MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015416	CT	3	6	519573	519578	0 %	50 %	0 %	50 %	330506807
10502	NC_015416	GAT	2	6	519637	519642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506807
10503	NC_015416	TCT	2	6	519814	519819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506807
10504	NC_015416	CTC	2	6	519833	519838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506807
10505	NC_015416	T	7	7	519871	519877	0 %	100 %	0 %	0 %	330506807
10506	NC_015416	CT	4	8	519911	519918	0 %	50 %	0 %	50 %	330506807
10507	NC_015416	CCA	2	6	519947	519952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506807
10508	NC_015416	TCC	2	6	520032	520037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506807
10509	NC_015416	TTGA	2	8	520052	520059	25 %	50 %	25 %	0 %	330506807
10510	NC_015416	TCT	2	6	520072	520077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506807
10511	NC_015416	GGGA	2	8	520117	520124	25 %	0 %	75 %	0 %	330506807
10512	NC_015416	GGA	2	6	520135	520140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506807
10513	NC_015416	GCA	2	6	520248	520253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506807
10514	NC_015416	GGT	2	6	520306	520311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506807
10515	NC_015416	GAT	2	6	520420	520425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506808
10516	NC_015416	CCA	3	9	520485	520493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506808
10517	NC_015416	CCT	2	6	520524	520529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506808
10518	NC_015416	GCTG	2	8	520544	520551	0 %	25 %	50 %	25 %	330506808
10519	NC_015416	T	6	6	520682	520687	0 %	100 %	0 %	0 %	330506808
10520	NC_015416	GCA	2	6	520689	520694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506808
10521	NC_015416	GGAT	2	8	520695	520702	25 %	25 %	50 %	0 %	330506808
10522	NC_015416	AGA	2	6	520715	520720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506808
10523	NC_015416	TCC	2	6	520721	520726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506808
10524	NC_015416	TCA	2	6	520739	520744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506808
10525	NC_015416	CT	3	6	520762	520767	0 %	50 %	0 %	50 %	330506808
10526	NC_015416	AG	3	6	520793	520798	50 %	0 %	50 %	0 %	330506808
10527	NC_015416	CTGC	2	8	520845	520852	0 %	25 %	25 %	50 %	330506808
10528	NC_015416	ATT	2	6	520950	520955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506809
10529	NC_015416	CTT	2	6	521068	521073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506809
10530	NC_015416	CAT	2	6	521079	521084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506809
10531	NC_015416	CT	4	8	521101	521108	0 %	50 %	0 %	50 %	330506809
10532	NC_015416	TCT	2	6	521112	521117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506809
10533	NC_015416	GCT	2	6	521154	521159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506809
10534	NC_015416	CT	3	6	521188	521193	0 %	50 %	0 %	50 %	330506809
10535	NC_015416	CCA	2	6	521223	521228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506809
10536	NC_015416	GC	3	6	521335	521340	0 %	0 %	50 %	50 %	330506809
10537	NC_015416	TAA	2	6	521468	521473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_015416	ATGA	2	8	521503	521510	50 %	25 %	25 %	0 %	330506810
10539	NC_015416	GGA	2	6	521565	521570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506810
10540	NC_015416	GAT	2	6	521703	521708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506810
10541	NC_015416	GTT	2	6	521779	521784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506810
10542	NC_015416	AGG	2	6	521804	521809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506810
10543	NC_015416	CAG	2	6	521842	521847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506810
10544	NC_015416	CGG	2	6	521888	521893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506810
10545	NC_015416	GAG	2	6	521911	521916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506810
10546	NC_015416	TC	3	6	521933	521938	0 %	50 %	0 %	50 %	330506810
10547	NC_015416	GCC	2	6	522033	522038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506810
10548	NC_015416	CTG	2	6	522049	522054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506810
10549	NC_015416	CCA	2	6	522061	522066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506810
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10552	NC_015416	CGC	2	6	522259	522264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506810
10553	NC_015416	ATGG	2	8	522265	522272	25 %	25 %	50 %	0 %	330506810
10554	NC_015416	GATG	2	8	522327	522334	25 %	25 %	50 %	0 %	330506810
10555	NC_015416	CGC	2	6	522366	522371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506810
10556	NC_015416	AGG	2	6	522455	522460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506810
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10558	NC_015416	GAG	2	6	522607	522612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506810
10559	NC_015416	GGC	2	6	522645	522650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506810
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10561	NC_015416	CAG	2	6	522706	522711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506810
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10563	NC_015416	GCCG	2	8	522800	522807	0 %	0 %	50 %	50 %	330506811
10564	NC_015416	CGG	2	6	522811	522816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506811
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10567	NC_015416	TGGG	2	8	522909	522916	0 %	25 %	75 %	0 %	330506811
10568	NC_015416	GAT	2	6	522944	522949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506811
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10570	NC_015416	CGCC	2	8	523036	523043	0 %	0 %	25 %	75 %	330506811
10571	NC_015416	TTC	2	6	523069	523074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506811
10572	NC_015416	TCCT	2	8	523095	523102	0 %	50 %	0 %	50 %	330506811
10573	NC_015416	GCT	3	9	523168	523176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506811
10574	NC_015416	CGG	2	6	523215	523220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506811
10575	NC_015416	GAT	2	6	523222	523227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506811
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10577	NC_015416	TC	3	6	523306	523311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10578	NC_015416	GGC	2	6	523408	523413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506812
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10580	NC_015416	ATG	2	6	523460	523465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506812
10581	NC_015416	GCT	3	9	523556	523564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506812
10582	NC_015416	GGAT	2	8	523574	523581	25 %	25 %	50 %	0 %	330506812
10583	NC_015416	A	8	8	523635	523642	100 %	0 %	0 %	0 %	330506812
10584	NC_015416	A	7	7	523715	523721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_015416	GTT	2	6	523898	523903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506813
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10588	NC_015416	GAG	2	6	523978	523983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506813
10589	NC_015416	GAGCA	2	10	524015	524024	40 %	0 %	40 %	20 %	330506813
10590	NC_015416	ACT	2	6	524085	524090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506814
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10592	NC_015416	CA	4	8	524235	524242	50 %	0 %	0 %	50 %	330506814
10593	NC_015416	CTGG	2	8	524299	524306	0 %	25 %	50 %	25 %	330506814
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10600	NC_015416	TC	3	6	524931	524936	0 %	50 %	0 %	50 %	330506814
10601	NC_015416	AATC	2	8	524971	524978	50 %	25 %	0 %	25 %	330506814
10602	NC_015416	TA	3	6	524987	524992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_015416	ATA	2	6	525004	525009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_015416	GAA	2	6	525048	525053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506815
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10606	NC_015416	GTC	2	6	525169	525174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506815
10607	NC_015416	TTGGT	2	10	525221	525230	0 %	60 %	40 %	0 %	330506815
10608	NC_015416	CAC	2	6	525293	525298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506815
10609	NC_015416	TGA	2	6	525398	525403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506815
10610	NC_015416	AAG	2	6	525420	525425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506815
10611	NC_015416	A	6	6	525480	525485	100 %	0 %	0 %	0 %	330506815
10612	NC_015416	TAA	2	6	525578	525583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506815
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10615	NC_015416	GAT	2	6	525618	525623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506815
10616	NC_015416	A	6	6	525650	525655	100 %	0 %	0 %	0 %	330506815
10617	NC_015416	GCA	2	6	525658	525663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506815
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10620	NC_015416	A	6	6	525846	525851	100 %	0 %	0 %	0 %	330506815
10621	NC_015416	ATG	2	6	526011	526016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506815
10622	NC_015416	ACA	2	6	526030	526035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506815
10623	NC_015416	GA	3	6	526097	526102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_015416	AAC	2	6	526165	526170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506816
10625	NC_015416	CCCT	2	8	526233	526240	0 %	25 %	0 %	75 %	330506816
10626	NC_015416	TGGT	2	8	526258	526265	0 %	50 %	50 %	0 %	330506816
10627	NC_015416	TGA	2	6	526280	526285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506816
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10631	NC_015416	TCC	2	6	526604	526609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10632	NC_015416	ATTG	2	8	526723	526730	25 %	50 %	25 %	0 %	330506817
10633	NC_015416	CT	3	6	526854	526859	0 %	50 %	0 %	50 %	330506818
10634	NC_015416	TCA	2	6	526860	526865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506818
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10653	NC_015416	TCA	2	6	527818	527823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506818
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10658	NC_015416	AAAT	2	8	528202	528209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10659	NC_015416	CATGAT	2	12	528227	528238	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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10662	NC_015416	CTC	2	6	528318	528323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10663	NC_015416	GGAT	2	8	528415	528422	25 %	25 %	50 %	0 %	330506819
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10686	NC_015416	AGATA	2	10	529943	529952	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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10701	NC_015416	TGG	2	6	530640	530645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10734	NC_015416	TAT	2	6	532122	532127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10735	NC_015416	TGC	2	6	532150	532155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10739	NC_015416	ACT	2	6	532195	532200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10741	NC_015416	T	7	7	532288	532294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10742	NC_015416	TCC	2	6	532303	532308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10743	NC_015416	CTA	2	6	532313	532318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10744	NC_015416	CTT	2	6	532328	532333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10991	NC_015416	GAT	2	6	544285	544290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506830
10992	NC_015416	GAC	2	6	544328	544333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506830
10993	NC_015416	AAC	2	6	544360	544365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10994	NC_015416	AG	3	6	544397	544402	50 %	0 %	50 %	0 %	330506831
10995	NC_015416	GCA	2	6	544449	544454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506831
10996	NC_015416	TCC	3	9	544598	544606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506831
10997	NC_015416	GGC	2	6	544667	544672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506831
10998	NC_015416	GAA	2	6	544675	544680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506831
10999	NC_015416	ATT	2	6	544760	544765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506831
11000	NC_015416	CCT	2	6	544945	544950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506831

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