MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 33259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014658	ACA	2	6	369791	369796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136611
10002	NC_014658	A	7	7	369845	369851	100 %	0 %	0 %	0 %	312136611
10003	NC_014658	AGTT	2	8	369864	369871	25 %	50 %	25 %	0 %	312136611
10004	NC_014658	TTG	2	6	370014	370019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136611
10005	NC_014658	CTT	2	6	370110	370115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136611
10006	NC_014658	ATT	2	6	370129	370134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136611
10007	NC_014658	AGA	2	6	370137	370142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136611
10008	NC_014658	AAT	2	6	370166	370171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136611
10009	NC_014658	A	7	7	370205	370211	100 %	0 %	0 %	0 %	312136611
10010	NC_014658	TG	3	6	370212	370217	0 %	50 %	50 %	0 %	312136611
10011	NC_014658	TAA	2	6	370242	370247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136611
10012	NC_014658	GAA	2	6	370334	370339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136611
10013	NC_014658	ATA	2	6	370341	370346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136611
10014	NC_014658	ATT	2	6	370351	370356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136611
10015	NC_014658	AAAC	2	8	370359	370366	75 %	0 %	0 %	25 %	312136611
10016	NC_014658	GTG	2	6	370380	370385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136611
10017	NC_014658	ATA	2	6	370442	370447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136611
10018	NC_014658	A	8	8	370460	370467	100 %	0 %	0 %	0 %	312136611
10019	NC_014658	GTC	2	6	370497	370502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136611
10020	NC_014658	TC	3	6	370521	370526	0 %	50 %	0 %	50 %	312136611
10021	NC_014658	A	6	6	370527	370532	100 %	0 %	0 %	0 %	312136611
10022	NC_014658	GAA	2	6	370538	370543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136611
10023	NC_014658	AT	3	6	370585	370590	50 %	50 %	0 %	0 %	312136611
10024	NC_014658	A	6	6	370600	370605	100 %	0 %	0 %	0 %	312136611
10025	NC_014658	CTT	2	6	370660	370665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136611
10026	NC_014658	AGAAT	2	10	370688	370697	60 %	20 %	20 %	0 %	312136611
10027	NC_014658	A	8	8	370720	370727	100 %	0 %	0 %	0 %	312136611
10028	NC_014658	TGA	2	6	370749	370754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136611
10029	NC_014658	GAA	2	6	370766	370771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136611
10030	NC_014658	AGG	2	6	370778	370783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136611
10031	NC_014658	AGG	2	6	370826	370831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136612
10032	NC_014658	GTT	2	6	370842	370847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136612
10033	NC_014658	A	8	8	370866	370873	100 %	0 %	0 %	0 %	312136612
10034	NC_014658	A	6	6	370915	370920	100 %	0 %	0 %	0 %	312136612
10035	NC_014658	AAAT	2	8	370933	370940	75 %	25 %	0 %	0 %	312136612
10036	NC_014658	AAC	2	6	371027	371032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136612
10037	NC_014658	AGA	2	6	371069	371074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136612
10038	NC_014658	A	6	6	371089	371094	100 %	0 %	0 %	0 %	312136612
10039	NC_014658	ATA	2	6	371181	371186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136612
10040	NC_014658	AGA	2	6	371201	371206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136612
10041	NC_014658	TGAT	2	8	371305	371312	25 %	50 %	25 %	0 %	312136612
10042	NC_014658	A	6	6	371343	371348	100 %	0 %	0 %	0 %	312136612
10043	NC_014658	ATT	2	6	371488	371493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136613
10044	NC_014658	CTT	2	6	371533	371538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136613
10045	NC_014658	T	6	6	371548	371553	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10046	NC_014658	T	7	7	371627	371633	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10047	NC_014658	CTT	2	6	371644	371649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136613
10048	NC_014658	CTC	2	6	371692	371697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136613
10049	NC_014658	AGG	2	6	371711	371716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136613
10050	NC_014658	TTC	2	6	371732	371737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136613
10051	NC_014658	TA	3	6	371744	371749	50 %	50 %	0 %	0 %	312136613
10052	NC_014658	TAACTT	2	12	371761	371772	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312136613
10053	NC_014658	T	6	6	371825	371830	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10054	NC_014658	T	6	6	371836	371841	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10055	NC_014658	CTT	2	6	371842	371847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136613
10056	NC_014658	TTC	2	6	371864	371869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136613
10057	NC_014658	T	6	6	371939	371944	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10058	NC_014658	T	6	6	371969	371974	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10059	NC_014658	CTG	2	6	372004	372009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136613
10060	NC_014658	T	6	6	372044	372049	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10061	NC_014658	CCA	2	6	372141	372146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136613
10062	NC_014658	CTTC	2	8	372235	372242	0 %	50 %	0 %	50 %	312136613
10063	NC_014658	CTT	2	6	372247	372252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136613
10064	NC_014658	CAA	2	6	372289	372294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136613
10065	NC_014658	TC	3	6	372347	372352	0 %	50 %	0 %	50 %	312136613
10066	NC_014658	T	6	6	372371	372376	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10067	NC_014658	T	6	6	372391	372396	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10068	NC_014658	T	6	6	372405	372410	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10069	NC_014658	T	6	6	372456	372461	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10070	NC_014658	TGC	2	6	372464	372469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136613
10071	NC_014658	TGG	2	6	372485	372490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136613
10072	NC_014658	AT	3	6	372532	372537	50 %	50 %	0 %	0 %	312136613
10073	NC_014658	ATA	2	6	372560	372565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136613
10074	NC_014658	ACAATG	2	12	372590	372601	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312136613
10075	NC_014658	AAGT	2	8	372611	372618	50 %	25 %	25 %	0 %	312136613
10076	NC_014658	TCT	2	6	372624	372629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136613
10077	NC_014658	TCT	2	6	372714	372719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136613
10078	NC_014658	T	6	6	372723	372728	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10079	NC_014658	ATC	2	6	372920	372925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136613
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10081	NC_014658	CAA	2	6	372962	372967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136613
10082	NC_014658	T	6	6	372984	372989	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
10083	NC_014658	T	7	7	373003	373009	0 %	100 %	0 %	0 %	312136613
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10086	NC_014658	CGTA	2	8	373133	373140	25 %	25 %	25 %	25 %	312136613
10087	NC_014658	TGG	2	6	373144	373149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136613
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10089	NC_014658	CTT	2	6	373247	373252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136614
10090	NC_014658	TAA	2	6	373253	373258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136614
10091	NC_014658	TAG	2	6	373292	373297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136614
10092	NC_014658	T	6	6	373362	373367	0 %	100 %	0 %	0 %	312136614
10093	NC_014658	A	6	6	373386	373391	100 %	0 %	0 %	0 %	312136614
10094	NC_014658	AC	3	6	373435	373440	50 %	0 %	0 %	50 %	312136614
10095	NC_014658	GTT	2	6	373465	373470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136614
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10098	NC_014658	TACA	2	8	373715	373722	50 %	25 %	0 %	25 %	312136614
10099	NC_014658	ATT	2	6	373747	373752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136614
10100	NC_014658	T	7	7	373751	373757	0 %	100 %	0 %	0 %	312136614
10101	NC_014658	T	6	6	373948	373953	0 %	100 %	0 %	0 %	312136615
10102	NC_014658	ATAAA	2	10	374000	374009	80 %	20 %	0 %	0 %	312136615
10103	NC_014658	CCCAG	2	10	374040	374049	20 %	0 %	20 %	60 %	312136615
10104	NC_014658	T	6	6	374073	374078	0 %	100 %	0 %	0 %	312136615
10105	NC_014658	CAG	2	6	374095	374100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136615
10106	NC_014658	CTT	3	9	374113	374121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136615
10107	NC_014658	CTA	2	6	374161	374166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136615
10108	NC_014658	ACA	2	6	374205	374210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136615
10109	NC_014658	CTA	2	6	374250	374255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136615
10110	NC_014658	TTTC	2	8	374304	374311	0 %	75 %	0 %	25 %	312136616
10111	NC_014658	CAA	2	6	374319	374324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136616
10112	NC_014658	CCTT	2	8	374345	374352	0 %	50 %	0 %	50 %	312136616
10113	NC_014658	T	6	6	374359	374364	0 %	100 %	0 %	0 %	312136616
10114	NC_014658	ATTC	2	8	374368	374375	25 %	50 %	0 %	25 %	312136616
10115	NC_014658	TTC	2	6	374455	374460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136616
10116	NC_014658	TCC	2	6	374620	374625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136616
10117	NC_014658	T	6	6	374709	374714	0 %	100 %	0 %	0 %	312136616
10118	NC_014658	T	6	6	374717	374722	0 %	100 %	0 %	0 %	312136616
10119	NC_014658	GCA	2	6	374756	374761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136616
10120	NC_014658	ATA	2	6	374782	374787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136616
10121	NC_014658	CTA	2	6	375021	375026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136616
10122	NC_014658	GAT	2	6	375039	375044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136616
10123	NC_014658	CAA	2	6	375186	375191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136616
10124	NC_014658	TAT	2	6	375250	375255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136616
10125	NC_014658	TCTT	2	8	375262	375269	0 %	75 %	0 %	25 %	312136616
10126	NC_014658	TTA	2	6	375279	375284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136616
10127	NC_014658	AAATT	2	10	375321	375330	60 %	40 %	0 %	0 %	312136617
10128	NC_014658	ATT	2	6	375334	375339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136617
10129	NC_014658	AAT	2	6	375390	375395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136617
10130	NC_014658	TA	3	6	375405	375410	50 %	50 %	0 %	0 %	312136617
10131	NC_014658	ATA	2	6	375567	375572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136617
10132	NC_014658	CT	3	6	375592	375597	0 %	50 %	0 %	50 %	312136617
10133	NC_014658	CCG	2	6	375610	375615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312136617
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10136	NC_014658	ATC	2	6	375744	375749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136617
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10149	NC_014658	CAT	2	6	376137	376142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136617
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10152	NC_014658	T	6	6	376273	376278	0 %	100 %	0 %	0 %	312136617
10153	NC_014658	T	6	6	376295	376300	0 %	100 %	0 %	0 %	312136617
10154	NC_014658	ACC	2	6	376347	376352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10155	NC_014658	AT	3	6	376388	376393	50 %	50 %	0 %	0 %	312136618
10156	NC_014658	T	6	6	376439	376444	0 %	100 %	0 %	0 %	312136618
10157	NC_014658	AC	3	6	376490	376495	50 %	0 %	0 %	50 %	312136618
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10161	NC_014658	T	7	7	376650	376656	0 %	100 %	0 %	0 %	312136618
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10227	NC_014658	AT	4	8	379096	379103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10228	NC_014658	A	6	6	379145	379150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10229	NC_014658	AAT	3	9	379225	379233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10230	NC_014658	GAAAT	2	10	379274	379283	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10231	NC_014658	A	7	7	379299	379305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10232	NC_014658	A	7	7	379311	379317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10233	NC_014658	A	6	6	379322	379327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10241	NC_014658	AGC	2	6	379574	379579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136620
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10243	NC_014658	TAC	2	6	379634	379639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136620
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10245	NC_014658	TTC	2	6	379820	379825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136620
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