MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015416	AGT	2	6	741796	741801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_015416	ATA	2	6	741817	741822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_015416	GAT	3	9	741870	741878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507024
15004	NC_015416	GA	3	6	741928	741933	50 %	0 %	50 %	0 %	330507024
15005	NC_015416	GGA	2	6	741938	741943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507024
15006	NC_015416	CAT	2	6	741968	741973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507024
15007	NC_015416	CTT	2	6	742025	742030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507024
15008	NC_015416	GTG	2	6	742138	742143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330507025
15009	NC_015416	CAT	2	6	742167	742172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507025
15010	NC_015416	GAAG	2	8	742180	742187	50 %	0 %	50 %	0 %	330507025
15011	NC_015416	CTT	2	6	742240	742245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507025
15012	NC_015416	AT	3	6	742284	742289	50 %	50 %	0 %	0 %	330507025
15013	NC_015416	AAT	2	6	742291	742296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507025
15014	NC_015416	AGTA	2	8	742303	742310	50 %	25 %	25 %	0 %	330507025
15015	NC_015416	CAT	2	6	742356	742361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_015416	ATT	2	6	742403	742408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_015416	CCA	2	6	742480	742485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15018	NC_015416	GTC	2	6	742505	742510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15019	NC_015416	TCCG	2	8	742511	742518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15020	NC_015416	GC	3	6	742529	742534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15021	NC_015416	TA	3	6	742651	742656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_015416	TC	3	6	742667	742672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15023	NC_015416	GTC	2	6	742956	742961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507026
15024	NC_015416	TCCG	2	8	742962	742969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15025	NC_015416	A	7	7	743010	743016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_015416	TGC	2	6	743022	743027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_015416	ATC	2	6	743030	743035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507027
15028	NC_015416	CCT	2	6	743042	743047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507027
15029	NC_015416	CCA	2	6	743060	743065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507027
15030	NC_015416	CCTG	2	8	743071	743078	0 %	25 %	25 %	50 %	330507027
15031	NC_015416	TGA	2	6	743081	743086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507027
15032	NC_015416	ATC	2	6	743092	743097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507027
15033	NC_015416	TCG	2	6	743098	743103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507027
15034	NC_015416	CAT	2	6	743109	743114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507027
15035	NC_015416	TGGTT	2	10	743145	743154	0 %	60 %	40 %	0 %	330507027
15036	NC_015416	GAT	2	6	743205	743210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507027
15037	NC_015416	TTC	2	6	743248	743253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507027
15038	NC_015416	GAA	2	6	743280	743285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507027
15039	NC_015416	TTC	2	6	743302	743307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507027
15040	NC_015416	CCA	2	6	743336	743341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507027
15041	NC_015416	AAT	2	6	743487	743492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507027
15042	NC_015416	AAT	2	6	743532	743537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507027
15043	NC_015416	ATC	2	6	743544	743549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507027
15044	NC_015416	TCT	2	6	743597	743602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507027
15045	NC_015416	ATC	2	6	743610	743615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507027
15046	NC_015416	TCC	2	6	743692	743697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507027
15047	NC_015416	TGATC	2	10	743732	743741	20 %	40 %	20 %	20 %	330507027
15048	NC_015416	TTCC	2	8	743750	743757	0 %	50 %	0 %	50 %	330507027
15049	NC_015416	AT	3	6	743773	743778	50 %	50 %	0 %	0 %	330507027
15050	NC_015416	GAG	2	6	743812	743817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507027
15051	NC_015416	GCA	2	6	743826	743831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507027
15052	NC_015416	TGAT	2	8	743841	743848	25 %	50 %	25 %	0 %	330507027
15053	NC_015416	CACGAG	2	12	743891	743902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507027
15054	NC_015416	CTT	2	6	743908	743913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507027
15055	NC_015416	TGA	2	6	743951	743956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507027
15056	NC_015416	ATT	2	6	743958	743963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330507027
15057	NC_015416	AT	3	6	743970	743975	50 %	50 %	0 %	0 %	330507027
15058	NC_015416	CAGC	2	8	744113	744120	25 %	0 %	25 %	50 %	330507027
15059	NC_015416	TAT	2	6	744138	744143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330507027
15060	NC_015416	GAT	3	9	744309	744317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507027
15061	NC_015416	CGTG	2	8	744322	744329	0 %	25 %	50 %	25 %	330507027
15062	NC_015416	ACA	2	6	744526	744531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15063	NC_015416	T	6	6	744532	744537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_015416	T	6	6	744539	744544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_015416	GCA	2	6	744573	744578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_015416	GCC	2	6	744588	744593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15067	NC_015416	CTG	2	6	744615	744620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_015416	TTC	2	6	744693	744698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15070	NC_015416	CCAG	2	8	744738	744745	25 %	0 %	25 %	50 %	330507028
15071	NC_015416	TGA	2	6	744887	744892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507028
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15073	NC_015416	GAT	2	6	744912	744917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507028
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15075	NC_015416	TCG	2	6	745103	745108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15076	NC_015416	TGA	2	6	745128	745133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15078	NC_015416	TGA	2	6	745283	745288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15082	NC_015416	GA	3	6	745611	745616	50 %	0 %	50 %	0 %	330507029
15083	NC_015416	CGA	2	6	745625	745630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507029
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15092	NC_015416	TAA	2	6	746190	746195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_015416	GAT	2	6	746206	746211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507031
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15101	NC_015416	GATCA	2	10	746581	746590	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15102	NC_015416	TCG	2	6	746637	746642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15104	NC_015416	GAG	2	6	746814	746819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_015416	ATC	3	9	746906	746914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507032
15106	NC_015416	AGGA	2	8	746951	746958	50 %	0 %	50 %	0 %	330507032
15107	NC_015416	CCA	2	6	746961	746966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330507032
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15123	NC_015416	CTC	2	6	747736	747741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507032
15124	NC_015416	AGGC	2	8	747747	747754	25 %	0 %	50 %	25 %	330507032
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15126	NC_015416	GAG	2	6	747957	747962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_015416	TCG	2	6	748482	748487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15129	NC_015416	GCG	2	6	748747	748752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15130	NC_015416	GCC	2	6	748763	748768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15132	NC_015416	TAA	2	6	748821	748826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15149	NC_015416	TAC	2	6	749588	749593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15235	NC_015416	AGGC	2	8	753811	753818	25 %	0 %	50 %	25 %	330507041
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15238	NC_015416	GAG	2	6	754021	754026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15239	NC_015416	TG	3	6	754497	754502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15240	NC_015416	TAT	2	6	754533	754538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15241	NC_015416	TCG	2	6	754540	754545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15242	NC_015416	CA	3	6	754567	754572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15243	NC_015416	TAA	2	6	754581	754586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15244	NC_015416	ATCCC	2	10	754625	754634	20 %	20 %	0 %	60 %	330507042
15245	NC_015416	TGA	2	6	754656	754661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507042
15246	NC_015416	AGGT	2	8	754691	754698	25 %	25 %	50 %	0 %	330507042
15247	NC_015416	GGA	2	6	754716	754721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330507042
15248	NC_015416	TCC	2	6	754730	754735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507042
15249	NC_015416	TCC	2	6	754763	754768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330507042
15250	NC_015416	CAGTGG	2	12	754819	754830	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330507042
15251	NC_015416	GCA	2	6	754870	754875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507042
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15253	NC_015416	GAT	2	6	754945	754950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507042
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15258	NC_015416	TCG	2	6	755219	755224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15259	NC_015416	TC	3	6	755315	755320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15260	NC_015416	GCA	2	6	755356	755361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330507043
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15272	NC_015416	TCA	2	6	755739	755744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15273	NC_015416	TAA	2	6	755785	755790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15274	NC_015416	TG	3	6	755816	755821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15275	NC_015416	TC	3	6	755843	755848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15276	NC_015416	GCT	2	6	756098	756103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507044
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15284	NC_015416	TGG	2	6	756311	756316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15285	NC_015416	ACGA	2	8	756358	756365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15288	NC_015416	TGGA	2	8	756412	756419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15289	NC_015416	AAGG	2	8	756420	756427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15290	NC_015416	TCG	2	6	756468	756473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15292	NC_015416	CAG	2	6	756527	756532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15312	NC_015416	CAT	2	6	757279	757284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15316	NC_015416	CTT	2	6	757411	757416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15321	NC_015416	GTG	2	6	757929	757934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15337	NC_015416	GAT	2	6	758629	758634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15355	NC_015416	GATC	2	8	759846	759853	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15356	NC_015416	TTC	2	6	759938	759943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507051
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15359	NC_015416	T	7	7	760156	760162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15360	NC_015416	ATA	2	6	760286	760291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330507052
15361	NC_015416	ATC	2	6	760294	760299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330507052
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15363	NC_015416	TGT	2	6	760422	760427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330507052
15364	NC_015416	TAGA	2	8	760450	760457	50 %	25 %	25 %	0 %	330507052
15365	NC_015416	CTG	2	6	760458	760463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330507052
15366	NC_015416	GATG	2	8	760552	760559	25 %	25 %	50 %	0 %	330507052
15367	NC_015416	TCT	2	6	760611	760616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330507052
15368	NC_015416	GAT	2	6	760633	760638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330507052
15369	NC_015416	CATT	2	8	760783	760790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15370	NC_015416	TGA	2	6	760854	760859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15371	NC_015416	CCGG	2	8	760863	760870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15372	NC_015416	GAT	2	6	760878	760883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15373	NC_015416	GATTG	2	10	760940	760949	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15374	NC_015416	ATC	2	6	761030	761035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15375	NC_015416	TCG	2	6	761081	761086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15376	NC_015416	CCA	2	6	761213	761218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15377	NC_015416	ATC	2	6	761300	761305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15378	NC_015416	CCAT	2	8	761350	761357	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15379	NC_015416	ATC	2	6	761381	761386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15380	NC_015416	TC	3	6	761385	761390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15381	NC_015416	TGC	2	6	761404	761409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15382	NC_015416	AGCT	2	8	761450	761457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15383	NC_015416	TGA	3	9	761484	761492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15384	NC_015416	A	6	6	761520	761525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15385	NC_015416	GCT	2	6	761550	761555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15386	NC_015416	TAC	2	6	761596	761601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15387	NC_015416	A	7	7	761623	761629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15388	NC_015416	TCA	2	6	761677	761682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15389	NC_015416	AGGT	2	8	761795	761802	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15390	NC_015416	GGC	2	6	761907	761912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15391	NC_015416	GA	3	6	761925	761930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15392	NC_015416	ACT	2	6	761967	761972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15394	NC_015416	CGT	2	6	762059	762064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15396	NC_015416	T	8	8	762110	762117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15397	NC_015416	T	6	6	762119	762124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15398	NC_015416	ATT	2	6	762133	762138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15400	NC_015416	CTT	2	6	762214	762219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15401	NC_015416	GTC	2	6	762227	762232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15402	NC_015416	CGTT	2	8	762235	762242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15403	NC_015416	ACC	2	6	762286	762291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15404	NC_015416	TC	3	6	762360	762365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15405	NC_015416	CCG	2	6	762384	762389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15407	NC_015416	CGT	2	6	762530	762535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15409	NC_015416	T	8	8	762581	762588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15411	NC_015416	ATT	2	6	762604	762609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15466	NC_015416	AT	3	6	764987	764992	50 %	50 %	0 %	0 %	330507055
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15484	NC_015416	ATT	2	6	765535	765540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15485	NC_015416	TATCC	2	10	765619	765628	20 %	40 %	0 %	40 %	330507056
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15499	NC_015416	GAA	2	6	766213	766218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330507056
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