MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 33259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_014658	CTT	2	6	313734	313739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136557
8503	NC_014658	CTTTT	2	10	313746	313755	0 %	80 %	0 %	20 %	312136557
8504	NC_014658	T	6	6	313752	313757	0 %	100 %	0 %	0 %	312136557
8505	NC_014658	T	6	6	313806	313811	0 %	100 %	0 %	0 %	312136557
8506	NC_014658	T	6	6	313864	313869	0 %	100 %	0 %	0 %	312136557
8507	NC_014658	TTC	2	6	313879	313884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136557
8508	NC_014658	TTC	2	6	313905	313910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136557
8509	NC_014658	ACT	2	6	313934	313939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136557
8510	NC_014658	TGG	2	6	313957	313962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136557
8511	NC_014658	CTTT	2	8	314015	314022	0 %	75 %	0 %	25 %	312136557
8512	NC_014658	CTT	2	6	314046	314051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136557
8513	NC_014658	T	7	7	314059	314065	0 %	100 %	0 %	0 %	312136557
8514	NC_014658	ATT	2	6	314092	314097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136557
8515	NC_014658	ACT	2	6	314135	314140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136557
8516	NC_014658	T	6	6	314149	314154	0 %	100 %	0 %	0 %	312136557
8517	NC_014658	TCT	2	6	314162	314167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136557
8518	NC_014658	GTT	2	6	314185	314190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136557
8519	NC_014658	T	7	7	314194	314200	0 %	100 %	0 %	0 %	312136557
8520	NC_014658	GTT	2	6	314234	314239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136557
8521	NC_014658	TAAC	2	8	314283	314290	50 %	25 %	0 %	25 %	312136557
8522	NC_014658	TCA	2	6	314300	314305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136557
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8524	NC_014658	TCA	2	6	314396	314401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136557
8525	NC_014658	ATT	2	6	314441	314446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136557
8526	NC_014658	TTA	2	6	314456	314461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136557
8527	NC_014658	TGA	2	6	314466	314471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136557
8528	NC_014658	CTT	2	6	314472	314477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136557
8529	NC_014658	GGA	2	6	314585	314590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136557
8530	NC_014658	CTG	2	6	314610	314615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136557
8531	NC_014658	CTT	2	6	314621	314626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136557
8532	NC_014658	TCCA	2	8	314650	314657	25 %	25 %	0 %	50 %	312136557
8533	NC_014658	TAG	2	6	314663	314668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136557
8534	NC_014658	CAA	3	9	314688	314696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136557
8535	NC_014658	GCAA	2	8	314717	314724	50 %	0 %	25 %	25 %	312136557
8536	NC_014658	CTT	2	6	314727	314732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136557
8537	NC_014658	TGC	2	6	314809	314814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136557
8538	NC_014658	TGGTG	2	10	314822	314831	0 %	40 %	60 %	0 %	312136557
8539	NC_014658	TTG	2	6	314858	314863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136557
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8541	NC_014658	T	7	7	314951	314957	0 %	100 %	0 %	0 %	312136557
8542	NC_014658	TGG	2	6	314977	314982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136557
8543	NC_014658	AGAA	2	8	315016	315023	75 %	0 %	25 %	0 %	312136557
8544	NC_014658	T	6	6	315028	315033	0 %	100 %	0 %	0 %	312136557
8545	NC_014658	ATA	2	6	315052	315057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136557
8546	NC_014658	TATCT	2	10	315100	315109	20 %	60 %	0 %	20 %	312136557
8547	NC_014658	AATCT	2	10	315174	315183	40 %	40 %	0 %	20 %	312136557
8548	NC_014658	AATTC	2	10	315204	315213	40 %	40 %	0 %	20 %	312136557
8549	NC_014658	AT	3	6	315239	315244	50 %	50 %	0 %	0 %	312136557
8550	NC_014658	TA	3	6	315304	315309	50 %	50 %	0 %	0 %	312136557
8551	NC_014658	T	6	6	315391	315396	0 %	100 %	0 %	0 %	312136557
8552	NC_014658	ATCAA	2	10	315401	315410	60 %	20 %	0 %	20 %	312136557
8553	NC_014658	TGT	2	6	315418	315423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136557
8554	NC_014658	TGG	2	6	315532	315537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136557
8555	NC_014658	GTA	2	6	315544	315549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136557
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8557	NC_014658	T	6	6	315602	315607	0 %	100 %	0 %	0 %	312136557
8558	NC_014658	AGG	2	6	315688	315693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136557
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8561	NC_014658	TA	3	6	315817	315822	50 %	50 %	0 %	0 %	312136557
8562	NC_014658	A	6	6	315865	315870	100 %	0 %	0 %	0 %	312136557
8563	NC_014658	TTA	2	6	315921	315926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136557
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8566	NC_014658	TTG	2	6	316108	316113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136557
8567	NC_014658	TACA	2	8	316120	316127	50 %	25 %	0 %	25 %	312136557
8568	NC_014658	AAT	2	6	316138	316143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136557
8569	NC_014658	TGT	2	6	316178	316183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136557
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8571	NC_014658	TA	3	6	316220	316225	50 %	50 %	0 %	0 %	312136557
8572	NC_014658	T	6	6	316233	316238	0 %	100 %	0 %	0 %	312136557
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8576	NC_014658	TA	3	6	316452	316457	50 %	50 %	0 %	0 %	312136557
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8580	NC_014658	T	6	6	316586	316591	0 %	100 %	0 %	0 %	312136557
8581	NC_014658	AATA	2	8	316642	316649	75 %	25 %	0 %	0 %	312136557
8582	NC_014658	TTAGAA	2	12	316652	316663	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312136557
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8584	NC_014658	GTT	2	6	316732	316737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136557
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8586	NC_014658	TTGG	2	8	316777	316784	0 %	50 %	50 %	0 %	312136557
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8588	NC_014658	ACT	2	6	316817	316822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136557
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8591	NC_014658	ATA	2	6	316913	316918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136557
8592	NC_014658	ATT	2	6	316919	316924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136557
8593	NC_014658	AATAT	2	10	316931	316940	60 %	40 %	0 %	0 %	312136557
8594	NC_014658	T	7	7	316966	316972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_014658	TTA	2	6	316980	316985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_014658	A	7	7	316992	316998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_014658	A	6	6	317012	317017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_014658	A	6	6	317019	317024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_014658	A	7	7	317028	317034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_014658	A	6	6	317036	317041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8603	NC_014658	TTGTTT	2	12	317266	317277	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312136558
8604	NC_014658	TTG	2	6	317371	317376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136558
8605	NC_014658	TAT	2	6	317447	317452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136558
8606	NC_014658	TAT	2	6	317473	317478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136558
8607	NC_014658	AGT	2	6	317509	317514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136558
8608	NC_014658	CAT	2	6	317578	317583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136558
8609	NC_014658	GCA	2	6	317610	317615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136558
8610	NC_014658	T	6	6	317644	317649	0 %	100 %	0 %	0 %	312136558
8611	NC_014658	TTTTG	2	10	317669	317678	0 %	80 %	20 %	0 %	312136558
8612	NC_014658	ATT	2	6	317687	317692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136558
8613	NC_014658	CAA	3	9	317770	317778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136558
8614	NC_014658	TTA	2	6	317782	317787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136558
8615	NC_014658	GTG	2	6	317814	317819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136558
8616	NC_014658	TTA	2	6	317821	317826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136558
8617	NC_014658	TAT	2	6	317833	317838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136558
8618	NC_014658	CTG	2	6	317842	317847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136558
8619	NC_014658	CAT	2	6	317863	317868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136558
8620	NC_014658	GTT	2	6	317906	317911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136558
8621	NC_014658	TAAG	2	8	317918	317925	50 %	25 %	25 %	0 %	312136558
8622	NC_014658	TAT	2	6	317959	317964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136558
8623	NC_014658	CTT	2	6	318058	318063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136558
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