MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_014122	CA	4	8	56085	56092	50 %	0 %	0 %	50 %	296108748
1503	NC_014122	CAG	2	6	56135	56140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108748
1504	NC_014122	ATGG	2	8	56204	56211	25 %	25 %	50 %	0 %	296108748
1505	NC_014122	ATCT	2	8	56250	56257	25 %	50 %	0 %	25 %	296108748
1506	NC_014122	CCT	2	6	56262	56267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108748
1507	NC_014122	TTG	2	6	56297	56302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108748
1508	NC_014122	AAC	2	6	56340	56345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108748
1509	NC_014122	CAA	2	6	56438	56443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108748
1510	NC_014122	TC	3	6	56455	56460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_014122	TATC	2	8	56536	56543	25 %	50 %	0 %	25 %	296108749
1512	NC_014122	T	6	6	56577	56582	0 %	100 %	0 %	0 %	296108749
1513	NC_014122	CTA	2	6	56635	56640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108749
1514	NC_014122	CT	3	6	56680	56685	0 %	50 %	0 %	50 %	296108749
1515	NC_014122	AGT	2	6	56687	56692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108749
1516	NC_014122	GAT	2	6	56704	56709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108749
1517	NC_014122	CTAT	2	8	56748	56755	25 %	50 %	0 %	25 %	296108749
1518	NC_014122	CTC	2	6	56822	56827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108749
1519	NC_014122	TCC	2	6	56921	56926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108749
1520	NC_014122	TATC	2	8	56935	56942	25 %	50 %	0 %	25 %	296108749
1521	NC_014122	T	6	6	56988	56993	0 %	100 %	0 %	0 %	296108749
1522	NC_014122	CTT	2	6	56994	56999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108749
1523	NC_014122	TTG	2	6	57059	57064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108749
1524	NC_014122	TCC	2	6	57079	57084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108749
1525	NC_014122	T	6	6	57087	57092	0 %	100 %	0 %	0 %	296108749
1526	NC_014122	TA	3	6	57134	57139	50 %	50 %	0 %	0 %	296108749
1527	NC_014122	TC	3	6	57159	57164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_014122	TTG	2	6	57208	57213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_014122	AGG	2	6	57237	57242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_014122	CTT	2	6	57255	57260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_014122	ATGT	2	8	57263	57270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_014122	TAA	2	6	57271	57276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_014122	TAA	2	6	57292	57297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_014122	A	6	6	57302	57307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_014122	TAA	2	6	57360	57365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108750
1536	NC_014122	ATC	2	6	57468	57473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108750
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1539	NC_014122	GAG	2	6	57585	57590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108750
1540	NC_014122	A	7	7	57605	57611	100 %	0 %	0 %	0 %	296108750
1541	NC_014122	TTG	2	6	57633	57638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108750
1542	NC_014122	CTT	2	6	57654	57659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108750
1543	NC_014122	TAG	2	6	57712	57717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108750
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1553	NC_014122	AAG	2	6	58031	58036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108750
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1557	NC_014122	GGA	2	6	58122	58127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108750
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1559	NC_014122	GA	4	8	58148	58155	50 %	0 %	50 %	0 %	296108750
1560	NC_014122	ATT	2	6	58182	58187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108750
1561	NC_014122	A	6	6	58219	58224	100 %	0 %	0 %	0 %	296108750
1562	NC_014122	AAG	2	6	58262	58267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108750
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1582	NC_014122	GA	3	6	59039	59044	50 %	0 %	50 %	0 %	296108750
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1585	NC_014122	TA	3	6	59132	59137	50 %	50 %	0 %	0 %	296108750
1586	NC_014122	AG	3	6	59139	59144	50 %	0 %	50 %	0 %	296108750
1587	NC_014122	ATTG	2	8	59174	59181	25 %	50 %	25 %	0 %	296108750
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1589	NC_014122	CCTT	2	8	59214	59221	0 %	50 %	0 %	50 %	296108751
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1598	NC_014122	TG	3	6	59477	59482	0 %	50 %	50 %	0 %	296108751
1599	NC_014122	GTT	2	6	59487	59492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108751
1600	NC_014122	TTTA	2	8	59552	59559	25 %	75 %	0 %	0 %	296108751
1601	NC_014122	AGCTCC	2	12	59657	59668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296108751
1602	NC_014122	TAA	2	6	59692	59697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108751
1603	NC_014122	TCT	2	6	59703	59708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108751
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1605	NC_014122	TCCT	2	8	59799	59806	0 %	50 %	0 %	50 %	296108751
1606	NC_014122	CT	3	6	59937	59942	0 %	50 %	0 %	50 %	296108751
1607	NC_014122	AG	4	8	59944	59951	50 %	0 %	50 %	0 %	296108751
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1609	NC_014122	GA	3	6	60019	60024	50 %	0 %	50 %	0 %	296108751
1610	NC_014122	TC	3	6	60046	60051	0 %	50 %	0 %	50 %	296108751
1611	NC_014122	TAAA	2	8	60070	60077	75 %	25 %	0 %	0 %	296108751
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1616	NC_014122	GT	3	6	60238	60243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014122	TAAT	2	8	60262	60269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_014122	TAA	2	6	60279	60284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_014122	AGA	2	6	60298	60303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_014122	AATGAA	2	12	60307	60318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296108752
1621	NC_014122	AT	3	6	60338	60343	50 %	50 %	0 %	0 %	296108752
1622	NC_014122	CT	4	8	60378	60385	0 %	50 %	0 %	50 %	296108752
1623	NC_014122	GA	4	8	60465	60472	50 %	0 %	50 %	0 %	296108752
1624	NC_014122	CACTAA	2	12	60505	60516	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296108752
1625	NC_014122	TTA	2	6	60540	60545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108752
1626	NC_014122	TA	4	8	60594	60601	50 %	50 %	0 %	0 %	296108752
1627	NC_014122	A	6	6	60611	60616	100 %	0 %	0 %	0 %	296108752
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1630	NC_014122	TTG	2	6	60684	60689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108752
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1751	NC_014122	CCT	2	6	65164	65169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108757
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