MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014002	GGA	2	6	820401	820406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495465
16002	NC_014002	T	7	7	820407	820413	0 %	100 %	0 %	0 %	294495465
16003	NC_014002	TAC	2	6	820427	820432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495466
16004	NC_014002	TTC	2	6	820612	820617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495466
16005	NC_014002	TTG	2	6	820632	820637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495466
16006	NC_014002	GCAGT	2	10	820698	820707	20 %	20 %	40 %	20 %	294495466
16007	NC_014002	AGC	2	6	820783	820788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495466
16008	NC_014002	ATA	2	6	820791	820796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495466
16009	NC_014002	AG	3	6	820839	820844	50 %	0 %	50 %	0 %	294495466
16010	NC_014002	GAA	2	6	820848	820853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495466
16011	NC_014002	GTT	2	6	820987	820992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495466
16012	NC_014002	GAA	2	6	821000	821005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495466
16013	NC_014002	GGAA	2	8	821038	821045	50 %	0 %	50 %	0 %	294495466
16014	NC_014002	TTA	2	6	821046	821051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495466
16015	NC_014002	ATT	2	6	821093	821098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495466
16016	NC_014002	CAATA	2	10	821099	821108	60 %	20 %	0 %	20 %	294495466
16017	NC_014002	GAT	2	6	821206	821211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495467
16018	NC_014002	T	6	6	821225	821230	0 %	100 %	0 %	0 %	294495467
16019	NC_014002	CTG	2	6	821237	821242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495467
16020	NC_014002	ATA	2	6	821300	821305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495467
16021	NC_014002	AGA	2	6	821334	821339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495467
16022	NC_014002	A	6	6	821450	821455	100 %	0 %	0 %	0 %	294495467
16023	NC_014002	TAA	2	6	821475	821480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495467
16024	NC_014002	TAT	2	6	821508	821513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_014002	GTT	2	6	821516	821521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_014002	GATA	2	8	821553	821560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_014002	CAC	2	6	821575	821580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495468
16028	NC_014002	AG	3	6	821662	821667	50 %	0 %	50 %	0 %	294495468
16029	NC_014002	GCT	2	6	821676	821681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495468
16030	NC_014002	TCC	2	6	821707	821712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495468
16031	NC_014002	TGG	2	6	821713	821718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495468
16032	NC_014002	TTGA	2	8	821739	821746	25 %	50 %	25 %	0 %	294495468
16033	NC_014002	TGA	2	6	821777	821782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495468
16034	NC_014002	TGT	2	6	821864	821869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495468
16035	NC_014002	ATG	2	6	821875	821880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495468
16036	NC_014002	AGA	2	6	821908	821913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495468
16037	NC_014002	TGG	2	6	821945	821950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495468
16038	NC_014002	GAA	2	6	822096	822101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495468
16039	NC_014002	AAT	2	6	822134	822139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495468
16040	NC_014002	GTG	2	6	822207	822212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495468
16041	NC_014002	AAGAT	2	10	822220	822229	60 %	20 %	20 %	0 %	294495468
16042	NC_014002	CAG	2	6	822249	822254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495468
16043	NC_014002	AGA	2	6	822311	822316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495468
16044	NC_014002	GAA	2	6	822318	822323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495468
16045	NC_014002	TGA	2	6	822367	822372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495469
16046	NC_014002	AAG	2	6	822392	822397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495469
16047	NC_014002	GTTG	2	8	822418	822425	0 %	50 %	50 %	0 %	294495469
16048	NC_014002	AAAG	2	8	822511	822518	75 %	0 %	25 %	0 %	294495469
16049	NC_014002	GCA	2	6	822527	822532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495469
16050	NC_014002	GAT	2	6	822563	822568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495469
16051	NC_014002	CAT	2	6	822589	822594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495469
16052	NC_014002	GAA	2	6	822644	822649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495469
16053	NC_014002	ATT	2	6	822671	822676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495469
16054	NC_014002	GAA	2	6	822743	822748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495469
16055	NC_014002	TGA	2	6	822781	822786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495469
16056	NC_014002	TGA	2	6	822801	822806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495469
16057	NC_014002	AAT	2	6	822820	822825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495469
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16061	NC_014002	GTT	2	6	823196	823201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495470
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16063	NC_014002	CTT	2	6	823310	823315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495470
16064	NC_014002	ATG	2	6	823352	823357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495470
16065	NC_014002	ATC	2	6	823508	823513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495470
16066	NC_014002	AAAT	2	8	823651	823658	75 %	25 %	0 %	0 %	294495470
16067	NC_014002	AACC	2	8	823675	823682	50 %	0 %	0 %	50 %	294495470
16068	NC_014002	T	6	6	823693	823698	0 %	100 %	0 %	0 %	294495470
16069	NC_014002	GAA	2	6	823706	823711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495470
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16077	NC_014002	TGA	2	6	823940	823945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495471
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16101	NC_014002	ATGG	2	8	825156	825163	25 %	25 %	50 %	0 %	294495472
16102	NC_014002	ATGTTC	2	12	825173	825184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294495472
16103	NC_014002	TGC	2	6	825210	825215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495472
16104	NC_014002	GAA	2	6	825370	825375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495472
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16106	NC_014002	GTT	2	6	825472	825477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495472
16107	NC_014002	TATT	2	8	825526	825533	25 %	75 %	0 %	0 %	294495472
16108	NC_014002	A	6	6	825592	825597	100 %	0 %	0 %	0 %	294495473
16109	NC_014002	A	6	6	825604	825609	100 %	0 %	0 %	0 %	294495473
16110	NC_014002	CAG	2	6	825627	825632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495473
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16117	NC_014002	T	7	7	826207	826213	0 %	100 %	0 %	0 %	294495475
16118	NC_014002	ACA	3	9	826225	826233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495475
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16243	NC_014002	TGT	2	6	832481	832486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495484
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16245	NC_014002	TCCGC	2	10	832528	832537	0 %	20 %	20 %	60 %	294495484
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