MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 33259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014658	ACT	2	6	501182	501187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136748
13502	NC_014658	TTC	2	6	501205	501210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136748
13503	NC_014658	TA	3	6	501216	501221	50 %	50 %	0 %	0 %	312136748
13504	NC_014658	CCT	2	6	501233	501238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136748
13505	NC_014658	TTTC	2	8	501246	501253	0 %	75 %	0 %	25 %	312136748
13506	NC_014658	CCT	2	6	501266	501271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136748
13507	NC_014658	ATTT	2	8	501283	501290	25 %	75 %	0 %	0 %	312136748
13508	NC_014658	GGT	2	6	501311	501316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136748
13509	NC_014658	T	6	6	501327	501332	0 %	100 %	0 %	0 %	312136748
13510	NC_014658	CTT	2	6	501333	501338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136748
13511	NC_014658	T	6	6	501345	501350	0 %	100 %	0 %	0 %	312136748
13512	NC_014658	TCTT	2	8	501355	501362	0 %	75 %	0 %	25 %	312136748
13513	NC_014658	CAA	2	6	501363	501368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136748
13514	NC_014658	CTT	2	6	501378	501383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136748
13515	NC_014658	TTA	2	6	501384	501389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136748
13516	NC_014658	TTTA	2	8	501478	501485	25 %	75 %	0 %	0 %	312136748
13517	NC_014658	TTTTCA	2	12	501507	501518	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312136749
13518	NC_014658	T	8	8	501541	501548	0 %	100 %	0 %	0 %	312136749
13519	NC_014658	TAT	2	6	501635	501640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136749
13520	NC_014658	TTC	2	6	501695	501700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136749
13521	NC_014658	A	7	7	501720	501726	100 %	0 %	0 %	0 %	312136749
13522	NC_014658	T	6	6	501728	501733	0 %	100 %	0 %	0 %	312136749
13523	NC_014658	AATTT	2	10	501735	501744	40 %	60 %	0 %	0 %	312136749
13524	NC_014658	ATT	2	6	501783	501788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136749
13525	NC_014658	GAA	2	6	501798	501803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136749
13526	NC_014658	GTT	2	6	501837	501842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136749
13527	NC_014658	TAC	2	6	501881	501886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136749
13528	NC_014658	TAT	2	6	501914	501919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136749
13529	NC_014658	T	6	6	501993	501998	0 %	100 %	0 %	0 %	312136749
13530	NC_014658	TGG	2	6	502055	502060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136749
13531	NC_014658	T	7	7	502082	502088	0 %	100 %	0 %	0 %	312136749
13532	NC_014658	TTC	2	6	502091	502096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136749
13533	NC_014658	TC	3	6	502095	502100	0 %	50 %	0 %	50 %	312136749
13534	NC_014658	T	6	6	502114	502119	0 %	100 %	0 %	0 %	312136749
13535	NC_014658	TTAA	2	8	502194	502201	50 %	50 %	0 %	0 %	312136749
13536	NC_014658	AGC	2	6	502217	502222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136749
13537	NC_014658	GCC	2	6	502241	502246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312136749
13538	NC_014658	T	6	6	502281	502286	0 %	100 %	0 %	0 %	312136750
13539	NC_014658	T	6	6	502288	502293	0 %	100 %	0 %	0 %	312136750
13540	NC_014658	AT	3	6	502311	502316	50 %	50 %	0 %	0 %	312136750
13541	NC_014658	CCA	2	6	502345	502350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136750
13542	NC_014658	CAG	2	6	502382	502387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136750
13543	NC_014658	TCT	2	6	502393	502398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136750
13544	NC_014658	CTT	3	9	502400	502408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136750
13545	NC_014658	TCT	2	6	502411	502416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136750
13546	NC_014658	T	8	8	502416	502423	0 %	100 %	0 %	0 %	312136750
13547	NC_014658	CTT	2	6	502433	502438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136750
13548	NC_014658	TCT	2	6	502441	502446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136750
13549	NC_014658	TCT	2	6	502498	502503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136750
13550	NC_014658	CTT	3	9	502514	502522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136750
13551	NC_014658	TC	3	6	502537	502542	0 %	50 %	0 %	50 %	312136750
13552	NC_014658	CCA	2	6	502612	502617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136750
13553	NC_014658	AT	3	6	502645	502650	50 %	50 %	0 %	0 %	312136750
13554	NC_014658	CCA	2	6	502687	502692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136750
13555	NC_014658	AAG	2	6	502817	502822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136750
13556	NC_014658	CAT	2	6	502892	502897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136750
13557	NC_014658	CAC	2	6	502901	502906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136750
13558	NC_014658	CAC	2	6	503012	503017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136750
13559	NC_014658	CA	3	6	503079	503084	50 %	0 %	0 %	50 %	312136750
13560	NC_014658	TACATC	2	12	503094	503105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136750
13561	NC_014658	TTC	2	6	503106	503111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136750
13562	NC_014658	T	6	6	503138	503143	0 %	100 %	0 %	0 %	312136750
13563	NC_014658	TCA	2	6	503188	503193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136750
13564	NC_014658	TTC	2	6	503232	503237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136750
13565	NC_014658	AAT	2	6	503242	503247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136750
13566	NC_014658	TC	3	6	503326	503331	0 %	50 %	0 %	50 %	312136750
13567	NC_014658	TTTC	2	8	503380	503387	0 %	75 %	0 %	25 %	312136750
13568	NC_014658	TCT	2	6	503404	503409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136750
13569	NC_014658	CAA	2	6	503570	503575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136750
13570	NC_014658	TGC	2	6	503610	503615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136750
13571	NC_014658	T	7	7	503673	503679	0 %	100 %	0 %	0 %	312136751
13572	NC_014658	TCT	2	6	503695	503700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136751
13573	NC_014658	ATGCAT	2	12	503721	503732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312136751
13574	NC_014658	ATA	2	6	503737	503742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136751
13575	NC_014658	ATG	2	6	503790	503795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136751
13576	NC_014658	TTGT	2	8	503878	503885	0 %	75 %	25 %	0 %	312136751
13577	NC_014658	T	7	7	503936	503942	0 %	100 %	0 %	0 %	312136751
13578	NC_014658	A	6	6	503947	503952	100 %	0 %	0 %	0 %	312136751
13579	NC_014658	TAT	2	6	503998	504003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136751
13580	NC_014658	CT	3	6	504139	504144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13581	NC_014658	TTCTTT	2	12	504203	504214	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312136752
13582	NC_014658	CTT	2	6	504228	504233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136752
13583	NC_014658	TGG	2	6	504286	504291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136752
13584	NC_014658	TA	3	6	504312	504317	50 %	50 %	0 %	0 %	312136752
13585	NC_014658	TGTC	2	8	504340	504347	0 %	50 %	25 %	25 %	312136752
13586	NC_014658	CTT	2	6	504402	504407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136752
13587	NC_014658	T	6	6	504464	504469	0 %	100 %	0 %	0 %	312136752
13588	NC_014658	ATT	2	6	504482	504487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136752
13589	NC_014658	TCCT	2	8	504510	504517	0 %	50 %	0 %	50 %	312136752
13590	NC_014658	TTC	2	6	504525	504530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136752
13591	NC_014658	GCT	3	9	504596	504604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136752
13592	NC_014658	CTATT	2	10	504642	504651	20 %	60 %	0 %	20 %	312136752
13593	NC_014658	AT	3	6	504654	504659	50 %	50 %	0 %	0 %	312136752
13594	NC_014658	AT	3	6	504705	504710	50 %	50 %	0 %	0 %	312136752
13595	NC_014658	AGC	2	6	504724	504729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136752
13596	NC_014658	AGT	2	6	504865	504870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136752
13597	NC_014658	TAC	2	6	504942	504947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136752
13598	NC_014658	CAA	2	6	504951	504956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136752
13599	NC_014658	T	6	6	505061	505066	0 %	100 %	0 %	0 %	312136752
13600	NC_014658	ATT	2	6	505228	505233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136752
13601	NC_014658	T	6	6	505270	505275	0 %	100 %	0 %	0 %	312136752
13602	NC_014658	AAT	2	6	505285	505290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136752
13603	NC_014658	T	6	6	505319	505324	0 %	100 %	0 %	0 %	312136752
13604	NC_014658	CTTT	2	8	505371	505378	0 %	75 %	0 %	25 %	312136752
13605	NC_014658	TCA	2	6	505550	505555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136752
13606	NC_014658	CTT	2	6	505580	505585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136752
13607	NC_014658	GTT	2	6	505596	505601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136752
13608	NC_014658	CAA	2	6	505614	505619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136752
13609	NC_014658	TAT	2	6	505632	505637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136752
13610	NC_014658	TCT	2	6	505688	505693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136752
13611	NC_014658	ATT	2	6	505696	505701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136752
13612	NC_014658	ATA	2	6	505718	505723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136752
13613	NC_014658	AGGA	2	8	505732	505739	50 %	0 %	50 %	0 %	312136752
13614	NC_014658	TCT	3	9	505814	505822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136752
13615	NC_014658	CTT	2	6	505866	505871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136752
13616	NC_014658	GAT	2	6	505923	505928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136752
13617	NC_014658	CTT	2	6	505932	505937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136752
13618	NC_014658	TGC	2	6	505951	505956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136752
13619	NC_014658	TAA	2	6	505957	505962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136752
13620	NC_014658	T	6	6	505996	506001	0 %	100 %	0 %	0 %	312136752
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13622	NC_014658	ATT	2	6	506068	506073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136752
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13991	NC_014658	ATC	2	6	519271	519276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
13992	NC_014658	CTA	2	6	519308	519313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
13993	NC_014658	TTC	2	6	519343	519348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
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13995	NC_014658	TA	3	6	519413	519418	50 %	50 %	0 %	0 %	312136763
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13998	NC_014658	ATTT	2	8	519606	519613	25 %	75 %	0 %	0 %	312136763
13999	NC_014658	TAT	2	6	519652	519657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
14000	NC_014658	TTTA	2	8	519673	519680	25 %	75 %	0 %	0 %	312136763

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