MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_014122	AC	3	6	1270254	1270259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34002	NC_014122	ACAAAA	2	12	1270269	1270280	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34003	NC_014122	A	6	6	1270277	1270282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34004	NC_014122	CAA	2	6	1270287	1270292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34005	NC_014122	AT	3	6	1270310	1270315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34006	NC_014122	AATAT	2	10	1270327	1270336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34007	NC_014122	AACA	2	8	1270361	1270368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34008	NC_014122	TAA	2	6	1270496	1270501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34009	NC_014122	AT	4	8	1270530	1270537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34010	NC_014122	AAGAA	2	10	1270550	1270559	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34011	NC_014122	A	6	6	1270575	1270580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34012	NC_014122	ATAA	2	8	1270677	1270684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34013	NC_014122	ATT	2	6	1270706	1270711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34014	NC_014122	AATT	2	8	1270715	1270722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34015	NC_014122	TA	3	6	1270760	1270765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34016	NC_014122	ATA	2	6	1270770	1270775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110076
34017	NC_014122	CAA	2	6	1270788	1270793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110076
34018	NC_014122	AGA	2	6	1270822	1270827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110076
34019	NC_014122	AGA	2	6	1270843	1270848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110076
34020	NC_014122	CTTT	2	8	1270916	1270923	0 %	75 %	0 %	25 %	296110076
34021	NC_014122	TACAT	2	10	1270936	1270945	40 %	40 %	0 %	20 %	296110076
34022	NC_014122	GTT	2	6	1271009	1271014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296110076
34023	NC_014122	TTC	2	6	1271061	1271066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110076
34024	NC_014122	AGA	2	6	1271089	1271094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110076
34025	NC_014122	A	6	6	1271119	1271124	100 %	0 %	0 %	0 %	296110076
34026	NC_014122	TATGTT	2	12	1271200	1271211	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296110076
34027	NC_014122	ATT	2	6	1271231	1271236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110076
34028	NC_014122	T	6	6	1271281	1271286	0 %	100 %	0 %	0 %	296110076
34029	NC_014122	AAC	2	6	1271291	1271296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110076
34030	NC_014122	TGA	2	6	1271371	1271376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110076
34031	NC_014122	GGAAAG	2	12	1271390	1271401	50 %	0 %	50 %	0 %	296110076
34032	NC_014122	AAAG	2	8	1271421	1271428	75 %	0 %	25 %	0 %	296110076
34033	NC_014122	GTT	2	6	1271515	1271520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296110076
34034	NC_014122	ATA	2	6	1271527	1271532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110076
34035	NC_014122	GAT	2	6	1271553	1271558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110077
34036	NC_014122	TGTTGA	2	12	1271585	1271596	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296110077
34037	NC_014122	A	6	6	1271608	1271613	100 %	0 %	0 %	0 %	296110077
34038	NC_014122	TAA	2	6	1271623	1271628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110077
34039	NC_014122	A	7	7	1271640	1271646	100 %	0 %	0 %	0 %	296110077
34040	NC_014122	CAA	2	6	1271659	1271664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110077
34041	NC_014122	AGG	2	6	1271785	1271790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296110077
34042	NC_014122	TGA	2	6	1271852	1271857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110077
34043	NC_014122	CTG	2	6	1271881	1271886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296110077
34044	NC_014122	GAA	2	6	1271919	1271924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110077
34045	NC_014122	AGA	2	6	1271987	1271992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110077
34046	NC_014122	ATT	2	6	1272009	1272014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110077
34047	NC_014122	TAA	2	6	1272016	1272021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110077
34048	NC_014122	TAA	2	6	1272061	1272066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110077
34049	NC_014122	AAG	2	6	1272110	1272115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110077
34050	NC_014122	AACAGG	2	12	1272140	1272151	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296110077
34051	NC_014122	GTT	2	6	1272168	1272173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296110077
34052	NC_014122	AGG	2	6	1272203	1272208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296110077
34053	NC_014122	ATG	2	6	1272228	1272233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110077
34054	NC_014122	GTT	2	6	1272240	1272245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296110077
34055	NC_014122	ATTA	2	8	1272266	1272273	50 %	50 %	0 %	0 %	296110077
34056	NC_014122	TA	3	6	1272328	1272333	50 %	50 %	0 %	0 %	296110078
34057	NC_014122	TAAA	2	8	1272335	1272342	75 %	25 %	0 %	0 %	296110078
34058	NC_014122	CTA	2	6	1272343	1272348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110078
34059	NC_014122	TCC	2	6	1272353	1272358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296110078
34060	NC_014122	AAAT	2	8	1272359	1272366	75 %	25 %	0 %	0 %	296110078
34061	NC_014122	AAT	2	6	1272402	1272407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110078
34062	NC_014122	TAG	2	6	1272428	1272433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110078
34063	NC_014122	AT	3	6	1272510	1272515	50 %	50 %	0 %	0 %	296110078
34064	NC_014122	CAA	2	6	1272547	1272552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110078
34065	NC_014122	TAT	2	6	1272557	1272562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110078
34066	NC_014122	CAA	2	6	1272568	1272573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110078
34067	NC_014122	TAA	2	6	1272596	1272601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110078
34068	NC_014122	T	7	7	1272608	1272614	0 %	100 %	0 %	0 %	296110078
34069	NC_014122	ATT	2	6	1272702	1272707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110078
34070	NC_014122	ATA	2	6	1272830	1272835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110078
34071	NC_014122	ATA	2	6	1272847	1272852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110078
34072	NC_014122	ATA	2	6	1272901	1272906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110078
34073	NC_014122	TGAAAA	2	12	1272974	1272985	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296110078
34074	NC_014122	CAA	2	6	1273111	1273116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110078
34075	NC_014122	CAG	2	6	1273120	1273125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296110078
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34077	NC_014122	AT	3	6	1273159	1273164	50 %	50 %	0 %	0 %	296110078
34078	NC_014122	ATAAA	2	10	1273190	1273199	80 %	20 %	0 %	0 %	296110078
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34080	NC_014122	CCT	2	6	1273239	1273244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296110078
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34082	NC_014122	ATATTA	2	12	1273273	1273284	50 %	50 %	0 %	0 %	296110078
34083	NC_014122	A	7	7	1273290	1273296	100 %	0 %	0 %	0 %	296110078
34084	NC_014122	TTC	2	6	1273306	1273311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110078
34085	NC_014122	TA	4	8	1273340	1273347	50 %	50 %	0 %	0 %	296110079
34086	NC_014122	TTA	2	6	1273348	1273353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110079
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34088	NC_014122	TTG	3	9	1273408	1273416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296110079
34089	NC_014122	TAT	2	6	1273451	1273456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110079
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34091	NC_014122	TAG	2	6	1273480	1273485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110079
34092	NC_014122	ATA	2	6	1273519	1273524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110079
34093	NC_014122	CAA	2	6	1273552	1273557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110079
34094	NC_014122	TGCT	2	8	1273585	1273592	0 %	50 %	25 %	25 %	296110079
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34100	NC_014122	ATT	2	6	1273728	1273733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110079
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34103	NC_014122	ATT	2	6	1273814	1273819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110079
34104	NC_014122	CAA	2	6	1273894	1273899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110079
34105	NC_014122	AGA	2	6	1273902	1273907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110079
34106	NC_014122	GTA	2	6	1273908	1273913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110079
34107	NC_014122	CTTT	2	8	1273924	1273931	0 %	75 %	0 %	25 %	296110079
34108	NC_014122	AAC	2	6	1273943	1273948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110079
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34112	NC_014122	TAAG	2	8	1274084	1274091	50 %	25 %	25 %	0 %	296110079
34113	NC_014122	TAAA	2	8	1274110	1274117	75 %	25 %	0 %	0 %	296110079
34114	NC_014122	TAA	2	6	1274126	1274131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110079
34115	NC_014122	ATCCC	2	10	1274146	1274155	20 %	20 %	0 %	60 %	296110079
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34117	NC_014122	ATAG	2	8	1274210	1274217	50 %	25 %	25 %	0 %	296110079
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34120	NC_014122	AAT	2	6	1274242	1274247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110079
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34122	NC_014122	TAA	2	6	1274294	1274299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110079
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34128	NC_014122	AT	3	6	1274446	1274451	50 %	50 %	0 %	0 %	296110080
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34479	NC_014122	AGTT	2	8	1287549	1287556	25 %	50 %	25 %	0 %	296110092
34480	NC_014122	GAA	2	6	1287560	1287565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110092
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34482	NC_014122	TA	3	6	1287589	1287594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34483	NC_014122	TTC	2	6	1287595	1287600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110093
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