MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 33259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_014658	AGG	2	6	1233896	1233901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312137503
33002	NC_014658	GCA	2	6	1233915	1233920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312137503
33003	NC_014658	TGT	2	6	1233950	1233955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312137503
33004	NC_014658	CAA	2	6	1234028	1234033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312137503
33005	NC_014658	A	6	6	1234032	1234037	100 %	0 %	0 %	0 %	312137503
33006	NC_014658	TAC	2	6	1234043	1234048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312137503
33007	NC_014658	TCA	2	6	1234064	1234069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312137503
33008	NC_014658	ATG	2	6	1234107	1234112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312137503
33009	NC_014658	GATG	2	8	1234130	1234137	25 %	25 %	50 %	0 %	312137503
33010	NC_014658	AGT	2	6	1234148	1234153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312137503
33011	NC_014658	TGA	2	6	1234157	1234162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312137503
33012	NC_014658	TAA	2	6	1234165	1234170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137503
33013	NC_014658	GAAA	2	8	1234225	1234232	75 %	0 %	25 %	0 %	312137504
33014	NC_014658	CAC	2	6	1234263	1234268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312137504
33015	NC_014658	ACA	2	6	1234286	1234291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312137504
33016	NC_014658	TAAG	2	8	1234293	1234300	50 %	25 %	25 %	0 %	312137504
33017	NC_014658	GCA	2	6	1234316	1234321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312137504
33018	NC_014658	TTG	2	6	1234362	1234367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312137504
33019	NC_014658	ACA	2	6	1234394	1234399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312137504
33020	NC_014658	A	6	6	1234399	1234404	100 %	0 %	0 %	0 %	312137504
33021	NC_014658	GAT	2	6	1234459	1234464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312137504
33022	NC_014658	GTC	2	6	1234541	1234546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312137504
33023	NC_014658	TCC	2	6	1234549	1234554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312137504
33024	NC_014658	GAA	2	6	1234604	1234609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312137504
33025	NC_014658	AGT	2	6	1234639	1234644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312137504
33026	NC_014658	TGG	2	6	1234720	1234725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312137504
33027	NC_014658	AAG	2	6	1234727	1234732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312137504
33028	NC_014658	A	7	7	1234773	1234779	100 %	0 %	0 %	0 %	312137504
33029	NC_014658	GATG	2	8	1234880	1234887	25 %	25 %	50 %	0 %	312137505
33030	NC_014658	ATG	2	6	1234906	1234911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312137505
33031	NC_014658	GGA	2	6	1234916	1234921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312137505
33032	NC_014658	A	6	6	1234928	1234933	100 %	0 %	0 %	0 %	312137505
33033	NC_014658	AGA	2	6	1234951	1234956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312137505
33034	NC_014658	GTA	2	6	1235055	1235060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312137505
33035	NC_014658	GA	3	6	1235088	1235093	50 %	0 %	50 %	0 %	312137505
33036	NC_014658	ATA	2	6	1235094	1235099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137505
33037	NC_014658	ACA	2	6	1235109	1235114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312137505
33038	NC_014658	CGC	2	6	1235155	1235160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312137505
33039	NC_014658	ACT	2	6	1235267	1235272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312137506
33040	NC_014658	GCA	2	6	1235286	1235291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312137506
33041	NC_014658	TTTG	2	8	1235342	1235349	0 %	75 %	25 %	0 %	312137506
33042	NC_014658	AAT	2	6	1235405	1235410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137506
33043	NC_014658	T	8	8	1235410	1235417	0 %	100 %	0 %	0 %	312137506
33044	NC_014658	T	6	6	1235419	1235424	0 %	100 %	0 %	0 %	312137506
33045	NC_014658	GAA	2	6	1235464	1235469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312137506
33046	NC_014658	TCT	2	6	1235532	1235537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312137506
33047	NC_014658	CAT	2	6	1235539	1235544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312137506
33048	NC_014658	ATCT	2	8	1235594	1235601	25 %	50 %	0 %	25 %	312137506
33049	NC_014658	T	6	6	1235601	1235606	0 %	100 %	0 %	0 %	312137506
33050	NC_014658	T	7	7	1235651	1235657	0 %	100 %	0 %	0 %	312137506
33051	NC_014658	TA	3	6	1235723	1235728	50 %	50 %	0 %	0 %	312137506
33052	NC_014658	T	7	7	1235771	1235777	0 %	100 %	0 %	0 %	312137506
33053	NC_014658	TCT	2	6	1235795	1235800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312137506
33054	NC_014658	CTT	2	6	1235821	1235826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312137506
33055	NC_014658	T	6	6	1235877	1235882	0 %	100 %	0 %	0 %	312137506
33056	NC_014658	TCCTTT	2	12	1235954	1235965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312137506
33057	NC_014658	CAAA	2	8	1236012	1236019	75 %	0 %	0 %	25 %	312137507
33058	NC_014658	TA	3	6	1236049	1236054	50 %	50 %	0 %	0 %	312137507
33059	NC_014658	CAC	2	6	1236057	1236062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312137507
33060	NC_014658	TCC	3	9	1236076	1236084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312137507
33061	NC_014658	TCC	2	6	1236088	1236093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312137507
33062	NC_014658	AAT	2	6	1236149	1236154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137507
33063	NC_014658	TCC	2	6	1236219	1236224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312137507
33064	NC_014658	ATC	2	6	1236280	1236285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312137507
33065	NC_014658	T	7	7	1236302	1236308	0 %	100 %	0 %	0 %	312137507
33066	NC_014658	CTA	2	6	1236449	1236454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312137507
33067	NC_014658	TCTT	2	8	1236505	1236512	0 %	75 %	0 %	25 %	312137507
33068	NC_014658	A	6	6	1236518	1236523	100 %	0 %	0 %	0 %	312137507
33069	NC_014658	TAA	2	6	1236540	1236545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137507
33070	NC_014658	TTA	2	6	1236584	1236589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312137507
33071	NC_014658	TTA	2	6	1236597	1236602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312137507
33072	NC_014658	T	6	6	1236616	1236621	0 %	100 %	0 %	0 %	312137507
33073	NC_014658	TCT	2	6	1236626	1236631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312137507
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33076	NC_014658	TAA	2	6	1236697	1236702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137507
33077	NC_014658	TTA	3	9	1236716	1236724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312137507
33078	NC_014658	CAT	2	6	1236741	1236746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312137507
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33080	NC_014658	TAA	2	6	1236817	1236822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137507
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33083	NC_014658	ATA	2	6	1236951	1236956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137507
33084	NC_014658	ATC	2	6	1237036	1237041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312137507
33085	NC_014658	CGG	2	6	1237057	1237062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312137507
33086	NC_014658	ATG	2	6	1237063	1237068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312137507
33087	NC_014658	TCT	2	6	1237094	1237099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312137507
33088	NC_014658	A	6	6	1237125	1237130	100 %	0 %	0 %	0 %	312137507
33089	NC_014658	TCA	2	6	1237166	1237171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312137507
33090	NC_014658	TAA	2	6	1237176	1237181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137507
33091	NC_014658	TTC	2	6	1237207	1237212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312137507
33092	NC_014658	ATA	2	6	1237224	1237229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137507
33093	NC_014658	TG	3	6	1237262	1237267	0 %	50 %	50 %	0 %	312137507
33094	NC_014658	CTT	2	6	1237287	1237292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312137507
33095	NC_014658	T	7	7	1237300	1237306	0 %	100 %	0 %	0 %	312137507
33096	NC_014658	TCATC	2	10	1237338	1237347	20 %	40 %	0 %	40 %	312137507
33097	NC_014658	CTA	2	6	1237360	1237365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312137508
33098	NC_014658	T	7	7	1237367	1237373	0 %	100 %	0 %	0 %	312137508
33099	NC_014658	ATT	2	6	1237375	1237380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312137508
33100	NC_014658	T	7	7	1237397	1237403	0 %	100 %	0 %	0 %	312137508
33101	NC_014658	ACCT	2	8	1237412	1237419	25 %	25 %	0 %	50 %	312137508
33102	NC_014658	TTTC	2	8	1237420	1237427	0 %	75 %	0 %	25 %	312137508
33103	NC_014658	CCA	2	6	1237428	1237433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312137508
33104	NC_014658	CTT	2	6	1237435	1237440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312137508
33105	NC_014658	ATA	2	6	1237443	1237448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137508
33106	NC_014658	T	7	7	1237453	1237459	0 %	100 %	0 %	0 %	312137508
33107	NC_014658	T	6	6	1237482	1237487	0 %	100 %	0 %	0 %	312137508
33108	NC_014658	TTG	2	6	1237511	1237516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312137508
33109	NC_014658	T	7	7	1237533	1237539	0 %	100 %	0 %	0 %	312137508
33110	NC_014658	CTT	2	6	1237553	1237558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312137508
33111	NC_014658	TCT	2	6	1237565	1237570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312137508
33112	NC_014658	TCC	2	6	1237614	1237619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312137509
33113	NC_014658	AAT	2	6	1237697	1237702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137509
33114	NC_014658	GCA	2	6	1237727	1237732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312137509
33115	NC_014658	T	6	6	1237774	1237779	0 %	100 %	0 %	0 %	312137509
33116	NC_014658	TAT	2	6	1237852	1237857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312137509
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33241	NC_014658	TTTTC	2	10	1242693	1242702	0 %	80 %	0 %	20 %	312137513
33242	NC_014658	CAAATT	2	12	1242768	1242779	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312137513
33243	NC_014658	T	6	6	1242817	1242822	0 %	100 %	0 %	0 %	312137513
33244	NC_014658	T	6	6	1242871	1242876	0 %	100 %	0 %	0 %	312137513
33245	NC_014658	ATC	2	6	1242904	1242909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312137513
33246	NC_014658	TCA	2	6	1242932	1242937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312137513
33247	NC_014658	T	6	6	1242964	1242969	0 %	100 %	0 %	0 %	312137513
33248	NC_014658	CCTT	2	8	1242980	1242987	0 %	50 %	0 %	50 %	312137513
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33250	NC_014658	TAA	2	6	1243087	1243092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137513
33251	NC_014658	TAA	2	6	1243095	1243100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137513
33252	NC_014658	TATT	2	8	1243107	1243114	25 %	75 %	0 %	0 %	312137513
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33254	NC_014658	T	6	6	1243171	1243176	0 %	100 %	0 %	0 %	312137513
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33259	NC_014658	ATTT	2	8	1243307	1243314	25 %	75 %	0 %	0 %	312137513

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