MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015416	GAG	2	6	545000	545005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506831
11002	NC_015416	GGT	2	6	545017	545022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506831
11003	NC_015416	ACCT	2	8	545111	545118	25 %	25 %	0 %	50 %	330506831
11004	NC_015416	AGA	2	6	545124	545129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506831
11005	NC_015416	AG	3	6	545134	545139	50 %	0 %	50 %	0 %	330506831
11006	NC_015416	CTT	2	6	545167	545172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506831
11007	NC_015416	CTGCG	2	10	545198	545207	0 %	20 %	40 %	40 %	330506831
11008	NC_015416	CTA	2	6	545296	545301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506831
11009	NC_015416	GCC	2	6	545327	545332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506831
11010	NC_015416	GAG	2	6	545381	545386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506831
11011	NC_015416	GGT	2	6	545398	545403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506831
11012	NC_015416	GAC	2	6	545432	545437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506831
11013	NC_015416	GGGAC	2	10	545463	545472	20 %	0 %	60 %	20 %	330506831
11014	NC_015416	GCT	2	6	545512	545517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506831
11015	NC_015416	CTG	2	6	545537	545542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506831
11016	NC_015416	AG	3	6	545557	545562	50 %	0 %	50 %	0 %	330506831
11017	NC_015416	ACC	2	6	545615	545620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506831
11018	NC_015416	AGC	2	6	545764	545769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506831
11019	NC_015416	AGG	2	6	545773	545778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506831
11020	NC_015416	CAC	2	6	545934	545939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506832
11021	NC_015416	TGG	2	6	545996	546001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506832
11022	NC_015416	TCA	2	6	546034	546039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506832
11023	NC_015416	GAC	2	6	546099	546104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506832
11024	NC_015416	GAG	2	6	546135	546140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506832
11025	NC_015416	GAG	2	6	546195	546200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506832
11026	NC_015416	CGG	2	6	546257	546262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506832
11027	NC_015416	ATC	2	6	546276	546281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506832
11028	NC_015416	GTTT	2	8	546287	546294	0 %	75 %	25 %	0 %	330506832
11029	NC_015416	ATT	2	6	546327	546332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506832
11030	NC_015416	AT	3	6	546370	546375	50 %	50 %	0 %	0 %	330506832
11031	NC_015416	CGG	2	6	546485	546490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506832
11032	NC_015416	CTGCCC	2	12	546555	546566	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	330506832
11033	NC_015416	GGA	2	6	546605	546610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506832
11034	NC_015416	GA	3	6	546633	546638	50 %	0 %	50 %	0 %	330506832
11035	NC_015416	GCT	2	6	546659	546664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506832
11036	NC_015416	GCG	2	6	546831	546836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506832
11037	NC_015416	A	7	7	546947	546953	100 %	0 %	0 %	0 %	330506832
11038	NC_015416	CTG	2	6	547071	547076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506832
11039	NC_015416	CAT	2	6	547104	547109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_015416	AGC	2	6	547112	547117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_015416	ATT	2	6	547255	547260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_015416	AT	3	6	547265	547270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_015416	ATAA	2	8	547325	547332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_015416	AGG	2	6	547348	547353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_015416	TGA	2	6	547363	547368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506833
11046	NC_015416	A	7	7	547368	547374	100 %	0 %	0 %	0 %	330506833
11047	NC_015416	T	6	6	547389	547394	0 %	100 %	0 %	0 %	330506833
11048	NC_015416	CAG	2	6	547459	547464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506833
11049	NC_015416	GA	3	6	547495	547500	50 %	0 %	50 %	0 %	330506833
11050	NC_015416	AG	4	8	547632	547639	50 %	0 %	50 %	0 %	330506833
11051	NC_015416	AAC	2	6	547650	547655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506833
11052	NC_015416	AGC	2	6	547656	547661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506833
11053	NC_015416	TCA	2	6	547693	547698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506833
11054	NC_015416	CCGG	2	8	547745	547752	0 %	0 %	50 %	50 %	330506833
11055	NC_015416	GA	4	8	547854	547861	50 %	0 %	50 %	0 %	330506833
11056	NC_015416	TC	3	6	547879	547884	0 %	50 %	0 %	50 %	330506833
11057	NC_015416	GTG	2	6	547905	547910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506833
11058	NC_015416	AT	3	6	547949	547954	50 %	50 %	0 %	0 %	330506833
11059	NC_015416	CAAG	2	8	547978	547985	50 %	0 %	25 %	25 %	330506833
11060	NC_015416	ATG	2	6	548160	548165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506833
11061	NC_015416	GAG	2	6	548169	548174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506833
11062	NC_015416	CTT	2	6	548176	548181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506833
11063	NC_015416	GCT	4	12	548190	548201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506833
11064	NC_015416	T	8	8	548217	548224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_015416	GAAA	2	8	548233	548240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_015416	GA	3	6	548248	548253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_015416	AG	3	6	548350	548355	50 %	0 %	50 %	0 %	330506834
11068	NC_015416	ACT	2	6	548480	548485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506834
11069	NC_015416	ACTCAG	2	12	548521	548532	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330506834
11070	NC_015416	ACC	2	6	548552	548557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506834
11071	NC_015416	CT	3	6	548635	548640	0 %	50 %	0 %	50 %	330506834
11072	NC_015416	CCT	2	6	548663	548668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506834
11073	NC_015416	CAC	2	6	548758	548763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506834
11074	NC_015416	CTT	2	6	548896	548901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506834
11075	NC_015416	CT	3	6	548965	548970	0 %	50 %	0 %	50 %	330506834
11076	NC_015416	CTA	2	6	548985	548990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506834
11077	NC_015416	ATA	2	6	549089	549094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506834
11078	NC_015416	TGG	2	6	549096	549101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506834
11079	NC_015416	CATTT	2	10	549103	549112	20 %	60 %	0 %	20 %	330506834
11080	NC_015416	CGG	2	6	549143	549148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506834
11081	NC_015416	ATG	2	6	549213	549218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506835
11082	NC_015416	AAG	2	6	549223	549228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506835
11083	NC_015416	TGG	2	6	549244	549249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506835
11084	NC_015416	CTG	2	6	549276	549281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506835
11085	NC_015416	GGA	2	6	549382	549387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506835
11086	NC_015416	GCT	2	6	549519	549524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506835
11087	NC_015416	ATC	2	6	549606	549611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506835
11088	NC_015416	CAT	2	6	549722	549727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506835
11089	NC_015416	AGTCC	2	10	549939	549948	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11090	NC_015416	GGA	2	6	549974	549979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_015416	ATC	2	6	550004	550009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_015416	AGG	2	6	550027	550032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_015416	CTG	2	6	550079	550084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_015416	AG	3	6	550129	550134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_015416	TGG	2	6	550161	550166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506836
11096	NC_015416	ACAAAG	2	12	550212	550223	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	330506836
11097	NC_015416	GAT	2	6	550225	550230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506836
11098	NC_015416	A	6	6	550321	550326	100 %	0 %	0 %	0 %	330506836
11099	NC_015416	AGA	2	6	550384	550389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506836
11100	NC_015416	TAA	2	6	550425	550430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506836
11101	NC_015416	GGA	2	6	550459	550464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506836
11102	NC_015416	TCA	2	6	550479	550484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506836
11103	NC_015416	TGA	2	6	550579	550584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506836
11104	NC_015416	TAA	2	6	550722	550727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506836
11105	NC_015416	GAC	2	6	550895	550900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506836
11106	NC_015416	CCAA	2	8	550929	550936	50 %	0 %	0 %	50 %	330506836
11107	NC_015416	TCAT	2	8	550975	550982	25 %	50 %	0 %	25 %	330506836
11108	NC_015416	GGAT	2	8	551016	551023	25 %	25 %	50 %	0 %	330506836
11109	NC_015416	AGA	2	6	551089	551094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506836
11110	NC_015416	GTG	2	6	551147	551152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506836
11111	NC_015416	CGAA	2	8	551199	551206	50 %	0 %	25 %	25 %	330506836
11112	NC_015416	GAT	2	6	551210	551215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506836
11113	NC_015416	CAG	2	6	551304	551309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506836
11114	NC_015416	ATTG	2	8	551350	551357	25 %	50 %	25 %	0 %	330506836
11115	NC_015416	GAC	2	6	551389	551394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506836
11116	NC_015416	GGA	2	6	551404	551409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506836
11117	NC_015416	AGCT	2	8	551418	551425	25 %	25 %	25 %	25 %	330506836
11118	NC_015416	CATAGA	2	12	551434	551445	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330506836
11119	NC_015416	CGAA	2	8	551514	551521	50 %	0 %	25 %	25 %	330506836
11120	NC_015416	TGA	2	6	551524	551529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506836
11121	NC_015416	GATC	2	8	551647	551654	25 %	25 %	25 %	25 %	330506836
11122	NC_015416	CCAAT	2	10	551655	551664	40 %	20 %	0 %	40 %	330506836
11123	NC_015416	GGA	2	6	551719	551724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506836
11124	NC_015416	TTA	2	6	551736	551741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506836
11125	NC_015416	AAAT	2	8	551764	551771	75 %	25 %	0 %	0 %	330506836
11126	NC_015416	GAT	2	6	551797	551802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506836
11127	NC_015416	TGA	2	6	551839	551844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506836
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11129	NC_015416	ATGG	2	8	551962	551969	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_015416	G	6	6	551968	551973	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11131	NC_015416	CTT	2	6	551995	552000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11132	NC_015416	CTT	2	6	552004	552009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11133	NC_015416	TGC	2	6	552173	552178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506837
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11138	NC_015416	CT	3	6	552358	552363	0 %	50 %	0 %	50 %	330506837
11139	NC_015416	GCC	2	6	552364	552369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506837
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11148	NC_015416	CTG	2	6	553023	553028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11150	NC_015416	TGT	2	6	553174	553179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11151	NC_015416	TCC	2	6	553293	553298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11152	NC_015416	AGA	2	6	553443	553448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11154	NC_015416	CCG	2	6	553483	553488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11170	NC_015416	T	6	6	554740	554745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11174	NC_015416	CATA	2	8	554979	554986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11211	NC_015416	AGT	2	6	556827	556832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11231	NC_015416	GAT	2	6	557654	557659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506842
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11233	NC_015416	A	6	6	557696	557701	100 %	0 %	0 %	0 %	330506842
11234	NC_015416	TGA	2	6	557708	557713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506842
11235	NC_015416	TGGCG	2	10	557784	557793	0 %	20 %	60 %	20 %	330506842
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11237	NC_015416	AAGGTG	2	12	557820	557831	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	330506842
11238	NC_015416	GTC	2	6	557838	557843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506842
11239	NC_015416	GAT	2	6	557847	557852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506842
11240	NC_015416	GGT	2	6	557864	557869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506842
11241	NC_015416	ATC	2	6	557874	557879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506842
11242	NC_015416	GACG	2	8	557966	557973	25 %	0 %	50 %	25 %	330506842
11243	NC_015416	T	6	6	558000	558005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11244	NC_015416	T	6	6	558058	558063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11245	NC_015416	TA	3	6	558066	558071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11246	NC_015416	TCA	2	6	558132	558137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11297	NC_015416	ATT	2	6	561019	561024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11356	NC_015416	TAT	2	6	563924	563929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11363	NC_015416	GTA	2	6	564058	564063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11368	NC_015416	GA	3	6	564423	564428	50 %	0 %	50 %	0 %	330506852
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11480	NC_015416	AGC	2	6	570539	570544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506861
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11482	NC_015416	AAGA	2	8	570671	570678	75 %	0 %	25 %	0 %	330506861
11483	NC_015416	CTA	2	6	570688	570693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506861
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11486	NC_015416	CAGG	2	8	570834	570841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11487	NC_015416	A	8	8	570938	570945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11488	NC_015416	ATC	2	6	570968	570973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506862
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11490	NC_015416	ATT	2	6	571007	571012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506862
11491	NC_015416	C	6	6	571050	571055	0 %	0 %	0 %	100 %	330506862
11492	NC_015416	TGC	2	6	571078	571083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506862
11493	NC_015416	TCAG	2	8	571161	571168	25 %	25 %	25 %	25 %	330506862
11494	NC_015416	CTGTA	2	10	571226	571235	20 %	40 %	20 %	20 %	330506862
11495	NC_015416	CAA	2	6	571243	571248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506862
11496	NC_015416	AG	3	6	571265	571270	50 %	0 %	50 %	0 %	330506862
11497	NC_015416	GTGG	2	8	571314	571321	0 %	25 %	75 %	0 %	330506862
11498	NC_015416	GATCG	2	10	571373	571382	20 %	20 %	40 %	20 %	330506862
11499	NC_015416	A	6	6	571386	571391	100 %	0 %	0 %	0 %	330506862
11500	NC_015416	GAA	2	6	571400	571405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506862

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