MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_014122	TCA	2	6	576893	576898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109331
15502	NC_014122	CTTC	2	8	576967	576974	0 %	50 %	0 %	50 %	296109331
15503	NC_014122	T	6	6	577039	577044	0 %	100 %	0 %	0 %	296109331
15504	NC_014122	CAT	2	6	577092	577097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109331
15505	NC_014122	CTT	2	6	577111	577116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109331
15506	NC_014122	TCT	2	6	577191	577196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109331
15507	NC_014122	AG	3	6	577206	577211	50 %	0 %	50 %	0 %	296109331
15508	NC_014122	CCA	2	6	577259	577264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296109331
15509	NC_014122	CTT	2	6	577265	577270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109331
15510	NC_014122	AGT	2	6	577299	577304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109331
15511	NC_014122	AT	3	6	577314	577319	50 %	50 %	0 %	0 %	296109331
15512	NC_014122	ATT	2	6	577352	577357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109331
15513	NC_014122	GA	3	6	577374	577379	50 %	0 %	50 %	0 %	296109331
15514	NC_014122	CAA	2	6	577392	577397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109331
15515	NC_014122	GAG	2	6	577437	577442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296109331
15516	NC_014122	TCATC	2	10	577452	577461	20 %	40 %	0 %	40 %	296109331
15517	NC_014122	AGG	2	6	577483	577488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296109331
15518	NC_014122	GAA	2	6	577524	577529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296109331
15519	NC_014122	ATA	2	6	577547	577552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296109331
15520	NC_014122	GA	3	6	577564	577569	50 %	0 %	50 %	0 %	296109331
15521	NC_014122	CTGT	2	8	577573	577580	0 %	50 %	25 %	25 %	296109331
15522	NC_014122	TCCA	2	8	577597	577604	25 %	25 %	0 %	50 %	296109331
15523	NC_014122	CT	3	6	577613	577618	0 %	50 %	0 %	50 %	296109331
15524	NC_014122	TAT	2	6	577659	577664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109331
15525	NC_014122	TTA	2	6	577722	577727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109331
15526	NC_014122	TA	3	6	577726	577731	50 %	50 %	0 %	0 %	296109331
15527	NC_014122	TTA	2	6	577764	577769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109331
15528	NC_014122	TCT	2	6	577779	577784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109331
15529	NC_014122	AGTT	2	8	577816	577823	25 %	50 %	25 %	0 %	296109331
15530	NC_014122	CAA	2	6	577830	577835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109331
15531	NC_014122	GAG	2	6	577895	577900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296109331
15532	NC_014122	CTTC	2	8	577937	577944	0 %	50 %	0 %	50 %	296109331
15533	NC_014122	AGTA	2	8	578031	578038	50 %	25 %	25 %	0 %	296109331
15534	NC_014122	CAA	2	6	578073	578078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296109331
15535	NC_014122	TTGT	2	8	578120	578127	0 %	75 %	25 %	0 %	296109331
15536	NC_014122	CAAC	2	8	578139	578146	50 %	0 %	0 %	50 %	296109331
15537	NC_014122	ATC	2	6	578158	578163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109331
15538	NC_014122	TC	4	8	578170	578177	0 %	50 %	0 %	50 %	296109331
15539	NC_014122	ATGG	2	8	578192	578199	25 %	25 %	50 %	0 %	296109331
15540	NC_014122	TGG	2	6	578212	578217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296109331
15541	NC_014122	AGGA	2	8	578221	578228	50 %	0 %	50 %	0 %	296109331
15542	NC_014122	CTG	2	6	578325	578330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296109331
15543	NC_014122	GACA	2	8	578421	578428	50 %	0 %	25 %	25 %	296109331
15544	NC_014122	TCC	2	6	578479	578484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109331
15545	NC_014122	TC	4	8	578486	578493	0 %	50 %	0 %	50 %	296109331
15546	NC_014122	TC	4	8	578517	578524	0 %	50 %	0 %	50 %	296109331
15547	NC_014122	GACA	2	8	578562	578569	50 %	0 %	25 %	25 %	296109331
15548	NC_014122	AAT	2	6	578611	578616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296109331
15549	NC_014122	TCCT	2	8	578664	578671	0 %	50 %	0 %	50 %	296109331
15550	NC_014122	CCT	2	6	578729	578734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109331
15551	NC_014122	TCA	2	6	578753	578758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109331
15552	NC_014122	GA	4	8	578811	578818	50 %	0 %	50 %	0 %	296109331
15553	NC_014122	ATT	2	6	578828	578833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109331
15554	NC_014122	CTC	2	6	578868	578873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109332
15555	NC_014122	ATT	2	6	578874	578879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296109332
15556	NC_014122	T	6	6	578887	578892	0 %	100 %	0 %	0 %	296109332
15557	NC_014122	TCA	2	6	578977	578982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109332
15558	NC_014122	TCTA	2	8	579027	579034	25 %	50 %	0 %	25 %	296109332
15559	NC_014122	TCT	2	6	579081	579086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109332
15560	NC_014122	CAT	2	6	579131	579136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109332
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15562	NC_014122	GCT	2	6	579178	579183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296109332
15563	NC_014122	TC	4	8	579202	579209	0 %	50 %	0 %	50 %	296109332
15564	NC_014122	TC	3	6	579212	579217	0 %	50 %	0 %	50 %	296109332
15565	NC_014122	CCTC	2	8	579229	579236	0 %	25 %	0 %	75 %	296109332
15566	NC_014122	GTTG	2	8	579253	579260	0 %	50 %	50 %	0 %	296109332
15567	NC_014122	CTT	2	6	579289	579294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109332
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15570	NC_014122	CAT	2	6	579386	579391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109332
15571	NC_014122	CT	3	6	579438	579443	0 %	50 %	0 %	50 %	296109332
15572	NC_014122	TCT	3	9	579454	579462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109332
15573	NC_014122	CTT	2	6	579487	579492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109332
15574	NC_014122	TCC	2	6	579513	579518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109332
15575	NC_014122	ATC	2	6	579520	579525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109332
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15578	NC_014122	TAACCT	2	12	579704	579715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109332
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15580	NC_014122	CCT	2	6	579731	579736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109332
15581	NC_014122	ACAG	2	8	579789	579796	50 %	0 %	25 %	25 %	296109332
15582	NC_014122	TC	3	6	579802	579807	0 %	50 %	0 %	50 %	296109332
15583	NC_014122	TCT	2	6	580014	580019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109332
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15586	NC_014122	GAT	2	6	580089	580094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296109332
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15588	NC_014122	CTA	2	6	580133	580138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109332
15589	NC_014122	TCA	2	6	580162	580167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109332
15590	NC_014122	AT	3	6	580175	580180	50 %	50 %	0 %	0 %	296109332
15591	NC_014122	TGTTT	2	10	580186	580195	0 %	80 %	20 %	0 %	296109332
15592	NC_014122	GTAA	2	8	580220	580227	50 %	25 %	25 %	0 %	296109332
15593	NC_014122	GT	5	10	580389	580398	0 %	50 %	50 %	0 %	296109332
15594	NC_014122	TTCCTC	2	12	580440	580451	0 %	50 %	0 %	50 %	296109332
15595	NC_014122	CCTT	2	8	580474	580481	0 %	50 %	0 %	50 %	296109332
15596	NC_014122	TCA	2	6	580489	580494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296109332
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15598	NC_014122	TTC	2	6	580620	580625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109332
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15600	NC_014122	CT	3	6	580674	580679	0 %	50 %	0 %	50 %	296109332
15601	NC_014122	CTC	2	6	580695	580700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296109332
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15604	NC_014122	AACCA	2	10	580872	580881	60 %	0 %	0 %	40 %	296109333
15605	NC_014122	GT	3	6	580926	580931	0 %	50 %	50 %	0 %	296109333
15606	NC_014122	TTG	2	6	581006	581011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296109333
15607	NC_014122	TCTA	2	8	581025	581032	25 %	50 %	0 %	25 %	296109333
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15609	NC_014122	TCT	2	6	581218	581223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109333
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15612	NC_014122	AATTT	2	10	581332	581341	40 %	60 %	0 %	0 %	296109333
15613	NC_014122	T	7	7	581339	581345	0 %	100 %	0 %	0 %	296109333
15614	NC_014122	CT	3	6	581353	581358	0 %	50 %	0 %	50 %	296109333
15615	NC_014122	TTTG	2	8	581428	581435	0 %	75 %	25 %	0 %	296109333
15616	NC_014122	TCT	2	6	581447	581452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296109333
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15623	NC_014122	TTG	2	6	581702	581707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296109333
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15995	NC_014122	TTC	2	6	596472	596477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15996	NC_014122	TCC	2	6	596508	596513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15997	NC_014122	AAC	2	6	596532	596537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15998	NC_014122	CTT	2	6	596614	596619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15999	NC_014122	AG	3	6	596624	596629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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