MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 33259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014658	GCT	2	6	519728	519733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136763
14002	NC_014658	AAG	2	6	519883	519888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136763
14003	NC_014658	GTG	2	6	519897	519902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136763
14004	NC_014658	TCC	2	6	519925	519930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136763
14005	NC_014658	ATG	2	6	519987	519992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136763
14006	NC_014658	CAT	2	6	520002	520007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
14007	NC_014658	AC	3	6	520022	520027	50 %	0 %	0 %	50 %	312136763
14008	NC_014658	CTG	2	6	520035	520040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136763
14009	NC_014658	T	6	6	520044	520049	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
14010	NC_014658	T	6	6	520056	520061	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
14011	NC_014658	TAT	2	6	520128	520133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14012	NC_014658	TTC	2	6	520152	520157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
14013	NC_014658	CCA	2	6	520217	520222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136763
14014	NC_014658	TAA	2	6	520270	520275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
14015	NC_014658	ATTT	2	8	520302	520309	25 %	75 %	0 %	0 %	312136763
14016	NC_014658	TTC	2	6	520354	520359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
14017	NC_014658	TTA	2	6	520386	520391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14018	NC_014658	ATT	2	6	520405	520410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14019	NC_014658	TAA	2	6	520411	520416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
14020	NC_014658	TTC	2	6	520439	520444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
14021	NC_014658	TGT	2	6	520475	520480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136763
14022	NC_014658	ACA	2	6	520509	520514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136763
14023	NC_014658	GAA	2	6	520517	520522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136763
14024	NC_014658	GCAAT	2	10	520527	520536	40 %	20 %	20 %	20 %	312136763
14025	NC_014658	TTA	2	6	520602	520607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14026	NC_014658	T	6	6	520692	520697	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
14027	NC_014658	CAA	2	6	520761	520766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136763
14028	NC_014658	CTA	2	6	520830	520835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
14029	NC_014658	CTT	2	6	520850	520855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
14030	NC_014658	TG	3	6	521058	521063	0 %	50 %	50 %	0 %	312136763
14031	NC_014658	AAC	2	6	521071	521076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136763
14032	NC_014658	ATA	2	6	521151	521156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
14033	NC_014658	T	6	6	521186	521191	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
14034	NC_014658	CAT	2	6	521271	521276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
14035	NC_014658	TTC	2	6	521282	521287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
14036	NC_014658	TAT	2	6	521307	521312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14037	NC_014658	TACT	2	8	521313	521320	25 %	50 %	0 %	25 %	312136763
14038	NC_014658	TCAA	2	8	521333	521340	50 %	25 %	0 %	25 %	312136763
14039	NC_014658	TTA	2	6	521358	521363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14040	NC_014658	ATC	2	6	521408	521413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
14041	NC_014658	AT	3	6	521477	521482	50 %	50 %	0 %	0 %	312136763
14042	NC_014658	TTC	2	6	521503	521508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
14043	NC_014658	CTT	2	6	521535	521540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
14044	NC_014658	T	6	6	521572	521577	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
14045	NC_014658	TTC	2	6	521581	521586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
14046	NC_014658	T	6	6	521699	521704	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
14047	NC_014658	CTAC	2	8	521711	521718	25 %	25 %	0 %	50 %	312136763
14048	NC_014658	TAT	2	6	521755	521760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14049	NC_014658	TGG	2	6	521806	521811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136763
14050	NC_014658	TAA	2	6	521819	521824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
14051	NC_014658	T	7	7	521835	521841	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
14052	NC_014658	TA	3	6	521877	521882	50 %	50 %	0 %	0 %	312136763
14053	NC_014658	TCA	2	6	522053	522058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
14054	NC_014658	ACCA	2	8	522062	522069	50 %	0 %	0 %	50 %	312136763
14055	NC_014658	GAT	2	6	522092	522097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136763
14056	NC_014658	ATT	2	6	522130	522135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14057	NC_014658	GAA	2	6	522136	522141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136763
14058	NC_014658	ATG	2	6	522159	522164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136763
14059	NC_014658	GAA	2	6	522167	522172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136763
14060	NC_014658	AAGA	2	8	522179	522186	75 %	0 %	25 %	0 %	312136763
14061	NC_014658	TAT	2	6	522196	522201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14062	NC_014658	TAT	2	6	522252	522257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14063	NC_014658	GCTG	2	8	522299	522306	0 %	25 %	50 %	25 %	312136763
14064	NC_014658	CTT	2	6	522324	522329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
14065	NC_014658	CTG	2	6	522438	522443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136763
14066	NC_014658	CAA	2	6	522534	522539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136763
14067	NC_014658	CAA	2	6	522564	522569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136763
14068	NC_014658	AAT	2	6	522577	522582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
14069	NC_014658	TTG	2	6	522583	522588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136763
14070	NC_014658	T	7	7	522652	522658	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
14071	NC_014658	T	6	6	522673	522678	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
14072	NC_014658	AAT	2	6	522681	522686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
14073	NC_014658	ATCC	2	8	522776	522783	25 %	25 %	0 %	50 %	312136763
14074	NC_014658	ATA	2	6	522853	522858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
14075	NC_014658	GCA	2	6	522863	522868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136763
14076	NC_014658	TAT	2	6	523080	523085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14077	NC_014658	TAT	2	6	523087	523092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14078	NC_014658	ACA	2	6	523109	523114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136763
14079	NC_014658	ATA	2	6	523157	523162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
14080	NC_014658	TGA	2	6	523165	523170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136763
14081	NC_014658	GTT	2	6	523217	523222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136763
14082	NC_014658	AGA	2	6	523303	523308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136763
14083	NC_014658	TTG	4	12	523336	523347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136763
14084	NC_014658	ACAAT	2	10	523395	523404	60 %	20 %	0 %	20 %	312136763
14085	NC_014658	CCT	2	6	523430	523435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14086	NC_014658	T	6	6	523435	523440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_014658	TTA	2	6	523442	523447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_014658	TA	3	6	523474	523479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_014658	TGA	2	6	523513	523518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_014658	TAAAAA	2	12	523546	523557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_014658	AATA	2	8	523579	523586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_014658	AGG	2	6	523587	523592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_014658	A	6	6	523594	523599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_014658	AT	3	6	523618	523623	50 %	50 %	0 %	0 %	312136764
14095	NC_014658	TTA	2	6	523624	523629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136764
14096	NC_014658	TTC	2	6	523650	523655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136764
14097	NC_014658	A	6	6	523668	523673	100 %	0 %	0 %	0 %	312136764
14098	NC_014658	AGA	2	6	523754	523759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136764
14099	NC_014658	ACC	2	6	523793	523798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136764
14100	NC_014658	T	8	8	523892	523899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_014658	ATC	2	6	523942	523947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136765
14102	NC_014658	TA	3	6	523987	523992	50 %	50 %	0 %	0 %	312136765
14103	NC_014658	TAC	2	6	524019	524024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136765
14104	NC_014658	ATC	3	9	524065	524073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136765
14105	NC_014658	ATT	2	6	524099	524104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136765
14106	NC_014658	ATT	2	6	524138	524143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136765
14107	NC_014658	TTG	2	6	524241	524246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136765
14108	NC_014658	AT	4	8	524248	524255	50 %	50 %	0 %	0 %	312136765
14109	NC_014658	CTT	2	6	524298	524303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136765
14110	NC_014658	T	6	6	524326	524331	0 %	100 %	0 %	0 %	312136765
14111	NC_014658	TCT	2	6	524365	524370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136765
14112	NC_014658	TAT	2	6	524383	524388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136765
14113	NC_014658	CTT	2	6	524412	524417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136765
14114	NC_014658	ATT	2	6	524464	524469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136765
14115	NC_014658	TTC	2	6	524490	524495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136765
14116	NC_014658	CAA	2	6	524502	524507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136765
14117	NC_014658	TTG	2	6	524559	524564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136765
14118	NC_014658	T	6	6	524567	524572	0 %	100 %	0 %	0 %	312136765
14119	NC_014658	TCT	2	6	524585	524590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136765
14120	NC_014658	TC	3	6	524596	524601	0 %	50 %	0 %	50 %	312136765
14121	NC_014658	TCT	2	6	524606	524611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136765
14122	NC_014658	TGCC	2	8	524659	524666	0 %	25 %	25 %	50 %	312136765
14123	NC_014658	T	6	6	524719	524724	0 %	100 %	0 %	0 %	312136765
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14244	NC_014658	TAAA	2	8	529156	529163	75 %	25 %	0 %	0 %	312136769
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