MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_014122	TAT	2	6	1252890	1252895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33502	NC_014122	ATTA	2	8	1252896	1252903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33503	NC_014122	TGG	2	6	1252934	1252939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33504	NC_014122	T	6	6	1253011	1253016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33505	NC_014122	ATT	2	6	1253017	1253022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33506	NC_014122	TTA	2	6	1253074	1253079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110065
33507	NC_014122	T	6	6	1253088	1253093	0 %	100 %	0 %	0 %	296110065
33508	NC_014122	AAC	2	6	1253094	1253099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110065
33509	NC_014122	AAT	2	6	1253100	1253105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110065
33510	NC_014122	TA	3	6	1253307	1253312	50 %	50 %	0 %	0 %	296110065
33511	NC_014122	A	6	6	1253352	1253357	100 %	0 %	0 %	0 %	296110065
33512	NC_014122	TAAAAA	2	12	1253402	1253413	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	296110065
33513	NC_014122	A	7	7	1253409	1253415	100 %	0 %	0 %	0 %	296110065
33514	NC_014122	TGA	2	6	1253417	1253422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110065
33515	NC_014122	CCTGT	2	10	1253441	1253450	0 %	40 %	20 %	40 %	296110065
33516	NC_014122	GAG	2	6	1253487	1253492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296110065
33517	NC_014122	TTAT	2	8	1253505	1253512	25 %	75 %	0 %	0 %	296110065
33518	NC_014122	AAGAG	2	10	1253590	1253599	60 %	0 %	40 %	0 %	296110065
33519	NC_014122	A	7	7	1253611	1253617	100 %	0 %	0 %	0 %	296110066
33520	NC_014122	ACT	2	6	1253673	1253678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110066
33521	NC_014122	GTT	2	6	1253702	1253707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296110066
33522	NC_014122	TAGCT	2	10	1253722	1253731	20 %	40 %	20 %	20 %	296110066
33523	NC_014122	GAG	3	9	1253783	1253791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296110066
33524	NC_014122	TCTCT	2	10	1253862	1253871	0 %	60 %	0 %	40 %	296110066
33525	NC_014122	TGA	2	6	1253899	1253904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110066
33526	NC_014122	TAT	2	6	1253920	1253925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110066
33527	NC_014122	GATG	2	8	1253927	1253934	25 %	25 %	50 %	0 %	296110066
33528	NC_014122	TAAG	2	8	1253940	1253947	50 %	25 %	25 %	0 %	296110066
33529	NC_014122	GATAA	2	10	1253951	1253960	60 %	20 %	20 %	0 %	296110066
33530	NC_014122	CT	3	6	1253983	1253988	0 %	50 %	0 %	50 %	296110066
33531	NC_014122	GAA	2	6	1254004	1254009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110066
33532	NC_014122	ATGG	2	8	1254059	1254066	25 %	25 %	50 %	0 %	296110066
33533	NC_014122	A	6	6	1254091	1254096	100 %	0 %	0 %	0 %	296110066
33534	NC_014122	TGA	2	6	1254103	1254108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110066
33535	NC_014122	TGA	2	6	1254130	1254135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110066
33536	NC_014122	ATA	2	6	1254207	1254212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110066
33537	NC_014122	GAG	2	6	1254255	1254260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296110066
33538	NC_014122	AG	3	6	1254284	1254289	50 %	0 %	50 %	0 %	296110066
33539	NC_014122	TAA	2	6	1254294	1254299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110066
33540	NC_014122	TTTA	2	8	1254314	1254321	25 %	75 %	0 %	0 %	296110066
33541	NC_014122	CT	3	6	1254332	1254337	0 %	50 %	0 %	50 %	296110066
33542	NC_014122	ATT	2	6	1254374	1254379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110066
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33544	NC_014122	AGA	2	6	1254464	1254469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110066
33545	NC_014122	ATT	2	6	1254488	1254493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110066
33546	NC_014122	TTAA	2	8	1254527	1254534	50 %	50 %	0 %	0 %	296110066
33547	NC_014122	ATA	2	6	1254537	1254542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110066
33548	NC_014122	TCT	2	6	1254543	1254548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110066
33549	NC_014122	GAAAG	2	10	1254582	1254591	60 %	0 %	40 %	0 %	296110066
33550	NC_014122	A	6	6	1254620	1254625	100 %	0 %	0 %	0 %	296110066
33551	NC_014122	AAG	2	6	1254647	1254652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110066
33552	NC_014122	AG	3	6	1254658	1254663	50 %	0 %	50 %	0 %	296110066
33553	NC_014122	TTAA	2	8	1254682	1254689	50 %	50 %	0 %	0 %	296110066
33554	NC_014122	ATAA	2	8	1254744	1254751	75 %	25 %	0 %	0 %	296110067
33555	NC_014122	TCC	2	6	1254759	1254764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296110067
33556	NC_014122	ACT	2	6	1254765	1254770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110067
33557	NC_014122	AGC	2	6	1254777	1254782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296110067
33558	NC_014122	CTT	2	6	1254783	1254788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110067
33559	NC_014122	TC	3	6	1254832	1254837	0 %	50 %	0 %	50 %	296110067
33560	NC_014122	GAGG	2	8	1254885	1254892	25 %	0 %	75 %	0 %	296110067
33561	NC_014122	ACA	2	6	1254898	1254903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110067
33562	NC_014122	CT	3	6	1254964	1254969	0 %	50 %	0 %	50 %	296110067
33563	NC_014122	T	6	6	1254988	1254993	0 %	100 %	0 %	0 %	296110067
33564	NC_014122	TCT	3	9	1255007	1255015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110067
33565	NC_014122	CTT	2	6	1255022	1255027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110067
33566	NC_014122	TCA	2	6	1255066	1255071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110067
33567	NC_014122	AG	3	6	1255083	1255088	50 %	0 %	50 %	0 %	296110067
33568	NC_014122	AT	3	6	1255131	1255136	50 %	50 %	0 %	0 %	296110067
33569	NC_014122	TCA	2	6	1255171	1255176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110067
33570	NC_014122	TAAA	2	8	1255193	1255200	75 %	25 %	0 %	0 %	296110067
33571	NC_014122	CTC	2	6	1255203	1255208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296110067
33572	NC_014122	TAT	2	6	1255328	1255333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110067
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33574	NC_014122	CT	3	6	1255412	1255417	0 %	50 %	0 %	50 %	296110067
33575	NC_014122	T	6	6	1255429	1255434	0 %	100 %	0 %	0 %	296110067
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33578	NC_014122	TTC	2	6	1255484	1255489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110067
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33585	NC_014122	TA	3	6	1255677	1255682	50 %	50 %	0 %	0 %	296110067
33586	NC_014122	AG	3	6	1255685	1255690	50 %	0 %	50 %	0 %	296110067
33587	NC_014122	GTT	2	6	1255728	1255733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296110067
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33589	NC_014122	CCT	2	6	1255784	1255789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296110067
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33591	NC_014122	CT	3	6	1255851	1255856	0 %	50 %	0 %	50 %	296110067
33592	NC_014122	TCA	3	9	1255894	1255902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110067
33593	NC_014122	AG	3	6	1255904	1255909	50 %	0 %	50 %	0 %	296110067
33594	NC_014122	TAT	2	6	1255940	1255945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110067
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33596	NC_014122	CTA	2	6	1256072	1256077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110067
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33599	NC_014122	CA	3	6	1256126	1256131	50 %	0 %	0 %	50 %	296110067
33600	NC_014122	TCTT	2	8	1256155	1256162	0 %	75 %	0 %	25 %	296110068
33601	NC_014122	TCCT	2	8	1256166	1256173	0 %	50 %	0 %	50 %	296110068
33602	NC_014122	AGCTTT	2	12	1256252	1256263	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296110068
33603	NC_014122	A	6	6	1256277	1256282	100 %	0 %	0 %	0 %	296110068
33604	NC_014122	CTG	2	6	1256290	1256295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296110068
33605	NC_014122	AAG	2	6	1256304	1256309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110068
33606	NC_014122	T	6	6	1256316	1256321	0 %	100 %	0 %	0 %	296110068
33607	NC_014122	AAG	2	6	1256385	1256390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110068
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33610	NC_014122	CCCCT	2	10	1256506	1256515	0 %	20 %	0 %	80 %	296110068
33611	NC_014122	ATG	2	6	1256517	1256522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110068
33612	NC_014122	AAT	2	6	1256594	1256599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110068
33613	NC_014122	TCCT	2	8	1256627	1256634	0 %	50 %	0 %	50 %	296110068
33614	NC_014122	TA	3	6	1256669	1256674	50 %	50 %	0 %	0 %	296110068
33615	NC_014122	TTG	2	6	1256713	1256718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296110068
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33618	NC_014122	AG	3	6	1256826	1256831	50 %	0 %	50 %	0 %	296110068
33619	NC_014122	TC	3	6	1256979	1256984	0 %	50 %	0 %	50 %	296110068
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33991	NC_014122	TAA	2	6	1269970	1269975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33999	NC_014122	A	7	7	1270193	1270199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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