MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

< Previous12...3233343536373839404142...7172Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_014122	CTAT	2	8	672582	672589	25 %	50 %	0 %	25 %	296109431
18003	NC_014122	CT	3	6	672636	672641	0 %	50 %	0 %	50 %	296109431
18004	NC_014122	TC	3	6	672696	672701	0 %	50 %	0 %	50 %	296109431
18005	NC_014122	TCA	2	6	672735	672740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109431
18006	NC_014122	AAG	3	9	672810	672818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296109431
18007	NC_014122	ACT	2	6	672831	672836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109431
18008	NC_014122	CAA	2	6	672868	672873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109431
18009	NC_014122	CTT	2	6	672995	673000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109431
18010	NC_014122	TAA	2	6	673001	673006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296109431
18011	NC_014122	TTC	2	6	673015	673020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109431
18012	NC_014122	ATC	2	6	673074	673079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109431
18013	NC_014122	CT	5	10	673089	673098	0 %	50 %	0 %	50 %	296109431
18014	NC_014122	CCT	2	6	673133	673138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109432
18015	NC_014122	CTC	2	6	673143	673148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109432
18016	NC_014122	CAA	2	6	673224	673229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109432
18017	NC_014122	ACA	2	6	673232	673237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109432
18018	NC_014122	CTT	2	6	673297	673302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109432
18019	NC_014122	TCA	2	6	673346	673351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109432
18020	NC_014122	AAC	2	6	673390	673395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109432
18021	NC_014122	CAG	2	6	673539	673544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296109432
18022	NC_014122	TCA	2	6	673790	673795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109432
18023	NC_014122	TCCT	2	8	673800	673807	0 %	50 %	0 %	50 %	296109432
18024	NC_014122	TGT	2	6	673813	673818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296109432
18025	NC_014122	ACT	2	6	673922	673927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109432
18026	NC_014122	GGT	2	6	673940	673945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296109432
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18028	NC_014122	CCT	2	6	674106	674111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109432
18029	NC_014122	AAC	2	6	674149	674154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109432
18030	NC_014122	TCA	2	6	674165	674170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109432
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18032	NC_014122	C	6	6	674250	674255	0 %	0 %	0 %	100 %	296109432
18033	NC_014122	CTT	2	6	674284	674289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109432
18034	NC_014122	CT	3	6	674302	674307	0 %	50 %	0 %	50 %	296109432
18035	NC_014122	TTA	2	6	674328	674333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109432
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18037	NC_014122	TGT	3	9	674380	674388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296109432
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18039	NC_014122	TCT	2	6	674481	674486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109432
18040	NC_014122	TTA	2	6	674554	674559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109433
18041	NC_014122	TAAA	2	8	674644	674651	75 %	25 %	0 %	0 %	296109433
18042	NC_014122	TAAA	2	8	674690	674697	75 %	25 %	0 %	0 %	296109433
18043	NC_014122	TTA	2	6	674751	674756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109433
18044	NC_014122	GA	3	6	674788	674793	50 %	0 %	50 %	0 %	296109433
18045	NC_014122	CTT	2	6	674832	674837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109433
18046	NC_014122	CCT	2	6	674839	674844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109433
18047	NC_014122	TAT	2	6	674861	674866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109433
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18049	NC_014122	CTT	2	6	674914	674919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109433
18050	NC_014122	TCCC	2	8	674941	674948	0 %	25 %	0 %	75 %	296109433
18051	NC_014122	TCT	2	6	675015	675020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109433
18052	NC_014122	TTGG	2	8	675073	675080	0 %	50 %	50 %	0 %	296109433
18053	NC_014122	AGT	2	6	675104	675109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109433
18054	NC_014122	CT	3	6	675140	675145	0 %	50 %	0 %	50 %	296109433
18055	NC_014122	CCTTAA	2	12	675172	675183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109433
18056	NC_014122	CT	3	6	675185	675190	0 %	50 %	0 %	50 %	296109433
18057	NC_014122	AAT	2	6	675210	675215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296109433
18058	NC_014122	T	6	6	675236	675241	0 %	100 %	0 %	0 %	296109433
18059	NC_014122	ATA	3	9	675256	675264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296109433
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18062	NC_014122	ACA	2	6	675372	675377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109433
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18064	NC_014122	CTG	3	9	675439	675447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296109433
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18068	NC_014122	TC	3	6	675586	675591	0 %	50 %	0 %	50 %	296109433
18069	NC_014122	ATCCAT	2	12	675629	675640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109433
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18071	NC_014122	TTA	3	9	675693	675701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109433
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18073	NC_014122	CTTA	2	8	675734	675741	25 %	50 %	0 %	25 %	296109433
18074	NC_014122	CTT	2	6	675780	675785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109433
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18076	NC_014122	CCTT	2	8	675819	675826	0 %	50 %	0 %	50 %	296109433
18077	NC_014122	TC	3	6	675865	675870	0 %	50 %	0 %	50 %	296109433
18078	NC_014122	AATA	2	8	675892	675899	75 %	25 %	0 %	0 %	296109433
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18082	NC_014122	ACC	2	6	676045	676050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18086	NC_014122	GA	3	6	676147	676152	50 %	0 %	50 %	0 %	296109434
18087	NC_014122	AGTT	2	8	676153	676160	25 %	50 %	25 %	0 %	296109434
18088	NC_014122	TCA	2	6	676165	676170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109434
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18093	NC_014122	TTA	2	6	676255	676260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109434
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18098	NC_014122	A	6	6	676355	676360	100 %	0 %	0 %	0 %	296109434
18099	NC_014122	AAAG	2	8	676376	676383	75 %	0 %	25 %	0 %	296109434
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18103	NC_014122	GATG	2	8	676601	676608	25 %	25 %	50 %	0 %	296109434
18104	NC_014122	TGA	2	6	676682	676687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109434
18105	NC_014122	AG	3	6	676708	676713	50 %	0 %	50 %	0 %	296109434
18106	NC_014122	GAT	2	6	676728	676733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109434
18107	NC_014122	CT	4	8	676796	676803	0 %	50 %	0 %	50 %	296109434
18108	NC_014122	TAA	2	6	676858	676863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296109434
18109	NC_014122	TGA	2	6	676904	676909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109434
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18113	NC_014122	GA	3	6	677139	677144	50 %	0 %	50 %	0 %	296109434
18114	NC_014122	AGA	2	6	677202	677207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296109435
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18116	NC_014122	GA	3	6	677227	677232	50 %	0 %	50 %	0 %	296109435
18117	NC_014122	AG	3	6	677278	677283	50 %	0 %	50 %	0 %	296109435
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18119	NC_014122	AAG	2	6	677318	677323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296109435
18120	NC_014122	TAAA	2	8	677363	677370	75 %	25 %	0 %	0 %	296109435
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18122	NC_014122	GAT	2	6	677419	677424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109435
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18232	NC_014122	ATTCC	2	10	681458	681467	20 %	40 %	0 %	40 %	296109440
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18241	NC_014122	ATCTC	2	10	681621	681630	20 %	40 %	0 %	40 %	296109440
18242	NC_014122	CTT	2	6	681633	681638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109440
18243	NC_014122	TCC	2	6	681652	681657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109440
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18245	NC_014122	TTAT	2	8	681686	681693	25 %	75 %	0 %	0 %	296109440
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18353	NC_014122	ACTTA	2	10	686285	686294	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18354	NC_014122	AG	3	6	686337	686342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18355	NC_014122	ATT	2	6	686416	686421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18356	NC_014122	AG	3	6	686425	686430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18357	NC_014122	AAC	2	6	686497	686502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18358	NC_014122	A	6	6	686520	686525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18359	NC_014122	AATA	2	8	686527	686534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18361	NC_014122	T	6	6	686563	686568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18493	NC_014122	TAT	2	6	692026	692031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109450
18494	NC_014122	TGT	2	6	692040	692045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296109450
18495	NC_014122	TAAT	2	8	692060	692067	50 %	50 %	0 %	0 %	296109450
18496	NC_014122	GAT	2	6	692101	692106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109450
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