MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014122	TCA	2	6	113260	113265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108811
3002	NC_014122	TCA	2	6	113272	113277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108811
3003	NC_014122	TAC	2	6	113301	113306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108811
3004	NC_014122	AAGA	2	8	113341	113348	75 %	0 %	25 %	0 %	296108811
3005	NC_014122	TTA	2	6	113392	113397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108811
3006	NC_014122	AGA	2	6	113408	113413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108811
3007	NC_014122	ACC	2	6	113425	113430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_014122	TACT	2	8	113465	113472	25 %	50 %	0 %	25 %	296108812
3009	NC_014122	ACT	2	6	113524	113529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108812
3010	NC_014122	TCA	2	6	113564	113569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108812
3011	NC_014122	CCA	2	6	113571	113576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296108812
3012	NC_014122	AATTC	2	10	113621	113630	40 %	40 %	0 %	20 %	296108812
3013	NC_014122	TCA	2	6	113636	113641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108812
3014	NC_014122	T	6	6	113648	113653	0 %	100 %	0 %	0 %	296108812
3015	NC_014122	TC	4	8	113679	113686	0 %	50 %	0 %	50 %	296108812
3016	NC_014122	TCA	2	6	113762	113767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108812
3017	NC_014122	TCT	2	6	113827	113832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108812
3018	NC_014122	CAG	2	6	113844	113849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108812
3019	NC_014122	CTT	2	6	113890	113895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108812
3020	NC_014122	TA	3	6	113917	113922	50 %	50 %	0 %	0 %	296108812
3021	NC_014122	GT	3	6	113932	113937	0 %	50 %	50 %	0 %	296108812
3022	NC_014122	TAAG	2	8	113968	113975	50 %	25 %	25 %	0 %	296108812
3023	NC_014122	TCCT	2	8	114004	114011	0 %	50 %	0 %	50 %	296108812
3024	NC_014122	TCTT	2	8	114017	114024	0 %	75 %	0 %	25 %	296108812
3025	NC_014122	CTG	2	6	114036	114041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296108812
3026	NC_014122	TCA	2	6	114077	114082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108812
3027	NC_014122	ATAG	2	8	114088	114095	50 %	25 %	25 %	0 %	296108812
3028	NC_014122	TA	3	6	114113	114118	50 %	50 %	0 %	0 %	296108812
3029	NC_014122	T	6	6	114122	114127	0 %	100 %	0 %	0 %	296108812
3030	NC_014122	TCT	2	6	114137	114142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108812
3031	NC_014122	CT	3	6	114160	114165	0 %	50 %	0 %	50 %	296108813
3032	NC_014122	T	6	6	114195	114200	0 %	100 %	0 %	0 %	296108813
3033	NC_014122	CAG	2	6	114239	114244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108813
3034	NC_014122	AAT	2	6	114261	114266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108813
3035	NC_014122	TCT	2	6	114281	114286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108813
3036	NC_014122	A	6	6	114313	114318	100 %	0 %	0 %	0 %	296108813
3037	NC_014122	T	6	6	114367	114372	0 %	100 %	0 %	0 %	296108813
3038	NC_014122	AT	3	6	114427	114432	50 %	50 %	0 %	0 %	296108813
3039	NC_014122	TTG	3	9	114470	114478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108813
3040	NC_014122	T	6	6	114501	114506	0 %	100 %	0 %	0 %	296108813
3041	NC_014122	T	6	6	114561	114566	0 %	100 %	0 %	0 %	296108813
3042	NC_014122	CTT	2	6	114582	114587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108813
3043	NC_014122	TCT	2	6	114593	114598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108813
3044	NC_014122	TAT	2	6	114612	114617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108813
3045	NC_014122	AG	3	6	114648	114653	50 %	0 %	50 %	0 %	296108813
3046	NC_014122	AATT	2	8	114716	114723	50 %	50 %	0 %	0 %	296108813
3047	NC_014122	T	6	6	114729	114734	0 %	100 %	0 %	0 %	296108813
3048	NC_014122	TTA	2	6	114761	114766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108813
3049	NC_014122	TTAG	2	8	114781	114788	25 %	50 %	25 %	0 %	296108813
3050	NC_014122	ATA	2	6	114841	114846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108813
3051	NC_014122	ACC	2	6	114872	114877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296108814
3052	NC_014122	TC	3	6	114926	114931	0 %	50 %	0 %	50 %	296108814
3053	NC_014122	AG	3	6	114934	114939	50 %	0 %	50 %	0 %	296108814
3054	NC_014122	AAAT	2	8	114956	114963	75 %	25 %	0 %	0 %	296108814
3055	NC_014122	A	6	6	114969	114974	100 %	0 %	0 %	0 %	296108814
3056	NC_014122	TAAA	2	8	115012	115019	75 %	25 %	0 %	0 %	296108814
3057	NC_014122	ATAG	2	8	115038	115045	50 %	25 %	25 %	0 %	296108814
3058	NC_014122	AG	3	6	115044	115049	50 %	0 %	50 %	0 %	296108814
3059	NC_014122	TAA	2	6	115064	115069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108814
3060	NC_014122	GTT	2	6	115119	115124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108814
3061	NC_014122	AG	3	6	115145	115150	50 %	0 %	50 %	0 %	296108814
3062	NC_014122	TGA	2	6	115163	115168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108814
3063	NC_014122	AG	3	6	115194	115199	50 %	0 %	50 %	0 %	296108814
3064	NC_014122	AG	3	6	115235	115240	50 %	0 %	50 %	0 %	296108814
3065	NC_014122	T	6	6	115281	115286	0 %	100 %	0 %	0 %	296108814
3066	NC_014122	CTC	2	6	115290	115295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108814
3067	NC_014122	TCC	2	6	115302	115307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108814
3068	NC_014122	TCTTT	2	10	115321	115330	0 %	80 %	0 %	20 %	296108814
3069	NC_014122	ACTA	2	8	115343	115350	50 %	25 %	0 %	25 %	296108814
3070	NC_014122	A	7	7	115364	115370	100 %	0 %	0 %	0 %	296108814
3071	NC_014122	ATA	2	6	115425	115430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108814
3072	NC_014122	TAT	2	6	115450	115455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108814
3073	NC_014122	ATA	3	9	115497	115505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108814
3074	NC_014122	AAT	2	6	115511	115516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108814
3075	NC_014122	ATT	3	9	115626	115634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_014122	AGG	2	6	115678	115683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108815
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3079	NC_014122	AG	3	6	115817	115822	50 %	0 %	50 %	0 %	296108815
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3081	NC_014122	ATG	2	6	115905	115910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108815
3082	NC_014122	TTA	2	6	115940	115945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108815
3083	NC_014122	ATTT	2	8	115972	115979	25 %	75 %	0 %	0 %	296108815
3084	NC_014122	TGA	2	6	116026	116031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108815
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3086	NC_014122	AGTA	2	8	116069	116076	50 %	25 %	25 %	0 %	296108815
3087	NC_014122	TA	3	6	116090	116095	50 %	50 %	0 %	0 %	296108815
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3089	NC_014122	AGGGAC	2	12	116338	116349	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296108815
3090	NC_014122	ATAA	2	8	116360	116367	75 %	25 %	0 %	0 %	296108815
3091	NC_014122	ATT	2	6	116378	116383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108815
3092	NC_014122	GAG	2	6	116405	116410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108815
3093	NC_014122	AAGG	2	8	116428	116435	50 %	0 %	50 %	0 %	296108815
3094	NC_014122	TTTA	2	8	116451	116458	25 %	75 %	0 %	0 %	296108815
3095	NC_014122	TAA	2	6	116561	116566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108815
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3098	NC_014122	A	6	6	116679	116684	100 %	0 %	0 %	0 %	296108816
3099	NC_014122	TTG	2	6	116698	116703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108816
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3102	NC_014122	ATATTG	2	12	116792	116803	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296108816
3103	NC_014122	AG	3	6	116818	116823	50 %	0 %	50 %	0 %	296108816
3104	NC_014122	GAG	3	9	116821	116829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108816
3105	NC_014122	CT	3	6	116862	116867	0 %	50 %	0 %	50 %	296108816
3106	NC_014122	A	6	6	116885	116890	100 %	0 %	0 %	0 %	296108816
3107	NC_014122	GTT	2	6	116899	116904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108816
3108	NC_014122	TGA	2	6	116958	116963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108816
3109	NC_014122	GAA	2	6	117020	117025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108816
3110	NC_014122	AAG	2	6	117032	117037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108816
3111	NC_014122	GA	3	6	117063	117068	50 %	0 %	50 %	0 %	296108816
3112	NC_014122	AAG	2	6	117074	117079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108816
3113	NC_014122	AGT	2	6	117220	117225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108816
3114	NC_014122	TAA	2	6	117242	117247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108816
3115	NC_014122	AGT	2	6	117261	117266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108816
3116	NC_014122	A	7	7	117309	117315	100 %	0 %	0 %	0 %	296108816
3117	NC_014122	GCA	2	6	117340	117345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108816
3118	NC_014122	A	6	6	117354	117359	100 %	0 %	0 %	0 %	296108816
3119	NC_014122	GCTATA	2	12	117367	117378	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296108816
3120	NC_014122	GGA	2	6	117394	117399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108816
3121	NC_014122	GA	3	6	117422	117427	50 %	0 %	50 %	0 %	296108816
3122	NC_014122	TAT	3	9	117455	117463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108816
3123	NC_014122	A	7	7	117473	117479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_014122	ATCA	2	8	117500	117507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_014122	CAG	2	6	117516	117521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_014122	ATC	3	9	117530	117538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_014122	T	6	6	117543	117548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014122	TCT	2	6	117576	117581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108817
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3132	NC_014122	TC	4	8	117686	117693	0 %	50 %	0 %	50 %	296108817
3133	NC_014122	TGG	2	6	117716	117721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296108817
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3139	NC_014122	T	6	6	117979	117984	0 %	100 %	0 %	0 %	296108818
3140	NC_014122	GGT	2	6	118049	118054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296108818
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3143	NC_014122	AT	3	6	118135	118140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_014122	GA	3	6	118169	118174	50 %	0 %	50 %	0 %	296108819
3145	NC_014122	TCT	2	6	118220	118225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108819
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3238	NC_014122	AGT	2	6	121622	121627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108819
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3241	NC_014122	TAT	2	6	121712	121717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3248	NC_014122	A	8	8	121983	121990	100 %	0 %	0 %	0 %	296108820
3249	NC_014122	GAG	2	6	121991	121996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108820
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3252	NC_014122	GTT	2	6	122062	122067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108820
3253	NC_014122	TA	3	6	122153	122158	50 %	50 %	0 %	0 %	296108820
3254	NC_014122	TGA	2	6	122160	122165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108820
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3364	NC_014122	G	6	6	126123	126128	0 %	0 %	100 %	0 %	296108824
3365	NC_014122	CTTT	2	8	126167	126174	0 %	75 %	0 %	25 %	296108824
3366	NC_014122	T	6	6	126172	126177	0 %	100 %	0 %	0 %	296108824
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3370	NC_014122	TTG	2	6	126238	126243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108824
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3372	NC_014122	AAC	2	6	126275	126280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108824
3373	NC_014122	CCTT	2	8	126352	126359	0 %	50 %	0 %	50 %	296108824
3374	NC_014122	CACT	2	8	126405	126412	25 %	25 %	0 %	50 %	296108824
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