	3	6	950730	950735	50 %	0 %	50 %	0 %	330507229
19255	NC_015416	AG	3	6	950740	950745	50 %	0 %	50 %	0 %	330507229
19256	NC_015416	CT	3	6	950765	950770	0 %	50 %	0 %	50 %	330507229
19257	NC_015416	ATC	2	6	950819	950824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507229
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19259	NC_015416	GCT	2	6	950947	950952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507229
19260	NC_015416	GGT	2	6	950953	950958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507229
19261	NC_015416	AGA	2	6	950980	950985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507229
19262	NC_015416	GA	3	6	951019	951024	50 %	0 %	50 %	0 %	330507229
19263	NC_015416	TCCAG	2	10	951066	951075	20 %	20 %	20 %	40 %	330507229
19264	NC_015416	GATG	2	8	951082	951089	25 %	25 %	50 %	0 %	330507229
19265	NC_015416	GAG	2	6	951090	951095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507229
19266	NC_015416	GAA	2	6	951110	951115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507229
19267	NC_015416	CTT	2	6	951131	951136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507229
19268	NC_015416	CGCC	2	8	951143	951150	0 %	0 %	25 %	75 %	330507229
19269	NC_015416	TGG	2	6	951210	951215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507229
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19271	NC_015416	GGT	2	6	951343	951348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507229
19272	NC_015416	CTT	2	6	951370	951375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507229
19273	NC_015416	AAT	2	6	951430	951435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507229
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19276	NC_015416	GGC	2	6	951503	951508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330507229
19277	NC_015416	AG	3	6	951602	951607	50 %	0 %	50 %	0 %	330507229
19278	NC_015416	GGC	2	6	951625	951630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330507229
19279	NC_015416	CT	3	6	951640	951645	0 %	50 %	0 %	50 %	330507229
19280	NC_015416	GAG	2	6	951679	951684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507229
19281	NC_015416	GGA	2	6	951715	951720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507229
19282	NC_015416	CT	3	6	951743	951748	0 %	50 %	0 %	50 %	330507229
19283	NC_015416	TGA	2	6	951783	951788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507229
19284	NC_015416	ATCA	2	8	951791	951798	50 %	25 %	0 %	25 %	330507229
19285	NC_015416	CTGCC	2	10	951835	951844	0 %	20 %	20 %	60 %	330507229
19286	NC_015416	GGGA	2	8	951861	951868	25 %	0 %	75 %	0 %	330507229
19287	NC_015416	ATG	2	6	951904	951909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507230
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19289	NC_015416	GA	3	6	951925	951930	50 %	0 %	50 %	0 %	330507230
19290	NC_015416	TCG	2	6	951980	951985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507230
19291	NC_015416	CTG	2	6	952006	952011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507230
19292	NC_015416	GAT	2	6	952038	952043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507230
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19294	NC_015416	CCGG	2	8	952218	952225	0 %	0 %	50 %	50 %	330507230
19295	NC_015416	CAG	2	6	952242	952247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507230
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19297	NC_015416	GGA	2	6	952305	952310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507230
19298	NC_015416	CTG	2	6	952312	952317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507230
19299	NC_015416	CAG	2	6	952380	952385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507230
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19303	NC_015416	TCG	2	6	952621	952626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507231
19304	NC_015416	AATCC	2	10	952639	952648	40 %	20 %	0 %	40 %	330507231
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19317	NC_015416	CTT	2	6	953552	953557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507231
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19320	NC_015416	GGA	4	12	953624	953635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507231
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19323	NC_015416	CAGT	2	8	953881	953888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19324	NC_015416	ATG	2	6	953975	953980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507232
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19327	NC_015416	GTTCGG	2	12	954045	954056	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	330507232
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19331	NC_015416	AT	3	6	954214	954219	50 %	50 %	0 %	0 %	330507232
19332	NC_015416	GCC	2	6	954268	954273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330507232
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19334	NC_015416	ACT	2	6	954389	954394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507232
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19351	NC_015416	TTCAAG	2	12	954916	954927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330507232
19352	NC_015416	GTG	2	6	954928	954933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507232
19353	NC_015416	AGA	2	6	955013	955018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507232
19354	NC_015416	CCA	2	6	955030	955035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507232
19355	NC_015416	CAC	2	6	955038	955043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507232
19356	NC_015416	ATT	2	6	955085	955090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19357	NC_015416	T	7	7	955101	955107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19358	NC_015416	CCA	2	6	955138	955143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19359	NC_015416	T	6	6	955168	955173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19360	NC_015416	TAAT	2	8	955177	955184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19361	NC_015416	AGC	2	6	955217	955222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19362	NC_015416	AT	3	6	955259	955264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19363	NC_015416	ATC	2	6	955274	955279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19364	NC_015416	TCCA	2	8	955320	955327	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19365	NC_015416	ATA	2	6	955349	955354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19387	NC_015416	T	6	6	956295	956300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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