MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_014002	A	6	6	844533	844538	100 %	0 %	0 %	0 %	294495499
16503	NC_014002	TGAAC	2	10	844539	844548	40 %	20 %	20 %	20 %	294495499
16504	NC_014002	TCA	2	6	844565	844570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495499
16505	NC_014002	CTG	2	6	844577	844582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16506	NC_014002	TAT	2	6	844594	844599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495500
16507	NC_014002	TTC	2	6	844612	844617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495500
16508	NC_014002	AGTAT	2	10	844628	844637	40 %	40 %	20 %	0 %	294495500
16509	NC_014002	TAT	2	6	844668	844673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495500
16510	NC_014002	TC	3	6	844683	844688	0 %	50 %	0 %	50 %	294495500
16511	NC_014002	TCTG	2	8	844695	844702	0 %	50 %	25 %	25 %	294495500
16512	NC_014002	AAT	2	6	844741	844746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495500
16513	NC_014002	GAT	2	6	844776	844781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495500
16514	NC_014002	AAAG	2	8	844785	844792	75 %	0 %	25 %	0 %	294495500
16515	NC_014002	TTG	2	6	844867	844872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495501
16516	NC_014002	TA	3	6	844977	844982	50 %	50 %	0 %	0 %	294495501
16517	NC_014002	TCA	2	6	845093	845098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495501
16518	NC_014002	ATA	2	6	845137	845142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495501
16519	NC_014002	ATT	2	6	845146	845151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495501
16520	NC_014002	CAG	2	6	845186	845191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495501
16521	NC_014002	TTTG	2	8	845224	845231	0 %	75 %	25 %	0 %	294495501
16522	NC_014002	ATT	2	6	845280	845285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495501
16523	NC_014002	ACA	2	6	845506	845511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495501
16524	NC_014002	TCT	2	6	845596	845601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495501
16525	NC_014002	GCA	2	6	845623	845628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495501
16526	NC_014002	TATC	2	8	845639	845646	25 %	50 %	0 %	25 %	294495501
16527	NC_014002	CAGC	2	8	845660	845667	25 %	0 %	25 %	50 %	294495501
16528	NC_014002	TCT	2	6	845692	845697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495501
16529	NC_014002	GCC	2	6	845720	845725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495501
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16534	NC_014002	A	6	6	845889	845894	100 %	0 %	0 %	0 %	294495501
16535	NC_014002	CTG	2	6	845933	845938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495501
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16537	NC_014002	TTCT	2	8	846055	846062	0 %	75 %	0 %	25 %	294495502
16538	NC_014002	CAG	2	6	846087	846092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495502
16539	NC_014002	CAA	2	6	846095	846100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495502
16540	NC_014002	CATT	2	8	846191	846198	25 %	50 %	0 %	25 %	294495502
16541	NC_014002	TC	3	6	846244	846249	0 %	50 %	0 %	50 %	294495502
16542	NC_014002	TGGA	2	8	846268	846275	25 %	25 %	50 %	0 %	294495502
16543	NC_014002	TCA	2	6	846283	846288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495502
16544	NC_014002	CTTCTG	2	12	846335	846346	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294495502
16545	NC_014002	TGGT	2	8	846437	846444	0 %	50 %	50 %	0 %	294495502
16546	NC_014002	AT	3	6	846498	846503	50 %	50 %	0 %	0 %	294495502
16547	NC_014002	TCA	2	6	846649	846654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495502
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16550	NC_014002	ACTT	2	8	846795	846802	25 %	50 %	0 %	25 %	294495502
16551	NC_014002	TCT	2	6	847060	847065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495502
16552	NC_014002	CGGC	2	8	847124	847131	0 %	0 %	50 %	50 %	294495502
16553	NC_014002	GAT	2	6	847174	847179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495502
16554	NC_014002	CTG	2	6	847181	847186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495502
16555	NC_014002	AGT	2	6	847216	847221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495502
16556	NC_014002	AGT	2	6	847225	847230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495502
16557	NC_014002	GTT	2	6	847285	847290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495503
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16560	NC_014002	ATT	2	6	847406	847411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495503
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16564	NC_014002	ATT	2	6	847838	847843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495503
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16566	NC_014002	TGC	2	6	847982	847987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495503
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16568	NC_014002	AT	3	6	848056	848061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16569	NC_014002	AT	3	6	848092	848097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16570	NC_014002	A	6	6	848109	848114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16572	NC_014002	CTG	2	6	848251	848256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495504
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16582	NC_014002	CA	3	6	848670	848675	50 %	0 %	0 %	50 %	294495504
16583	NC_014002	TTTA	2	8	848684	848691	25 %	75 %	0 %	0 %	294495504
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16585	NC_014002	GTA	2	6	848720	848725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495504
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16589	NC_014002	A	6	6	848885	848890	100 %	0 %	0 %	0 %	294495504
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16597	NC_014002	CCG	2	6	849339	849344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495505
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16602	NC_014002	GTCAT	2	10	849618	849627	20 %	40 %	20 %	20 %	294495505
16603	NC_014002	CT	3	6	849629	849634	0 %	50 %	0 %	50 %	294495505
16604	NC_014002	ATC	2	6	849693	849698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495505
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16609	NC_014002	AGC	2	6	849887	849892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495505
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16612	NC_014002	TAA	2	6	850147	850152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495505
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16617	NC_014002	AT	3	6	850313	850318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16618	NC_014002	A	6	6	850332	850337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16619	NC_014002	TC	3	6	850445	850450	0 %	50 %	0 %	50 %	294495506
16620	NC_014002	TA	3	6	850464	850469	50 %	50 %	0 %	0 %	294495506
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16991	NC_014002	TTG	2	6	870183	870188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495523
16992	NC_014002	TAC	2	6	870200	870205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495523
16993	NC_014002	TGCC	2	8	870325	870332	0 %	25 %	25 %	50 %	294495523
16994	NC_014002	ATG	2	6	870358	870363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495523
16995	NC_014002	CGG	2	6	870493	870498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294495523
16996	NC_014002	GAT	2	6	870511	870516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495523
16997	NC_014002	ACG	2	6	870590	870595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495524
16998	NC_014002	TCA	2	6	870624	870629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495524
16999	NC_014002	CCAG	2	8	870652	870659	25 %	0 %	25 %	50 %	294495524
17000	NC_014002	GGC	2	6	870665	870670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294495524

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