MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014122	CT	3	6	17832	17837	0 %	50 %	0 %	50 %	296108709
502	NC_014122	ATT	2	6	17879	17884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108709
503	NC_014122	ATT	2	6	17912	17917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108709
504	NC_014122	TTA	2	6	17951	17956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108709
505	NC_014122	TA	3	6	18066	18071	50 %	50 %	0 %	0 %	296108709
506	NC_014122	TCTA	2	8	18092	18099	25 %	50 %	0 %	25 %	296108709
507	NC_014122	CT	3	6	18103	18108	0 %	50 %	0 %	50 %	296108709
508	NC_014122	T	6	6	18145	18150	0 %	100 %	0 %	0 %	296108709
509	NC_014122	TG	3	6	18171	18176	0 %	50 %	50 %	0 %	296108709
510	NC_014122	AAAAAT	2	12	18184	18195	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	296108709
511	NC_014122	TA	3	6	18222	18227	50 %	50 %	0 %	0 %	296108710
512	NC_014122	ACA	2	6	18260	18265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108710
513	NC_014122	TTAA	2	8	18268	18275	50 %	50 %	0 %	0 %	296108710
514	NC_014122	GAT	2	6	18354	18359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108710
515	NC_014122	AAAG	2	8	18363	18370	75 %	0 %	25 %	0 %	296108710
516	NC_014122	TGA	2	6	18372	18377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108710
517	NC_014122	TCT	2	6	18456	18461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108710
518	NC_014122	CTCAT	2	10	18473	18482	20 %	40 %	0 %	40 %	296108710
519	NC_014122	AG	3	6	18510	18515	50 %	0 %	50 %	0 %	296108710
520	NC_014122	AG	3	6	18544	18549	50 %	0 %	50 %	0 %	296108710
521	NC_014122	A	6	6	18554	18559	100 %	0 %	0 %	0 %	296108710
522	NC_014122	AG	4	8	18567	18574	50 %	0 %	50 %	0 %	296108710
523	NC_014122	ATT	2	6	18577	18582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108710
524	NC_014122	CTT	2	6	18636	18641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108710
525	NC_014122	TTG	2	6	18671	18676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108710
526	NC_014122	ATA	2	6	18685	18690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108710
527	NC_014122	TCT	2	6	18712	18717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108710
528	NC_014122	TTA	2	6	18732	18737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108710
529	NC_014122	TA	3	6	18736	18741	50 %	50 %	0 %	0 %	296108710
530	NC_014122	GAA	2	6	18759	18764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108710
531	NC_014122	TA	3	6	18874	18879	50 %	50 %	0 %	0 %	296108710
532	NC_014122	TCT	2	6	18953	18958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108711
533	NC_014122	TAA	2	6	18960	18965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108711
534	NC_014122	TC	3	6	18978	18983	0 %	50 %	0 %	50 %	296108711
535	NC_014122	AAATT	2	10	18986	18995	60 %	40 %	0 %	0 %	296108711
536	NC_014122	TCT	2	6	19001	19006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108711
537	NC_014122	TAA	2	6	19020	19025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108711
538	NC_014122	AT	3	6	19081	19086	50 %	50 %	0 %	0 %	296108711
539	NC_014122	AT	3	6	19093	19098	50 %	50 %	0 %	0 %	296108711
540	NC_014122	ATT	2	6	19102	19107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108711
541	NC_014122	TAT	2	6	19120	19125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108711
542	NC_014122	CAT	2	6	19131	19136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108711
543	NC_014122	T	6	6	19174	19179	0 %	100 %	0 %	0 %	296108711
544	NC_014122	AAT	2	6	19180	19185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108711
545	NC_014122	AGG	2	6	19270	19275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108711
546	NC_014122	CAA	2	6	19293	19298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108711
547	NC_014122	TAA	2	6	19316	19321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108711
548	NC_014122	GAA	2	6	19344	19349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108711
549	NC_014122	TAA	2	6	19362	19367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108711
550	NC_014122	TGT	2	6	19568	19573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108711
551	NC_014122	T	7	7	19646	19652	0 %	100 %	0 %	0 %	296108711
552	NC_014122	TAT	2	6	19698	19703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108711
553	NC_014122	TCA	2	6	19793	19798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108711
554	NC_014122	AAAT	2	8	19799	19806	75 %	25 %	0 %	0 %	296108711
555	NC_014122	TTG	2	6	19815	19820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108711
556	NC_014122	TA	3	6	19842	19847	50 %	50 %	0 %	0 %	296108711
557	NC_014122	AAT	2	6	19880	19885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108711
558	NC_014122	A	6	6	19993	19998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014122	AAT	2	6	20051	20056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108712
560	NC_014122	GAA	2	6	20057	20062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108712
561	NC_014122	TAG	2	6	20068	20073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108712
562	NC_014122	GTA	2	6	20074	20079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108712
563	NC_014122	GCT	2	6	20097	20102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296108712
564	NC_014122	ATA	2	6	20190	20195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108712
565	NC_014122	CCA	2	6	20270	20275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296108712
566	NC_014122	ATCA	2	8	20297	20304	50 %	25 %	0 %	25 %	296108712
567	NC_014122	A	6	6	20339	20344	100 %	0 %	0 %	0 %	296108712
568	NC_014122	AGC	2	6	20381	20386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108712
569	NC_014122	TA	3	6	20403	20408	50 %	50 %	0 %	0 %	296108712
570	NC_014122	A	6	6	20451	20456	100 %	0 %	0 %	0 %	296108712
571	NC_014122	AAT	2	6	20474	20479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108712
572	NC_014122	AGT	2	6	20508	20513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108712
573	NC_014122	ACT	2	6	20592	20597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108712
574	NC_014122	ATA	2	6	20634	20639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108712
575	NC_014122	CCT	2	6	20661	20666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108712
576	NC_014122	TAGA	2	8	20671	20678	50 %	25 %	25 %	0 %	296108712
577	NC_014122	T	6	6	20703	20708	0 %	100 %	0 %	0 %	296108712
578	NC_014122	ATG	2	6	20722	20727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108712
579	NC_014122	ATA	2	6	20767	20772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108712
580	NC_014122	TTAATA	2	12	20806	20817	50 %	50 %	0 %	0 %	296108712
581	NC_014122	AT	3	6	20832	20837	50 %	50 %	0 %	0 %	296108712
582	NC_014122	T	6	6	20847	20852	0 %	100 %	0 %	0 %	296108712
583	NC_014122	TC	3	6	20865	20870	0 %	50 %	0 %	50 %	296108712
584	NC_014122	TC	3	6	20878	20883	0 %	50 %	0 %	50 %	296108713
585	NC_014122	TCA	2	6	20896	20901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108713
586	NC_014122	CCA	2	6	20937	20942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296108713
587	NC_014122	TAT	2	6	20951	20956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108713
588	NC_014122	GCA	3	9	20970	20978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108713
589	NC_014122	TAT	2	6	21055	21060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108713
590	NC_014122	CAA	2	6	21076	21081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108713
591	NC_014122	AAG	2	6	21084	21089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108713
592	NC_014122	TGT	2	6	21101	21106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108713
593	NC_014122	AGA	2	6	21141	21146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108713
594	NC_014122	TTA	2	6	21154	21159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108713
595	NC_014122	GCA	2	6	21213	21218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108713
596	NC_014122	CAA	2	6	21283	21288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108713
597	NC_014122	ATT	2	6	21330	21335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108713
598	NC_014122	AAT	2	6	21359	21364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108713
599	NC_014122	TAC	2	6	21403	21408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108713
600	NC_014122	A	6	6	21414	21419	100 %	0 %	0 %	0 %	296108713
601	NC_014122	A	7	7	21482	21488	100 %	0 %	0 %	0 %	296108713
602	NC_014122	ATA	2	6	21526	21531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108713
603	NC_014122	CCA	2	6	21537	21542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296108713
604	NC_014122	TAA	3	9	21550	21558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108713
605	NC_014122	ATA	2	6	21591	21596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108713
606	NC_014122	ATT	2	6	21662	21667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108713
607	NC_014122	ATT	2	6	21756	21761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108713
608	NC_014122	GAAAAA	2	12	21769	21780	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	296108713
609	NC_014122	T	6	6	21796	21801	0 %	100 %	0 %	0 %	296108713
610	NC_014122	CTA	2	6	21804	21809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108713
611	NC_014122	T	6	6	21913	21918	0 %	100 %	0 %	0 %	296108714
612	NC_014122	CTT	2	6	21937	21942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108714
613	NC_014122	GTA	2	6	21981	21986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108714
614	NC_014122	AT	3	6	21988	21993	50 %	50 %	0 %	0 %	296108714
615	NC_014122	TTTA	2	8	22160	22167	25 %	75 %	0 %	0 %	296108714
616	NC_014122	TAA	2	6	22184	22189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108714
617	NC_014122	TACT	2	8	22317	22324	25 %	50 %	0 %	25 %	296108714
618	NC_014122	ATC	2	6	22350	22355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108714
619	NC_014122	CAAA	2	8	22356	22363	75 %	0 %	0 %	25 %	296108714
620	NC_014122	CTG	2	6	22402	22407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296108714
621	NC_014122	TTC	2	6	22439	22444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108714
622	NC_014122	CCT	2	6	22503	22508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108714
623	NC_014122	AAT	2	6	22515	22520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108714
624	NC_014122	TGGA	2	8	22541	22548	25 %	25 %	50 %	0 %	296108714
625	NC_014122	CAT	2	6	22571	22576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108714
626	NC_014122	TAT	2	6	22660	22665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108714
627	NC_014122	ATAA	2	8	22697	22704	75 %	25 %	0 %	0 %	296108714
628	NC_014122	T	6	6	22778	22783	0 %	100 %	0 %	0 %	296108714
629	NC_014122	CTT	2	6	22819	22824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108714
630	NC_014122	CTT	2	6	22828	22833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108714
631	NC_014122	T	6	6	22874	22879	0 %	100 %	0 %	0 %	296108714
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