MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_015416	CGC	2	6	2489234	2489239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508673
51002	NC_015416	T	6	6	2489286	2489291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51003	NC_015416	TGC	2	6	2489314	2489319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51004	NC_015416	GCC	2	6	2489359	2489364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51005	NC_015416	GAGC	2	8	2489419	2489426	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51006	NC_015416	GTT	2	6	2489613	2489618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51007	NC_015416	CTC	2	6	2489663	2489668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51008	NC_015416	TAAT	2	8	2489675	2489682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51009	NC_015416	CTC	2	6	2489685	2489690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51010	NC_015416	A	6	6	2489843	2489848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51011	NC_015416	GGC	2	6	2489904	2489909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508674
51012	NC_015416	GAG	2	6	2489921	2489926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508674
51013	NC_015416	ATC	2	6	2489988	2489993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508674
51014	NC_015416	CTT	2	6	2489996	2490001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508674
51015	NC_015416	TCG	2	6	2490012	2490017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508674
51016	NC_015416	AGC	2	6	2490020	2490025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508674
51017	NC_015416	CTA	2	6	2490103	2490108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508674
51018	NC_015416	TC	3	6	2490132	2490137	0 %	50 %	0 %	50 %	330508674
51019	NC_015416	GAA	2	6	2490161	2490166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508674
51020	NC_015416	AATT	2	8	2490192	2490199	50 %	50 %	0 %	0 %	330508674
51021	NC_015416	TAC	2	6	2490200	2490205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51022	NC_015416	GTA	2	6	2490343	2490348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51023	NC_015416	GCCCCT	2	12	2490410	2490421	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51024	NC_015416	GAA	2	6	2490434	2490439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51025	NC_015416	CTT	2	6	2490484	2490489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508675
51026	NC_015416	TGA	2	6	2490530	2490535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508675
51027	NC_015416	CCA	2	6	2490566	2490571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508675
51028	NC_015416	TGG	2	6	2490628	2490633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508675
51029	NC_015416	CCT	2	6	2490665	2490670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508675
51030	NC_015416	TCT	2	6	2490680	2490685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508675
51031	NC_015416	ATC	2	6	2490727	2490732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508675
51032	NC_015416	CCA	2	6	2490752	2490757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508675
51033	NC_015416	TC	3	6	2490793	2490798	0 %	50 %	0 %	50 %	330508675
51034	NC_015416	TCA	2	6	2490911	2490916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508675
51035	NC_015416	ACCC	2	8	2490935	2490942	25 %	0 %	0 %	75 %	330508675
51036	NC_015416	CAA	2	6	2490979	2490984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508675
51037	NC_015416	CAGC	2	8	2491139	2491146	25 %	0 %	25 %	50 %	330508675
51038	NC_015416	CGC	2	6	2491152	2491157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508675
51039	NC_015416	CGC	2	6	2491202	2491207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508675
51040	NC_015416	GGA	2	6	2491227	2491232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508675
51041	NC_015416	GAA	3	9	2491359	2491367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508675
51042	NC_015416	CTG	2	6	2491382	2491387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508675
51043	NC_015416	CCG	2	6	2491400	2491405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508675
51044	NC_015416	AGGCAG	2	12	2491419	2491430	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330508675
51045	NC_015416	AGT	2	6	2491454	2491459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508675
51046	NC_015416	AGGA	2	8	2491474	2491481	50 %	0 %	50 %	0 %	330508675
51047	NC_015416	GA	3	6	2491480	2491485	50 %	0 %	50 %	0 %	330508675
51048	NC_015416	GGT	2	6	2491530	2491535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508675
51049	NC_015416	GATC	2	8	2491571	2491578	25 %	25 %	25 %	25 %	330508675
51050	NC_015416	CAC	2	6	2491602	2491607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508675
51051	NC_015416	CGC	2	6	2491608	2491613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508675
51052	NC_015416	CAG	2	6	2491614	2491619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508675
51053	NC_015416	CTT	2	6	2491647	2491652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508675
51054	NC_015416	CGCCC	2	10	2491677	2491686	0 %	0 %	20 %	80 %	330508675
51055	NC_015416	GGC	2	6	2491704	2491709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508675
51056	NC_015416	CGC	2	6	2491724	2491729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508675
51057	NC_015416	CTG	2	6	2491790	2491795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508675
51058	NC_015416	CCCG	2	8	2491823	2491830	0 %	0 %	25 %	75 %	330508675
51059	NC_015416	CGA	2	6	2491985	2491990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508675
51060	NC_015416	GCC	2	6	2491995	2492000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508675
51061	NC_015416	GCA	2	6	2492009	2492014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508675
51062	NC_015416	ACG	2	6	2492017	2492022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508675
51063	NC_015416	GAGG	2	8	2492042	2492049	25 %	0 %	75 %	0 %	330508675
51064	NC_015416	GAA	3	9	2492058	2492066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508675
51065	NC_015416	CCA	2	6	2492081	2492086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508675
51066	NC_015416	GA	3	6	2492137	2492142	50 %	0 %	50 %	0 %	330508675
51067	NC_015416	TCT	2	6	2492167	2492172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508675
51068	NC_015416	A	6	6	2492233	2492238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51069	NC_015416	CTTTT	2	10	2492240	2492249	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51070	NC_015416	ACT	2	6	2492257	2492262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51071	NC_015416	AAGG	2	8	2492271	2492278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51072	NC_015416	ATGGA	2	10	2492292	2492301	40 %	20 %	40 %	0 %	330508676
51073	NC_015416	CTG	2	6	2492355	2492360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508676
51074	NC_015416	ATCTAT	2	12	2492564	2492575	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	330508676
51075	NC_015416	A	6	6	2492686	2492691	100 %	0 %	0 %	0 %	330508676
51076	NC_015416	CCA	2	6	2492734	2492739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508676
51077	NC_015416	AGG	2	6	2492757	2492762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508676
51078	NC_015416	TCA	2	6	2492814	2492819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508676
51079	NC_015416	CCA	2	6	2492886	2492891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508676
51080	NC_015416	GCA	2	6	2492943	2492948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508676
51081	NC_015416	ATC	2	6	2492951	2492956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508676
51082	NC_015416	TGA	2	6	2492959	2492964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508676
51083	NC_015416	GCA	2	6	2492967	2492972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508676
51084	NC_015416	ATA	2	6	2493104	2493109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330508676
51085	NC_015416	GGC	2	6	2493143	2493148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508676
51086	NC_015416	ACT	2	6	2493180	2493185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508676
51087	NC_015416	AG	3	6	2493258	2493263	50 %	0 %	50 %	0 %	330508676
51088	NC_015416	ATG	2	6	2493327	2493332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508676
51089	NC_015416	ATT	2	6	2493408	2493413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508676
51090	NC_015416	ACA	2	6	2493474	2493479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508676
51091	NC_015416	AAC	2	6	2493481	2493486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330508676
51092	NC_015416	AGGCA	2	10	2493499	2493508	40 %	0 %	40 %	20 %	330508676
51093	NC_015416	CGA	2	6	2493510	2493515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508676
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51097	NC_015416	CT	3	6	2493859	2493864	0 %	50 %	0 %	50 %	330508676
51098	NC_015416	G	6	6	2493906	2493911	0 %	0 %	100 %	0 %	330508676
51099	NC_015416	CAAGCC	2	12	2493930	2493941	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	330508676
51100	NC_015416	GAGC	2	8	2493960	2493967	25 %	0 %	50 %	25 %	330508676
51101	NC_015416	AGC	2	6	2494022	2494027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508676
51102	NC_015416	GCT	2	6	2494041	2494046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508676
51103	NC_015416	CAGA	2	8	2494145	2494152	50 %	0 %	25 %	25 %	330508677
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51105	NC_015416	AAAG	2	8	2494261	2494268	75 %	0 %	25 %	0 %	330508677
51106	NC_015416	TCT	2	6	2494324	2494329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508677
51107	NC_015416	GGA	2	6	2494338	2494343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508677
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51109	NC_015416	AGGA	2	8	2494421	2494428	50 %	0 %	50 %	0 %	330508677
51110	NC_015416	CCA	2	6	2494493	2494498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330508677
51111	NC_015416	GCTG	2	8	2494582	2494589	0 %	25 %	50 %	25 %	330508677
51112	NC_015416	CGA	2	6	2494591	2494596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508677
51113	NC_015416	TTC	2	6	2494718	2494723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508677
51114	NC_015416	TTCA	2	8	2494781	2494788	25 %	50 %	0 %	25 %	330508677
51115	NC_015416	AGA	2	6	2494795	2494800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508677
51116	NC_015416	GA	3	6	2494799	2494804	50 %	0 %	50 %	0 %	330508677
51117	NC_015416	CAG	2	6	2494831	2494836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508677
51118	NC_015416	ATG	2	6	2494854	2494859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508677
51119	NC_015416	ATC	2	6	2494931	2494936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508677
51120	NC_015416	CT	3	6	2494987	2494992	0 %	50 %	0 %	50 %	330508677
51121	NC_015416	ATT	3	9	2495034	2495042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330508677
51122	NC_015416	TTC	2	6	2495055	2495060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51123	NC_015416	A	6	6	2495065	2495070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51124	NC_015416	A	6	6	2495149	2495154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51125	NC_015416	AT	4	8	2495229	2495236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51126	NC_015416	A	6	6	2495282	2495287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51127	NC_015416	CTG	2	6	2495299	2495304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51128	NC_015416	TCC	2	6	2495320	2495325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51129	NC_015416	TGC	2	6	2495360	2495365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51130	NC_015416	GAT	2	6	2495380	2495385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51131	NC_015416	GAC	2	6	2495577	2495582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508678
51132	NC_015416	TA	3	6	2495619	2495624	50 %	50 %	0 %	0 %	330508678
51133	NC_015416	ATTT	2	8	2495665	2495672	25 %	75 %	0 %	0 %	330508678
51134	NC_015416	A	7	7	2495710	2495716	100 %	0 %	0 %	0 %	330508678
51135	NC_015416	AG	3	6	2495730	2495735	50 %	0 %	50 %	0 %	330508678
51136	NC_015416	AGA	2	6	2495753	2495758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330508678
51137	NC_015416	TGG	2	6	2495768	2495773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330508678
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51139	NC_015416	TGA	2	6	2495830	2495835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508678
51140	NC_015416	TCCG	2	8	2495843	2495850	0 %	25 %	25 %	50 %	330508678
51141	NC_015416	GA	3	6	2495851	2495856	50 %	0 %	50 %	0 %	330508678
51142	NC_015416	GGA	2	6	2495877	2495882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508678
51143	NC_015416	GAT	2	6	2495889	2495894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508678
51144	NC_015416	AAGC	2	8	2495896	2495903	50 %	0 %	25 %	25 %	330508678
51145	NC_015416	ATC	2	6	2495934	2495939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508678
51146	NC_015416	GAT	2	6	2496045	2496050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508678
51147	NC_015416	GGA	2	6	2496081	2496086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330508678
51148	NC_015416	TCG	3	9	2496088	2496096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508678
51149	NC_015416	CTG	2	6	2496138	2496143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508678
51150	NC_015416	AGCG	2	8	2496201	2496208	25 %	0 %	50 %	25 %	330508678
51151	NC_015416	GGTC	2	8	2496229	2496236	0 %	25 %	50 %	25 %	330508678
51152	NC_015416	CAG	2	6	2496237	2496242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508678
51153	NC_015416	CTG	2	6	2496244	2496249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508678
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51158	NC_015416	CAAGA	2	10	2496395	2496404	60 %	0 %	20 %	20 %	330508678
51159	NC_015416	GCA	2	6	2496517	2496522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508678
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51161	NC_015416	GAT	2	6	2496558	2496563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508678
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51165	NC_015416	TGGC	2	8	2496674	2496681	0 %	25 %	50 %	25 %	330508678
51166	NC_015416	ATCAG	2	10	2496690	2496699	40 %	20 %	20 %	20 %	330508678
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51179	NC_015416	TGA	2	6	2497130	2497135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508678
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51232	NC_015416	AAAT	2	8	2500484	2500491	75 %	25 %	0 %	0 %	330508678
51233	NC_015416	TCA	2	6	2500533	2500538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508678
51234	NC_015416	GCA	2	6	2500587	2500592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508678
51235	NC_015416	GCA	2	6	2500767	2500772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508678
51236	NC_015416	GCC	2	6	2500808	2500813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330508678
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51238	NC_015416	AGC	2	6	2500869	2500874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508678
51239	NC_015416	GGC	2	6	2500988	2500993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330508678
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51250	NC_015416	CTG	2	6	2501437	2501442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508678
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51253	NC_015416	GCCA	2	8	2501580	2501587	25 %	0 %	25 %	50 %	330508678
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51272	NC_015416	CTT	3	9	2502718	2502726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51308	NC_015416	ATT	2	6	2504078	2504083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51311	NC_015416	TC	3	6	2504239	2504244	0 %	50 %	0 %	50 %	330508681
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51331	NC_015416	TA	3	6	2504769	2504774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51334	NC_015416	TGG	2	6	2504861	2504866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51335	NC_015416	TCC	2	6	2504935	2504940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51336	NC_015416	AGAA	2	8	2505027	2505034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51337	NC_015416	AGGA	2	8	2505037	2505044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51338	NC_015416	GCA	2	6	2505069	2505074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51339	NC_015416	A	8	8	2505078	2505085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51340	NC_015416	TCC	2	6	2505099	2505104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51341	NC_015416	AGG	2	6	2505144	2505149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51342	NC_015416	TA	3	6	2505167	2505172	50 %	50 %	0 %	0 %	330508682
51343	NC_015416	GCA	2	6	2505204	2505209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330508682
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51345	NC_015416	TGGCA	2	10	2505247	2505256	20 %	20 %	40 %	20 %	330508682
51346	NC_015416	TGC	2	6	2505312	2505317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508682
51347	NC_015416	CAAAC	2	10	2505327	2505336	60 %	0 %	0 %	40 %	330508682
51348	NC_015416	ATG	2	6	2505378	2505383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508682
51349	NC_015416	T	6	6	2505507	2505512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51350	NC_015416	AGCC	2	8	2505513	2505520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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51352	NC_015416	TCT	2	6	2505565	2505570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330508683
51353	NC_015416	CTG	2	6	2505601	2505606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330508683
51354	NC_015416	CTC	2	6	2505673	2505678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330508683
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51467	NC_015416	TCT	4	12	2511675	2511686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51471	NC_015416	AAT	2	6	2511836	2511841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51472	NC_015416	GAG	2	6	2511853	2511858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51473	NC_015416	AAG	2	6	2511881	2511886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51474	NC_015416	GGA	2	6	2511893	2511898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51475	NC_015416	AAG	2	6	2511914	2511919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51476	NC_015416	AGG	2	6	2511930	2511935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51477	NC_015416	GATC	2	8	2512007	2512014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51478	NC_015416	ATC	2	6	2512212	2512217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330508689
51479	NC_015416	AGT	2	6	2512265	2512270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330508689
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51492	NC_015416	GAG	2	6	2512894	2512899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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51499	NC_015416	TCT	2	6	2513795	2513800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51500	NC_015416	TAA	2	6	2513814	2513819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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