MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 33259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014658	ATAGA	2	10	222606	222615	60 %	20 %	20 %	0 %	312136451
6002	NC_014658	A	6	6	222630	222635	100 %	0 %	0 %	0 %	312136451
6003	NC_014658	AAG	2	6	222654	222659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136451
6004	NC_014658	ATA	2	6	222708	222713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136451
6005	NC_014658	AAT	2	6	222757	222762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136451
6006	NC_014658	TAA	2	6	222766	222771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136451
6007	NC_014658	ATA	2	6	222779	222784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136451
6008	NC_014658	AGCTTT	2	12	222852	222863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312136452
6009	NC_014658	T	6	6	222861	222866	0 %	100 %	0 %	0 %	312136452
6010	NC_014658	TCA	3	9	222883	222891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136452
6011	NC_014658	TAT	2	6	222903	222908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136452
6012	NC_014658	CTTT	2	8	222924	222931	0 %	75 %	0 %	25 %	312136452
6013	NC_014658	T	6	6	222939	222944	0 %	100 %	0 %	0 %	312136452
6014	NC_014658	AGC	2	6	222966	222971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136452
6015	NC_014658	ACC	2	6	222987	222992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136452
6016	NC_014658	GAT	2	6	223024	223029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136452
6017	NC_014658	CTT	2	6	223046	223051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136452
6018	NC_014658	GCA	2	6	223057	223062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136452
6019	NC_014658	T	6	6	223072	223077	0 %	100 %	0 %	0 %	312136452
6020	NC_014658	T	6	6	223107	223112	0 %	100 %	0 %	0 %	312136452
6021	NC_014658	CAG	2	6	223154	223159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136452
6022	NC_014658	TCC	2	6	223224	223229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136452
6023	NC_014658	T	6	6	223234	223239	0 %	100 %	0 %	0 %	312136452
6024	NC_014658	TCC	2	6	223360	223365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_014658	TAA	2	6	223374	223379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_014658	TTTA	2	8	223380	223387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_014658	T	6	6	223390	223395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_014658	TAAAA	2	10	223398	223407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_014658	TA	4	8	223424	223431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_014658	GAAA	2	8	223433	223440	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_014658	ATTA	2	8	223460	223467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_014658	AGG	2	6	223475	223480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_014658	AGG	2	6	223601	223606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136453
6034	NC_014658	TGA	2	6	223611	223616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136453
6035	NC_014658	ACA	2	6	223624	223629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136453
6036	NC_014658	ATA	2	6	223639	223644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136453
6037	NC_014658	AAT	2	6	223719	223724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136453
6038	NC_014658	TG	3	6	223773	223778	0 %	50 %	50 %	0 %	312136453
6039	NC_014658	ATT	2	6	223795	223800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136453
6040	NC_014658	GGA	2	6	223801	223806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136453
6041	NC_014658	A	6	6	223806	223811	100 %	0 %	0 %	0 %	312136453
6042	NC_014658	TAAC	2	8	223847	223854	50 %	25 %	0 %	25 %	312136453
6043	NC_014658	AATAC	2	10	223855	223864	60 %	20 %	0 %	20 %	312136453
6044	NC_014658	GTGG	2	8	223880	223887	0 %	25 %	75 %	0 %	312136453
6045	NC_014658	GGA	2	6	223897	223902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136453
6046	NC_014658	ACA	2	6	223931	223936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136453
6047	NC_014658	TAA	2	6	223944	223949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136453
6048	NC_014658	ATC	2	6	223951	223956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136453
6049	NC_014658	ATT	2	6	224005	224010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136453
6050	NC_014658	ACAAT	2	10	224015	224024	60 %	20 %	0 %	20 %	312136453
6051	NC_014658	GGA	2	6	224035	224040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136453
6052	NC_014658	ATA	2	6	224096	224101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136453
6053	NC_014658	TA	3	6	224127	224132	50 %	50 %	0 %	0 %	312136453
6054	NC_014658	CAG	2	6	224184	224189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136453
6055	NC_014658	TGG	2	6	224190	224195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136453
6056	NC_014658	AGG	2	6	224196	224201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136453
6057	NC_014658	ACA	2	6	224237	224242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136453
6058	NC_014658	ACA	2	6	224252	224257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136453
6059	NC_014658	GGA	2	6	224275	224280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136453
6060	NC_014658	AAT	2	6	224317	224322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136453
6061	NC_014658	AT	3	6	224321	224326	50 %	50 %	0 %	0 %	312136453
6062	NC_014658	AGTG	2	8	224346	224353	25 %	25 %	50 %	0 %	312136453
6063	NC_014658	AT	3	6	224389	224394	50 %	50 %	0 %	0 %	312136453
6064	NC_014658	TTA	2	6	224405	224410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136453
6065	NC_014658	ATA	2	6	224453	224458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136453
6066	NC_014658	ATT	2	6	224483	224488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136453
6067	NC_014658	ATA	2	6	224507	224512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136453
6068	NC_014658	TAC	2	6	224539	224544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136453
6069	NC_014658	GCA	2	6	224590	224595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136453
6070	NC_014658	A	7	7	224647	224653	100 %	0 %	0 %	0 %	312136453
6071	NC_014658	AAAATA	2	12	224674	224685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312136453
6072	NC_014658	ATG	2	6	224696	224701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136453
6073	NC_014658	CAAAA	2	10	224896	224905	80 %	0 %	0 %	20 %	312136453
6074	NC_014658	CAA	2	6	224939	224944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136453
6075	NC_014658	AAACAA	2	12	225038	225049	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	312136453
6076	NC_014658	TA	3	6	225220	225225	50 %	50 %	0 %	0 %	312136453
6077	NC_014658	AGA	2	6	225243	225248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136453
6078	NC_014658	T	7	7	225274	225280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_014658	T	8	8	225282	225289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_014658	T	6	6	225291	225296	0 %	100 %	0 %	0 %	312136454
6081	NC_014658	ACA	2	6	225305	225310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136454
6082	NC_014658	T	6	6	225315	225320	0 %	100 %	0 %	0 %	312136454
6083	NC_014658	T	6	6	225324	225329	0 %	100 %	0 %	0 %	312136454
6084	NC_014658	T	6	6	225354	225359	0 %	100 %	0 %	0 %	312136454
6085	NC_014658	T	7	7	225399	225405	0 %	100 %	0 %	0 %	312136454
6086	NC_014658	CCT	2	6	225503	225508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136454
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6088	NC_014658	AAAACT	2	12	225587	225598	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312136454
6089	NC_014658	T	6	6	225605	225610	0 %	100 %	0 %	0 %	312136454
6090	NC_014658	ATC	2	6	225634	225639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136454
6091	NC_014658	A	6	6	225649	225654	100 %	0 %	0 %	0 %	312136454
6092	NC_014658	TCT	2	6	225665	225670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136454
6093	NC_014658	T	7	7	225679	225685	0 %	100 %	0 %	0 %	312136454
6094	NC_014658	T	6	6	225701	225706	0 %	100 %	0 %	0 %	312136454
6095	NC_014658	TAT	2	6	225724	225729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136454
6096	NC_014658	TCA	2	6	225785	225790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136454
6097	NC_014658	CAA	2	6	225816	225821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136454
6098	NC_014658	ATT	2	6	225824	225829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136454
6099	NC_014658	ACA	2	6	225893	225898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136454
6100	NC_014658	T	6	6	225996	226001	0 %	100 %	0 %	0 %	312136454
6101	NC_014658	A	7	7	226003	226009	100 %	0 %	0 %	0 %	312136454
6102	NC_014658	ATA	2	6	226024	226029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136454
6103	NC_014658	T	7	7	226046	226052	0 %	100 %	0 %	0 %	312136454
6104	NC_014658	CAT	2	6	226062	226067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136454
6105	NC_014658	T	7	7	226085	226091	0 %	100 %	0 %	0 %	312136454
6106	NC_014658	CAT	2	6	226155	226160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136454
6107	NC_014658	GTT	2	6	226169	226174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136454
6108	NC_014658	A	6	6	226205	226210	100 %	0 %	0 %	0 %	312136454
6109	NC_014658	AGG	2	6	226228	226233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136454
6110	NC_014658	TTAT	2	8	226235	226242	25 %	75 %	0 %	0 %	312136454
6111	NC_014658	CATA	2	8	226309	226316	50 %	25 %	0 %	25 %	312136454
6112	NC_014658	CTT	2	6	226337	226342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136454
6113	NC_014658	CTT	2	6	226370	226375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136454
6114	NC_014658	TCC	2	6	226378	226383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136454
6115	NC_014658	A	6	6	226403	226408	100 %	0 %	0 %	0 %	312136454
6116	NC_014658	TATAA	2	10	226411	226420	60 %	40 %	0 %	0 %	312136454
6117	NC_014658	A	6	6	226448	226453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_014658	ATTA	2	8	226475	226482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_014658	TCA	2	6	226505	226510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_014658	TCA	3	9	226533	226541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_014658	TTC	2	6	226552	226557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_014658	TCA	3	9	226588	226596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_014658	ATTTTT	2	12	226602	226613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312136455
6124	NC_014658	T	7	7	226609	226615	0 %	100 %	0 %	0 %	312136455
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