MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_014122	TAT	2	6	1214495	1214500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110018
32503	NC_014122	CTA	2	6	1214551	1214556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110018
32504	NC_014122	TCC	2	6	1214572	1214577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296110018
32505	NC_014122	T	6	6	1214610	1214615	0 %	100 %	0 %	0 %	296110018
32506	NC_014122	TC	3	6	1214633	1214638	0 %	50 %	0 %	50 %	296110018
32507	NC_014122	CCA	2	6	1214677	1214682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296110018
32508	NC_014122	TTA	2	6	1214735	1214740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110018
32509	NC_014122	CCA	2	6	1214821	1214826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296110018
32510	NC_014122	ATA	2	6	1214851	1214856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110018
32511	NC_014122	C	6	6	1214947	1214952	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32512	NC_014122	A	6	6	1214962	1214967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32513	NC_014122	A	6	6	1214970	1214975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32514	NC_014122	AT	4	8	1215007	1215014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32515	NC_014122	ATG	2	6	1215055	1215060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32516	NC_014122	AAAATT	2	12	1215128	1215139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110019
32517	NC_014122	ATCTAT	2	12	1215147	1215158	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296110019
32518	NC_014122	GTTT	2	8	1215195	1215202	0 %	75 %	25 %	0 %	296110019
32519	NC_014122	T	6	6	1215477	1215482	0 %	100 %	0 %	0 %	296110019
32520	NC_014122	AGA	2	6	1215569	1215574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110019
32521	NC_014122	CTAT	2	8	1215757	1215764	25 %	50 %	0 %	25 %	296110019
32522	NC_014122	AGG	2	6	1215773	1215778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296110019
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32524	NC_014122	GA	4	8	1215814	1215821	50 %	0 %	50 %	0 %	296110019
32525	NC_014122	ATG	2	6	1215871	1215876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110019
32526	NC_014122	TTC	2	6	1215901	1215906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110019
32527	NC_014122	TCT	2	6	1215982	1215987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110019
32528	NC_014122	CTTC	2	8	1216046	1216053	0 %	50 %	0 %	50 %	296110019
32529	NC_014122	ATA	2	6	1216080	1216085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110019
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32532	NC_014122	A	6	6	1216207	1216212	100 %	0 %	0 %	0 %	296110019
32533	NC_014122	GAT	2	6	1216215	1216220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110019
32534	NC_014122	GAA	2	6	1216242	1216247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110019
32535	NC_014122	A	6	6	1216332	1216337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32536	NC_014122	T	6	6	1216374	1216379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32537	NC_014122	T	7	7	1216383	1216389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32538	NC_014122	AAT	2	6	1216398	1216403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32539	NC_014122	TA	3	6	1216405	1216410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32540	NC_014122	TTA	2	6	1216461	1216466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32541	NC_014122	A	6	6	1216483	1216488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32542	NC_014122	AGG	2	6	1216491	1216496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32543	NC_014122	GAT	2	6	1216505	1216510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110020
32544	NC_014122	TAG	2	6	1216543	1216548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110020
32545	NC_014122	AGT	2	6	1216554	1216559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110020
32546	NC_014122	TTA	2	6	1216596	1216601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110020
32547	NC_014122	TTA	2	6	1216626	1216631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110020
32548	NC_014122	TAG	2	6	1216637	1216642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110020
32549	NC_014122	TAT	2	6	1216643	1216648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110020
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32552	NC_014122	AG	4	8	1216831	1216838	50 %	0 %	50 %	0 %	296110020
32553	NC_014122	AG	4	8	1216844	1216851	50 %	0 %	50 %	0 %	296110020
32554	NC_014122	A	7	7	1216899	1216905	100 %	0 %	0 %	0 %	296110020
32555	NC_014122	AG	3	6	1216907	1216912	50 %	0 %	50 %	0 %	296110020
32556	NC_014122	A	6	6	1216936	1216941	100 %	0 %	0 %	0 %	296110020
32557	NC_014122	TGC	3	9	1216955	1216963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296110020
32558	NC_014122	AGG	2	6	1216984	1216989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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32561	NC_014122	AGGA	2	8	1217067	1217074	50 %	0 %	50 %	0 %	296110021
32562	NC_014122	TTAA	2	8	1217087	1217094	50 %	50 %	0 %	0 %	296110021
32563	NC_014122	AG	3	6	1217305	1217310	50 %	0 %	50 %	0 %	296110021
32564	NC_014122	ATT	2	6	1217318	1217323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110021
32565	NC_014122	AG	3	6	1217331	1217336	50 %	0 %	50 %	0 %	296110021
32566	NC_014122	TG	3	6	1217401	1217406	0 %	50 %	50 %	0 %	296110022
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32569	NC_014122	TA	3	6	1217463	1217468	50 %	50 %	0 %	0 %	296110022
32570	NC_014122	ACA	2	6	1217538	1217543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110022
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32572	NC_014122	TC	3	6	1217589	1217594	0 %	50 %	0 %	50 %	296110022
32573	NC_014122	AT	3	6	1217628	1217633	50 %	50 %	0 %	0 %	296110022
32574	NC_014122	AGG	3	9	1217641	1217649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296110022
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32577	NC_014122	GTT	2	6	1217672	1217677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296110022
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32605	NC_014122	CTC	3	9	1218522	1218530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296110023
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32611	NC_014122	TAA	2	6	1218710	1218715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110024
32612	NC_014122	TA	3	6	1218747	1218752	50 %	50 %	0 %	0 %	296110024
32613	NC_014122	AG	3	6	1218769	1218774	50 %	0 %	50 %	0 %	296110024
32614	NC_014122	TAG	2	6	1218818	1218823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110024
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32617	NC_014122	CTTT	2	8	1218952	1218959	0 %	75 %	0 %	25 %	296110025
32618	NC_014122	ATC	2	6	1219039	1219044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110025
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32620	NC_014122	TTC	2	6	1219117	1219122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110025
32621	NC_014122	AG	3	6	1219191	1219196	50 %	0 %	50 %	0 %	296110025
32622	NC_014122	CT	3	6	1219230	1219235	0 %	50 %	0 %	50 %	296110025
32623	NC_014122	TC	3	6	1219236	1219241	0 %	50 %	0 %	50 %	296110025
32624	NC_014122	CCTATC	2	12	1219253	1219264	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296110025
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32627	NC_014122	TAA	2	6	1219335	1219340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110025
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32646	NC_014122	T	6	6	1220018	1220023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32648	NC_014122	G	6	6	1220099	1220104	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32649	NC_014122	GAA	2	6	1220112	1220117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110026
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32657	NC_014122	A	7	7	1220389	1220395	100 %	0 %	0 %	0 %	296110026
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32724	NC_014122	ATT	2	6	1223356	1223361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110029
32725	NC_014122	CTTTTA	2	12	1223414	1223425	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296110029
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32727	NC_014122	TTAAAA	2	12	1223518	1223529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110029
32728	NC_014122	AGA	2	6	1223579	1223584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110029
32729	NC_014122	AT	3	6	1223649	1223654	50 %	50 %	0 %	0 %	296110029
32730	NC_014122	ATA	2	6	1223657	1223662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110029
32731	NC_014122	CTT	2	6	1223664	1223669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110029
32732	NC_014122	CT	4	8	1223682	1223689	0 %	50 %	0 %	50 %	296110029
32733	NC_014122	AAAAT	2	10	1223714	1223723	80 %	20 %	0 %	0 %	296110029
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32736	NC_014122	TTA	2	6	1223818	1223823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110029
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32738	NC_014122	TAA	2	6	1223882	1223887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110029
32739	NC_014122	A	6	6	1223895	1223900	100 %	0 %	0 %	0 %	296110029
32740	NC_014122	AT	4	8	1223923	1223930	50 %	50 %	0 %	0 %	296110029
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32742	NC_014122	ATT	2	6	1223972	1223977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110029
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32777	NC_014122	TTA	2	6	1225307	1225312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32835	NC_014122	T	6	6	1227647	1227652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32836	NC_014122	A	6	6	1227680	1227685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32837	NC_014122	T	6	6	1227695	1227700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32844	NC_014122	AGA	2	6	1227829	1227834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296110032
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32846	NC_014122	GA	3	6	1227869	1227874	50 %	0 %	50 %	0 %	296110032
32847	NC_014122	TGA	2	6	1227887	1227892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110032
32848	NC_014122	AG	3	6	1227893	1227898	50 %	0 %	50 %	0 %	296110032
32849	NC_014122	GA	3	6	1227927	1227932	50 %	0 %	50 %	0 %	296110032
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32852	NC_014122	A	7	7	1228062	1228068	100 %	0 %	0 %	0 %	296110033
32853	NC_014122	GA	3	6	1228134	1228139	50 %	0 %	50 %	0 %	296110033
32854	NC_014122	TGA	2	6	1228141	1228146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296110033
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32856	NC_014122	GTTG	2	8	1228270	1228277	0 %	50 %	50 %	0 %	296110033
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32860	NC_014122	TA	3	6	1228489	1228494	50 %	50 %	0 %	0 %	296110033
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