MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52001	NC_015416	CT	3	6	2539315	2539320	0 %	50 %	0 %	50 %	330508718
52002	NC_015416	TGCT	2	8	2539369	2539376	0 %	50 %	25 %	25 %	330508718
52003	NC_015416	CCT	2	6	2539381	2539386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508718
52004	NC_015416	GGA	2	6	2539414	2539419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508718
52005	NC_015416	A	6	6	2539431	2539436	100 %	0 %	0 %	0 %	330508718
52006	NC_015416	TGG	2	6	2539456	2539461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508718
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52010	NC_015416	TC	3	6	2539731	2539736	0 %	50 %	0 %	50 %	330508719
52011	NC_015416	CT	3	6	2539826	2539831	0 %	50 %	0 %	50 %	330508719
52012	NC_015416	GGC	2	6	2539965	2539970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508719
52013	NC_015416	TGG	2	6	2540009	2540014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508719
52014	NC_015416	TGA	2	6	2540016	2540021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508719
52015	NC_015416	GAG	3	9	2540059	2540067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508719
52016	NC_015416	TGA	2	6	2540095	2540100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508719
52017	NC_015416	CGAT	2	8	2540111	2540118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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52111	NC_015416	TA	3	6	2545354	2545359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52115	NC_015416	GATG	2	8	2545736	2545743	25 %	25 %	50 %	0 %	330508725
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52117	NC_015416	T	6	6	2545758	2545763	0 %	100 %	0 %	0 %	330508725
52118	NC_015416	GAA	2	6	2545779	2545784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508725
52119	NC_015416	CAG	2	6	2545788	2545793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508725
52120	NC_015416	ATG	2	6	2545794	2545799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508725
52121	NC_015416	ATG	2	6	2545806	2545811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508725
52122	NC_015416	ATG	3	9	2545815	2545823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508725
52123	NC_015416	ATG	2	6	2545827	2545832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508725
52124	NC_015416	ATG	2	6	2545839	2545844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508725
52125	NC_015416	ATG	2	6	2545866	2545871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508725
52126	NC_015416	ATG	2	6	2545875	2545880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508725
52127	NC_015416	GCA	2	6	2545913	2545918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508725
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52129	NC_015416	GAT	2	6	2545931	2545936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508725
52130	NC_015416	ATG	2	6	2545953	2545958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508725
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52140	NC_015416	C	6	6	2546608	2546613	0 %	0 %	0 %	100 %	330508726
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52152	NC_015416	TGA	2	6	2547378	2547383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508726
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52154	NC_015416	TCT	2	6	2547474	2547479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508726
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52166	NC_015416	TAG	2	6	2548112	2548117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52186	NC_015416	T	6	6	2549018	2549023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52187	NC_015416	CT	4	8	2549061	2549068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52188	NC_015416	TA	3	6	2549087	2549092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52193	NC_015416	TA	3	6	2549172	2549177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52221	NC_015416	AG	3	6	2550319	2550324	50 %	0 %	50 %	0 %	330508729
52222	NC_015416	GAA	2	6	2550342	2550347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508729
52223	NC_015416	GGA	3	9	2550354	2550362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508729
52224	NC_015416	TGC	2	6	2550421	2550426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508729
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52229	NC_015416	GTG	2	6	2550626	2550631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508730
52230	NC_015416	GCT	2	6	2550659	2550664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508730
52231	NC_015416	TGG	2	6	2550720	2550725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508730
52232	NC_015416	GAG	2	6	2550743	2550748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508730
52233	NC_015416	CT	3	6	2550896	2550901	0 %	50 %	0 %	50 %	330508730
52234	NC_015416	ATGC	2	8	2550905	2550912	25 %	25 %	25 %	25 %	330508730
52235	NC_015416	GCT	2	6	2551017	2551022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508730
52236	NC_015416	ATC	2	6	2551097	2551102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508730
52237	NC_015416	AAG	2	6	2551182	2551187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508730
52238	NC_015416	ATG	2	6	2551216	2551221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508730
52239	NC_015416	GCA	2	6	2551234	2551239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52240	NC_015416	CGC	2	6	2551430	2551435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508731
52241	NC_015416	AAAG	2	8	2551506	2551513	75 %	0 %	25 %	0 %	330508731
52242	NC_015416	TGT	2	6	2551575	2551580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508731
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52244	NC_015416	AGA	2	6	2551619	2551624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52245	NC_015416	CGA	2	6	2551639	2551644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52246	NC_015416	CT	3	6	2551648	2551653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52247	NC_015416	TGA	2	6	2551698	2551703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52248	NC_015416	GGA	2	6	2551757	2551762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508732
52249	NC_015416	TC	3	6	2551797	2551802	0 %	50 %	0 %	50 %	330508732
52250	NC_015416	AG	3	6	2551814	2551819	50 %	0 %	50 %	0 %	330508732
52251	NC_015416	TTG	2	6	2551845	2551850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508732
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52253	NC_015416	ACT	2	6	2551964	2551969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52254	NC_015416	GCT	2	6	2551992	2551997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52255	NC_015416	CG	3	6	2551998	2552003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52256	NC_015416	GGCA	2	8	2552110	2552117	25 %	0 %	50 %	25 %	330508733
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52264	NC_015416	CCTG	2	8	2552391	2552398	0 %	25 %	25 %	50 %	330508734
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52266	NC_015416	TGCCC	2	10	2552462	2552471	0 %	20 %	20 %	60 %	330508734
52267	NC_015416	GCA	2	6	2552558	2552563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508734
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52269	NC_015416	A	7	7	2552723	2552729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52271	NC_015416	AGGT	2	8	2552783	2552790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52272	NC_015416	CTT	2	6	2552833	2552838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52274	NC_015416	TGAT	2	8	2552899	2552906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52275	NC_015416	GAA	3	9	2552913	2552921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52276	NC_015416	ATG	2	6	2552973	2552978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52291	NC_015416	TA	3	6	2553640	2553645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52292	NC_015416	TAT	2	6	2553861	2553866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508736
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52342	NC_015416	ATA	3	9	2556403	2556411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508738
52343	NC_015416	ATT	2	6	2556424	2556429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52344	NC_015416	CAAA	2	8	2556506	2556513	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52345	NC_015416	TA	3	6	2556590	2556595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52346	NC_015416	AAGAT	2	10	2556637	2556646	60 %	20 %	20 %	0 %	330508739
52347	NC_015416	GCA	3	9	2556661	2556669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508739
52348	NC_015416	GTT	2	6	2556670	2556675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330508739
52349	NC_015416	CAGA	2	8	2556701	2556708	50 %	0 %	25 %	25 %	330508739
52350	NC_015416	GAG	2	6	2556816	2556821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508739
52351	NC_015416	GAA	2	6	2556911	2556916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508739
52352	NC_015416	AGT	2	6	2556981	2556986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52353	NC_015416	TGG	2	6	2556987	2556992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52354	NC_015416	ATGA	2	8	2557019	2557026	50 %	25 %	25 %	0 %	330508740
52355	NC_015416	AATC	2	8	2557041	2557048	50 %	25 %	0 %	25 %	330508740
52356	NC_015416	TGA	2	6	2557131	2557136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508740
52357	NC_015416	GAAG	2	8	2557225	2557232	50 %	0 %	50 %	0 %	330508740
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52359	NC_015416	CAT	2	6	2557292	2557297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508740
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52361	NC_015416	AG	3	6	2557328	2557333	50 %	0 %	50 %	0 %	330508740
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52422	NC_015416	CCAT	2	8	2559832	2559839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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52472	NC_015416	ATG	2	6	2562796	2562801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508745
52473	NC_015416	A	6	6	2562855	2562860	100 %	0 %	0 %	0 %	330508745
52474	NC_015416	GGA	2	6	2562885	2562890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508745
52475	NC_015416	CAGA	2	8	2562898	2562905	50 %	0 %	25 %	25 %	330508745
52476	NC_015416	TCC	2	6	2562935	2562940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508745
52477	NC_015416	CTA	2	6	2563218	2563223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508745
52478	NC_015416	ATA	2	6	2563233	2563238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508745
52479	NC_015416	ACC	2	6	2563241	2563246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508745
52480	NC_015416	AT	3	6	2563274	2563279	50 %	50 %	0 %	0 %	330508745
52481	NC_015416	AGA	2	6	2563287	2563292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508745
52482	NC_015416	ATC	2	6	2563362	2563367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508745
52483	NC_015416	AT	3	6	2563385	2563390	50 %	50 %	0 %	0 %	330508745
52484	NC_015416	TCTA	2	8	2563510	2563517	25 %	50 %	0 %	25 %	330508745
52485	NC_015416	GGGT	2	8	2563550	2563557	0 %	25 %	75 %	0 %	330508745
52486	NC_015416	CT	3	6	2563635	2563640	0 %	50 %	0 %	50 %	330508745
52487	NC_015416	AT	3	6	2563645	2563650	50 %	50 %	0 %	0 %	330508745
52488	NC_015416	AGA	2	6	2563952	2563957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508745
52489	NC_015416	TGC	2	6	2564041	2564046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508745
52490	NC_015416	CAG	2	6	2564074	2564079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52491	NC_015416	TGC	2	6	2564082	2564087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52492	NC_015416	CTT	2	6	2564104	2564109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52493	NC_015416	CTT	2	6	2564156	2564161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52494	NC_015416	CGATTG	2	12	2564169	2564180	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52495	NC_015416	GAA	2	6	2564228	2564233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52496	NC_015416	CAC	2	6	2564264	2564269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508746
52497	NC_015416	GCCC	2	8	2564379	2564386	0 %	0 %	25 %	75 %	330508746
52498	NC_015416	CAAAGA	2	12	2564439	2564450	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	330508746
52499	NC_015416	AGA	2	6	2564550	2564555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508746
52500	NC_015416	TC	3	6	2564620	2564625	0 %	50 %	0 %	50 %	330508746

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