MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 33259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014658	GGA	2	6	184242	184247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136412
5002	NC_014658	AGACA	2	10	184262	184271	60 %	0 %	20 %	20 %	312136412
5003	NC_014658	TGG	2	6	184315	184320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136412
5004	NC_014658	AAG	2	6	184368	184373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136412
5005	NC_014658	ATT	2	6	184492	184497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136412
5006	NC_014658	TGA	2	6	184499	184504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136412
5007	NC_014658	GGAATG	2	12	184506	184517	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312136412
5008	NC_014658	TA	4	8	184526	184533	50 %	50 %	0 %	0 %	312136412
5009	NC_014658	ACT	2	6	184579	184584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136412
5010	NC_014658	TG	3	6	184600	184605	0 %	50 %	50 %	0 %	312136412
5011	NC_014658	AGA	2	6	184649	184654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136412
5012	NC_014658	AAT	2	6	184676	184681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136412
5013	NC_014658	TATGGA	2	12	184728	184739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136412
5014	NC_014658	TAA	2	6	184753	184758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136412
5015	NC_014658	A	6	6	184833	184838	100 %	0 %	0 %	0 %	312136412
5016	NC_014658	AG	3	6	184843	184848	50 %	0 %	50 %	0 %	312136412
5017	NC_014658	CATT	3	12	184852	184863	25 %	50 %	0 %	25 %	312136412
5018	NC_014658	TGT	2	6	184914	184919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136412
5019	NC_014658	TAA	2	6	184945	184950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136412
5020	NC_014658	A	6	6	184956	184961	100 %	0 %	0 %	0 %	312136412
5021	NC_014658	TTA	2	6	184982	184987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136412
5022	NC_014658	GAA	2	6	185019	185024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136412
5023	NC_014658	GAC	2	6	185071	185076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136412
5024	NC_014658	CAG	2	6	185077	185082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136412
5025	NC_014658	ATA	2	6	185085	185090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136412
5026	NC_014658	AAC	2	6	185144	185149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136412
5027	NC_014658	ACC	2	6	185192	185197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136412
5028	NC_014658	GAA	2	6	185208	185213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136412
5029	NC_014658	AGAC	2	8	185217	185224	50 %	0 %	25 %	25 %	312136412
5030	NC_014658	AC	4	8	185292	185299	50 %	0 %	0 %	50 %	312136412
5031	NC_014658	TA	3	6	185306	185311	50 %	50 %	0 %	0 %	312136412
5032	NC_014658	GCA	2	6	185373	185378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136412
5033	NC_014658	TGG	2	6	185456	185461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136412
5034	NC_014658	TG	3	6	185472	185477	0 %	50 %	50 %	0 %	312136412
5035	NC_014658	AAG	2	6	185509	185514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136412
5036	NC_014658	GCA	3	9	185562	185570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136412
5037	NC_014658	ACA	2	6	185609	185614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136412
5038	NC_014658	AAT	2	6	185615	185620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136412
5039	NC_014658	AGG	2	6	185642	185647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136412
5040	NC_014658	T	6	6	185673	185678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014658	CCTT	2	8	185679	185686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_014658	T	6	6	185685	185690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_014658	T	6	6	185692	185697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_014658	A	6	6	185778	185783	100 %	0 %	0 %	0 %	312136413
5045	NC_014658	A	6	6	185824	185829	100 %	0 %	0 %	0 %	312136413
5046	NC_014658	GGA	3	9	185889	185897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136413
5047	NC_014658	A	6	6	185922	185927	100 %	0 %	0 %	0 %	312136413
5048	NC_014658	T	6	6	186037	186042	0 %	100 %	0 %	0 %	312136413
5049	NC_014658	TTTG	2	8	186050	186057	0 %	75 %	25 %	0 %	312136413
5050	NC_014658	TAAA	2	8	186064	186071	75 %	25 %	0 %	0 %	312136413
5051	NC_014658	ATGCA	2	10	186104	186113	40 %	20 %	20 %	20 %	312136413
5052	NC_014658	ATT	2	6	186128	186133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136413
5053	NC_014658	ATG	2	6	186148	186153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136413
5054	NC_014658	GAT	2	6	186282	186287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136413
5055	NC_014658	AAT	2	6	186329	186334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136413
5056	NC_014658	GAA	2	6	186345	186350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136413
5057	NC_014658	TAAT	2	8	186378	186385	50 %	50 %	0 %	0 %	312136413
5058	NC_014658	AAT	2	6	186400	186405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136414
5059	NC_014658	T	6	6	186407	186412	0 %	100 %	0 %	0 %	312136414
5060	NC_014658	CTT	2	6	186414	186419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136414
5061	NC_014658	T	6	6	186418	186423	0 %	100 %	0 %	0 %	312136414
5062	NC_014658	TCT	2	6	186428	186433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136414
5063	NC_014658	TTC	3	9	186434	186442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136414
5064	NC_014658	T	6	6	186479	186484	0 %	100 %	0 %	0 %	312136414
5065	NC_014658	TTG	2	6	186546	186551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136414
5066	NC_014658	T	6	6	186561	186566	0 %	100 %	0 %	0 %	312136414
5067	NC_014658	TGT	2	6	186595	186600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136414
5068	NC_014658	CAG	2	6	186684	186689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136414
5069	NC_014658	TAT	2	6	186768	186773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136414
5070	NC_014658	AAC	2	6	186896	186901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136415
5071	NC_014658	GCT	2	6	186933	186938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136415
5072	NC_014658	CTT	2	6	186988	186993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136415
5073	NC_014658	TC	3	6	187011	187016	0 %	50 %	0 %	50 %	312136415
5074	NC_014658	AT	3	6	187025	187030	50 %	50 %	0 %	0 %	312136415
5075	NC_014658	T	6	6	187217	187222	0 %	100 %	0 %	0 %	312136415
5076	NC_014658	TCA	2	6	187239	187244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136415
5077	NC_014658	GGT	2	6	187353	187358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136415
5078	NC_014658	AT	3	6	187400	187405	50 %	50 %	0 %	0 %	312136415
5079	NC_014658	CTT	2	6	187406	187411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136415
5080	NC_014658	TCT	3	9	187419	187427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136415
5081	NC_014658	ATA	2	6	187454	187459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136415
5082	NC_014658	TGG	2	6	187673	187678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136415
5083	NC_014658	CAT	2	6	187717	187722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136415
5084	NC_014658	TGC	2	6	187736	187741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136415
5085	NC_014658	TTTTCC	2	12	187817	187828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136415
5086	NC_014658	GTA	2	6	187871	187876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136415
5087	NC_014658	GTT	2	6	187908	187913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136415
5088	NC_014658	TTC	2	6	187918	187923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136415
5089	NC_014658	GAG	2	6	187969	187974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136415
5090	NC_014658	T	6	6	188102	188107	0 %	100 %	0 %	0 %	312136415
5091	NC_014658	T	6	6	188126	188131	0 %	100 %	0 %	0 %	312136415
5092	NC_014658	TCG	2	6	188253	188258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136415
5093	NC_014658	CTT	2	6	188287	188292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136415
5094	NC_014658	T	7	7	188291	188297	0 %	100 %	0 %	0 %	312136415
5095	NC_014658	T	6	6	188390	188395	0 %	100 %	0 %	0 %	312136415
5096	NC_014658	T	6	6	188406	188411	0 %	100 %	0 %	0 %	312136415
5097	NC_014658	ACC	2	6	188450	188455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_014658	CA	3	6	188506	188511	50 %	0 %	0 %	50 %	312136416
5099	NC_014658	CTG	2	6	188530	188535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136416
5100	NC_014658	T	8	8	188554	188561	0 %	100 %	0 %	0 %	312136416
5101	NC_014658	T	6	6	188610	188615	0 %	100 %	0 %	0 %	312136416
5102	NC_014658	TGG	2	6	188649	188654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136416
5103	NC_014658	TAACA	2	10	188755	188764	60 %	20 %	0 %	20 %	312136416
5104	NC_014658	CTG	2	6	188779	188784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136416
5105	NC_014658	TGA	2	6	188807	188812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136416
5106	NC_014658	AAC	2	6	188846	188851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136416
5107	NC_014658	ATA	2	6	188864	188869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136416
5108	NC_014658	TCT	2	6	188890	188895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136416
5109	NC_014658	ATT	2	6	188898	188903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136416
5110	NC_014658	CAA	2	6	188983	188988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136416
5111	NC_014658	AAAT	2	8	189166	189173	75 %	25 %	0 %	0 %	312136416
5112	NC_014658	TCC	2	6	189194	189199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136416
5113	NC_014658	TTA	2	6	189237	189242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136416
5114	NC_014658	AT	4	8	189321	189328	50 %	50 %	0 %	0 %	312136416
5115	NC_014658	TGC	2	6	189359	189364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136416
5116	NC_014658	GTACC	2	10	189376	189385	20 %	20 %	20 %	40 %	312136416
5117	NC_014658	CAT	2	6	189592	189597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136416
5118	NC_014658	T	7	7	189682	189688	0 %	100 %	0 %	0 %	312136416
5119	NC_014658	T	7	7	189710	189716	0 %	100 %	0 %	0 %	312136416
5120	NC_014658	CATC	2	8	189721	189728	25 %	25 %	0 %	50 %	312136416
5121	NC_014658	TGT	2	6	189852	189857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136417
5122	NC_014658	CAA	2	6	189947	189952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136417
5123	NC_014658	TTTTAT	2	12	189969	189980	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312136417
5124	NC_014658	T	6	6	189985	189990	0 %	100 %	0 %	0 %	312136417
5125	NC_014658	GAAT	2	8	189991	189998	50 %	25 %	25 %	0 %	312136417
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5373	NC_014658	CCTT	2	8	199317	199324	0 %	50 %	0 %	50 %	312136429
5374	NC_014658	CTA	2	6	199348	199353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136429
5375	NC_014658	TAA	3	9	199394	199402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136429
5376	NC_014658	GTT	2	6	199404	199409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136429
5377	NC_014658	ATTTT	2	10	199443	199452	20 %	80 %	0 %	0 %	312136429
5378	NC_014658	A	7	7	199460	199466	100 %	0 %	0 %	0 %	312136429
5379	NC_014658	T	6	6	199473	199478	0 %	100 %	0 %	0 %	312136429
5380	NC_014658	TA	4	8	199569	199576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5381	NC_014658	A	7	7	199586	199592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5382	NC_014658	GGT	2	6	199604	199609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_014658	GAG	2	6	199636	199641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5422	NC_014658	T	7	7	201089	201095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5451	NC_014658	T	6	6	202083	202088	0 %	100 %	0 %	0 %	312136432
5452	NC_014658	TAT	2	6	202126	202131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136432
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5454	NC_014658	T	6	6	202170	202175	0 %	100 %	0 %	0 %	312136432
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5485	NC_014658	GCT	2	6	203429	203434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136434
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5489	NC_014658	T	8	8	203580	203587	0 %	100 %	0 %	0 %	312136434
5490	NC_014658	TCA	2	6	203612	203617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136434
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5492	NC_014658	T	6	6	203631	203636	0 %	100 %	0 %	0 %	312136434
5493	NC_014658	TATTT	2	10	203650	203659	20 %	80 %	0 %	0 %	312136434
5494	NC_014658	AT	3	6	203660	203665	50 %	50 %	0 %	0 %	312136434
5495	NC_014658	TC	3	6	203707	203712	0 %	50 %	0 %	50 %	312136434
5496	NC_014658	TTA	2	6	203727	203732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136434
5497	NC_014658	T	6	6	203743	203748	0 %	100 %	0 %	0 %	312136434
5498	NC_014658	AATTCC	2	12	203755	203766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136434
5499	NC_014658	TTC	2	6	203775	203780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136434
5500	NC_014658	CTT	2	6	203849	203854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136435

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