MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Moraxella catarrhalis RH4 chromosome

Total Repeats: 40232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_014147	CCTG	2	8	1620791	1620798	0 %	25 %	25 %	50 %	296113864
35002	NC_014147	TCA	2	6	1620821	1620826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113864
35003	NC_014147	CAC	2	6	1620912	1620917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296113864
35004	NC_014147	TCAATT	2	12	1620932	1620943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296113864
35005	NC_014147	CTT	2	6	1620966	1620971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296113864
35006	NC_014147	ATC	2	6	1621090	1621095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113864
35007	NC_014147	CAAG	2	8	1621101	1621108	50 %	0 %	25 %	25 %	296113864
35008	NC_014147	AC	3	6	1621179	1621184	50 %	0 %	0 %	50 %	296113864
35009	NC_014147	TAGGCG	2	12	1621204	1621215	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296113864
35010	NC_014147	ATG	2	6	1621252	1621257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296113864
35011	NC_014147	ATC	2	6	1621270	1621275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113864
35012	NC_014147	TGTA	2	8	1621287	1621294	25 %	50 %	25 %	0 %	296113864
35013	NC_014147	GGCT	2	8	1621310	1621317	0 %	25 %	50 %	25 %	296113864
35014	NC_014147	ATC	2	6	1621372	1621377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113864
35015	NC_014147	TCA	2	6	1621418	1621423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113864
35016	NC_014147	GAT	2	6	1621464	1621469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296113864
35017	NC_014147	CCA	2	6	1621488	1621493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296113864
35018	NC_014147	CCA	2	6	1621532	1621537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296113864
35019	NC_014147	ATA	2	6	1621585	1621590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296113864
35020	NC_014147	CGC	2	6	1621605	1621610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296113864
35021	NC_014147	TTTCA	2	10	1621621	1621630	20 %	60 %	0 %	20 %	296113864
35022	NC_014147	CTT	2	6	1621689	1621694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296113864
35023	NC_014147	TAAA	2	8	1621738	1621745	75 %	25 %	0 %	0 %	296113864
35024	NC_014147	A	7	7	1621759	1621765	100 %	0 %	0 %	0 %	296113864
35025	NC_014147	T	6	6	1621768	1621773	0 %	100 %	0 %	0 %	296113864
35026	NC_014147	A	6	6	1621858	1621863	100 %	0 %	0 %	0 %	296113864
35027	NC_014147	GCACA	2	10	1621894	1621903	40 %	0 %	20 %	40 %	296113864
35028	NC_014147	CAC	2	6	1621926	1621931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296113864
35029	NC_014147	ATGG	2	8	1622002	1622009	25 %	25 %	50 %	0 %	296113864
35030	NC_014147	TGAA	2	8	1622089	1622096	50 %	25 %	25 %	0 %	296113864
35031	NC_014147	AC	3	6	1622142	1622147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35032	NC_014147	CAT	3	9	1622157	1622165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35033	NC_014147	TCA	2	6	1622167	1622172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35034	NC_014147	TGA	2	6	1622219	1622224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35035	NC_014147	TCA	2	6	1622277	1622282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35036	NC_014147	GAT	2	6	1622310	1622315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35037	NC_014147	ATCA	2	8	1622358	1622365	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35038	NC_014147	AATTAA	2	12	1622366	1622377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35039	NC_014147	GAT	2	6	1622445	1622450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296113865
35040	NC_014147	TAC	2	6	1622515	1622520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113865
35041	NC_014147	TGT	2	6	1622522	1622527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296113865
35042	NC_014147	GAA	2	6	1622529	1622534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296113865
35043	NC_014147	TTGGTT	2	12	1622542	1622553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296113865
35044	NC_014147	TGA	3	9	1622591	1622599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296113865
35045	NC_014147	CAT	2	6	1622661	1622666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113865
35046	NC_014147	TTG	2	6	1622704	1622709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296113865
35047	NC_014147	GTC	2	6	1622749	1622754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296113865
35048	NC_014147	TAA	2	6	1622856	1622861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296113865
35049	NC_014147	ATC	2	6	1622903	1622908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35050	NC_014147	TTAAA	2	10	1622917	1622926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35051	NC_014147	TCATT	2	10	1622928	1622937	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35052	NC_014147	ATC	2	6	1622947	1622952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35053	NC_014147	TATG	2	8	1622966	1622973	25 %	50 %	25 %	0 %	296113866
35054	NC_014147	TAG	2	6	1623070	1623075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296113866
35055	NC_014147	GCC	2	6	1623102	1623107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296113866
35056	NC_014147	GGC	2	6	1623147	1623152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296113866
35057	NC_014147	CAG	2	6	1623154	1623159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296113866
35058	NC_014147	TGG	2	6	1623169	1623174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296113866
35059	NC_014147	TTA	2	6	1623200	1623205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296113866
35060	NC_014147	TGG	2	6	1623218	1623223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296113866
35061	NC_014147	TGA	2	6	1623224	1623229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296113866
35062	NC_014147	ACA	2	6	1623309	1623314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296113866
35063	NC_014147	TG	3	6	1623321	1623326	0 %	50 %	50 %	0 %	296113866
35064	NC_014147	ATA	2	6	1623397	1623402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296113866
35065	NC_014147	CTG	2	6	1623547	1623552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296113866
35066	NC_014147	AAG	2	6	1623568	1623573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296113866
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35068	NC_014147	ATT	2	6	1623635	1623640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296113866
35069	NC_014147	TGG	2	6	1623697	1623702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296113866
35070	NC_014147	ACCA	2	8	1623722	1623729	50 %	0 %	0 %	50 %	296113866
35071	NC_014147	GAT	2	6	1623747	1623752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296113866
35072	NC_014147	TGT	2	6	1623782	1623787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296113866
35073	NC_014147	AGTCA	2	10	1623789	1623798	40 %	20 %	20 %	20 %	296113866
35074	NC_014147	T	6	6	1623836	1623841	0 %	100 %	0 %	0 %	296113866
35075	NC_014147	GGC	2	6	1623899	1623904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296113866
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35077	NC_014147	A	6	6	1623960	1623965	100 %	0 %	0 %	0 %	296113866
35078	NC_014147	TCT	2	6	1623992	1623997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35079	NC_014147	TAT	2	6	1624039	1624044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35080	NC_014147	AAT	2	6	1624063	1624068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35081	NC_014147	CAA	2	6	1624103	1624108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35082	NC_014147	A	6	6	1624114	1624119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35083	NC_014147	TAA	2	6	1624127	1624132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296113867
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35086	NC_014147	CCG	2	6	1624256	1624261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296113867
35087	NC_014147	CAA	2	6	1624309	1624314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296113867
35088	NC_014147	TGGC	2	8	1624331	1624338	0 %	25 %	50 %	25 %	296113867
35089	NC_014147	GCA	2	6	1624362	1624367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296113867
35090	NC_014147	TAAT	2	8	1624370	1624377	50 %	50 %	0 %	0 %	296113867
35091	NC_014147	ACC	2	6	1624447	1624452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296113867
35092	NC_014147	TAT	2	6	1624464	1624469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296113867
35093	NC_014147	AATC	2	8	1624470	1624477	50 %	25 %	0 %	25 %	296113867
35094	NC_014147	CAT	2	6	1624482	1624487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113867
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35097	NC_014147	GCAA	2	8	1624661	1624668	50 %	0 %	25 %	25 %	296113867
35098	NC_014147	CT	3	6	1624737	1624742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35099	NC_014147	TAAT	2	8	1624749	1624756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35100	NC_014147	T	6	6	1624875	1624880	0 %	100 %	0 %	0 %	296113868
35101	NC_014147	TAACT	2	10	1624915	1624924	40 %	40 %	0 %	20 %	296113868
35102	NC_014147	T	6	6	1624938	1624943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35103	NC_014147	TCA	2	6	1625037	1625042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113869
35104	NC_014147	TCA	2	6	1625048	1625053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113869
35105	NC_014147	CACG	2	8	1625068	1625075	25 %	0 %	25 %	50 %	296113869
35106	NC_014147	A	8	8	1625176	1625183	100 %	0 %	0 %	0 %	296113869
35107	NC_014147	ATA	2	6	1625231	1625236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296113869
35108	NC_014147	TAT	2	6	1625304	1625309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296113869
35109	NC_014147	TAT	2	6	1625335	1625340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296113869
35110	NC_014147	TGA	2	6	1625427	1625432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296113869
35111	NC_014147	A	6	6	1625440	1625445	100 %	0 %	0 %	0 %	296113869
35112	NC_014147	CAAG	2	8	1625526	1625533	50 %	0 %	25 %	25 %	296113869
35113	NC_014147	AGC	2	6	1625559	1625564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296113869
35114	NC_014147	TCA	2	6	1625594	1625599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113869
35115	NC_014147	CGG	2	6	1625685	1625690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296113869
35116	NC_014147	GAA	2	6	1625743	1625748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296113869
35117	NC_014147	TTTG	2	8	1625796	1625803	0 %	75 %	25 %	0 %	296113869
35118	NC_014147	TAT	2	6	1625848	1625853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296113869
35119	NC_014147	AGC	2	6	1625867	1625872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296113869
35120	NC_014147	TGA	2	6	1625898	1625903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296113869
35121	NC_014147	CAT	2	6	1625973	1625978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113869
35122	NC_014147	T	6	6	1626031	1626036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35150	NC_014147	A	7	7	1627532	1627538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35151	NC_014147	A	6	6	1627542	1627547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35152	NC_014147	AAACC	2	10	1627562	1627571	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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35158	NC_014147	T	7	7	1627785	1627791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35159	NC_014147	TGC	2	6	1627831	1627836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35161	NC_014147	TTAAG	2	10	1627882	1627891	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35162	NC_014147	CA	3	6	1627923	1627928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35163	NC_014147	ATG	2	6	1627945	1627950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296113872
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35186	NC_014147	ATA	2	6	1628848	1628853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35189	NC_014147	A	7	7	1628929	1628935	100 %	0 %	0 %	0 %	296113873
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35234	NC_014147	CCAT	2	8	1630829	1630836	25 %	25 %	0 %	50 %	296113876
35235	NC_014147	TGA	2	6	1630878	1630883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296113876
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35239	NC_014147	ACA	2	6	1631031	1631036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35353	NC_014147	CA	3	6	1636726	1636731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35354	NC_014147	ATCCA	2	10	1636762	1636771	40 %	20 %	0 %	40 %	296113884
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35478	NC_014147	GATG	2	8	1641190	1641197	25 %	25 %	50 %	0 %	296113887
35479	NC_014147	CAT	2	6	1641243	1641248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296113887
35480	NC_014147	CGAC	2	8	1641251	1641258	25 %	0 %	25 %	50 %	296113887
35481	NC_014147	ACCC	2	8	1641263	1641270	25 %	0 %	0 %	75 %	296113887
35482	NC_014147	ATAA	2	8	1641275	1641282	75 %	25 %	0 %	0 %	296113887
35483	NC_014147	CAA	2	6	1641295	1641300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296113887
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35490	NC_014147	ATA	2	6	1641670	1641675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296113888
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