MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014122	CTA	2	6	130511	130516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108829
3502	NC_014122	TA	3	6	130576	130581	50 %	50 %	0 %	0 %	296108829
3503	NC_014122	CT	3	6	130587	130592	0 %	50 %	0 %	50 %	296108829
3504	NC_014122	CACT	2	8	130652	130659	25 %	25 %	0 %	50 %	296108829
3505	NC_014122	ATTC	2	8	130695	130702	25 %	50 %	0 %	25 %	296108829
3506	NC_014122	A	6	6	130707	130712	100 %	0 %	0 %	0 %	296108829
3507	NC_014122	CTT	2	6	130771	130776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108829
3508	NC_014122	CTC	2	6	130872	130877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108829
3509	NC_014122	TC	3	6	130876	130881	0 %	50 %	0 %	50 %	296108829
3510	NC_014122	TTCCAA	2	12	131031	131042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108829
3511	NC_014122	TC	3	6	131071	131076	0 %	50 %	0 %	50 %	296108829
3512	NC_014122	CTA	2	6	131109	131114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108829
3513	NC_014122	TAAAAA	2	12	131122	131133	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	296108829
3514	NC_014122	AGGA	2	8	131266	131273	50 %	0 %	50 %	0 %	296108829
3515	NC_014122	TC	3	6	131287	131292	0 %	50 %	0 %	50 %	296108829
3516	NC_014122	TCT	2	6	131298	131303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108829
3517	NC_014122	TCA	2	6	131330	131335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108829
3518	NC_014122	TCT	2	6	131360	131365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108829
3519	NC_014122	CAA	2	6	131367	131372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108829
3520	NC_014122	ATATC	2	10	131375	131384	40 %	40 %	0 %	20 %	296108829
3521	NC_014122	TC	3	6	131467	131472	0 %	50 %	0 %	50 %	296108829
3522	NC_014122	T	6	6	131575	131580	0 %	100 %	0 %	0 %	296108829
3523	NC_014122	T	6	6	131588	131593	0 %	100 %	0 %	0 %	296108829
3524	NC_014122	ATC	2	6	131662	131667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108829
3525	NC_014122	TA	3	6	131745	131750	50 %	50 %	0 %	0 %	296108829
3526	NC_014122	TC	3	6	131760	131765	0 %	50 %	0 %	50 %	296108829
3527	NC_014122	CTT	2	6	131770	131775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108829
3528	NC_014122	TCT	2	6	131790	131795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108829
3529	NC_014122	TCC	2	6	131810	131815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108829
3530	NC_014122	ATCTCA	2	12	131843	131854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108829
3531	NC_014122	CTT	2	6	131857	131862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108829
3532	NC_014122	ATA	2	6	131888	131893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108829
3533	NC_014122	TC	3	6	131951	131956	0 %	50 %	0 %	50 %	296108830
3534	NC_014122	AGCTAT	2	12	131970	131981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296108830
3535	NC_014122	AAG	2	6	132078	132083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108830
3536	NC_014122	CAA	2	6	132143	132148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108830
3537	NC_014122	T	6	6	132151	132156	0 %	100 %	0 %	0 %	296108830
3538	NC_014122	TTC	2	6	132184	132189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108830
3539	NC_014122	TC	3	6	132238	132243	0 %	50 %	0 %	50 %	296108830
3540	NC_014122	TGT	2	6	132263	132268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108830
3541	NC_014122	CCA	2	6	132283	132288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296108830
3542	NC_014122	CAT	3	9	132305	132313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108830
3543	NC_014122	TCA	2	6	132337	132342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108830
3544	NC_014122	AAC	2	6	132369	132374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108830
3545	NC_014122	TCA	2	6	132379	132384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108830
3546	NC_014122	TC	3	6	132389	132394	0 %	50 %	0 %	50 %	296108830
3547	NC_014122	TAG	2	6	132407	132412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108830
3548	NC_014122	CTG	2	6	132434	132439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296108830
3549	NC_014122	AGT	2	6	132497	132502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108830
3550	NC_014122	AC	3	6	132532	132537	50 %	0 %	0 %	50 %	296108830
3551	NC_014122	CAT	2	6	132599	132604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108830
3552	NC_014122	TAACC	2	10	132609	132618	40 %	20 %	0 %	40 %	296108830
3553	NC_014122	CCT	2	6	132652	132657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108830
3554	NC_014122	TC	3	6	132774	132779	0 %	50 %	0 %	50 %	296108831
3555	NC_014122	TC	3	6	132896	132901	0 %	50 %	0 %	50 %	296108831
3556	NC_014122	CAG	2	6	132906	132911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108831
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3558	NC_014122	TAGA	2	8	133052	133059	50 %	25 %	25 %	0 %	296108831
3559	NC_014122	CAA	2	6	133063	133068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108831
3560	NC_014122	TAA	2	6	133076	133081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108831
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3562	NC_014122	GAG	2	6	133177	133182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108831
3563	NC_014122	CTC	2	6	133189	133194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108831
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3565	NC_014122	AAT	2	6	133235	133240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108831
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3570	NC_014122	AGC	2	6	133489	133494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108831
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3578	NC_014122	AG	3	6	133822	133827	50 %	0 %	50 %	0 %	296108832
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3582	NC_014122	AGT	2	6	133928	133933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108832
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3587	NC_014122	GAT	2	6	134131	134136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108832
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3589	NC_014122	AT	3	6	134199	134204	50 %	50 %	0 %	0 %	296108832
3590	NC_014122	T	6	6	134218	134223	0 %	100 %	0 %	0 %	296108832
3591	NC_014122	CA	3	6	134248	134253	50 %	0 %	0 %	50 %	296108832
3592	NC_014122	T	6	6	134257	134262	0 %	100 %	0 %	0 %	296108832
3593	NC_014122	TAA	2	6	134319	134324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108832
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3595	NC_014122	GCA	2	6	134411	134416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108832
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3602	NC_014122	ATA	2	6	134639	134644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108832
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3604	NC_014122	AG	3	6	134682	134687	50 %	0 %	50 %	0 %	296108832
3605	NC_014122	TTA	2	6	134700	134705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108832
3606	NC_014122	GA	3	6	134726	134731	50 %	0 %	50 %	0 %	296108832
3607	NC_014122	AAG	2	6	134738	134743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108832
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3610	NC_014122	TAA	2	6	134915	134920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108833
3611	NC_014122	TC	4	8	134950	134957	0 %	50 %	0 %	50 %	296108833
3612	NC_014122	ATGG	2	8	134979	134986	25 %	25 %	50 %	0 %	296108833
3613	NC_014122	ATT	2	6	135036	135041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108833
3614	NC_014122	GGTT	2	8	135046	135053	0 %	50 %	50 %	0 %	296108833
3615	NC_014122	TGA	2	6	135068	135073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108833
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3618	NC_014122	GA	3	6	135196	135201	50 %	0 %	50 %	0 %	296108833
3619	NC_014122	AG	3	6	135207	135212	50 %	0 %	50 %	0 %	296108833
3620	NC_014122	AAG	2	6	135228	135233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108833
3621	NC_014122	A	6	6	135248	135253	100 %	0 %	0 %	0 %	296108833
3622	NC_014122	CT	3	6	135288	135293	0 %	50 %	0 %	50 %	296108833
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3624	NC_014122	TAA	2	6	135386	135391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108833
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3629	NC_014122	TAA	2	6	135667	135672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108833
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3742	NC_014122	TAAGCC	2	12	139727	139738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296108836
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3867	NC_014122	GA	3	6	144671	144676	50 %	0 %	50 %	0 %	296108842
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3998	NC_014122	GTT	2	6	149571	149576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108847
3999	NC_014122	T	6	6	149588	149593	0 %	100 %	0 %	0 %	296108847
4000	NC_014122	GA	3	6	149637	149642	50 %	0 %	50 %	0 %	296108847

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