MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Moraxella catarrhalis RH4 chromosome

Total Repeats: 40232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014147	ATCAA	2	10	605241	605250	60 %	20 %	0 %	20 %	296112821
13002	NC_014147	ACAT	2	8	605337	605344	50 %	25 %	0 %	25 %	296112821
13003	NC_014147	ACC	2	6	605351	605356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112821
13004	NC_014147	ATA	2	6	605385	605390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296112821
13005	NC_014147	CAA	2	6	605491	605496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112821
13006	NC_014147	CAAAG	2	10	605510	605519	60 %	0 %	20 %	20 %	296112821
13007	NC_014147	AGCACC	2	12	605660	605671	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296112821
13008	NC_014147	CAAT	2	8	605707	605714	50 %	25 %	0 %	25 %	296112821
13009	NC_014147	AAT	2	6	605807	605812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296112821
13010	NC_014147	AGA	2	6	605906	605911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296112821
13011	NC_014147	TGA	2	6	605926	605931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112821
13012	NC_014147	ATG	3	9	605952	605960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112821
13013	NC_014147	T	6	6	605962	605967	0 %	100 %	0 %	0 %	296112821
13014	NC_014147	TGG	2	6	605987	605992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296112821
13015	NC_014147	TGA	2	6	605997	606002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112821
13016	NC_014147	ATG	2	6	606012	606017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112821
13017	NC_014147	A	6	6	606047	606052	100 %	0 %	0 %	0 %	296112821
13018	NC_014147	ATCA	2	8	606088	606095	50 %	25 %	0 %	25 %	296112822
13019	NC_014147	CAT	2	6	606120	606125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112822
13020	NC_014147	TCA	2	6	606200	606205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112822
13021	NC_014147	CTTG	2	8	606270	606277	0 %	50 %	25 %	25 %	296112822
13022	NC_014147	CGA	2	6	606369	606374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112822
13023	NC_014147	CAC	2	6	606438	606443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112822
13024	NC_014147	GCC	2	6	606454	606459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296112822
13025	NC_014147	CAT	2	6	606489	606494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112822
13026	NC_014147	CAT	2	6	606513	606518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112822
13027	NC_014147	TGT	2	6	606554	606559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296112822
13028	NC_014147	A	6	6	606560	606565	100 %	0 %	0 %	0 %	296112822
13029	NC_014147	TTG	2	6	606614	606619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296112822
13030	NC_014147	C	6	6	606710	606715	0 %	0 %	0 %	100 %	296112822
13031	NC_014147	A	6	6	606725	606730	100 %	0 %	0 %	0 %	296112822
13032	NC_014147	GCA	2	6	606762	606767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112822
13033	NC_014147	GCGT	2	8	606799	606806	0 %	25 %	50 %	25 %	296112822
13034	NC_014147	AATTT	2	10	606878	606887	40 %	60 %	0 %	0 %	296112822
13035	NC_014147	TTG	2	6	606890	606895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296112822
13036	NC_014147	GCGT	2	8	606915	606922	0 %	25 %	50 %	25 %	296112822
13037	NC_014147	A	6	6	606941	606946	100 %	0 %	0 %	0 %	296112822
13038	NC_014147	GT	3	6	606989	606994	0 %	50 %	50 %	0 %	296112822
13039	NC_014147	CAT	2	6	607068	607073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112822
13040	NC_014147	CTT	2	6	607074	607079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296112822
13041	NC_014147	TTG	2	6	607120	607125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296112822
13042	NC_014147	CAC	2	6	607155	607160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112822
13043	NC_014147	CAA	2	6	607321	607326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112823
13044	NC_014147	ATG	2	6	607341	607346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112823
13045	NC_014147	CATT	2	8	607374	607381	25 %	50 %	0 %	25 %	296112823
13046	NC_014147	CA	3	6	607382	607387	50 %	0 %	0 %	50 %	296112823
13047	NC_014147	GCA	2	6	607520	607525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112823
13048	NC_014147	GAT	2	6	607539	607544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112823
13049	NC_014147	GCAA	2	8	607598	607605	50 %	0 %	25 %	25 %	296112823
13050	NC_014147	TG	3	6	607722	607727	0 %	50 %	50 %	0 %	296112823
13051	NC_014147	ACC	2	6	607740	607745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112823
13052	NC_014147	A	6	6	607750	607755	100 %	0 %	0 %	0 %	296112823
13053	NC_014147	GTG	2	6	607771	607776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296112823
13054	NC_014147	TGC	2	6	607801	607806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112823
13055	NC_014147	TTA	2	6	607807	607812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296112823
13056	NC_014147	TTA	2	6	607823	607828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296112823
13057	NC_014147	GTG	2	6	607835	607840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_014147	TGTT	2	8	607841	607848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_014147	T	8	8	607852	607859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_014147	AATA	2	8	607869	607876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_014147	ACA	2	6	607925	607930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112824
13062	NC_014147	ATG	2	6	607939	607944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112824
13063	NC_014147	GTTT	2	8	607989	607996	0 %	75 %	25 %	0 %	296112824
13064	NC_014147	ACT	2	6	608000	608005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112824
13065	NC_014147	TCAT	2	8	608048	608055	25 %	50 %	0 %	25 %	296112824
13066	NC_014147	CA	3	6	608084	608089	50 %	0 %	0 %	50 %	296112824
13067	NC_014147	CAG	2	6	608184	608189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112824
13068	NC_014147	CTTGTT	2	12	608217	608228	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296112824
13069	NC_014147	CAAC	2	8	608236	608243	50 %	0 %	0 %	50 %	296112824
13070	NC_014147	CGCA	2	8	608261	608268	25 %	0 %	25 %	50 %	296112824
13071	NC_014147	GCGA	2	8	608344	608351	25 %	0 %	50 %	25 %	296112824
13072	NC_014147	ATA	2	6	608472	608477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296112825
13073	NC_014147	GTC	2	6	608648	608653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112826
13074	NC_014147	CTTTTG	2	12	608654	608665	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296112826
13075	NC_014147	ATTG	2	8	608706	608713	25 %	50 %	25 %	0 %	296112826
13076	NC_014147	GGT	2	6	608761	608766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296112826
13077	NC_014147	A	7	7	608867	608873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_014147	CTG	2	6	608876	608881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_014147	T	6	6	608897	608902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_014147	GATT	2	8	608912	608919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_014147	ATT	2	6	608931	608936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_014147	TACA	2	8	608946	608953	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13083	NC_014147	TGTA	2	8	608969	608976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_014147	ATCA	2	8	608979	608986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13085	NC_014147	AAGGT	2	10	609084	609093	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_014147	CTG	2	6	609105	609110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_014147	TCA	2	6	609111	609116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_014147	AAC	2	6	609162	609167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_014147	TGG	2	6	609192	609197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_014147	TGC	2	6	609256	609261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_014147	TGG	2	6	609270	609275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_014147	GAC	2	6	609283	609288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_014147	TAG	2	6	609297	609302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_014147	GTC	2	6	609310	609315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_014147	GGT	2	6	609326	609331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_014147	TGT	2	6	609339	609344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_014147	ATA	2	6	609351	609356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_014147	TGCG	2	8	609402	609409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13099	NC_014147	GCCA	2	8	609438	609445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13100	NC_014147	GGT	2	6	609470	609475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_014147	ATA	2	6	609515	609520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_014147	ATT	2	6	609552	609557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_014147	GCA	2	6	609633	609638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_014147	T	6	6	609669	609674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_014147	ATG	2	6	609680	609685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_014147	GCAG	2	8	609697	609704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13107	NC_014147	GTG	2	6	609869	609874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_014147	CGCC	2	8	609878	609885	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13109	NC_014147	TG	3	6	609890	609895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_014147	ATG	2	6	610002	610007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_014147	TGTACC	2	12	610059	610070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_014147	GAC	2	6	610093	610098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_014147	CAGC	2	8	610110	610117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13114	NC_014147	GAC	2	6	610257	610262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_014147	CTG	2	6	610309	610314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_014147	AAT	2	6	610315	610320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_014147	CTC	2	6	610401	610406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13118	NC_014147	ACCA	2	8	610413	610420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13119	NC_014147	GGT	2	6	610465	610470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_014147	TTA	2	6	610557	610562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_014147	CCG	2	6	610600	610605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13122	NC_014147	ATT	2	6	610680	610685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_014147	CAAA	2	8	610823	610830	75 %	0 %	0 %	25 %	296112827
13124	NC_014147	CAAG	2	8	610843	610850	50 %	0 %	25 %	25 %	296112827
13125	NC_014147	CATT	2	8	610903	610910	25 %	50 %	0 %	25 %	296112827
13126	NC_014147	TGG	2	6	610924	610929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296112827
13127	NC_014147	GTG	2	6	610952	610957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296112827
13128	NC_014147	TGA	2	6	610975	610980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112827
13129	NC_014147	TGAT	2	8	611004	611011	25 %	50 %	25 %	0 %	296112827
13130	NC_014147	TGA	2	6	611080	611085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112827
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13133	NC_014147	TA	3	6	611153	611158	50 %	50 %	0 %	0 %	296112827
13134	NC_014147	A	6	6	611187	611192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13135	NC_014147	T	6	6	611217	611222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13136	NC_014147	AAAAT	2	10	611243	611252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13137	NC_014147	TAA	2	6	611343	611348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13138	NC_014147	CTG	2	6	611354	611359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13139	NC_014147	GTG	2	6	611380	611385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13150	NC_014147	ATA	2	6	611873	611878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296112829
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13233	NC_014147	AACC	2	8	614765	614772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13234	NC_014147	TTAT	2	8	614804	614811	25 %	75 %	0 %	0 %	296112832
13235	NC_014147	GGC	2	6	614841	614846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112832
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13237	NC_014147	GGC	2	6	614931	614936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112832
13238	NC_014147	ATG	2	6	615034	615039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112832
13239	NC_014147	CAT	2	6	615041	615046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112832
13240	NC_014147	CACT	2	8	615047	615054	25 %	25 %	0 %	50 %	296112832
13241	NC_014147	CT	3	6	615198	615203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13242	NC_014147	TTGA	2	8	615220	615227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13243	NC_014147	AAT	2	6	615310	615315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13244	NC_014147	CTT	2	6	615406	615411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296112833
13245	NC_014147	TCA	2	6	615543	615548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112833
13246	NC_014147	CGCA	2	8	615560	615567	25 %	0 %	25 %	50 %	296112833
13247	NC_014147	AAG	2	6	615574	615579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296112833
13248	NC_014147	TGA	2	6	615611	615616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112833
13249	NC_014147	TCA	3	9	615637	615645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112833
13250	NC_014147	CAA	2	6	615658	615663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112833
13251	NC_014147	TGA	2	6	615679	615684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112833
13252	NC_014147	TAAA	2	8	615716	615723	75 %	25 %	0 %	0 %	296112833
13253	NC_014147	CTT	2	6	615724	615729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296112833
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13281	NC_014147	TAA	2	6	617171	617176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13282	NC_014147	A	6	6	617208	617213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13283	NC_014147	GATT	2	8	617238	617245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13284	NC_014147	TTA	2	6	617246	617251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13285	NC_014147	TTATA	2	10	617257	617266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13286	NC_014147	TAA	2	6	617273	617278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13287	NC_014147	ATC	2	6	617280	617285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13313	NC_014147	T	6	6	618759	618764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13352	NC_014147	GTC	2	6	620859	620864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13367	NC_014147	CCA	2	6	621511	621516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112839
13368	NC_014147	CA	3	6	621615	621620	50 %	0 %	0 %	50 %	296112839
13369	NC_014147	AC	3	6	621643	621648	50 %	0 %	0 %	50 %	296112839
13370	NC_014147	ATT	2	6	621675	621680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296112839
13371	NC_014147	ATC	2	6	621741	621746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112839
13372	NC_014147	GCT	2	6	621757	621762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112839
13373	NC_014147	CAT	2	6	621851	621856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112839
13374	NC_014147	CAT	2	6	621917	621922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112839
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13378	NC_014147	AGT	2	6	622016	622021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112839
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13384	NC_014147	CAT	2	6	622214	622219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112839
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13387	NC_014147	CCAT	2	8	622279	622286	25 %	25 %	0 %	50 %	296112839
13388	NC_014147	ACC	2	6	622359	622364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112839
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13391	NC_014147	A	7	7	622510	622516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13392	NC_014147	GAT	2	6	622550	622555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112840
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13395	NC_014147	AAC	2	6	622715	622720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112841
13396	NC_014147	A	6	6	622819	622824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13397	NC_014147	CATCAG	2	12	622825	622836	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13398	NC_014147	CTGATG	3	18	622845	622862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13399	NC_014147	GATT	2	8	622885	622892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13400	NC_014147	GCC	2	6	622945	622950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296112842
13401	NC_014147	CGCCAT	2	12	623112	623123	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296112842
13402	NC_014147	TGA	2	6	623127	623132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112842
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13404	NC_014147	TGG	2	6	623249	623254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296112842
13405	NC_014147	CTG	2	6	623267	623272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112842
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13432	NC_014147	GTC	2	6	624540	624545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112842
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13438	NC_014147	TGCTG	2	10	624793	624802	0 %	40 %	40 %	20 %	296112842
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13471	NC_014147	AACTTT	2	12	626457	626468	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296112842
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13475	NC_014147	TCA	2	6	626707	626712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112842
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13485	NC_014147	TCA	2	6	627205	627210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112842
13486	NC_014147	CCA	2	6	627217	627222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112842
13487	NC_014147	TGC	2	6	627491	627496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112842
13488	NC_014147	CCA	2	6	627503	627508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112842
13489	NC_014147	T	6	6	627579	627584	0 %	100 %	0 %	0 %	296112842
13490	NC_014147	ATTGGC	2	12	627678	627689	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296112842
13491	NC_014147	ACC	2	6	627774	627779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112842
13492	NC_014147	TCA	2	6	627853	627858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112842
13493	NC_014147	AGT	2	6	627906	627911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112842
13494	NC_014147	CTG	3	9	627917	627925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112842
13495	NC_014147	TTG	2	6	627926	627931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296112842
13496	NC_014147	GTATTA	2	12	627937	627948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296112842
13497	NC_014147	ACC	2	6	628029	628034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112842
13498	NC_014147	AGTACC	2	12	628056	628067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296112842
13499	NC_014147	TACC	2	8	628070	628077	25 %	25 %	0 %	50 %	296112842
13500	NC_014147	TGC	2	6	628166	628171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112842

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