MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_015416	CT	3	6	2684305	2684310	0 %	50 %	0 %	50 %	330508868
55002	NC_015416	CCT	2	6	2684314	2684319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508868
55003	NC_015416	T	6	6	2684414	2684419	0 %	100 %	0 %	0 %	330508868
55004	NC_015416	AGGC	2	8	2684422	2684429	25 %	0 %	50 %	25 %	330508868
55005	NC_015416	T	6	6	2684443	2684448	0 %	100 %	0 %	0 %	330508868
55006	NC_015416	TGG	2	6	2684636	2684641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508869
55007	NC_015416	GAG	3	9	2684704	2684712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508869
55008	NC_015416	GAT	2	6	2684802	2684807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508869
55009	NC_015416	CTC	2	6	2684811	2684816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508869
55010	NC_015416	GAGAT	2	10	2684875	2684884	40 %	20 %	40 %	0 %	330508869
55011	NC_015416	CCG	2	6	2684891	2684896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508869
55012	NC_015416	ACC	2	6	2684938	2684943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508869
55013	NC_015416	TCG	2	6	2684947	2684952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508869
55014	NC_015416	AGT	2	6	2684996	2685001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508869
55015	NC_015416	A	6	6	2685007	2685012	100 %	0 %	0 %	0 %	330508869
55016	NC_015416	ATC	2	6	2685046	2685051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508869
55017	NC_015416	TCC	2	6	2685076	2685081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508869
55018	NC_015416	GAC	2	6	2685135	2685140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508869
55019	NC_015416	CCCTG	2	10	2685278	2685287	0 %	20 %	20 %	60 %	330508869
55020	NC_015416	CCGG	2	8	2685296	2685303	0 %	0 %	50 %	50 %	330508869
55021	NC_015416	CAG	2	6	2685356	2685361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508869
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55023	NC_015416	TGC	2	6	2685395	2685400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508869
55024	NC_015416	CAT	2	6	2685420	2685425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508869
55025	NC_015416	GCT	2	6	2685430	2685435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508869
55026	NC_015416	AG	3	6	2685456	2685461	50 %	0 %	50 %	0 %	330508869
55027	NC_015416	AGG	2	6	2685475	2685480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508869
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55029	NC_015416	TAA	2	6	2685548	2685553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55030	NC_015416	AAGA	2	8	2685592	2685599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55031	NC_015416	TGGG	2	8	2685652	2685659	0 %	25 %	75 %	0 %	330508870
55032	NC_015416	ACG	2	6	2685667	2685672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508870
55033	NC_015416	CCA	2	6	2685728	2685733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508870
55034	NC_015416	TGC	2	6	2685809	2685814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508870
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55036	NC_015416	TGC	2	6	2685914	2685919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508870
55037	NC_015416	TTG	2	6	2685997	2686002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508870
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55041	NC_015416	CTG	2	6	2686134	2686139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508870
55042	NC_015416	GAGCCC	2	12	2686140	2686151	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330508870
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55051	NC_015416	TGGA	2	8	2686461	2686468	25 %	25 %	50 %	0 %	330508870
55052	NC_015416	GAAGA	2	10	2686478	2686487	60 %	0 %	40 %	0 %	330508870
55053	NC_015416	ACT	2	6	2686529	2686534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508870
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55060	NC_015416	TC	3	6	2687195	2687200	0 %	50 %	0 %	50 %	330508872
55061	NC_015416	GAA	2	6	2687217	2687222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508872
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55065	NC_015416	TTG	2	6	2687450	2687455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508872
55066	NC_015416	TCCCC	2	10	2687549	2687558	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
55067	NC_015416	TCT	2	6	2687572	2687577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55068	NC_015416	A	8	8	2687605	2687612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55069	NC_015416	A	8	8	2687617	2687624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55070	NC_015416	GA	3	6	2687635	2687640	50 %	0 %	50 %	0 %	330508873
55071	NC_015416	GGC	2	6	2687655	2687660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508873
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55085	NC_015416	AT	3	6	2688153	2688158	50 %	50 %	0 %	0 %	330508873
55086	NC_015416	TCC	2	6	2688213	2688218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508873
55087	NC_015416	TGCCTA	2	12	2688224	2688235	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330508873
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55089	NC_015416	ATC	2	6	2688271	2688276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508873
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55098	NC_015416	TGC	2	6	2688630	2688635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55099	NC_015416	GAT	2	6	2688748	2688753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508875
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55102	NC_015416	TCA	2	6	2688816	2688821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508875
55103	NC_015416	GCC	2	6	2688946	2688951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508875
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55105	NC_015416	TCT	2	6	2688967	2688972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508875
55106	NC_015416	CAGCT	2	10	2689030	2689039	20 %	20 %	20 %	40 %	330508875
55107	NC_015416	GCT	3	9	2689037	2689045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508875
55108	NC_015416	TGG	2	6	2689050	2689055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508875
55109	NC_015416	TA	3	6	2689135	2689140	50 %	50 %	0 %	0 %	330508875
55110	NC_015416	GCG	2	6	2689154	2689159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508875
55111	NC_015416	AG	3	6	2689208	2689213	50 %	0 %	50 %	0 %	330508875
55112	NC_015416	AT	3	6	2689302	2689307	50 %	50 %	0 %	0 %	330508875
55113	NC_015416	CA	3	6	2689324	2689329	50 %	0 %	0 %	50 %	330508875
55114	NC_015416	TTCA	2	8	2689369	2689376	25 %	50 %	0 %	25 %	330508875
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55118	NC_015416	TGG	2	6	2689445	2689450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508875
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55129	NC_015416	ATCA	2	8	2690416	2690423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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55220	NC_015416	TAG	2	6	2694445	2694450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55221	NC_015416	TTG	2	6	2694526	2694531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55222	NC_015416	ATGG	2	8	2694570	2694577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55223	NC_015416	AGA	2	6	2694596	2694601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55224	NC_015416	AGGA	2	8	2694689	2694696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55225	NC_015416	TGG	2	6	2694775	2694780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55226	NC_015416	AGA	2	6	2694784	2694789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55227	NC_015416	TA	3	6	2694847	2694852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55228	NC_015416	CGAAGG	2	12	2694856	2694867	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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55230	NC_015416	AATC	2	8	2695050	2695057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55231	NC_015416	AAGC	2	8	2695075	2695082	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55232	NC_015416	TCCT	2	8	2695116	2695123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55233	NC_015416	TAAT	2	8	2695206	2695213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55234	NC_015416	AT	4	8	2695248	2695255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55235	NC_015416	ATA	2	6	2695292	2695297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55237	NC_015416	ATTG	2	8	2695483	2695490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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55476	NC_015416	TCA	2	6	2708251	2708256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55477	NC_015416	ATC	2	6	2708284	2708289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508891
55478	NC_015416	TCG	2	6	2708300	2708305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508891
55479	NC_015416	TCC	2	6	2708351	2708356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508891
55480	NC_015416	CTT	2	6	2708363	2708368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508891
55481	NC_015416	CTC	2	6	2708374	2708379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508891
55482	NC_015416	CT	3	6	2708416	2708421	0 %	50 %	0 %	50 %	330508891
55483	NC_015416	ATC	2	6	2708462	2708467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508891
55484	NC_015416	CTG	2	6	2708471	2708476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508891
55485	NC_015416	CGG	2	6	2708516	2708521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508891
55486	NC_015416	CTG	2	6	2708541	2708546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508891
55487	NC_015416	TTC	2	6	2708646	2708651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508891
55488	NC_015416	CCA	2	6	2708697	2708702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508891
55489	NC_015416	GCA	2	6	2708750	2708755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508891
55490	NC_015416	GTC	2	6	2708806	2708811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508891
55491	NC_015416	TTC	2	6	2708857	2708862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508891
55492	NC_015416	TC	3	6	2708885	2708890	0 %	50 %	0 %	50 %	330508891
55493	NC_015416	AATGA	2	10	2708907	2708916	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55494	NC_015416	CAA	2	6	2708923	2708928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55495	NC_015416	A	7	7	2708971	2708977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55496	NC_015416	ATA	2	6	2708981	2708986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55497	NC_015416	TCA	2	6	2708989	2708994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55498	NC_015416	AAATTG	2	12	2709008	2709019	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55499	NC_015416	AT	3	6	2709076	2709081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55500	NC_015416	GA	3	6	2709145	2709150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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