MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium gilvum Spyr1 plasmid pMSPYR101

Total Repeats: 5337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014811	CGGC	2	8	163	170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014811	GCC	2	6	236	241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014811	TGC	2	6	310	315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441476
4	NC_014811	CGG	2	6	414	419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441476
5	NC_014811	CCG	2	6	491	496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441476
6	NC_014811	CAG	2	6	532	537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441476
7	NC_014811	TCG	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441476
8	NC_014811	GCA	3	9	621	629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441476
9	NC_014811	TCG	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441476
10	NC_014811	GC	3	6	746	751	0 %	0 %	50 %	50 %	315441476
11	NC_014811	CGT	3	9	768	776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441476
12	NC_014811	GCAG	2	8	777	784	25 %	0 %	50 %	25 %	315441476
13	NC_014811	TCG	2	6	812	817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441476
14	NC_014811	GCG	2	6	874	879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441476
15	NC_014811	GTC	2	6	884	889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441476
16	NC_014811	GCCA	2	8	935	942	25 %	0 %	25 %	50 %	315441476
17	NC_014811	GCC	2	6	1043	1048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441476
18	NC_014811	GGCT	2	8	1135	1142	0 %	25 %	50 %	25 %	315441476
19	NC_014811	GGC	2	6	1256	1261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441476
20	NC_014811	AGT	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315441476
21	NC_014811	CG	3	6	1322	1327	0 %	0 %	50 %	50 %	315441476
22	NC_014811	GCG	2	6	1373	1378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441476
23	NC_014811	CGT	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441476
24	NC_014811	GGC	2	6	1438	1443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441476
25	NC_014811	ACCG	2	8	1476	1483	25 %	0 %	25 %	50 %	315441476
26	NC_014811	CGAG	2	8	1527	1534	25 %	0 %	50 %	25 %	315441476
27	NC_014811	CCA	2	6	1562	1567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441476
28	NC_014811	CTG	2	6	1597	1602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441476
29	NC_014811	CTG	2	6	1665	1670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441476
30	NC_014811	GCC	2	6	1695	1700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441476
31	NC_014811	AGA	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315441476
32	NC_014811	CGT	2	6	1776	1781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441476
33	NC_014811	GCC	2	6	1828	1833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441476
34	NC_014811	CGG	2	6	1844	1849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441476
35	NC_014811	GC	3	6	1851	1856	0 %	0 %	50 %	50 %	315441476
36	NC_014811	GGC	2	6	1861	1866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441476
37	NC_014811	GGTC	2	8	1940	1947	0 %	25 %	50 %	25 %	315441476
38	NC_014811	GT	3	6	1967	1972	0 %	50 %	50 %	0 %	315441476
39	NC_014811	CCCG	2	8	2040	2047	0 %	0 %	25 %	75 %	315441476
40	NC_014811	CGG	2	6	2112	2117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441476
41	NC_014811	GC	4	8	2149	2156	0 %	0 %	50 %	50 %	315441476
42	NC_014811	GGTG	2	8	2258	2265	0 %	25 %	75 %	0 %	315441476
43	NC_014811	GTG	2	6	2270	2275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441476
44	NC_014811	CGG	2	6	2280	2285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441476
45	NC_014811	CAT	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441476
46	NC_014811	CGC	2	6	2346	2351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441476
47	NC_014811	GCC	2	6	2432	2437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441476
48	NC_014811	GGCG	2	8	2469	2476	0 %	0 %	75 %	25 %	315441476
49	NC_014811	CCG	2	6	2508	2513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441476
50	NC_014811	GCG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441477
51	NC_014811	GTG	2	6	2548	2553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441477
52	NC_014811	CGG	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441477
53	NC_014811	GGC	2	6	2577	2582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441477
54	NC_014811	CTT	2	6	2595	2600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315441477
55	NC_014811	CGC	2	6	2667	2672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441477
56	NC_014811	ACG	2	6	2740	2745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441477
57	NC_014811	CAG	2	6	2757	2762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441477
58	NC_014811	CTG	2	6	2793	2798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441477
59	NC_014811	TGA	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315441478
60	NC_014811	CG	3	6	2885	2890	0 %	0 %	50 %	50 %	315441478
61	NC_014811	CAG	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441478
62	NC_014811	TCG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441478
63	NC_014811	GGT	2	6	2936	2941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441478
64	NC_014811	TG	3	6	3006	3011	0 %	50 %	50 %	0 %	315441478
65	NC_014811	GCCG	2	8	3056	3063	0 %	0 %	50 %	50 %	315441478
66	NC_014811	GCGCT	2	10	3093	3102	0 %	20 %	40 %	40 %	315441478
67	NC_014811	GGC	2	6	3145	3150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441478
68	NC_014811	CGA	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441478
69	NC_014811	AAC	2	6	3282	3287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315441478
70	NC_014811	CCA	2	6	3288	3293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441478
71	NC_014811	CGA	2	6	3334	3339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441478
72	NC_014811	CAC	2	6	3350	3355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441478
73	NC_014811	GGC	2	6	3361	3366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441478
74	NC_014811	GGC	2	6	3398	3403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441478
75	NC_014811	GAC	2	6	3436	3441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441478
76	NC_014811	CG	3	6	3444	3449	0 %	0 %	50 %	50 %	315441478
77	NC_014811	AAC	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315441478
78	NC_014811	TCG	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441478
79	NC_014811	GGC	2	6	3579	3584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441478
80	NC_014811	CGG	2	6	3624	3629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441478
81	NC_014811	TGA	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315441478
82	NC_014811	GAA	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315441478
83	NC_014811	CCG	2	6	3785	3790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441478
84	NC_014811	CTCG	2	8	3798	3805	0 %	25 %	25 %	50 %	315441478
85	NC_014811	CG	3	6	3804	3809	0 %	0 %	50 %	50 %	315441478
86	NC_014811	TCG	2	6	3814	3819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441478
87	NC_014811	GCT	2	6	3841	3846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441478
88	NC_014811	CAT	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441478
89	NC_014811	CCT	2	6	3883	3888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315441478
90	NC_014811	ACG	2	6	3898	3903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441478
91	NC_014811	CGC	2	6	3926	3931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441478
92	NC_014811	ACACCC	2	12	3948	3959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441478
93	NC_014811	TTG	2	6	3960	3965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014811	CAA	2	6	3975	3980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014811	ACGGG	2	10	4038	4047	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014811	ACG	2	6	4063	4068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014811	CAA	2	6	4092	4097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014811	GGC	2	6	4115	4120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014811	CTG	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014811	ATGA	2	8	4282	4289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014811	C	6	6	4344	4349	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_014811	AGC	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014811	CGC	2	6	4464	4469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014811	CTT	2	6	4518	4523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014811	AGG	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014811	CGG	2	6	4580	4585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441479
107	NC_014811	GC	3	6	4656	4661	0 %	0 %	50 %	50 %	315441479
108	NC_014811	CCG	2	6	4737	4742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441479
109	NC_014811	GC	3	6	4749	4754	0 %	0 %	50 %	50 %	315441479
110	NC_014811	CGG	2	6	4763	4768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441479
111	NC_014811	GC	3	6	4806	4811	0 %	0 %	50 %	50 %	315441479
112	NC_014811	CGA	2	6	4830	4835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441479
113	NC_014811	AGC	2	6	4890	4895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441479
114	NC_014811	TCGA	2	8	4939	4946	25 %	25 %	25 %	25 %	315441479
115	NC_014811	CGA	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441479
116	NC_014811	GCT	2	6	4974	4979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441479
117	NC_014811	C	6	6	4988	4993	0 %	0 %	0 %	100 %	315441479
118	NC_014811	CGC	2	6	5013	5018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441479
119	NC_014811	G	7	7	5137	5143	0 %	0 %	100 %	0 %	315441479
120	NC_014811	GC	3	6	5200	5205	0 %	0 %	50 %	50 %	315441479
121	NC_014811	GGT	2	6	5365	5370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441480
122	NC_014811	ACC	2	6	5380	5385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441480
123	NC_014811	TCGAC	2	10	5438	5447	20 %	20 %	20 %	40 %	315441480
124	NC_014811	CAC	2	6	5448	5453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441480
125	NC_014811	GCC	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441480
126	NC_014811	CGG	2	6	5490	5495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441480
127	NC_014811	ACCT	2	8	5597	5604	25 %	25 %	0 %	50 %	315441480
128	NC_014811	CGC	2	6	5605	5610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441480
129	NC_014811	GCA	2	6	5640	5645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441480
130	NC_014811	TACC	2	8	5662	5669	25 %	25 %	0 %	50 %	315441480
131	NC_014811	GC	4	8	5688	5695	0 %	0 %	50 %	50 %	315441480
132	NC_014811	CAG	2	6	5703	5708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441480
133	NC_014811	CGA	2	6	5813	5818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441480
134	NC_014811	GT	3	6	5832	5837	0 %	50 %	50 %	0 %	315441480
135	NC_014811	CAG	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441480
136	NC_014811	ATC	2	6	5872	5877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441480
137	NC_014811	GAC	2	6	5930	5935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441480
138	NC_014811	TAG	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014811	AC	3	6	6074	6079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014811	GGC	2	6	6108	6113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014811	CGA	2	6	6163	6168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014811	TCCG	2	8	6182	6189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014811	GTG	2	6	6253	6258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441481
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234	NC_014811	GGC	2	6	10029	10034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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259	NC_014811	CA	3	6	11065	11070	50 %	0 %	0 %	50 %	315441486
260	NC_014811	GTT	2	6	11078	11083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315441486
261	NC_014811	GCCA	2	8	11188	11195	25 %	0 %	25 %	50 %	315441486
262	NC_014811	C	7	7	11232	11238	0 %	0 %	0 %	100 %	315441486
263	NC_014811	CAGC	2	8	11292	11299	25 %	0 %	25 %	50 %	315441486
264	NC_014811	GCG	2	6	11352	11357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441486
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268	NC_014811	CGG	2	6	11537	11542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441486
269	NC_014811	GCA	2	6	11566	11571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441486
270	NC_014811	GCCG	2	8	11619	11626	0 %	0 %	50 %	50 %	315441486
271	NC_014811	AGC	2	6	11677	11682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441486
272	NC_014811	CGT	2	6	11718	11723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441486
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282	NC_014811	CGG	3	9	12073	12081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441486
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289	NC_014811	GGC	2	6	12310	12315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_014811	GC	3	6	12347	12352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
292	NC_014811	TGG	2	6	12465	12470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_014811	CGG	2	6	12524	12529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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362	NC_014811	CGAGC	2	10	15221	15230	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
363	NC_014811	GTT	2	6	15310	15315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_014811	CAGC	2	8	16020	16027	25 %	0 %	25 %	50 %	315441489
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392	NC_014811	TCG	3	9	16310	16318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441490
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397	NC_014811	TGC	3	9	16563	16571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441490
398	NC_014811	CTC	2	6	16608	16613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
399	NC_014811	GA	3	6	16696	16701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
400	NC_014811	GCC	2	6	16744	16749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
401	NC_014811	CTG	2	6	16795	16800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441491
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