MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015416	CT	3	6	296906	296911	0 %	50 %	0 %	50 %	330506600
6002	NC_015416	CTTT	2	8	296924	296931	0 %	75 %	0 %	25 %	330506600
6003	NC_015416	AAT	2	6	296934	296939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506600
6004	NC_015416	GAG	2	6	296954	296959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506600
6005	NC_015416	TCT	2	6	297041	297046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506601
6006	NC_015416	ATTG	2	8	297067	297074	25 %	50 %	25 %	0 %	330506601
6007	NC_015416	GCC	2	6	297157	297162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506601
6008	NC_015416	CAT	2	6	297286	297291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_015416	CAT	2	6	297376	297381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_015416	CCCAC	2	10	297405	297414	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6011	NC_015416	GACA	2	8	297438	297445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6012	NC_015416	ATC	2	6	297475	297480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_015416	TCAGA	2	10	297610	297619	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6014	NC_015416	TAA	2	6	297633	297638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_015416	TCA	2	6	297649	297654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_015416	GCCT	2	8	297667	297674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_015416	GAT	2	6	297675	297680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_015416	CT	3	6	297705	297710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_015416	ATC	2	6	297741	297746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_015416	CTTC	2	8	297766	297773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6021	NC_015416	TCT	2	6	297797	297802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_015416	TATG	2	8	297917	297924	25 %	50 %	25 %	0 %	330506602
6023	NC_015416	TAT	2	6	297943	297948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506602
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6025	NC_015416	TTC	2	6	297967	297972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506602
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6027	NC_015416	GAT	2	6	298037	298042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506602
6028	NC_015416	AT	3	6	298077	298082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_015416	TCT	2	6	298118	298123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506603
6030	NC_015416	TCCC	2	8	298172	298179	0 %	25 %	0 %	75 %	330506603
6031	NC_015416	GTA	2	6	298242	298247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506603
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6033	NC_015416	TCT	2	6	298337	298342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506603
6034	NC_015416	CCA	2	6	298343	298348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506603
6035	NC_015416	GAACTT	2	12	298392	298403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330506603
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6040	NC_015416	AT	3	6	298580	298585	50 %	50 %	0 %	0 %	330506603
6041	NC_015416	C	6	6	298586	298591	0 %	0 %	0 %	100 %	330506603
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6045	NC_015416	TGA	2	6	298777	298782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_015416	TAG	2	6	298852	298857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_015416	ATT	2	6	298886	298891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_015416	CTC	2	6	298956	298961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506604
6049	NC_015416	ATTG	2	8	299238	299245	25 %	50 %	25 %	0 %	330506604
6050	NC_015416	CAT	3	9	299287	299295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506604
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6054	NC_015416	AAC	2	6	299475	299480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506604
6055	NC_015416	T	6	6	299487	299492	0 %	100 %	0 %	0 %	330506604
6056	NC_015416	TTCT	2	8	299500	299507	0 %	75 %	0 %	25 %	330506604
6057	NC_015416	GAT	2	6	299553	299558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506604
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6059	NC_015416	GA	3	6	299667	299672	50 %	0 %	50 %	0 %	330506604
6060	NC_015416	GCT	2	6	299731	299736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506604
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6063	NC_015416	ATA	3	9	299847	299855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_015416	CTT	2	6	299873	299878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_015416	TCG	2	6	299991	299996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506605
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6079	NC_015416	ACC	2	6	300342	300347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_015416	TA	3	6	300352	300357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6082	NC_015416	GA	3	6	300659	300664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_015416	GAT	2	6	300709	300714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506606
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6094	NC_015416	CAG	2	6	301259	301264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_015416	TGG	2	6	301272	301277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_015416	AG	3	6	301348	301353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_015416	CTTG	2	8	301420	301427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6098	NC_015416	AGC	2	6	301474	301479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_015416	AGC	2	6	301656	301661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_015416	TAA	2	6	301662	301667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6106	NC_015416	GAA	2	6	301945	301950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_015416	GATCA	2	10	302116	302125	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6108	NC_015416	CGG	2	6	302169	302174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_015416	CCG	2	6	302200	302205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_015416	GGA	2	6	302238	302243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_015416	AT	3	6	302250	302255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_015416	TCGT	2	8	302310	302317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6113	NC_015416	TGA	2	6	302327	302332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_015416	GCC	2	6	302365	302370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_015416	GCA	2	6	302372	302377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_015416	AGGAT	2	10	302390	302399	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_015416	TCA	2	6	302423	302428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_015416	TGCCG	2	10	302616	302625	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6119	NC_015416	TCC	2	6	302642	302647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_015416	CGG	2	6	302754	302759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6123	NC_015416	GAG	2	6	302917	302922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_015416	CGC	2	6	302963	302968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_015416	TCGAT	2	10	303052	303061	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6126	NC_015416	GCCT	2	8	303063	303070	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_015416	TCA	2	6	303101	303106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_015416	ATC	2	6	303118	303123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_015416	AGG	2	6	303311	303316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_015416	TTC	2	6	303334	303339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506608
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6245	NC_015416	T	8	8	309524	309531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6249	NC_015416	TAT	2	6	309745	309750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6250	NC_015416	T	6	6	309761	309766	0 %	100 %	0 %	0 %	330506614
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6254	NC_015416	GGA	2	6	310080	310085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506614
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6373	NC_015416	A	6	6	316537	316542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6375	NC_015416	CTC	3	9	316619	316627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506621
6376	NC_015416	CCGGCC	2	12	316686	316697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506621
6377	NC_015416	ATC	2	6	316755	316760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506621
6378	NC_015416	CCT	2	6	316855	316860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506621
6379	NC_015416	TCATTC	2	12	316923	316934	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	330506621
6380	NC_015416	GCTG	2	8	317000	317007	0 %	25 %	50 %	25 %	330506621
6381	NC_015416	CGTT	2	8	317147	317154	0 %	50 %	25 %	25 %	330506621
6382	NC_015416	AG	3	6	317210	317215	50 %	0 %	50 %	0 %	330506621
6383	NC_015416	CGC	2	6	317251	317256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506621
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6385	NC_015416	GTA	2	6	317354	317359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506621
6386	NC_015416	GTA	2	6	317414	317419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506621
6387	NC_015416	TGAT	2	8	317492	317499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6388	NC_015416	TAAA	2	8	317513	317520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6389	NC_015416	CAG	2	6	317608	317613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6402	NC_015416	AGTG	2	8	318264	318271	25 %	25 %	50 %	0 %	330506622
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6412	NC_015416	CGA	2	6	318908	318913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506622
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6463	NC_015416	TTG	2	6	321415	321420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506624
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6465	NC_015416	GTA	2	6	321501	321506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506624
6466	NC_015416	TC	4	8	321525	321532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6467	NC_015416	TCA	2	6	321631	321636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506625
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6477	NC_015416	GGTT	2	8	322218	322225	0 %	50 %	50 %	0 %	330506625
6478	NC_015416	GATC	2	8	322268	322275	25 %	25 %	25 %	25 %	330506625
6479	NC_015416	GCG	2	6	322286	322291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506625
6480	NC_015416	GCA	2	6	322292	322297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506625
6481	NC_015416	CG	3	6	322303	322308	0 %	0 %	50 %	50 %	330506625
6482	NC_015416	AGA	2	6	322328	322333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506625
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6485	NC_015416	TTCCA	2	10	322441	322450	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6486	NC_015416	TCCT	2	8	322511	322518	0 %	50 %	0 %	50 %	330506626
6487	NC_015416	GAT	2	6	322536	322541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506626
6488	NC_015416	GAT	2	6	322611	322616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506626
6489	NC_015416	GCC	2	6	322733	322738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506626
6490	NC_015416	ATG	2	6	322759	322764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506626
6491	NC_015416	GCA	2	6	322787	322792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506626
6492	NC_015416	CCGAG	2	10	322859	322868	20 %	0 %	40 %	40 %	330506626
6493	NC_015416	GAC	2	6	322923	322928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506626
6494	NC_015416	T	6	6	322930	322935	0 %	100 %	0 %	0 %	330506626
6495	NC_015416	GGC	2	6	322954	322959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506626
6496	NC_015416	CAC	2	6	322973	322978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506626
6497	NC_015416	CCT	2	6	323030	323035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506626
6498	NC_015416	TCGC	2	8	323056	323063	0 %	25 %	25 %	50 %	330506626
6499	NC_015416	CAAT	2	8	323075	323082	50 %	25 %	0 %	25 %	330506626
6500	NC_015416	TCT	2	6	323102	323107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506626

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