MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 3078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014214	GCT	2	6	14	19	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014214	CCTC	2	8	116	123	0 %	25 %	0 %	75 %	297567865
3	NC_014214	TCT	2	6	155	160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
4	NC_014214	GGTCGT	2	12	233	244	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	297567865
5	NC_014214	CTC	2	6	399	404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567865
6	NC_014214	GCC	2	6	442	447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567865
7	NC_014214	CAG	2	6	450	455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567865
8	NC_014214	CGT	3	9	479	487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567865
9	NC_014214	CCTC	2	8	494	501	0 %	25 %	0 %	75 %	297567865
10	NC_014214	TGG	2	6	589	594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567865
11	NC_014214	CTG	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567865
12	NC_014214	GCC	2	6	650	655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567865
13	NC_014214	GGT	2	6	663	668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567865
14	NC_014214	GCC	2	6	717	722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567865
15	NC_014214	GGTT	2	8	776	783	0 %	50 %	50 %	0 %	297567865
16	NC_014214	AGC	2	6	864	869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567865
17	NC_014214	AGG	2	6	884	889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567865
18	NC_014214	GCAAG	2	10	890	899	40 %	0 %	40 %	20 %	297567865
19	NC_014214	CCT	2	6	959	964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567865
20	NC_014214	GGC	2	6	1031	1036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567865
21	NC_014214	GCG	2	6	1074	1079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567865
22	NC_014214	TTC	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
23	NC_014214	GAC	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567865
24	NC_014214	CAC	2	6	1299	1304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
25	NC_014214	TGC	2	6	1438	1443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567865
26	NC_014214	ACTCGG	2	12	1469	1480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297567865
27	NC_014214	ACG	2	6	1486	1491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567865
28	NC_014214	TTC	2	6	1521	1526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
29	NC_014214	TCT	2	6	1549	1554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
30	NC_014214	GCG	3	9	1597	1605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567865
31	NC_014214	CCA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
32	NC_014214	T	6	6	1844	1849	0 %	100 %	0 %	0 %	297567865
33	NC_014214	CAC	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
34	NC_014214	CGGG	2	8	1924	1931	0 %	0 %	75 %	25 %	297567865
35	NC_014214	G	6	6	1929	1934	0 %	0 %	100 %	0 %	297567865
36	NC_014214	CAC	2	6	1947	1952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
37	NC_014214	CGG	2	6	1970	1975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567865
38	NC_014214	GGT	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567865
39	NC_014214	CAC	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
40	NC_014214	TCC	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567865
41	NC_014214	TTC	2	6	2067	2072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
42	NC_014214	TGA	2	6	2102	2107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567865
43	NC_014214	TCC	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014214	TCT	2	6	2149	2154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567866
45	NC_014214	CAGC	2	8	2195	2202	25 %	0 %	25 %	50 %	297567866
46	NC_014214	CAG	2	6	2256	2261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567866
47	NC_014214	CAG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567866
48	NC_014214	GCGG	2	8	2364	2371	0 %	0 %	75 %	25 %	297567866
49	NC_014214	GC	3	6	2388	2393	0 %	0 %	50 %	50 %	297567866
50	NC_014214	G	6	6	2405	2410	0 %	0 %	100 %	0 %	297567866
51	NC_014214	CGG	2	6	2426	2431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567866
52	NC_014214	AGC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567866
53	NC_014214	GCC	2	6	2491	2496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567866
54	NC_014214	C	6	6	2542	2547	0 %	0 %	0 %	100 %	297567866
55	NC_014214	AGCC	2	8	2550	2557	25 %	0 %	25 %	50 %	297567866
56	NC_014214	GCG	2	6	2590	2595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567866
57	NC_014214	TCCA	2	8	2605	2612	25 %	25 %	0 %	50 %	297567866
58	NC_014214	CG	3	6	2657	2662	0 %	0 %	50 %	50 %	297567867
59	NC_014214	CTC	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567867
60	NC_014214	CCG	2	6	2702	2707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567867
61	NC_014214	CGT	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567867
62	NC_014214	C	7	7	2741	2747	0 %	0 %	0 %	100 %	297567867
63	NC_014214	GCT	2	6	2770	2775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567867
64	NC_014214	TCC	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567867
65	NC_014214	TCC	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567867
66	NC_014214	TCCC	2	8	2878	2885	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_014214	CAC	2	6	2946	2951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567868
68	NC_014214	GCC	2	6	2967	2972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567868
69	NC_014214	C	7	7	3009	3015	0 %	0 %	0 %	100 %	297567868
70	NC_014214	CCT	2	6	3118	3123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014214	TA	4	8	3134	3141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014214	ACC	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014214	CCG	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567869
74	NC_014214	CTC	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567869
75	NC_014214	GGA	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567869
76	NC_014214	TCC	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567869
77	NC_014214	CTC	2	6	3384	3389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567870
78	NC_014214	CTC	2	6	3431	3436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567870
79	NC_014214	CCG	2	6	3446	3451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567870
80	NC_014214	CCGC	2	8	3457	3464	0 %	0 %	25 %	75 %	297567870
81	NC_014214	CGCTTG	2	12	3465	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567870
82	NC_014214	CCT	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567870
83	NC_014214	GAT	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567870
84	NC_014214	CG	3	6	3528	3533	0 %	0 %	50 %	50 %	297567870
85	NC_014214	CAG	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567870
86	NC_014214	CAAAA	2	10	3599	3608	80 %	0 %	0 %	20 %	297567870
87	NC_014214	TCG	2	6	3612	3617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567870
88	NC_014214	CCT	2	6	3633	3638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014214	GCC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014214	TC	3	6	3681	3686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014214	GAT	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014214	GTC	2	6	3790	3795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014214	ACGA	2	8	3821	3828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014214	CAG	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014214	CTG	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014214	ACC	2	6	4016	4021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014214	C	6	6	4020	4025	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_014214	GGA	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014214	GCGA	2	8	4064	4071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014214	CCT	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567871
101	NC_014214	CT	3	6	4171	4176	0 %	50 %	0 %	50 %	297567871
102	NC_014214	CGGG	2	8	4452	4459	0 %	0 %	75 %	25 %	297567871
103	NC_014214	CCT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567871
104	NC_014214	GGGC	2	8	4524	4531	0 %	0 %	75 %	25 %	297567871
105	NC_014214	CTC	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567871
106	NC_014214	GAA	2	6	4722	4727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567871
107	NC_014214	AAAG	2	8	4734	4741	75 %	0 %	25 %	0 %	297567871
108	NC_014214	GCC	2	6	4760	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567871
109	NC_014214	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567871
110	NC_014214	GC	4	8	4857	4864	0 %	0 %	50 %	50 %	297567871
111	NC_014214	CGG	2	6	4909	4914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567871
112	NC_014214	AG	3	6	4919	4924	50 %	0 %	50 %	0 %	297567871
113	NC_014214	GGT	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014214	GCT	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014214	CCTT	2	8	5373	5380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014214	CAG	2	6	5386	5391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014214	GCT	2	6	5395	5400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014214	T	6	6	5418	5423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014214	TACC	2	8	5443	5450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014214	GGC	2	6	5470	5475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014214	GCC	2	6	5480	5485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014214	CTT	2	6	5507	5512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014214	GCC	2	6	5598	5603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567872
124	NC_014214	TCC	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567872
125	NC_014214	CCT	2	6	5662	5667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567872
126	NC_014214	GCC	2	6	5670	5675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567872
127	NC_014214	CAG	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567872
128	NC_014214	CAC	2	6	5735	5740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567872
129	NC_014214	CAG	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567872
130	NC_014214	CAG	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567872
131	NC_014214	CTG	2	6	5798	5803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567872
132	NC_014214	AGC	2	6	5838	5843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567872
133	NC_014214	ACC	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567872
134	NC_014214	CTC	2	6	5957	5962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567872
135	NC_014214	CCG	2	6	5972	5977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567872
136	NC_014214	CTT	2	6	5980	5985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567872
137	NC_014214	GCG	2	6	6017	6022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567872
138	NC_014214	ACC	2	6	6030	6035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567872
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397	NC_014214	G	6	6	15918	15923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_014214	CAT	2	6	16189	16194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_014214	CAA	2	6	16234	16239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_014214	TATT	2	8	16265	16272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_014214	GACCGG	2	12	16406	16417	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297567892
405	NC_014214	GAC	2	6	16457	16462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567892
406	NC_014214	GCC	2	6	16494	16499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567892
407	NC_014214	C	6	6	16530	16535	0 %	0 %	0 %	100 %	297567892
408	NC_014214	GCG	2	6	16572	16577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567892
409	NC_014214	ACG	2	6	16599	16604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567892
410	NC_014214	CTA	2	6	16693	16698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567892
411	NC_014214	CG	3	6	16746	16751	0 %	0 %	50 %	50 %	297567892
412	NC_014214	CGG	2	6	16767	16772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567892
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422	NC_014214	CTG	3	9	17204	17212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567892
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430	NC_014214	CTT	2	6	17567	17572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567892
431	NC_014214	GCT	2	6	17589	17594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567892
432	NC_014214	TTC	2	6	17601	17606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567892
433	NC_014214	CCT	2	6	17614	17619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_014214	GAG	2	6	17623	17628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
435	NC_014214	GGAAA	2	10	17650	17659	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
436	NC_014214	A	8	8	17741	17748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_014214	GCT	2	6	17754	17759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_014214	AGC	2	6	17763	17768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_014214	CAG	2	6	17775	17780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_014214	TAG	2	6	17792	17797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567893
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456	NC_014214	TTA	2	6	18491	18496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_014214	GAA	2	6	18521	18526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
458	NC_014214	GGA	2	6	18581	18586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567894
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471	NC_014214	CCT	2	6	19394	19399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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479	NC_014214	GC	3	6	19738	19743	0 %	0 %	50 %	50 %	297567895
480	NC_014214	CTC	2	6	19784	19789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567895
481	NC_014214	CCA	2	6	19945	19950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567895
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488	NC_014214	CGG	2	6	20163	20168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567896
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492	NC_014214	GCA	2	6	20317	20322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567896
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499	NC_014214	AGG	2	6	20605	20610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_014214	C	7	7	20648	20654	0 %	0 %	0 %	100 %	297567897

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