MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015416	GAA	2	6	838537	838542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_015416	TAG	2	6	838671	838676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17003	NC_015416	CG	3	6	838898	838903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17004	NC_015416	GTA	3	9	838957	838965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_015416	TGGC	2	8	839021	839028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17006	NC_015416	TCTT	2	8	839054	839061	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17007	NC_015416	CGC	2	6	839081	839086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17008	NC_015416	GA	4	8	839092	839099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_015416	GAA	2	6	839125	839130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_015416	GGC	2	6	839151	839156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_015416	GC	3	6	839200	839205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17012	NC_015416	GTGC	2	8	839231	839238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17013	NC_015416	GTC	2	6	839240	839245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17014	NC_015416	GTAG	2	8	839277	839284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_015416	GGA	2	6	839309	839314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_015416	TCC	2	6	839397	839402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17017	NC_015416	CGG	2	6	839439	839444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17018	NC_015416	CCG	2	6	839507	839512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17019	NC_015416	TCG	2	6	839513	839518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17020	NC_015416	GAC	2	6	839521	839526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17021	NC_015416	CAG	2	6	839527	839532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17022	NC_015416	G	6	6	839541	839546	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_015416	AAC	2	6	839641	839646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17024	NC_015416	AGC	2	6	839664	839669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17025	NC_015416	TAG	2	6	839774	839779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17026	NC_015416	GTAGCA	2	12	839848	839859	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17027	NC_015416	TGA	2	6	840103	840108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_015416	GCTA	2	8	840214	840221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17029	NC_015416	GTG	2	6	840260	840265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_015416	TAA	2	6	840314	840319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17031	NC_015416	GGA	2	6	840404	840409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17032	NC_015416	CGG	2	6	840422	840427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17033	NC_015416	GTA	2	6	840455	840460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17034	NC_015416	GGC	2	6	840476	840481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17035	NC_015416	TAGG	2	8	840638	840645	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17036	NC_015416	TAC	2	6	840692	840697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17037	NC_015416	GCC	3	9	840707	840715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17038	NC_015416	TGGG	2	8	840753	840760	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17039	NC_015416	CAA	2	6	840823	840828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17040	NC_015416	CT	3	6	840914	840919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17041	NC_015416	GTC	2	6	840966	840971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17042	NC_015416	GCA	2	6	841039	841044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17043	NC_015416	GTT	2	6	841060	841065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17044	NC_015416	CGT	2	6	841101	841106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17045	NC_015416	GGTT	2	8	841156	841163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_015416	AGC	2	6	841227	841232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17047	NC_015416	GT	3	6	841332	841337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17048	NC_015416	CTA	2	6	841371	841376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17049	NC_015416	GGC	2	6	841519	841524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17050	NC_015416	AGA	2	6	841563	841568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17051	NC_015416	TTA	2	6	841653	841658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_015416	GCT	2	6	841766	841771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17053	NC_015416	GGC	2	6	841785	841790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17054	NC_015416	CGGA	2	8	841791	841798	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17055	NC_015416	CTTT	2	8	841819	841826	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17056	NC_015416	T	7	7	841824	841830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_015416	TAT	2	6	841865	841870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17058	NC_015416	CAT	2	6	841942	841947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17059	NC_015416	TTC	2	6	841979	841984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17060	NC_015416	TTCC	2	8	842010	842017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17061	NC_015416	ATG	2	6	842031	842036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17062	NC_015416	GCC	2	6	842160	842165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330507123
17063	NC_015416	TCA	2	6	842207	842212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507123
17064	NC_015416	TTA	2	6	842335	842340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17065	NC_015416	TGG	2	6	842352	842357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17066	NC_015416	GCA	2	6	842383	842388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17067	NC_015416	GCT	2	6	842400	842405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17068	NC_015416	TGAAA	2	10	842563	842572	60 %	20 %	20 %	0 %	330507124
17069	NC_015416	TGAT	2	8	842643	842650	25 %	50 %	25 %	0 %	330507124
17070	NC_015416	ATA	2	6	842696	842701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507124
17071	NC_015416	TA	3	6	842747	842752	50 %	50 %	0 %	0 %	330507124
17072	NC_015416	AGA	2	6	842812	842817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507124
17073	NC_015416	TGT	2	6	842830	842835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507124
17074	NC_015416	AAT	2	6	842885	842890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507124
17075	NC_015416	ATGC	2	8	842902	842909	25 %	25 %	25 %	25 %	330507124
17076	NC_015416	GGACT	2	10	842981	842990	20 %	20 %	40 %	20 %	330507124
17077	NC_015416	CAAT	2	8	843073	843080	50 %	25 %	0 %	25 %	330507124
17078	NC_015416	CT	3	6	843090	843095	0 %	50 %	0 %	50 %	330507124
17079	NC_015416	AAAT	2	8	843115	843122	75 %	25 %	0 %	0 %	330507124
17080	NC_015416	ACT	2	6	843189	843194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507124
17081	NC_015416	TCT	2	6	843235	843240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507124
17082	NC_015416	CAA	2	6	843273	843278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330507124
17083	NC_015416	TGA	2	6	843334	843339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507124
17084	NC_015416	GGA	2	6	843374	843379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507124
17085	NC_015416	ATGC	2	8	843416	843423	25 %	25 %	25 %	25 %	330507124
17086	NC_015416	AT	3	6	843499	843504	50 %	50 %	0 %	0 %	330507124
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17091	NC_015416	GAA	2	6	843793	843798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507125
17092	NC_015416	GGC	2	6	843804	843809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330507125
17093	NC_015416	AGGC	2	8	843852	843859	25 %	0 %	50 %	25 %	330507125
17094	NC_015416	CATC	2	8	843892	843899	25 %	25 %	0 %	50 %	330507125
17095	NC_015416	GCTG	2	8	843928	843935	0 %	25 %	50 %	25 %	330507125
17096	NC_015416	GA	3	6	844004	844009	50 %	0 %	50 %	0 %	330507125
17097	NC_015416	A	7	7	844045	844051	100 %	0 %	0 %	0 %	330507125
17098	NC_015416	AGA	2	6	844068	844073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507125
17099	NC_015416	GAG	2	6	844082	844087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507125
17100	NC_015416	GAC	2	6	844109	844114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507125
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17102	NC_015416	TTA	2	6	844299	844304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330507126
17103	NC_015416	CAG	2	6	844322	844327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507126
17104	NC_015416	TTGCT	2	10	844393	844402	0 %	60 %	20 %	20 %	330507126
17105	NC_015416	AAG	3	9	844405	844413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507126
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17107	NC_015416	GCA	2	6	844533	844538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507126
17108	NC_015416	CAG	2	6	844575	844580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507126
17109	NC_015416	AAG	2	6	844614	844619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507126
17110	NC_015416	GAA	2	6	844653	844658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507126
17111	NC_015416	TCA	2	6	844689	844694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507126
17112	NC_015416	GAG	2	6	844834	844839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507126
17113	NC_015416	CCA	2	6	845023	845028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507127
17114	NC_015416	TC	3	6	845030	845035	0 %	50 %	0 %	50 %	330507127
17115	NC_015416	TGCA	2	8	845041	845048	25 %	25 %	25 %	25 %	330507127
17116	NC_015416	GAAG	2	8	845117	845124	50 %	0 %	50 %	0 %	330507127
17117	NC_015416	AG	3	6	845123	845128	50 %	0 %	50 %	0 %	330507127
17118	NC_015416	TGA	2	6	845131	845136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507127
17119	NC_015416	GAC	2	6	845160	845165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507127
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17121	NC_015416	TC	3	6	845217	845222	0 %	50 %	0 %	50 %	330507127
17122	NC_015416	CT	3	6	845242	845247	0 %	50 %	0 %	50 %	330507127
17123	NC_015416	TGA	2	6	845253	845258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507127
17124	NC_015416	ATCC	2	8	845260	845267	25 %	25 %	0 %	50 %	330507127
17125	NC_015416	AGC	2	6	845424	845429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507127
17126	NC_015416	CTT	2	6	845454	845459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507127
17127	NC_015416	TCAG	2	8	845464	845471	25 %	25 %	25 %	25 %	330507127
17128	NC_015416	GAA	2	6	845523	845528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507127
17129	NC_015416	GAA	2	6	845578	845583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507127
17130	NC_015416	TTC	2	6	845585	845590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507127
17131	NC_015416	AAG	2	6	845606	845611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507127
17132	NC_015416	AGC	2	6	845623	845628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507127
17133	NC_015416	TTC	2	6	845658	845663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507127
17134	NC_015416	TCT	2	6	845668	845673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507127
17135	NC_015416	AAG	2	6	845708	845713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507127
17136	NC_015416	CAT	2	6	845720	845725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507127
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17142	NC_015416	GAT	2	6	846072	846077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507128
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17146	NC_015416	TGCA	2	8	846167	846174	25 %	25 %	25 %	25 %	330507128
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17148	NC_015416	AG	3	6	846249	846254	50 %	0 %	50 %	0 %	330507128
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17153	NC_015416	TGA	2	6	846379	846384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507128
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17173	NC_015416	CGC	2	6	847040	847045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17174	NC_015416	TAC	2	6	847056	847061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17210	NC_015416	CATTCG	2	12	849515	849526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17219	NC_015416	ATT	2	6	850115	850120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17220	NC_015416	TA	3	6	850121	850126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17221	NC_015416	TA	3	6	850150	850155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17222	NC_015416	AT	3	6	850167	850172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17223	NC_015416	TCA	2	6	850283	850288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17224	NC_015416	TGG	2	6	850424	850429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507134
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17228	NC_015416	GTC	2	6	850570	850575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507134
17229	NC_015416	TCC	2	6	850589	850594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507134
17230	NC_015416	GGT	2	6	850635	850640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507134
17231	NC_015416	GCC	2	6	850642	850647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330507134
17232	NC_015416	CTA	2	6	850653	850658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507134
17233	NC_015416	CGC	2	6	850756	850761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330507134
17234	NC_015416	CTC	2	6	850766	850771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507134
17235	NC_015416	ATTG	2	8	850800	850807	25 %	50 %	25 %	0 %	330507134
17236	NC_015416	CCTG	2	8	850842	850849	0 %	25 %	25 %	50 %	330507134
17237	NC_015416	C	6	6	850856	850861	0 %	0 %	0 %	100 %	330507134
17238	NC_015416	ATC	2	6	850939	850944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507134
17239	NC_015416	AGC	2	6	850956	850961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507134
17240	NC_015416	A	6	6	851023	851028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17241	NC_015416	GCT	2	6	851098	851103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17242	NC_015416	GCAC	2	8	851300	851307	25 %	0 %	25 %	50 %	330507135
17243	NC_015416	ATC	3	9	851313	851321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507135
17244	NC_015416	ATA	2	6	851487	851492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507135
17245	NC_015416	GGCT	2	8	851509	851516	0 %	25 %	50 %	25 %	330507135
17246	NC_015416	AT	3	6	851655	851660	50 %	50 %	0 %	0 %	330507135
17247	NC_015416	AAT	2	6	851667	851672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507135
17248	NC_015416	TCA	2	6	851674	851679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507135
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17252	NC_015416	CTG	2	6	851798	851803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507135
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17256	NC_015416	CGAT	2	8	851884	851891	25 %	25 %	25 %	25 %	330507135
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17350	NC_015416	GCGG	2	8	856344	856351	0 %	0 %	75 %	25 %	330507139
17351	NC_015416	GAA	2	6	856391	856396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507139
17352	NC_015416	GAAGA	2	10	856416	856425	60 %	0 %	40 %	0 %	330507139
17353	NC_015416	CTG	2	6	856506	856511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507139
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17364	NC_015416	AAG	2	6	857076	857081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507139
17365	NC_015416	ATAG	2	8	857124	857131	50 %	25 %	25 %	0 %	330507139
17366	NC_015416	ATA	2	6	857239	857244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507139
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17492	NC_015416	GA	5	10	863150	863159	50 %	0 %	50 %	0 %	330507147
17493	NC_015416	GCA	2	6	863185	863190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507147
17494	NC_015416	TGA	2	6	863231	863236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507147
17495	NC_015416	TGC	2	6	863304	863309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17496	NC_015416	GCCA	2	8	863317	863324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17497	NC_015416	AAG	2	6	863354	863359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507148
17498	NC_015416	GAGG	2	8	863360	863367	25 %	0 %	75 %	0 %	330507148
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17500	NC_015416	ATC	2	6	863491	863496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507148

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