MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 33259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014658	CTTC	2	8	167488	167495	0 %	50 %	0 %	50 %	312136394
4502	NC_014658	AAC	2	6	167544	167549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136395
4503	NC_014658	CTT	2	6	167648	167653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136395
4504	NC_014658	CT	3	6	167759	167764	0 %	50 %	0 %	50 %	312136395
4505	NC_014658	TCT	2	6	167796	167801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136396
4506	NC_014658	TCTT	2	8	167808	167815	0 %	75 %	0 %	25 %	312136396
4507	NC_014658	T	8	8	167903	167910	0 %	100 %	0 %	0 %	312136396
4508	NC_014658	TGTT	2	8	167917	167924	0 %	75 %	25 %	0 %	312136396
4509	NC_014658	TGG	2	6	167974	167979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136397
4510	NC_014658	T	8	8	168006	168013	0 %	100 %	0 %	0 %	312136397
4511	NC_014658	CTAT	2	8	168062	168069	25 %	50 %	0 %	25 %	312136397
4512	NC_014658	AAC	2	6	168083	168088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136397
4513	NC_014658	TA	3	6	168136	168141	50 %	50 %	0 %	0 %	312136397
4514	NC_014658	CTT	2	6	168167	168172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136397
4515	NC_014658	ATC	2	6	168202	168207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136397
4516	NC_014658	CTT	2	6	168209	168214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136397
4517	NC_014658	CAA	2	6	168225	168230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136397
4518	NC_014658	CAA	2	6	168255	168260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136397
4519	NC_014658	T	6	6	168262	168267	0 %	100 %	0 %	0 %	312136397
4520	NC_014658	AAT	2	6	168273	168278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136397
4521	NC_014658	ATT	2	6	168286	168291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136397
4522	NC_014658	ATCC	2	8	168297	168304	25 %	25 %	0 %	50 %	312136397
4523	NC_014658	T	6	6	168312	168317	0 %	100 %	0 %	0 %	312136397
4524	NC_014658	TAA	2	6	168327	168332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136397
4525	NC_014658	T	7	7	168336	168342	0 %	100 %	0 %	0 %	312136397
4526	NC_014658	TTTAAT	2	12	168344	168355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136397
4527	NC_014658	CAG	3	9	168390	168398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136397
4528	NC_014658	CCA	2	6	168494	168499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136397
4529	NC_014658	TCA	2	6	168519	168524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136397
4530	NC_014658	ATTCTT	2	12	168538	168549	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312136398
4531	NC_014658	CTAG	2	8	168625	168632	25 %	25 %	25 %	25 %	312136398
4532	NC_014658	AT	3	6	168731	168736	50 %	50 %	0 %	0 %	312136398
4533	NC_014658	TCT	2	6	168740	168745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136398
4534	NC_014658	TTC	2	6	168801	168806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136398
4535	NC_014658	TTC	2	6	168852	168857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136398
4536	NC_014658	AT	3	6	168869	168874	50 %	50 %	0 %	0 %	312136398
4537	NC_014658	TCCT	2	8	168975	168982	0 %	50 %	0 %	50 %	312136399
4538	NC_014658	T	6	6	168990	168995	0 %	100 %	0 %	0 %	312136399
4539	NC_014658	TTG	2	6	169018	169023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136399
4540	NC_014658	TC	3	6	169063	169068	0 %	50 %	0 %	50 %	312136399
4541	NC_014658	CCA	2	6	169094	169099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136399
4542	NC_014658	TCCA	2	8	169132	169139	25 %	25 %	0 %	50 %	312136399
4543	NC_014658	AT	3	6	169141	169146	50 %	50 %	0 %	0 %	312136399
4544	NC_014658	ACC	2	6	169176	169181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136399
4545	NC_014658	GAC	2	6	169197	169202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136399
4546	NC_014658	GGT	2	6	169244	169249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136399
4547	NC_014658	T	6	6	169261	169266	0 %	100 %	0 %	0 %	312136399
4548	NC_014658	CAT	2	6	169311	169316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136399
4549	NC_014658	TGT	2	6	169321	169326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136399
4550	NC_014658	CCT	2	6	169336	169341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136400
4551	NC_014658	GTTTTT	2	12	169343	169354	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312136400
4552	NC_014658	ATA	2	6	169357	169362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136400
4553	NC_014658	CTA	2	6	169384	169389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136400
4554	NC_014658	TCT	2	6	169416	169421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136400
4555	NC_014658	T	6	6	169431	169436	0 %	100 %	0 %	0 %	312136400
4556	NC_014658	T	6	6	169476	169481	0 %	100 %	0 %	0 %	312136400
4557	NC_014658	ATT	2	6	169514	169519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136400
4558	NC_014658	CTG	2	6	169552	169557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136400
4559	NC_014658	T	7	7	169580	169586	0 %	100 %	0 %	0 %	312136400
4560	NC_014658	T	6	6	169616	169621	0 %	100 %	0 %	0 %	312136401
4561	NC_014658	T	8	8	169623	169630	0 %	100 %	0 %	0 %	312136401
4562	NC_014658	AT	3	6	169636	169641	50 %	50 %	0 %	0 %	312136401
4563	NC_014658	TCC	2	6	169689	169694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136401
4564	NC_014658	CTA	2	6	169708	169713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136401
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4566	NC_014658	TCT	2	6	169755	169760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136401
4567	NC_014658	TC	3	6	169833	169838	0 %	50 %	0 %	50 %	312136401
4568	NC_014658	TAAA	2	8	169871	169878	75 %	25 %	0 %	0 %	312136401
4569	NC_014658	TTCT	2	8	169886	169893	0 %	75 %	0 %	25 %	312136401
4570	NC_014658	ATC	2	6	169906	169911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136401
4571	NC_014658	TCT	2	6	169920	169925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136401
4572	NC_014658	A	6	6	169986	169991	100 %	0 %	0 %	0 %	312136402
4573	NC_014658	ATTA	2	8	170024	170031	50 %	50 %	0 %	0 %	312136402
4574	NC_014658	CAT	2	6	170053	170058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136402
4575	NC_014658	TAA	2	6	170063	170068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136402
4576	NC_014658	GCTTCA	2	12	170139	170150	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312136402
4577	NC_014658	ATT	2	6	170160	170165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136402
4578	NC_014658	T	6	6	170185	170190	0 %	100 %	0 %	0 %	312136402
4579	NC_014658	T	8	8	170197	170204	0 %	100 %	0 %	0 %	312136402
4580	NC_014658	GATG	2	8	170211	170218	25 %	25 %	50 %	0 %	312136402
4581	NC_014658	AT	3	6	170284	170289	50 %	50 %	0 %	0 %	312136402
4582	NC_014658	TATTT	2	10	170303	170312	20 %	80 %	0 %	0 %	312136402
4583	NC_014658	T	7	7	170327	170333	0 %	100 %	0 %	0 %	312136402
4584	NC_014658	T	6	6	170356	170361	0 %	100 %	0 %	0 %	312136402
4585	NC_014658	TA	3	6	170372	170377	50 %	50 %	0 %	0 %	312136402
4586	NC_014658	T	6	6	170383	170388	0 %	100 %	0 %	0 %	312136402
4587	NC_014658	ATTTAT	2	12	170402	170413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136402
4588	NC_014658	ATA	2	6	170496	170501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136402
4589	NC_014658	TAAT	2	8	170511	170518	50 %	50 %	0 %	0 %	312136403
4590	NC_014658	T	7	7	170527	170533	0 %	100 %	0 %	0 %	312136403
4591	NC_014658	CCA	2	6	170549	170554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136403
4592	NC_014658	AGC	2	6	170593	170598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136403
4593	NC_014658	T	6	6	170639	170644	0 %	100 %	0 %	0 %	312136403
4594	NC_014658	T	8	8	170728	170735	0 %	100 %	0 %	0 %	312136403
4595	NC_014658	CTG	2	6	170829	170834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136403
4596	NC_014658	AAC	2	6	170845	170850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136403
4597	NC_014658	T	7	7	170862	170868	0 %	100 %	0 %	0 %	312136403
4598	NC_014658	T	6	6	170870	170875	0 %	100 %	0 %	0 %	312136403
4599	NC_014658	ATTAA	2	10	170897	170906	60 %	40 %	0 %	0 %	312136403
4600	NC_014658	GTT	2	6	170945	170950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136403
4601	NC_014658	ATC	2	6	170951	170956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136403
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4603	NC_014658	ATT	2	6	170980	170985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136403
4604	NC_014658	CTT	3	9	171033	171041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136403
4605	NC_014658	TAC	2	6	171043	171048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136403
4606	NC_014658	CAT	2	6	171061	171066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136403
4607	NC_014658	CCG	2	6	171068	171073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312136403
4608	NC_014658	T	6	6	171102	171107	0 %	100 %	0 %	0 %	312136403
4609	NC_014658	AAT	2	6	171110	171115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136403
4610	NC_014658	CTT	2	6	171129	171134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136403
4611	NC_014658	ATA	2	6	171142	171147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136403
4612	NC_014658	CTG	2	6	171150	171155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136403
4613	NC_014658	TCC	2	6	171169	171174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136403
4614	NC_014658	AATT	2	8	171208	171215	50 %	50 %	0 %	0 %	312136403
4615	NC_014658	AT	3	6	171221	171226	50 %	50 %	0 %	0 %	312136403
4616	NC_014658	T	6	6	171281	171286	0 %	100 %	0 %	0 %	312136404
4617	NC_014658	T	6	6	171409	171414	0 %	100 %	0 %	0 %	312136404
4618	NC_014658	T	7	7	171484	171490	0 %	100 %	0 %	0 %	312136404
4619	NC_014658	TCT	2	6	171527	171532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136404
4620	NC_014658	ATT	2	6	171553	171558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136404
4621	NC_014658	T	6	6	171557	171562	0 %	100 %	0 %	0 %	312136404
4622	NC_014658	TA	3	6	171658	171663	50 %	50 %	0 %	0 %	312136404
4623	NC_014658	ATCT	2	8	171693	171700	25 %	50 %	0 %	25 %	312136404
4624	NC_014658	TC	3	6	171711	171716	0 %	50 %	0 %	50 %	312136404
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4626	NC_014658	CTT	2	6	171771	171776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136404
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4984	NC_014658	CGAT	2	8	183588	183595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4985	NC_014658	TA	3	6	183603	183608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4997	NC_014658	GAT	2	6	184032	184037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136412
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5000	NC_014658	AGC	2	6	184178	184183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136412

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