MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_014122	GAGAAA	2	12	37084	37095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108729
1003	NC_014122	CTGT	2	8	37133	37140	0 %	50 %	25 %	25 %	296108729
1004	NC_014122	ATT	2	6	37171	37176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108729
1005	NC_014122	AT	3	6	37241	37246	50 %	50 %	0 %	0 %	296108729
1006	NC_014122	A	6	6	37262	37267	100 %	0 %	0 %	0 %	296108729
1007	NC_014122	TA	3	6	37271	37276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014122	AAAT	2	8	37319	37326	75 %	25 %	0 %	0 %	296108730
1009	NC_014122	GTAG	2	8	37367	37374	25 %	25 %	50 %	0 %	296108730
1010	NC_014122	AACTT	2	10	37410	37419	40 %	40 %	0 %	20 %	296108730
1011	NC_014122	AAAGG	2	10	37454	37463	60 %	0 %	40 %	0 %	296108730
1012	NC_014122	AGA	2	6	37492	37497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108730
1013	NC_014122	AAG	2	6	37577	37582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108730
1014	NC_014122	AAG	2	6	37601	37606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108730
1015	NC_014122	ATA	2	6	37673	37678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108730
1016	NC_014122	GTT	2	6	37745	37750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108730
1017	NC_014122	AAGAG	2	10	37804	37813	60 %	0 %	40 %	0 %	296108730
1018	NC_014122	AG	3	6	37831	37836	50 %	0 %	50 %	0 %	296108730
1019	NC_014122	GGA	2	6	37868	37873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108730
1020	NC_014122	AGA	2	6	37879	37884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108730
1021	NC_014122	AG	3	6	37898	37903	50 %	0 %	50 %	0 %	296108730
1022	NC_014122	ACC	2	6	37957	37962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296108730
1023	NC_014122	ACC	2	6	37984	37989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296108730
1024	NC_014122	TTA	2	6	38006	38011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108730
1025	NC_014122	AGTA	2	8	38075	38082	50 %	25 %	25 %	0 %	296108730
1026	NC_014122	AAGA	2	8	38107	38114	75 %	0 %	25 %	0 %	296108730
1027	NC_014122	GAA	2	6	38120	38125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108730
1028	NC_014122	CAT	2	6	38146	38151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108730
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1030	NC_014122	GA	3	6	38210	38215	50 %	0 %	50 %	0 %	296108730
1031	NC_014122	TAG	2	6	38220	38225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108730
1032	NC_014122	ATGG	2	8	38243	38250	25 %	25 %	50 %	0 %	296108730
1033	NC_014122	AAG	2	6	38320	38325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108730
1034	NC_014122	AG	3	6	38342	38347	50 %	0 %	50 %	0 %	296108730
1035	NC_014122	AG	3	6	38369	38374	50 %	0 %	50 %	0 %	296108730
1036	NC_014122	GAA	2	6	38376	38381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108730
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1040	NC_014122	GCT	2	6	38483	38488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296108730
1041	NC_014122	GCA	2	6	38501	38506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108730
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1043	NC_014122	GA	3	6	38641	38646	50 %	0 %	50 %	0 %	296108730
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1050	NC_014122	AAG	2	6	38939	38944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108730
1051	NC_014122	TGA	2	6	38977	38982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108730
1052	NC_014122	AG	3	6	39003	39008	50 %	0 %	50 %	0 %	296108730
1053	NC_014122	TCAA	2	8	39045	39052	50 %	25 %	0 %	25 %	296108730
1054	NC_014122	AGA	2	6	39076	39081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108730
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1056	NC_014122	AGC	2	6	39103	39108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108730
1057	NC_014122	TAGA	2	8	39159	39166	50 %	25 %	25 %	0 %	296108730
1058	NC_014122	ATC	2	6	39167	39172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108730
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1060	NC_014122	AGA	2	6	39259	39264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108730
1061	NC_014122	TGTA	2	8	39310	39317	25 %	50 %	25 %	0 %	296108730
1062	NC_014122	AG	3	6	39383	39388	50 %	0 %	50 %	0 %	296108730
1063	NC_014122	ACT	2	6	39396	39401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108730
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1067	NC_014122	TGA	2	6	39499	39504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108730
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1102	NC_014122	CAT	2	6	40659	40664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108731
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1107	NC_014122	T	6	6	40807	40812	0 %	100 %	0 %	0 %	296108731
1108	NC_014122	TTTA	2	8	40833	40840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014122	AT	4	8	40864	40871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014122	ACTT	2	8	40896	40903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_014122	GTTTTT	2	12	40935	40946	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014122	TTAG	2	8	40992	40999	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014122	TAT	2	6	41018	41023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014122	ATT	2	6	41049	41054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014122	T	6	6	41059	41064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014122	T	6	6	41067	41072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014122	GTTTT	2	10	41091	41100	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014122	ATTTT	2	10	41136	41145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014122	AGTA	2	8	41158	41165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014122	TAAA	2	8	41190	41197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014122	AACCT	2	10	41204	41213	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1122	NC_014122	TA	3	6	41240	41245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014122	A	6	6	41321	41326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014122	CTA	2	6	41341	41346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_014122	ATTTT	2	10	41384	41393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014122	TAT	2	6	41397	41402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014122	A	7	7	41421	41427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014122	TTAA	2	8	41428	41435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014122	AAT	2	6	41439	41444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1131	NC_014122	AAAAT	2	10	41466	41475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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