MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015416	ATC	2	6	596456	596461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506877
12002	NC_015416	TCCC	2	8	596470	596477	0 %	25 %	0 %	75 %	330506877
12003	NC_015416	CCA	2	6	596479	596484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506877
12004	NC_015416	AGT	2	6	596508	596513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506877
12005	NC_015416	CT	3	6	596594	596599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12006	NC_015416	CT	3	6	596623	596628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12007	NC_015416	GGC	2	6	596657	596662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12008	NC_015416	CAC	2	6	596698	596703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12009	NC_015416	TC	3	6	596723	596728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12010	NC_015416	TC	3	6	596745	596750	0 %	50 %	0 %	50 %	330506878
12011	NC_015416	CTT	2	6	596808	596813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506878
12012	NC_015416	CTC	2	6	596883	596888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506878
12013	NC_015416	CTT	2	6	597003	597008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506878
12014	NC_015416	ATGC	2	8	597149	597156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12015	NC_015416	GCC	2	6	597173	597178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12016	NC_015416	TTC	2	6	597187	597192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12017	NC_015416	AGC	2	6	597193	597198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12018	NC_015416	CAG	2	6	597219	597224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12019	NC_015416	TAA	2	6	597242	597247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_015416	CTG	2	6	597261	597266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12021	NC_015416	GAA	2	6	597397	597402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12022	NC_015416	GATA	2	8	597409	597416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12023	NC_015416	CTT	2	6	597524	597529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506879
12024	NC_015416	CTG	3	9	597537	597545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506879
12025	NC_015416	AGG	2	6	597604	597609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506879
12026	NC_015416	CAT	2	6	597620	597625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506879
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12028	NC_015416	ACT	2	6	597643	597648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506879
12029	NC_015416	GAA	2	6	597767	597772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506879
12030	NC_015416	CAG	2	6	597808	597813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506879
12031	NC_015416	GAG	2	6	597862	597867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506879
12032	NC_015416	CAT	2	6	597983	597988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506879
12033	NC_015416	AGG	2	6	598048	598053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506879
12034	NC_015416	T	6	6	598057	598062	0 %	100 %	0 %	0 %	330506879
12035	NC_015416	GAT	2	6	598064	598069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506879
12036	NC_015416	TCC	2	6	598086	598091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506879
12037	NC_015416	AAT	2	6	598106	598111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506879
12038	NC_015416	GTCT	2	8	598128	598135	0 %	50 %	25 %	25 %	330506879
12039	NC_015416	ATC	2	6	598146	598151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506879
12040	NC_015416	TGG	2	6	598306	598311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506879
12041	NC_015416	CTC	2	6	598312	598317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506879
12042	NC_015416	GGA	2	6	598338	598343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506879
12043	NC_015416	TCT	2	6	598355	598360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506879
12044	NC_015416	TGG	2	6	598375	598380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506879
12045	NC_015416	TTC	2	6	598479	598484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506879
12046	NC_015416	AGG	2	6	598503	598508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506879
12047	NC_015416	TGG	2	6	598587	598592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506880
12048	NC_015416	CTC	2	6	598776	598781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506880
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12051	NC_015416	TGC	2	6	598986	598991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506880
12052	NC_015416	AGA	3	9	599070	599078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506880
12053	NC_015416	GCA	2	6	599165	599170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506880
12054	NC_015416	GTG	2	6	599231	599236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506880
12055	NC_015416	GAA	2	6	599303	599308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12056	NC_015416	CAT	2	6	599312	599317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506881
12057	NC_015416	AAG	2	6	599323	599328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506881
12058	NC_015416	AGG	2	6	599358	599363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506881
12059	NC_015416	GGC	2	6	599408	599413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506881
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12061	NC_015416	TTG	2	6	599487	599492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506881
12062	NC_015416	GGA	2	6	599533	599538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506881
12063	NC_015416	CTTTG	2	10	599549	599558	0 %	60 %	20 %	20 %	330506881
12064	NC_015416	AG	3	6	599568	599573	50 %	0 %	50 %	0 %	330506881
12065	NC_015416	AAG	2	6	599583	599588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506881
12066	NC_015416	GCT	2	6	599711	599716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506881
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12069	NC_015416	TGC	2	6	599778	599783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506881
12070	NC_015416	GAG	2	6	599879	599884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506881
12071	NC_015416	GCT	2	6	599902	599907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506881
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12087	NC_015416	AGCAAC	2	12	600360	600371	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330506881
12088	NC_015416	AGC	2	6	600390	600395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506881
12089	NC_015416	AGC	2	6	600402	600407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506881
12090	NC_015416	CAG	2	6	600413	600418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506881
12091	NC_015416	A	6	6	600419	600424	100 %	0 %	0 %	0 %	330506881
12092	NC_015416	AGG	2	6	600456	600461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506881
12093	NC_015416	TCAGGC	2	12	600469	600480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330506881
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12098	NC_015416	TGC	2	6	600786	600791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506881
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12103	NC_015416	ATG	2	6	601085	601090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506881
12104	NC_015416	AGC	2	6	601173	601178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506881
12105	NC_015416	GGT	2	6	601210	601215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506881
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12107	NC_015416	CGG	2	6	601273	601278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506881
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12117	NC_015416	GCT	2	6	601847	601852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506882
12118	NC_015416	TCT	2	6	601945	601950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506882
12119	NC_015416	ACC	2	6	601953	601958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506882
12120	NC_015416	GAG	2	6	601968	601973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506882
12121	NC_015416	GAT	2	6	602018	602023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506882
12122	NC_015416	TCGC	2	8	602127	602134	0 %	25 %	25 %	50 %	330506882
12123	NC_015416	GTTC	2	8	602141	602148	0 %	50 %	25 %	25 %	330506882
12124	NC_015416	GGA	2	6	602195	602200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506882
12125	NC_015416	TTG	2	6	602206	602211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506882
12126	NC_015416	TCA	2	6	602309	602314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506883
12127	NC_015416	TGA	2	6	602321	602326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506883
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12129	NC_015416	ATC	2	6	602419	602424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506883
12130	NC_015416	ACC	2	6	602440	602445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506883
12131	NC_015416	CTA	2	6	602487	602492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506883
12132	NC_015416	TGA	2	6	602502	602507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506883
12133	NC_015416	GAT	2	6	602556	602561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506883
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12135	NC_015416	TGGT	2	8	602651	602658	0 %	50 %	50 %	0 %	330506883
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12138	NC_015416	CTG	2	6	602707	602712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506883
12139	NC_015416	CTTGAT	2	12	602748	602759	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330506883
12140	NC_015416	CTT	2	6	602784	602789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506883
12141	NC_015416	CT	3	6	602790	602795	0 %	50 %	0 %	50 %	330506883
12142	NC_015416	CT	3	6	602825	602830	0 %	50 %	0 %	50 %	330506883
12143	NC_015416	CCCTG	2	10	602888	602897	0 %	20 %	20 %	60 %	330506883
12144	NC_015416	TCT	2	6	602921	602926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506883
12145	NC_015416	GGGA	2	8	602943	602950	25 %	0 %	75 %	0 %	330506883
12146	NC_015416	TGG	2	6	602951	602956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506883
12147	NC_015416	GAG	2	6	602961	602966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506883
12148	NC_015416	ATG	2	6	603011	603016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12149	NC_015416	CGC	2	6	603031	603036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12150	NC_015416	CTG	2	6	603078	603083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506884
12151	NC_015416	CAT	2	6	603113	603118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506884
12152	NC_015416	ATT	2	6	603170	603175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506884
12153	NC_015416	G	6	6	603200	603205	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12154	NC_015416	GCA	2	6	603294	603299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506885
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12158	NC_015416	CAGG	2	8	603459	603466	25 %	0 %	50 %	25 %	330506885
12159	NC_015416	GAT	2	6	603469	603474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506885
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12171	NC_015416	TGAT	2	8	604282	604289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12172	NC_015416	ATT	2	6	604303	604308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12173	NC_015416	T	6	6	604307	604312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12174	NC_015416	T	6	6	604314	604319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12175	NC_015416	AAT	2	6	604378	604383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12176	NC_015416	A	6	6	604457	604462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12177	NC_015416	GAG	2	6	604504	604509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12182	NC_015416	TGA	2	6	604757	604762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12184	NC_015416	TTC	2	6	604816	604821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12187	NC_015416	CTG	2	6	604899	604904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12189	NC_015416	CAT	2	6	605120	605125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506887
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12193	NC_015416	GA	3	6	605221	605226	50 %	0 %	50 %	0 %	330506887
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12195	NC_015416	CTG	2	6	605351	605356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506888
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12199	NC_015416	CTT	3	9	605704	605712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12200	NC_015416	AATT	2	8	605761	605768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12201	NC_015416	CTG	2	6	605916	605921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506889
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12223	NC_015416	GAT	2	6	606581	606586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506890
12224	NC_015416	GAG	3	9	606599	606607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506890
12225	NC_015416	AG	3	6	606635	606640	50 %	0 %	50 %	0 %	330506890
12226	NC_015416	CACC	2	8	606652	606659	25 %	0 %	0 %	75 %	330506890
12227	NC_015416	CCA	2	6	606693	606698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506890
12228	NC_015416	TGC	2	6	606861	606866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506890
12229	NC_015416	ATC	2	6	606875	606880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506890
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12231	NC_015416	TCC	2	6	606963	606968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506890
12232	NC_015416	ATCC	2	8	606997	607004	25 %	25 %	0 %	50 %	330506890
12233	NC_015416	GGA	2	6	607006	607011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506890
12234	NC_015416	GCCAT	2	10	607077	607086	20 %	20 %	20 %	40 %	330506890
12235	NC_015416	TGGGC	2	10	607102	607111	0 %	20 %	60 %	20 %	330506890
12236	NC_015416	AGC	2	6	607158	607163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506890
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12238	NC_015416	GCA	2	6	607298	607303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506890
12239	NC_015416	GA	3	6	607332	607337	50 %	0 %	50 %	0 %	330506890
12240	NC_015416	GAA	2	6	607396	607401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506890
12241	NC_015416	TC	3	6	607426	607431	0 %	50 %	0 %	50 %	330506890
12242	NC_015416	TGC	2	6	607461	607466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506890
12243	NC_015416	GCT	2	6	607565	607570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506890
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12245	NC_015416	T	6	6	607582	607587	0 %	100 %	0 %	0 %	330506890
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12252	NC_015416	AGGG	2	8	607875	607882	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12253	NC_015416	CGA	2	6	607883	607888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12254	NC_015416	CTC	2	6	607923	607928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12255	NC_015416	AGGA	2	8	607958	607965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12256	NC_015416	GGCT	2	8	608018	608025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12257	NC_015416	ATC	2	6	608071	608076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506891
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12271	NC_015416	TC	3	6	608998	609003	0 %	50 %	0 %	50 %	330506891
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12296	NC_015416	ATT	2	6	610300	610305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12347	NC_015416	CTG	2	6	612961	612966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506894
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12350	NC_015416	CAG	2	6	613054	613059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506895
12351	NC_015416	TCG	2	6	613145	613150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506895
12352	NC_015416	CTTT	2	8	613152	613159	0 %	75 %	0 %	25 %	330506895
12353	NC_015416	GCG	2	6	613163	613168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506895
12354	NC_015416	AG	3	6	613181	613186	50 %	0 %	50 %	0 %	330506895
12355	NC_015416	GAT	2	6	613203	613208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506895
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12358	NC_015416	GAA	2	6	613380	613385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12359	NC_015416	CAGC	2	8	613557	613564	25 %	0 %	25 %	50 %	330506896
12360	NC_015416	TGG	2	6	613613	613618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506896
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12362	NC_015416	CCG	2	6	613643	613648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506896
12363	NC_015416	ATC	2	6	613663	613668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506896
12364	NC_015416	TAT	2	6	613671	613676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506896
12365	NC_015416	GCC	2	6	613683	613688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506896
12366	NC_015416	CCT	2	6	613709	613714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506896
12367	NC_015416	AGG	2	6	613723	613728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506896
12368	NC_015416	ATC	2	6	613731	613736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506896
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12375	NC_015416	TTC	2	6	614028	614033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506896
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12378	NC_015416	TGA	2	6	614106	614111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506897
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12403	NC_015416	ACC	2	6	615124	615129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12407	NC_015416	GGA	2	6	615232	615237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12408	NC_015416	GCA	2	6	615256	615261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12409	NC_015416	AT	3	6	615269	615274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12410	NC_015416	TC	3	6	615400	615405	0 %	50 %	0 %	50 %	330506898
12411	NC_015416	TGC	2	6	615421	615426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506898
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12419	NC_015416	CCAT	2	8	615723	615730	25 %	25 %	0 %	50 %	330506898
12420	NC_015416	GCCTG	2	10	615744	615753	0 %	20 %	40 %	40 %	330506898
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12434	NC_015416	CCTG	2	8	616431	616438	0 %	25 %	25 %	50 %	330506899
12435	NC_015416	GATA	2	8	616560	616567	50 %	25 %	25 %	0 %	330506899
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12444	NC_015416	CATC	2	8	617039	617046	25 %	25 %	0 %	50 %	330506900
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12456	NC_015416	AG	3	6	617649	617654	50 %	0 %	50 %	0 %	330506900
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12464	NC_015416	AATCAG	2	12	618107	618118	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12465	NC_015416	T	6	6	618200	618205	0 %	100 %	0 %	0 %	330506901
12466	NC_015416	TAG	2	6	618210	618215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506901
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12475	NC_015416	AGG	2	6	618592	618597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506901
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12478	NC_015416	TGGG	2	8	618746	618753	0 %	25 %	75 %	0 %	330506902
12479	NC_015416	GGC	2	6	618808	618813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506902
12480	NC_015416	GA	3	6	618906	618911	50 %	0 %	50 %	0 %	330506902
12481	NC_015416	GAGCC	2	10	618921	618930	20 %	0 %	40 %	40 %	330506902
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