MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 33259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_014658	TTC	2	6	631954	631959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136874
17003	NC_014658	ATC	2	6	631972	631977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136874
17004	NC_014658	AAAT	2	8	631982	631989	75 %	25 %	0 %	0 %	312136874
17005	NC_014658	T	8	8	632010	632017	0 %	100 %	0 %	0 %	312136874
17006	NC_014658	CAA	2	6	632025	632030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136874
17007	NC_014658	GCA	2	6	632135	632140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136874
17008	NC_014658	T	6	6	632196	632201	0 %	100 %	0 %	0 %	312136874
17009	NC_014658	TCT	2	6	632219	632224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136874
17010	NC_014658	TATCA	2	10	632254	632263	40 %	40 %	0 %	20 %	312136874
17011	NC_014658	AAT	2	6	632326	632331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136874
17012	NC_014658	TCT	2	6	632360	632365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136875
17013	NC_014658	TCT	2	6	632515	632520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136875
17014	NC_014658	CTA	2	6	632559	632564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136875
17015	NC_014658	GAA	3	9	632590	632598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136875
17016	NC_014658	TTC	2	6	632688	632693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136875
17017	NC_014658	ATA	2	6	632695	632700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136875
17018	NC_014658	GATT	2	8	632725	632732	25 %	50 %	25 %	0 %	312136875
17019	NC_014658	TC	3	6	632903	632908	0 %	50 %	0 %	50 %	312136875
17020	NC_014658	TTC	2	6	632974	632979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136875
17021	NC_014658	T	6	6	633003	633008	0 %	100 %	0 %	0 %	312136875
17022	NC_014658	CTT	2	6	633015	633020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136875
17023	NC_014658	TTG	2	6	633045	633050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136875
17024	NC_014658	T	6	6	633058	633063	0 %	100 %	0 %	0 %	312136875
17025	NC_014658	TCTA	2	8	633142	633149	25 %	50 %	0 %	25 %	312136875
17026	NC_014658	CAT	2	6	633231	633236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136875
17027	NC_014658	TA	3	6	633288	633293	50 %	50 %	0 %	0 %	312136875
17028	NC_014658	TCA	2	6	633305	633310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136875
17029	NC_014658	TAA	2	6	633313	633318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136875
17030	NC_014658	T	6	6	633355	633360	0 %	100 %	0 %	0 %	312136875
17031	NC_014658	CTTT	2	8	633426	633433	0 %	75 %	0 %	25 %	312136875
17032	NC_014658	AAT	2	6	633475	633480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136875
17033	NC_014658	CTT	2	6	633549	633554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136875
17034	NC_014658	TCATC	2	10	633576	633585	20 %	40 %	0 %	40 %	312136875
17035	NC_014658	TGG	2	6	633607	633612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136875
17036	NC_014658	GCA	2	6	633648	633653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136875
17037	NC_014658	CAT	2	6	633670	633675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136875
17038	NC_014658	TAAA	2	8	633705	633712	75 %	25 %	0 %	0 %	312136875
17039	NC_014658	TC	3	6	633736	633741	0 %	50 %	0 %	50 %	312136875
17040	NC_014658	GTT	2	6	633762	633767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136875
17041	NC_014658	CTT	2	6	633777	633782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136875
17042	NC_014658	TTC	2	6	633787	633792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136875
17043	NC_014658	TATTTT	2	12	633796	633807	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312136875
17044	NC_014658	T	6	6	633860	633865	0 %	100 %	0 %	0 %	312136875
17045	NC_014658	T	6	6	633871	633876	0 %	100 %	0 %	0 %	312136875
17046	NC_014658	CATT	2	8	633893	633900	25 %	50 %	0 %	25 %	312136875
17047	NC_014658	ATT	2	6	633932	633937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136875
17048	NC_014658	GGT	2	6	634103	634108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136875
17049	NC_014658	ATT	2	6	634123	634128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136875
17050	NC_014658	ACA	2	6	634139	634144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136875
17051	NC_014658	AAT	2	6	634174	634179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136875
17052	NC_014658	AT	3	6	634233	634238	50 %	50 %	0 %	0 %	312136875
17053	NC_014658	AACT	2	8	634240	634247	50 %	25 %	0 %	25 %	312136875
17054	NC_014658	TG	3	6	634250	634255	0 %	50 %	50 %	0 %	312136875
17055	NC_014658	AGG	2	6	634312	634317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136875
17056	NC_014658	AT	3	6	634340	634345	50 %	50 %	0 %	0 %	312136875
17057	NC_014658	TGC	2	6	634354	634359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136875
17058	NC_014658	TAA	2	6	634375	634380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136875
17059	NC_014658	T	6	6	634401	634406	0 %	100 %	0 %	0 %	312136875
17060	NC_014658	TCT	2	6	634448	634453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136875
17061	NC_014658	TTTC	2	8	634482	634489	0 %	75 %	0 %	25 %	312136875
17062	NC_014658	TTC	2	6	634513	634518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136875
17063	NC_014658	AT	3	6	634534	634539	50 %	50 %	0 %	0 %	312136875
17064	NC_014658	T	8	8	634570	634577	0 %	100 %	0 %	0 %	312136875
17065	NC_014658	AATTC	2	10	634712	634721	40 %	40 %	0 %	20 %	312136875
17066	NC_014658	CCT	2	6	634745	634750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136875
17067	NC_014658	TCC	2	6	634813	634818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136875
17068	NC_014658	ACT	2	6	634868	634873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136875
17069	NC_014658	TCT	2	6	634889	634894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136875
17070	NC_014658	T	7	7	634926	634932	0 %	100 %	0 %	0 %	312136875
17071	NC_014658	TC	3	6	634953	634958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17072	NC_014658	TCT	2	6	634974	634979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136876
17073	NC_014658	CTT	2	6	635007	635012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136876
17074	NC_014658	CAC	2	6	635074	635079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136876
17075	NC_014658	TC	3	6	635180	635185	0 %	50 %	0 %	50 %	312136876
17076	NC_014658	TCAATG	2	12	635188	635199	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312136876
17077	NC_014658	ACC	2	6	635249	635254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136876
17078	NC_014658	ATA	2	6	635354	635359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136876
17079	NC_014658	TAC	2	6	635360	635365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136876
17080	NC_014658	T	6	6	635389	635394	0 %	100 %	0 %	0 %	312136876
17081	NC_014658	TCT	3	9	635469	635477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136876
17082	NC_014658	TTC	3	9	635506	635514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136876
17083	NC_014658	ATTA	2	8	635591	635598	50 %	50 %	0 %	0 %	312136876
17084	NC_014658	ATTT	2	8	635743	635750	25 %	75 %	0 %	0 %	312136876
17085	NC_014658	CTA	2	6	635782	635787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136876
17086	NC_014658	GGAC	2	8	635802	635809	25 %	0 %	50 %	25 %	312136876
17087	NC_014658	TCT	3	9	635825	635833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136876
17088	NC_014658	GTG	2	6	635875	635880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136876
17089	NC_014658	T	7	7	635993	635999	0 %	100 %	0 %	0 %	312136876
17090	NC_014658	TCT	2	6	636015	636020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136876
17091	NC_014658	CCA	2	6	636024	636029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136876
17092	NC_014658	TCT	2	6	636035	636040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136876
17093	NC_014658	CT	3	6	636039	636044	0 %	50 %	0 %	50 %	312136876
17094	NC_014658	AGA	2	6	636064	636069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136876
17095	NC_014658	CAG	2	6	636094	636099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136876
17096	NC_014658	ATTT	2	8	636100	636107	25 %	75 %	0 %	0 %	312136876
17097	NC_014658	ACA	2	6	636156	636161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136876
17098	NC_014658	GCT	2	6	636315	636320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136876
17099	NC_014658	GAA	2	6	636339	636344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136876
17100	NC_014658	CTG	2	6	636391	636396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136876
17101	NC_014658	TCT	2	6	636462	636467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136876
17102	NC_014658	CTT	2	6	636496	636501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136876
17103	NC_014658	TTA	2	6	636502	636507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136876
17104	NC_014658	ACA	2	6	636582	636587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136876
17105	NC_014658	ATT	2	6	636635	636640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136876
17106	NC_014658	GAT	2	6	636646	636651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136876
17107	NC_014658	CTTCT	2	10	636682	636691	0 %	60 %	0 %	40 %	312136876
17108	NC_014658	TTTC	2	8	636692	636699	0 %	75 %	0 %	25 %	312136876
17109	NC_014658	TCT	2	6	636705	636710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136876
17110	NC_014658	AT	3	6	636758	636763	50 %	50 %	0 %	0 %	312136876
17111	NC_014658	CCTA	2	8	636787	636794	25 %	25 %	0 %	50 %	312136877
17112	NC_014658	TTC	2	6	636798	636803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136877
17113	NC_014658	T	6	6	636827	636832	0 %	100 %	0 %	0 %	312136877
17114	NC_014658	CTT	2	6	636836	636841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136877
17115	NC_014658	TAAC	2	8	636887	636894	50 %	25 %	0 %	25 %	312136877
17116	NC_014658	TTC	2	6	636932	636937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136877
17117	NC_014658	TG	3	6	636943	636948	0 %	50 %	50 %	0 %	312136877
17118	NC_014658	ACT	2	6	637000	637005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136877
17119	NC_014658	TGTCC	2	10	637038	637047	0 %	40 %	20 %	40 %	312136877
17120	NC_014658	TCC	2	6	637234	637239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136877
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17122	NC_014658	AT	3	6	637347	637352	50 %	50 %	0 %	0 %	312136877
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17240	NC_014658	AAAGA	2	10	641410	641419	80 %	0 %	20 %	0 %	312136881
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17243	NC_014658	AG	3	6	641471	641476	50 %	0 %	50 %	0 %	312136881
17244	NC_014658	A	7	7	641564	641570	100 %	0 %	0 %	0 %	312136881
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