MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_014122	ACAGGG	2	12	615841	615852	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296109364
16502	NC_014122	GA	4	8	615856	615863	50 %	0 %	50 %	0 %	296109364
16503	NC_014122	TCA	2	6	615880	615885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109364
16504	NC_014122	AAC	2	6	615891	615896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109364
16505	NC_014122	TCT	2	6	615923	615928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109364
16506	NC_014122	TCC	4	12	615942	615953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109364
16507	NC_014122	TTAA	2	8	615955	615962	50 %	50 %	0 %	0 %	296109364
16508	NC_014122	T	7	7	615972	615978	0 %	100 %	0 %	0 %	296109364
16509	NC_014122	TCA	2	6	615985	615990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109364
16510	NC_014122	CAT	2	6	616013	616018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109364
16511	NC_014122	TACT	2	8	616028	616035	25 %	50 %	0 %	25 %	296109364
16512	NC_014122	TAAA	2	8	616139	616146	75 %	25 %	0 %	0 %	296109364
16513	NC_014122	GCT	2	6	616147	616152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296109364
16514	NC_014122	CAA	2	6	616172	616177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109364
16515	NC_014122	GCT	2	6	616201	616206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296109364
16516	NC_014122	CT	3	6	616220	616225	0 %	50 %	0 %	50 %	296109364
16517	NC_014122	GCT	2	6	616311	616316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296109365
16518	NC_014122	TA	3	6	616337	616342	50 %	50 %	0 %	0 %	296109365
16519	NC_014122	TAAT	2	8	616372	616379	50 %	50 %	0 %	0 %	296109365
16520	NC_014122	ATG	2	6	616455	616460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109365
16521	NC_014122	TA	3	6	616483	616488	50 %	50 %	0 %	0 %	296109365
16522	NC_014122	CT	3	6	616489	616494	0 %	50 %	0 %	50 %	296109365
16523	NC_014122	T	6	6	616512	616517	0 %	100 %	0 %	0 %	296109365
16524	NC_014122	CAA	2	6	616585	616590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109365
16525	NC_014122	GCT	2	6	616653	616658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296109365
16526	NC_014122	CT	5	10	616805	616814	0 %	50 %	0 %	50 %	296109365
16527	NC_014122	CTT	2	6	616835	616840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16528	NC_014122	AGC	2	6	616856	616861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296109365
16529	NC_014122	CTTA	2	8	616889	616896	25 %	50 %	0 %	25 %	296109365
16530	NC_014122	TTA	2	6	616975	616980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109365
16531	NC_014122	TCTT	2	8	617008	617015	0 %	75 %	0 %	25 %	296109365
16532	NC_014122	ATT	2	6	617028	617033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109365
16533	NC_014122	GAG	2	6	617059	617064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296109365
16534	NC_014122	CTT	2	6	617101	617106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16535	NC_014122	TCC	2	6	617123	617128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109365
16536	NC_014122	CATCAA	2	12	617158	617169	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16537	NC_014122	TCT	2	6	617181	617186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16538	NC_014122	TA	3	6	617240	617245	50 %	50 %	0 %	0 %	296109365
16539	NC_014122	CTC	2	6	617255	617260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109365
16540	NC_014122	TCC	2	6	617288	617293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109365
16541	NC_014122	CTC	2	6	617402	617407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109365
16542	NC_014122	CCA	2	6	617514	617519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296109365
16543	NC_014122	CAA	2	6	617554	617559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109365
16544	NC_014122	ACA	2	6	617699	617704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109365
16545	NC_014122	GAT	2	6	617753	617758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109365
16546	NC_014122	TTTC	2	8	617762	617769	0 %	75 %	0 %	25 %	296109365
16547	NC_014122	CT	3	6	617792	617797	0 %	50 %	0 %	50 %	296109365
16548	NC_014122	AAT	2	6	617812	617817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296109365
16549	NC_014122	CTG	2	6	617842	617847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296109365
16550	NC_014122	CAA	2	6	617857	617862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109365
16551	NC_014122	TAT	2	6	617920	617925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109365
16552	NC_014122	TG	3	6	617940	617945	0 %	50 %	50 %	0 %	296109365
16553	NC_014122	CT	3	6	617969	617974	0 %	50 %	0 %	50 %	296109365
16554	NC_014122	TTC	2	6	618011	618016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16555	NC_014122	TCAGC	2	10	618067	618076	20 %	20 %	20 %	40 %	296109365
16556	NC_014122	TTC	2	6	618080	618085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16557	NC_014122	TA	3	6	618116	618121	50 %	50 %	0 %	0 %	296109365
16558	NC_014122	TC	3	6	618128	618133	0 %	50 %	0 %	50 %	296109365
16559	NC_014122	TCT	2	6	618154	618159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16560	NC_014122	CTT	2	6	618167	618172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16561	NC_014122	CTT	2	6	618241	618246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16562	NC_014122	TAGT	2	8	618295	618302	25 %	50 %	25 %	0 %	296109365
16563	NC_014122	CTC	2	6	618313	618318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109365
16564	NC_014122	AAC	3	9	618350	618358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109365
16565	NC_014122	TGC	2	6	618380	618385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296109365
16566	NC_014122	TCA	2	6	618414	618419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109365
16567	NC_014122	AGC	2	6	618443	618448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296109365
16568	NC_014122	CTT	2	6	618495	618500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16569	NC_014122	TTC	2	6	618532	618537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16570	NC_014122	TCC	2	6	618572	618577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109365
16571	NC_014122	TAA	2	6	618598	618603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296109365
16572	NC_014122	TC	3	6	618618	618623	0 %	50 %	0 %	50 %	296109365
16573	NC_014122	TCT	2	6	618625	618630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16574	NC_014122	TTC	2	6	618635	618640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16575	NC_014122	TG	3	6	618683	618688	0 %	50 %	50 %	0 %	296109365
16576	NC_014122	GAT	2	6	618722	618727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109365
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16578	NC_014122	TTC	2	6	618791	618796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
16579	NC_014122	CTTA	2	8	618833	618840	25 %	50 %	0 %	25 %	296109365
16580	NC_014122	CTC	2	6	618854	618859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109365
16581	NC_014122	TCC	2	6	618875	618880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109365
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16586	NC_014122	CT	3	6	619025	619030	0 %	50 %	0 %	50 %	296109365
16587	NC_014122	TCCTC	2	10	619032	619041	0 %	40 %	0 %	60 %	296109365
16588	NC_014122	CAT	2	6	619078	619083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109365
16589	NC_014122	CTGT	2	8	619132	619139	0 %	50 %	25 %	25 %	296109365
16590	NC_014122	CCT	2	6	619140	619145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109365
16591	NC_014122	CTTT	2	8	619170	619177	0 %	75 %	0 %	25 %	296109365
16592	NC_014122	AGT	2	6	619330	619335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109365
16593	NC_014122	CAA	2	6	619354	619359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109365
16594	NC_014122	AAT	2	6	619376	619381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296109365
16595	NC_014122	T	7	7	619387	619393	0 %	100 %	0 %	0 %	296109365
16596	NC_014122	TCT	2	6	619398	619403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109365
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16598	NC_014122	GGT	2	6	619499	619504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296109366
16599	NC_014122	TA	3	6	619632	619637	50 %	50 %	0 %	0 %	296109366
16600	NC_014122	ATG	2	6	619680	619685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109366
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16602	NC_014122	CTAAGG	2	12	619715	619726	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296109366
16603	NC_014122	ATT	2	6	619911	619916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109366
16604	NC_014122	CT	3	6	619940	619945	0 %	50 %	0 %	50 %	296109366
16605	NC_014122	TAA	2	6	619959	619964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296109366
16606	NC_014122	CTCTT	2	10	619970	619979	0 %	60 %	0 %	40 %	296109366
16607	NC_014122	CAA	2	6	620021	620026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109366
16608	NC_014122	CAA	2	6	620067	620072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109366
16609	NC_014122	CTC	2	6	620073	620078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109366
16610	NC_014122	TCC	2	6	620083	620088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109366
16611	NC_014122	TTAG	2	8	620128	620135	25 %	50 %	25 %	0 %	296109366
16612	NC_014122	CT	3	6	620136	620141	0 %	50 %	0 %	50 %	296109366
16613	NC_014122	CAT	2	6	620168	620173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109366
16614	NC_014122	TAAG	2	8	620180	620187	50 %	25 %	25 %	0 %	296109366
16615	NC_014122	TCA	2	6	620188	620193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109366
16616	NC_014122	TGA	2	6	620212	620217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109366
16617	NC_014122	ACT	2	6	620242	620247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109366
16618	NC_014122	ATG	2	6	620342	620347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109366
16619	NC_014122	A	6	6	620387	620392	100 %	0 %	0 %	0 %	296109366
16620	NC_014122	TCT	2	6	620452	620457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109366
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16996	NC_014122	TGT	2	6	633723	633728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296109385
16997	NC_014122	GA	3	6	633755	633760	50 %	0 %	50 %	0 %	296109385
16998	NC_014122	TCA	2	6	633761	633766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109385
16999	NC_014122	TAT	2	6	633792	633797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109385
17000	NC_014122	TCA	2	6	633838	633843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109385

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