MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_015416	CTG	2	6	889332	889337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507171
18003	NC_015416	GGCT	2	8	889353	889360	0 %	25 %	50 %	25 %	330507171
18004	NC_015416	AGC	2	6	889402	889407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507171
18005	NC_015416	GTT	2	6	889456	889461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
18006	NC_015416	TC	3	6	889463	889468	0 %	50 %	0 %	50 %	330507171
18007	NC_015416	GTC	2	6	889511	889516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507171
18008	NC_015416	ATT	2	6	889531	889536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330507171
18009	NC_015416	TGC	2	6	889606	889611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507171
18010	NC_015416	CTG	2	6	889626	889631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507171
18011	NC_015416	GGCT	2	8	889647	889654	0 %	25 %	50 %	25 %	330507171
18012	NC_015416	TTG	2	6	889688	889693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
18013	NC_015416	GTT	2	6	889750	889755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
18014	NC_015416	GTT	2	6	889802	889807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
18015	NC_015416	GTCCAG	2	12	889808	889819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330507171
18016	NC_015416	CGGAT	2	10	889891	889900	20 %	20 %	40 %	20 %	330507171
18017	NC_015416	CTG	2	6	889920	889925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507171
18018	NC_015416	GGCT	2	8	889941	889948	0 %	25 %	50 %	25 %	330507171
18019	NC_015416	TGG	2	6	889975	889980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507171
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18021	NC_015416	GTT	2	6	890044	890049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
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18023	NC_015416	GTG	2	6	890093	890098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507171
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18025	NC_015416	CTG	2	6	890214	890219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507171
18026	NC_015416	GTT	2	6	890275	890280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
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18028	NC_015416	TC	3	6	890345	890350	0 %	50 %	0 %	50 %	330507171
18029	NC_015416	GTG	2	6	890387	890392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507171
18030	NC_015416	GTCCAG	2	12	890396	890407	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330507171
18031	NC_015416	CTG	2	6	890508	890513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507171
18032	NC_015416	TGG	2	6	890563	890568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507171
18033	NC_015416	TTG	2	6	890570	890575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
18034	NC_015416	GTT	2	6	890632	890637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
18035	NC_015416	TC	3	6	890639	890644	0 %	50 %	0 %	50 %	330507171
18036	NC_015416	GTG	2	6	890681	890686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507171
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18040	NC_015416	TTG	2	6	890864	890869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
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18043	NC_015416	GTG	2	6	890975	890980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507171
18044	NC_015416	GTCCAG	2	12	890984	890995	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330507171
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18046	NC_015416	CTG	2	6	891096	891101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507171
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18050	NC_015416	GTC	2	6	891275	891280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507171
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18052	NC_015416	CTG	2	6	891390	891395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507171
18053	NC_015416	GGCT	2	8	891411	891418	0 %	25 %	50 %	25 %	330507171
18054	NC_015416	GTT	2	6	891451	891456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
18055	NC_015416	GTT	2	6	891514	891519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
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18061	NC_015416	GTT	2	6	891808	891813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
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18067	NC_015416	GTT	2	6	892102	892107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507171
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18069	NC_015416	CGGAT	2	10	892243	892252	20 %	20 %	40 %	20 %	330507171
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18076	NC_015416	CAAGAA	2	12	892878	892889	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	330507171
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18078	NC_015416	T	7	7	892918	892924	0 %	100 %	0 %	0 %	330507171
18079	NC_015416	CTCTC	2	10	892979	892988	0 %	40 %	0 %	60 %	330507171
18080	NC_015416	CTTC	2	8	892997	893004	0 %	50 %	0 %	50 %	330507171
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18082	NC_015416	TCA	2	6	893047	893052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18083	NC_015416	GATG	2	8	893242	893249	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_015416	CT	3	6	893310	893315	0 %	50 %	0 %	50 %	330507172
18085	NC_015416	TTATCT	2	12	893371	893382	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	330507172
18086	NC_015416	TAT	2	6	893412	893417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330507172
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18088	NC_015416	CTG	2	6	893486	893491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507172
18089	NC_015416	ATT	2	6	893512	893517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330507172
18090	NC_015416	CTG	2	6	893520	893525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507172
18091	NC_015416	TTG	2	6	893545	893550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507172
18092	NC_015416	CAA	2	6	893598	893603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330507172
18093	NC_015416	CAA	2	6	893729	893734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330507172
18094	NC_015416	AACC	2	8	893760	893767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18095	NC_015416	ATC	2	6	893820	893825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18096	NC_015416	AATGC	2	10	893828	893837	40 %	20 %	20 %	20 %	330507173
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18099	NC_015416	TCA	2	6	893893	893898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507173
18100	NC_015416	GCA	2	6	893902	893907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507173
18101	NC_015416	CCA	2	6	893949	893954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507173
18102	NC_015416	GGA	3	9	893985	893993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507173
18103	NC_015416	CAC	2	6	894086	894091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507173
18104	NC_015416	TGG	2	6	894095	894100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507173
18105	NC_015416	GAC	2	6	894162	894167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507173
18106	NC_015416	CTTC	2	8	894231	894238	0 %	50 %	0 %	50 %	330507173
18107	NC_015416	GGT	2	6	894332	894337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507173
18108	NC_015416	A	6	6	894387	894392	100 %	0 %	0 %	0 %	330507173
18109	NC_015416	G	6	6	894411	894416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18110	NC_015416	TG	3	6	894468	894473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18111	NC_015416	GCA	2	6	894525	894530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507174
18112	NC_015416	GGCC	2	8	894557	894564	0 %	0 %	50 %	50 %	330507174
18113	NC_015416	TGC	2	6	894606	894611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507174
18114	NC_015416	GAT	2	6	894618	894623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507174
18115	NC_015416	GCC	2	6	894701	894706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330507174
18116	NC_015416	ACA	2	6	894724	894729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330507174
18117	NC_015416	TGGAG	2	10	894748	894757	20 %	20 %	60 %	0 %	330507174
18118	NC_015416	A	6	6	894762	894767	100 %	0 %	0 %	0 %	330507174
18119	NC_015416	ATG	2	6	894790	894795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507174
18120	NC_015416	CTAT	2	8	894808	894815	25 %	50 %	0 %	25 %	330507174
18121	NC_015416	TGG	2	6	894856	894861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507174
18122	NC_015416	GCT	2	6	894874	894879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507174
18123	NC_015416	TGC	2	6	894917	894922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507174
18124	NC_015416	A	6	6	894990	894995	100 %	0 %	0 %	0 %	330507174
18125	NC_015416	GCGGG	2	10	895010	895019	0 %	0 %	80 %	20 %	330507174
18126	NC_015416	CTG	2	6	895034	895039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507174
18127	NC_015416	CAT	2	6	895040	895045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507174
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18131	NC_015416	GA	3	6	895210	895215	50 %	0 %	50 %	0 %	330507175
18132	NC_015416	TCC	2	6	895544	895549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507175
18133	NC_015416	CCG	2	6	895554	895559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330507175
18134	NC_015416	CCCGT	2	10	895593	895602	0 %	20 %	20 %	60 %	330507175
18135	NC_015416	TGA	2	6	895629	895634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507175
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18145	NC_015416	CCGC	2	8	895940	895947	0 %	0 %	25 %	75 %	330507175
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18148	NC_015416	ACTG	2	8	896007	896014	25 %	25 %	25 %	25 %	330507175
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18150	NC_015416	GTG	2	6	896137	896142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507175
18151	NC_015416	GTA	2	6	896215	896220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507175
18152	NC_015416	CTT	2	6	896224	896229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507175
18153	NC_015416	CAGT	2	8	896243	896250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18154	NC_015416	CTT	2	6	896253	896258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18155	NC_015416	TTC	2	6	896286	896291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18156	NC_015416	CTT	2	6	896315	896320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507176
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18238	NC_015416	TCT	2	6	900076	900081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507178
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18474	NC_015416	TAA	2	6	911860	911865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18475	NC_015416	ATTG	2	8	911906	911913	25 %	50 %	25 %	0 %	330507190
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18483	NC_015416	GGA	2	6	912278	912283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507190
18484	NC_015416	TGG	2	6	912310	912315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507190
18485	NC_015416	T	7	7	912358	912364	0 %	100 %	0 %	0 %	330507191
18486	NC_015416	GAA	2	6	912412	912417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507191
18487	NC_015416	CTG	2	6	912448	912453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507191
18488	NC_015416	GCT	2	6	912487	912492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507191
18489	NC_015416	GA	3	6	912514	912519	50 %	0 %	50 %	0 %	330507191
18490	NC_015416	GGA	2	6	912524	912529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507191
18491	NC_015416	AG	3	6	912567	912572	50 %	0 %	50 %	0 %	330507191
18492	NC_015416	TCT	2	6	912623	912628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507191
18493	NC_015416	CTC	2	6	912648	912653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507191
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18495	NC_015416	GGGC	2	8	912787	912794	0 %	0 %	75 %	25 %	330507191
18496	NC_015416	ACC	2	6	912813	912818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507191
18497	NC_015416	GA	3	6	912838	912843	50 %	0 %	50 %	0 %	330507191
18498	NC_015416	AATCC	2	10	912857	912866	40 %	20 %	0 %	40 %	330507191
18499	NC_015416	ATG	2	6	912889	912894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507191
18500	NC_015416	GGA	2	6	912980	912985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507191

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