MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_014002	AGC	2	6	919406	919411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495575
18002	NC_014002	ATGC	2	8	919416	919423	25 %	25 %	25 %	25 %	294495575
18003	NC_014002	TG	3	6	919581	919586	0 %	50 %	50 %	0 %	294495575
18004	NC_014002	TTC	2	6	919606	919611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495575
18005	NC_014002	AGC	2	6	919871	919876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495575
18006	NC_014002	TGA	2	6	919930	919935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495575
18007	NC_014002	TTG	2	6	919946	919951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495575
18008	NC_014002	CTTTAG	2	12	919992	920003	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18009	NC_014002	TCG	2	6	920065	920070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18010	NC_014002	ATG	2	6	920087	920092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_014002	T	6	6	920220	920225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18012	NC_014002	GAA	2	6	920281	920286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18013	NC_014002	AGT	2	6	920369	920374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_014002	CGA	2	6	920399	920404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495576
18015	NC_014002	GGT	2	6	920619	920624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495576
18016	NC_014002	TTTC	2	8	920667	920674	0 %	75 %	0 %	25 %	294495576
18017	NC_014002	GCA	2	6	920691	920696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495576
18018	NC_014002	AAAG	2	8	920859	920866	75 %	0 %	25 %	0 %	294495576
18019	NC_014002	GTC	2	6	920869	920874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495576
18020	NC_014002	GGT	2	6	920877	920882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495576
18021	NC_014002	AGCC	2	8	920949	920956	25 %	0 %	25 %	50 %	294495576
18022	NC_014002	CATTTT	2	12	920965	920976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294495576
18023	NC_014002	CTT	2	6	920986	920991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495576
18024	NC_014002	GAG	2	6	921081	921086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495576
18025	NC_014002	CAT	2	6	921155	921160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495576
18026	NC_014002	TCGGT	2	10	921271	921280	0 %	40 %	40 %	20 %	294495576
18027	NC_014002	TGG	2	6	921289	921294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495576
18028	NC_014002	GTTTC	2	10	921298	921307	0 %	60 %	20 %	20 %	294495576
18029	NC_014002	GAA	2	6	921367	921372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495576
18030	NC_014002	T	6	6	921377	921382	0 %	100 %	0 %	0 %	294495576
18031	NC_014002	A	6	6	921409	921414	100 %	0 %	0 %	0 %	294495576
18032	NC_014002	GGA	2	6	921415	921420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495576
18033	NC_014002	GCT	2	6	921470	921475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495576
18034	NC_014002	AGG	2	6	921564	921569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495576
18035	NC_014002	CCTGA	2	10	921570	921579	20 %	20 %	20 %	40 %	294495576
18036	NC_014002	CTA	2	6	921650	921655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495576
18037	NC_014002	ATTT	2	8	921729	921736	25 %	75 %	0 %	0 %	294495576
18038	NC_014002	A	6	6	921759	921764	100 %	0 %	0 %	0 %	294495576
18039	NC_014002	AT	3	6	921789	921794	50 %	50 %	0 %	0 %	294495576
18040	NC_014002	GAAA	2	8	921795	921802	75 %	0 %	25 %	0 %	294495576
18041	NC_014002	GAA	2	6	921813	921818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495576
18042	NC_014002	CAT	2	6	921871	921876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495576
18043	NC_014002	T	7	7	921916	921922	0 %	100 %	0 %	0 %	294495576
18044	NC_014002	CCTG	2	8	921935	921942	0 %	25 %	25 %	50 %	294495576
18045	NC_014002	GCT	2	6	921960	921965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495576
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18050	NC_014002	GTT	2	6	922146	922151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495576
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18053	NC_014002	GCA	2	6	922287	922292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495576
18054	NC_014002	AGC	2	6	922302	922307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495576
18055	NC_014002	GAAA	2	8	922316	922323	75 %	0 %	25 %	0 %	294495576
18056	NC_014002	CTT	2	6	922351	922356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495576
18057	NC_014002	GGA	2	6	922366	922371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495576
18058	NC_014002	CAA	2	6	922378	922383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495576
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18060	NC_014002	TGA	2	6	922448	922453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495576
18061	NC_014002	TGA	2	6	922469	922474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495576
18062	NC_014002	ACC	2	6	922512	922517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495576
18063	NC_014002	GT	3	6	922546	922551	0 %	50 %	50 %	0 %	294495576
18064	NC_014002	AAAG	2	8	922631	922638	75 %	0 %	25 %	0 %	294495576
18065	NC_014002	T	8	8	922667	922674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18066	NC_014002	ACA	2	6	922732	922737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495577
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18068	NC_014002	TTG	2	6	922803	922808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495577
18069	NC_014002	TTC	2	6	922854	922859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495577
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18072	NC_014002	AGC	2	6	922993	922998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495577
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18075	NC_014002	ATTT	2	8	923289	923296	25 %	75 %	0 %	0 %	294495577
18076	NC_014002	TCA	4	12	923329	923340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495577
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18078	NC_014002	ATCA	2	8	923412	923419	50 %	25 %	0 %	25 %	294495577
18079	NC_014002	GCA	2	6	923461	923466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495577
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18081	NC_014002	GAT	2	6	923494	923499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495577
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18088	NC_014002	CTT	2	6	923738	923743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495577
18089	NC_014002	TGC	2	6	923929	923934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495577
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18091	NC_014002	GTCT	2	8	923969	923976	0 %	50 %	25 %	25 %	294495577
18092	NC_014002	TCT	2	6	923980	923985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495577
18093	NC_014002	TTC	2	6	924036	924041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495577
18094	NC_014002	GGATT	2	10	924078	924087	20 %	40 %	40 %	0 %	294495577
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18098	NC_014002	TAGAT	2	10	924294	924303	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_014002	TAA	2	6	924318	924323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18100	NC_014002	TAAT	2	8	924354	924361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_014002	GAG	2	6	924392	924397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18102	NC_014002	CGT	2	6	924407	924412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18103	NC_014002	CCA	2	6	924533	924538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495578
18104	NC_014002	TTGTA	2	10	924589	924598	20 %	60 %	20 %	0 %	294495578
18105	NC_014002	CATTTT	2	12	924637	924648	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294495578
18106	NC_014002	CAT	2	6	924649	924654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495578
18107	NC_014002	CTT	2	6	924673	924678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495578
18108	NC_014002	T	6	6	924723	924728	0 %	100 %	0 %	0 %	294495578
18109	NC_014002	TCT	2	6	924792	924797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495578
18110	NC_014002	CTT	2	6	924847	924852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495578
18111	NC_014002	CTGTG	2	10	924893	924902	0 %	40 %	40 %	20 %	294495578
18112	NC_014002	TTA	2	6	924960	924965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495578
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18114	NC_014002	A	8	8	924994	925001	100 %	0 %	0 %	0 %	294495578
18115	NC_014002	GAAG	2	8	925017	925024	50 %	0 %	50 %	0 %	294495578
18116	NC_014002	TCTGGT	2	12	925114	925125	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294495578
18117	NC_014002	GCT	2	6	925146	925151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495578
18118	NC_014002	TAAT	2	8	925183	925190	50 %	50 %	0 %	0 %	294495578
18119	NC_014002	TAG	2	6	925208	925213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18120	NC_014002	TA	3	6	925245	925250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18121	NC_014002	GAA	2	6	925252	925257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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