MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

< Previous12...3031323334353637383940...7980Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_014002	CAT	2	6	870802	870807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495524
17003	NC_014002	GGCAT	2	10	870845	870854	20 %	20 %	40 %	20 %	294495524
17004	NC_014002	AAT	2	6	870891	870896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495524
17005	NC_014002	GT	3	6	870935	870940	0 %	50 %	50 %	0 %	294495524
17006	NC_014002	GTC	2	6	870958	870963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495524
17007	NC_014002	CCA	2	6	871119	871124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495524
17008	NC_014002	GGC	2	6	871203	871208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294495524
17009	NC_014002	TTC	2	6	871219	871224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495524
17010	NC_014002	CCT	2	6	871355	871360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495524
17011	NC_014002	CAT	2	6	871407	871412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495524
17012	NC_014002	CTT	2	6	871478	871483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495524
17013	NC_014002	CAGGGG	2	12	871549	871560	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	294495524
17014	NC_014002	TCG	2	6	871589	871594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495524
17015	NC_014002	TTC	2	6	871624	871629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495524
17016	NC_014002	TCT	2	6	871710	871715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495524
17017	NC_014002	CTGT	2	8	871741	871748	0 %	50 %	25 %	25 %	294495524
17018	NC_014002	ACA	2	6	871757	871762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495524
17019	NC_014002	TCC	2	6	871771	871776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495524
17020	NC_014002	GTC	2	6	871819	871824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495524
17021	NC_014002	GTA	2	6	871850	871855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495524
17022	NC_014002	A	6	6	871948	871953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_014002	AT	3	6	871965	871970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17024	NC_014002	TAA	2	6	872017	872022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17025	NC_014002	GCTA	2	8	872059	872066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17026	NC_014002	T	6	6	872093	872098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17027	NC_014002	TAT	2	6	872104	872109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_014002	ATG	2	6	872157	872162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495525
17029	NC_014002	AGT	2	6	872266	872271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495525
17030	NC_014002	GGAT	2	8	872335	872342	25 %	25 %	50 %	0 %	294495525
17031	NC_014002	GAC	2	6	872357	872362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495525
17032	NC_014002	A	6	6	872399	872404	100 %	0 %	0 %	0 %	294495525
17033	NC_014002	TGCA	2	8	872433	872440	25 %	25 %	25 %	25 %	294495525
17034	NC_014002	GGT	2	6	872477	872482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495525
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17036	NC_014002	TGA	2	6	872593	872598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495525
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17040	NC_014002	TA	3	6	872863	872868	50 %	50 %	0 %	0 %	294495525
17041	NC_014002	ATA	2	6	872955	872960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495525
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17045	NC_014002	ATC	2	6	873104	873109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495525
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17047	NC_014002	TC	3	6	873208	873213	0 %	50 %	0 %	50 %	294495525
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17053	NC_014002	ACC	2	6	873730	873735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495525
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17055	NC_014002	AAT	2	6	873799	873804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495525
17056	NC_014002	GAG	2	6	873806	873811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495525
17057	NC_014002	AAC	2	6	873883	873888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495525
17058	NC_014002	GGA	2	6	873928	873933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495525
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17061	NC_014002	GGT	2	6	874043	874048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17062	NC_014002	A	6	6	874049	874054	100 %	0 %	0 %	0 %	294495526
17063	NC_014002	ATG	2	6	874064	874069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495526
17064	NC_014002	A	6	6	874088	874093	100 %	0 %	0 %	0 %	294495526
17065	NC_014002	ATGAA	2	10	874145	874154	60 %	20 %	20 %	0 %	294495526
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17102	NC_014002	A	6	6	876514	876519	100 %	0 %	0 %	0 %	294495526
17103	NC_014002	GAG	2	6	876520	876525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495526
17104	NC_014002	TAAC	2	8	876602	876609	50 %	25 %	0 %	25 %	294495527
17105	NC_014002	AAC	3	9	876607	876615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495527
17106	NC_014002	TGC	2	6	876625	876630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495527
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17108	NC_014002	CCAG	2	8	876750	876757	25 %	0 %	25 %	50 %	294495527
17109	NC_014002	A	6	6	876871	876876	100 %	0 %	0 %	0 %	294495527
17110	NC_014002	GTT	2	6	876944	876949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495527
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17112	NC_014002	AT	3	6	877133	877138	50 %	50 %	0 %	0 %	294495527
17113	NC_014002	TCC	2	6	877162	877167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495527
17114	NC_014002	AAAG	2	8	877204	877211	75 %	0 %	25 %	0 %	294495527
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17116	NC_014002	AATG	2	8	877258	877265	50 %	25 %	25 %	0 %	294495527
17117	NC_014002	CCA	2	6	877390	877395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495527
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17119	NC_014002	TCCC	2	8	877506	877513	0 %	25 %	0 %	75 %	294495527
17120	NC_014002	TGC	2	6	877621	877626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495527
17121	NC_014002	GTAA	2	8	877637	877644	50 %	25 %	25 %	0 %	294495527
17122	NC_014002	CAT	2	6	877656	877661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495527
17123	NC_014002	CAA	2	6	877683	877688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495527
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17127	NC_014002	ATG	2	6	877883	877888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495527
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17130	NC_014002	T	7	7	878049	878055	0 %	100 %	0 %	0 %	294495527
17131	NC_014002	A	6	6	878076	878081	100 %	0 %	0 %	0 %	294495527
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17134	NC_014002	TA	3	6	878267	878272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17135	NC_014002	T	6	6	878364	878369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17136	NC_014002	AAAG	2	8	878377	878384	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17137	NC_014002	CA	3	6	878423	878428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17138	NC_014002	TACT	2	8	878525	878532	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17139	NC_014002	A	8	8	878552	878559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17140	NC_014002	AACC	2	8	878659	878666	50 %	0 %	0 %	50 %	294495529
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17143	NC_014002	GAA	2	6	879122	879127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495529
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17208	NC_014002	TAAT	2	8	881885	881892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17209	NC_014002	TAT	2	6	881911	881916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17231	NC_014002	CAT	2	6	883256	883261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495535
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17240	NC_014002	TTTG	2	8	883745	883752	0 %	75 %	25 %	0 %	294495535
17241	NC_014002	CCAT	2	8	883791	883798	25 %	25 %	0 %	50 %	294495535
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17366	NC_014002	GATA	2	8	889365	889372	50 %	25 %	25 %	0 %	294495543
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17400	NC_014002	TAGGT	2	10	891165	891174	20 %	40 %	40 %	0 %	294495543
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17490	NC_014002	TCC	2	6	895689	895694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495549
17491	NC_014002	CTTC	2	8	895717	895724	0 %	50 %	0 %	50 %	294495549
17492	NC_014002	CTG	2	6	895815	895820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495549
17493	NC_014002	AT	3	6	895875	895880	50 %	50 %	0 %	0 %	294495549
17494	NC_014002	TTCTT	2	10	895904	895913	0 %	80 %	0 %	20 %	294495549
17495	NC_014002	TGC	2	6	895934	895939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495549
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17499	NC_014002	AGA	2	6	896144	896149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17500	NC_014002	AAT	2	6	896191	896196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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